BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-134D08.T7 (MSMg01no134_d08.b1) | MSMg01-134D08.TJ (MSMg01no134_d08.g1) |
ACC | AG340979 | AG340980 |
length | 1,179 | 1,170 |
length of high quality (start - end) | 294 (496 - 789) | 706 (132 - 837) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no134_d08.b1 PHD_FILE: MSMg01no134_d08.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:49:23 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no134_d08.g1 PHD_FILE: MSMg01no134_d08.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:49:23 2005 |
singlet/doublet | doublet | doublet |
---|
BLAST hit | unique | unique |
---|
Map location. | (42,340,346 - 42,340,639) | (42,501,253 - 42,501,830) |
---|
sequence | NNNGGGGACACTGGGXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGGA
ATTCCAGGACTGCCAGGGCTATACAGAGAAACCCTGTCTCAGAAAACTCA
AAAAAAGAAAAAAGAAAGAAAAAAAAAAACACCAACGAAAAAAGAAAAAA
AAGATTTTCAAGTTAATATTGTGTTGAATTTTATGTCTCTATTTTTAGAT
AAAATTTTAATATGATTCTAGTAAAATTATCTGCCTGTTAAAGTTTATTT
CTTTTGTTTGTAGTTAGTGACTTTCTGTACTAAAGTTATCCCCATGTTTC
CTCCTTTATCTGCCCTCCTTTCAACATGGTAGGTAATCCATAGTAGAAAT
CCACAATCTTCCTTAAGAGCACTTGGAAACCGTTCTCATGGTCACTCCGT
TTTCTGAGCCTCTGCTTCCGTGTCAGCTTCTATTTCTCCTCTCTGATTCT
TTTTTCCCCCCCCCACCCTTAGTTTTTATATGTATAAGAAAAGCATGGGG
TGTATTGCTAGGGTTGTCCGCACTTCTAATTCTAGTGCTTGGGGCTCTAA
GACAGCCCAACTCAAAGCCAGCCTGGGCTATATAGGAAGCCCAATCTGAG
AAAATAAACAGGGCCTATGGAGAAGGTCATCAGATAGAGACATGCCTGTC
CCAAAACCTGACAACCTAAATTCAATCCCCAAGTTCCACAGCGGAAGTAG
AGAACGGCCTCCTGCAGGTTATCTTTTGGCCTCCATACTTGCATTGTGGA
GTATGGATGGATGGATGGATGAATGAATGAATGTAATTAAATCCTCACAC
CCCACCCTTATCCTAGATTATAAATTTATTTTTGAACTCCAAATATGTTG
TCAGTAGGATTTTATGATTTGGGCATATTTCTTGTTATATTGATATTATT
CTTTGTATTATTAGTAACCTTTCCCTGGAAACGTTTTCTTATGTACTTTC
CTCTTATTTATACTGACACAATTTTATCTTTAAAATTCTTTAATTTTATC
TCATTTCTCTTTTTTATATTCATTCTTATCTTTCATTTTTTTTCTTTTTA
TTTATGCTTTAAATTCTTCTTTTCTCTTCTTCCTCTTATTTTATTTCCTC
TTAATTTTATTTCTTCTTCATCTCTTAATTATCTTCTCTATACCTTCCAT
ATCTTTATATACTTCATCTTCTCCTTACT
| CGTGTCTTTTTAAAGGCATGGAGCTGGGGCGCCXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCTTTAACCGCTGATGGGTTGATGGTTC
GTTTGCTGATTTCTTAAACGCTGCTTCTCGCCCCTCGAGACTATAAAAAA
GAGTTATGAGAACTGAATGAGACAGCCAACTCATATTATAACAGCCAAGT
GGAGGCATGTGGGTGTGATTTATAGTTAGCCCTATAGAGAAAGATATCTT
GCCCGATCCTATTTCCGTCCTCTTGAAGGATCTAGCCAAAGTTGAACACT
TTATTTCCTGTATCACCGCTGAAGCAGTTTCAACAGGTACTTGTCAGCGA
GCTTCGTGCTGAATGAGCTCGGAGCTTTATCCTGACCGAATCTGAAACTG
TTTAAAATTTAGAATTTGCTTCTGAAGATGTTGTCGATAAAATACAAAGA
AGTTAAGACAGCAGTTATTAAAACCTATGTAGTGCTTTCCATGTTTCCAT
GATTGGTTCTTTGTTTTTTTGAGACAAGGTTTCTCTGTGTAGTCCTGGAA
CTTAACTCTGTAGACTAGGATAGCCATGAACTCAGACACTCACCTGCCTC
ACCTCCCCCACCCCACCAACCCCCAAGTGCTGGGATTAAAGGCTTGGGCT
GCAACCACAGCAAGGCTCAGAATTTGTTGTAAGCACTCTGAATAATCACT
TTTCCCCTAAGATCTCTCCTCGTGTTTCCATTTATGGAGCTGTAATTCAT
AAGCCATAAACTCCTTTTAAAGTGTACAGCTAGTGGGGTTTAGTATATTT
ACGAGTTCACCACTATTTAGTCAGTAAGCATTTTGCCACTCCAAAGGAGA
CTGTTTAACCAAACATTAAATAGTCCCACCCCTTCTGCCCGCCCTTCCAG
CTTCTGTCGAATGCTTTCCAGCTTATAGGATTTACTTGTTATGAATATGT
TAAGGCCTGTGGAATTAAATTGTACCTAGCCTTCTATGGTTGGCCTTCTT
TCCCTTAGGTGGTTGTTGAAAAAGGATTTTCCCCACTATCTTCTCGTTGT
TCCTTGTAAATCTCCGAAATTCCCACCCCGTGCTTTGTCCTCCCTCTTTC
TTTGCCTATCCCCTGCATCCTCCCCGAAAAACCACTCCTCTTTTTGCTAT
CTCTCTTTTCTTTTGTCTTC
|
