| BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
|---|
| end name | MSMg01-146B20.T7 (MSMg01no146_b20.b1) | MSMg01-146B20.TJ (MSMg01no146_b20.g1) |
|---|
| ACC | AG349739 | AG349740 |
|---|
| length | 1,207 | 1,185 |
|---|
length of high quality
(start - end) | 702 (137 - 838) | 728 (90 - 817) |
|---|
| definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no146_b20.b1 PHD_FILE: MSMg01no146_b20.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:07:30 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no146_b20.g1 PHD_FILE: MSMg01no146_b20.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:07:30 2005 |
|---|
| singlet/doublet | --- | singlet |
|---|
| BLAST hit | no hit data | unique |
|---|
| sequence | NCCCTACTTNNNNNAGCATTGGCGCTAAGACTCCTAAGGGAGAGGATCCG
CGGAATTCCACGACTTGAAAAATCCTTTAAACCACCACGTCCATTTGGGC
ATCGAAGGGCAACCCTAACTACCTGTGGATCACCCATGTAAGCTACACTG
GGCGTGGTGGCGCACACCTTTAATCCCAGCACTCGGGAGGCAGAGGCAGG
CGGATTTCTGAGTTCAAAGCCAGCCAGGGCTATACAGAGAGACCCTGTCT
TCGAAAACCCCCTTCCCCCAAAAAACAAACAAACAAAAAAAACAAACGTA
AGCTACAGTGGTCACCCAGACCTATGGTCCACACAGGATGCCCAGGTAGG
AAGATGCAAATCTGAGGCCAGCCTAAGTGACAAAGCAAGATCTCATCTCA
GGAATTAGACAGAAGTCCAGATGGGAACTCTAGCTAGCCTGGGGATAAGG
CTCAGCTGGTATAAGAGTGCCTAGCAACACAACGCCCTGGGTTCACTACC
CACCACCCCATGCACCACACTGGAGAGAGCATCATGTGTACTATATGGAT
GCACCACCTGTCAATTTAAAAGCCATAGGGTCTATAGCTTGGGCAGGAAA
TGGAAATGGAGGGTAGAGCACCCAGGAGACAAAGGATTCTGGGATAGAGC
CAGACTGGCTATCCACCTGGGATGAGGTAAGGAGAAGGATGCATGGTAGC
TGAATGCAGTCACGTGACAGAATGTAGGTTAAAATAATTGGGTTATTTTA
GCTATGATCTACTCAGAGTAGAGCCTAGCTGTATGGCCAAGGTATATATA
AATATACTTTTGAGTCTGAGTCTTATTTCTGAGAGCATGTGGCTAGGAAG
AAGAACCAGGACCTAACTCTATACCACATATGGTGGTACAAGCAGTTCCT
TCCTAGCTGCAAAGGAAGAGCCAAGAGGACCAGACGCTCAAGATGATCTG
CAACTACCCCAGTGGGCCTGAGGACTTCCTTGAATACATGAAACTTACCT
CAAAAAAAAAAAAAATGGGTAAGTAGGTTAAAAAAAAAGGGTACCCCCCC
TGGCTGTATTTCCCCAAAAAACCCAGTTTAATTTCCCCCGACCCTTAATT
AGAGGTGGAAAAAATTAACCCCCACCCCAAGAGATTAAAAGGACCTCCTT
TGGAAAATGCCCGAGGGGTGGGTGGGTTTTAATATTATATTCCCTCCTAA
TTCCAGT
| CTTCCTTTTTTNTNATCATGGTAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCCTTTTAAGTCAGCCTAAGCTACAC
AGCAAGATTCTATGTACCCTAACTCCATCAACCACCCCATAAGCAAACTG
TGATATATCAATACAATGGAATACTCTTTGGCAATAAAATACTAACTCAC
CCAATAACATGGATAAAAATGAAAAACATACTAAATAAAAGAAGCCACGT
ATAAAAGCACTCCCTGTATACAAGTCTATGTATAGCAATTGTCTAGAAGG
CAAATGTACAGACAGAAGGTAGACGGTTGGTTATCTGGGGCTAGGATCAG
AAATCACCACAAACGAGCACATCAGACCACTGAATGAGAATGGAAATGTT
CTAAAATGTTAGTAATTAGTTGCACTATATTTACTAAAAAAGATTTGCCC
TATAATTTTAAAATGTAAATAGCGTGTTCTAGAACCCAACCCTCAGTAAA
GTGTAGGTTTTTGCTTTTGTTTTTTAAAACTTTTCCCCCAGTAAGAGTGG
TATATACACTTTTTCGCCCTTTAATTTTATTGTATGGATGTTTTGCCAGC
ATGTGTGCCCATGGAGACCAGAGTTAAAGGTAGTTGCAAGCTGTCGTATG
GGTTCTGAAAACATACTATGGATTTAAATTCATCTTTTATATTTAACCAA
GAAACTCATTAAGAATATTAAGCTTGCTTGGTGTGACAGCACAGGTCTAT
TAAAGCTCTAGGAGGCAGGGCAGCCAACTCTGTGGGACCATCTTGTCTAC
ATAGGAAGTTCCAGGCCAGCCAGGAACTGCATAGAGTCCATATCTCAAAA
GAGAAACTGAACGTGCCATTACTAGCTTCCCGAAAATAGTAACAGACGTC
CCAAAACAGTTCTTCTCACCTGAATTTTGTTTAGAGCCTGAGGAACCTCC