quality values | Open.Hide. 0 0 0 3 6 6 6 6 6 6 7 7 8 8 14 15 12 9 8 8 10 10 9 8 11 12 9 8 8 11 14 20 26 29 42 28 20 24 26 30 30 42 48 48 42 36 39 42 42 48
48 53 47 50 43 40 37 40 43 43 43 43 50 43 50 50 48 48 35 35 41 57 47 47 47 57 57 57 51 51 51 50 43 43 43 43 50 50 50 50 50 48 48 57 46 54 48 43 43 43
43 59 59 59 59 59 59 59 59 57 43 47 43 46 46 46 46 57 48 48 59 48 47 47 59 47 30 24 10 10 9 9 9 10 19 26 28 34 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59
59 59 59 59 59 59 57 57 48 48 48 50 53 53 57 50 50 50 53 53 57 57 57 57 57 50 59 59 59 39 37 26 23 17 12 11 11 11 15 18 24 28 28 33 30 30 23 23 23 28
28 37 37 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 59 59 59 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 50 53 57 57 53 53 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 41 41 32 28 16 13 10
10 10 10 25 23 59 43 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 47 47 31 19 13 6 6 6
8 12 18 18 21 21 20 20 22 17 13 12 9 12 25 28 39 59 59 59 59 37 30 21 26 24 32 31 28 19 19 11 11 11 8 8 7 7 7 8 8 11 11 11 11 18 16 28 33 59
59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 59 59 59 68 59 59 68 68 59 59 59 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 59 59 44 57 57 59 57
57 57 59 59 48 48 48 59 57 57 57 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 48 48 59 59 59 57 57 57 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 54 54 47 59 42 48
48 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 47 35 35 47 59 59 59 68 68 68 68 68 57 57 48 48 57 48 43 43 43 43 47 47 59 59 59 32 37 28 28 25 33 33 48 59 48 47
47 47 39 37 37 37 29 29 37 41 41 47 41 41 41 48 47 47 41 47 41 41 41 31 32 35 37 37 39 37 37 37 41 41 47 48 48 47 41 41 47 47 44 41 37 34 39 39 39 41
40 41 41 41 41 41 39 31 28 39 37 37 39 37 37 41 50 50 48 37 39 39 41 41 59 37 41 39 36 36 31 39 39 41 41 47 47 47 47 59 41 41 44 37 39 39 44 31 31 32
37 37 37 41 33 33 33 33 37 37 39 39 37 37 39 39 34 34 41 41 39 36 36 44 37 32 28 32 32 28 31 28 27 27 14 13 13 14 11 13 18 16 22 19 19 10 10 10 10 10
10 10 11 11 11 10 10 13 11 13 11 9 9 9 10 10 10 13 10 10 10 8 10 8 8 8 8 9 10 11 12 12 15 15 19 11 11 9 11 9 9 8 8 6 6 8 6 9 10 10
10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 13 23 16 15 12 12 10 8 8 8 8 8 10 12 11 11 16 15 11 11 8 8 8 8 10 10 8 8 8 9 11 10 10 10 10 10 8 8 8
8 8 10 8 8 6 6 8 8 6 6 6 6 8 8 9 9 10 9 9 9 8 8 8 8 10 10 12 19 12 12 11 10 10 10 10 7 7 8 7 8 10 8 8 8 10 8 12 8 8
8 8 8 8 8 8 8 15 19 19 8 7 7 8 6 8 6 6 8 6 9 9 9 13 10 8 8 8 8 10 9 12 9 9 9 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 10 9 10 10
9 8 8 8 8 8 9 8 8 8 7 9 10 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 6 6 8 8 8 8 6 6 8 8 9 10 14 10 11 12 12 10 10 8 8 11 10 8 10 8 10
8 8 8 8 8 8 8 13 11 11 8 8 8 8 8 8 8 16 19 19 14 10 8 8 8 8 8 8 6 8 6 6 13 13 13 8 8 8 11 8 8 10 10 10 13 10 10 8 8 6
6 8 8 7 7 11 11 13 7 6 8 8 8 12 10 10 8 8 6 6 10 12 13 8 8 13 11 14 10 10 8 8 17 15 8 8 8 8 6 6 9 9 14 12 12 8 8 8 8 8
10 8 6 6 6 8 8 8 8 8 7 7 10 8 8 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 9 | Open.Hide. 9 9 9 10 10 9 9 9 8 19 19 19 8 6 6 6 6 6 7 8 9 12 6 14 6 6 6 7 12 16 13 9 7 9 8 11 11 21 19 19 10 10 10 23 22 31 30 30 35 38
36 38 36 37 37 37 35 32 36 36 53 53 53 50 50 50 50 47 34 27 10 8 6 8 8 9 13 15 16 19 12 8 8 8 10 19 22 31 53 53 53 50 50 50 53 53 53 48 47 47
47 47 44 33 31 31 31 30 21 19 8 8 8 8 8 10 11 12 16 17 18 18 11 10 10 14 15 8 8 8 8 9 19 34 34 41 42 50 50 41 41 47 53 50 53 53 53 59 59 59
59 59 53 53 53 53 53 53 59 59 57 47 47 47 47 47 50 50 53 50 53 57 53 53 59 59 59 50 46 43 28 19 10 9 9 9 11 30 25 41 41 41 46 32 32 20 20 20 24 26
33 37 59 59 59 48 48 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 57 68 68 68 68 68 68 54 54 54 57 54 54 54 54 54 54 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57
57 59 59 59 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 48 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 68 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 57 59 57 57 57 57 57 57
57 68 68 68 68 68 68 59 57 57 57 57 57 57 68 68 68 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 57 57 59 59 68 68 59 59 57 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 59 59 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 44 33 26 12 13 13 26
26 34 33 62 62 62 62 68 62 62 62 62 62 62 62 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 62 62 62 52 62 45 52 52 62 62 62
52 52 62 62 62 68 62 62 62 52 52 52 62 62 62 62 62 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 59 59 68 68 59 59 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 68 59 57 57
57 57 57 57 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 59 59 59 57 57 59 59 59 52 52 52 59 59 59 59 59 57
57 59 59 59 50 50 57 59 59 59 57 57 50 47 57 57 59 59 68 68 68 59 59 57 57 57 57 57 57 48 48 57 44 43 57 57 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59
59 48 48 48 48 54 54 54 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 48 48 48 48 48 46 59 59 57 57 57 59 59 48 48 48 57 57 57 50 48 48 48 47 47 41 39 30 22 12 9
9 9 22 20 32 35 39 39 43 47 59 59 57 48 43 43 33 23 19 11 11 21 34 32 48 48 48 48 48 48 59 59 48 41 41 41 41 41 44 37 31 31 37 37 37 39 40 40 41 48
59 59 48 57 57 59 59 57 50 43 43 39 43 43 48 48 48 48 43 34 19 11 11 23 25 43 37 34 36 36 36 38 48 50 50 50 50 47 59 34 30 24 19 20 23 30 32 33 41 41
47 41 30 28 19 25 30 34 34 34 28 33 37 43 46 59 59 59 59 59 59 48 48 48 48 48 34 28 22 22 22 32 42 57 57 57 48 48 48 59 59 47 37 37 30 37 37 43 48 43
48 42 39 42 32 24 16 11 11 11 18 18 20 28 22 23 16 23 26 24 25 25 31 34 43 39 39 37 35 32 32 41 39 39 34 24 13 10 10 15 15 10 10 10 15 19 19 15 14 14
21 17 13 10 10 13 13 13 23 12 9 8 8 8 13 8 8 8 11 10 11 12 18 16 16 12 13 18 12 13 13 15 16 22 24 28 34 32 25 16 15 11 11 11 21 15 18 12 12 12
15 12 20 20 20 12 16 8 8 8 8 8 15 15 14 9 8 10 10 10 28 19 12 13 10 10 10 14 14 18 23 19 18 24 23 12 12 16 17 24 24 30 30 28 22 15 15 15 12 10
10 11 9 9 9 10 10 10 9 10 10 11 11 9 13 8 8 8 9 8 8 6 6 6 8 8 8 10 10 10 10 9 9 9 8 8 8 8 8 8 8 11 10 10 10 10 10 12 17 18
16 10 12 7 6 6 6 9 7 7 8 8 10 9 8 12 10 10 10 10 11 11 11 8 8 8 8 8 8 8 10 10 8 11 12 10 8 8 8 9 9 6 6 6 6 8 8 8 8 8
8 8 10 8 8 8 11 10 8 8 8 8 8 8 11 11 11 17 12 8 8 8 7 7 9 9 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 17 15 18 10 12 9
7 10 8 10 10 8 10 10 10 18 11 11 10 10 10 8 8 6 8 8 10 8 8 10 10 10 10 11 19 17 13 13 6 6 6 6 6 10 8 8 8 8 10 10 10 12 9 9 9 9
9 9 8 8 8 8 8 8 12 13 12 17 10 8 8 8 8 8 8 8 |