ATGTTCGACTTTTGCCTTCTTCTTCTTGGATGAGGAGGAAAAAGGTTGAC
TTAAAAAGCCCAACCAGGTTTTTTTACCCTCAAGAAATGGAAAAAAATTC
GGTTTTTTTAAAAAGATCTTCCAATTCTCCAAAAAGCTTGGGATCCCATT
AGGTTTCTAAAAAAAAACCTAAAACCTTTTTTAAAATTTTTTTTAAATTA
TTTAAACCCCCCATGTCTTTTGTTATATAACTCCA
|
|---|
| quality values | Open.Hide. 0 3 8 8 8 8 7 8 3 0 0 0 0 0 3 6 6 7 7 8 6 8 10 10 8 8 8 8 8 19 19 8 8 8 8 8 8 19 22 36 33 36 33 36 33 33 37 37 37 33
37 37 37 31 28 32 37 37 37 28 28 28 37 30 31 30 30 28 25 25 30 12 12 9 13 7 7 6 6 6 6 8 8 8 8 8 13 17 28 28 31 31 44 44 53 53 50 50 50 53
53 53 53 53 44 50 50 50 47 47 23 23 11 10 10 10 13 10 19 19 28 29 28 33 30 30 19 15 7 7 7 8 8 8 12 12 16 22 26 41 33 31 31 31 36 36 38 48 57 57
48 48 42 42 47 47 42 47 48 48 57 57 59 59 59 54 54 54 47 47 47 48 48 54 59 59 68 57 57 57 57 57 57 57 48 48 57 48 57 48 48 48 48 48 57 57 57 59 57 54
54 57 54 54 57 57 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 68 57 59 57 57 57 57 57 54 54 59 54 54 52 57 57 68 68 50 50 50 50 50 50
57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 52 52 52 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57
57 57 57 57 57 57 68 62 62 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 62 62
62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 44 39
23 9 10 9 9 9 9 15 39 39 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 52
52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62
62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 62 62 62 62 62 62 57 57 59 59 59 59 59 57 57 52 57 57 57 59 68 68 68 68 68 68
68 68 68 57 57 57 54 52 57 57 57 57 57 57 59 59 68 68 68 59 59 57 57 57 57 59 59 59 68 68 59 59 57 57 57 59 59 68 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57
57 57 57 57 57 59 59 54 50 50 44 43 43 57 57 57 48 47 47 48 50 46 44 43 43 43 37 44 44 57 57 57 48 47 54 57 57 54 47 47 59 57 68 68 57 57 57 59 57 57
57 57 54 54 54 54 57 59 57 57 57 57 57 57 59 59 57 57 57 54 54 54 54 54 57 57 48 48 48 50 48 48 48 47 47 47 42 42 47 48 57 50 48 46 46 40 40 40 47 41
41 37 31 31 37 37 37 41 46 46 47 48 37 47 47 47 47 47 48 48 48 47 42 40 39 41 43 43 36 34 41 41 47 41 41 37 37 41 40 39 59 46 47 59 59 59 59 59 59 46
46 46 47 57 57 57 57 57 57 57 57 57 44 43 40 37 33 33 33 27 27 30 33 28 32 39 43 47 39 39 39 41 43 41 34 31 35 30 31 24 30 19 19 14 19 21 28 37 48 36
33 33 33 37 37 41 39 30 30 26 26 30 25 36 36 37 37 39 37 37 39 43 43 36 36 36 34 39 36 29 30 24 28 19 23 12 15 16 18 19 18 22 34 21 23 12 10 10 10 10
10 12 18 19 25 19 24 25 34 25 25 28 34 36 30 24 28 18 26 21 28 28 28 23 28 28 36 37 36 37 24 21 11 11 10 11 13 10 17 15 15 14 16 16 12 9 9 11 10 12
18 18 12 16 11 10 10 10 13 15 19 24 14 13 8 8 8 11 13 24 19 23 20 19 15 13 11 10 10 16 12 9 9 10 15 13 18 12 12 12 15 16 11 15 15 19 16 15 10 11
8 15 8 10 10 11 9 11 8 8 8 8 8 8 10 10 10 10 12 16 19 16 16 11 9 9 12 14 24 19 14 13 8 8 8 8 8 9 10 16 11 9 10 10 8 8 11 16 9 9
9 9 9 20 30 41 43 43 37 22 15 9 9 9 9 9 9 10 10 11 11 10 10 10 10 10 11 12 12 12 12 14 20 15 15 9 10 8 8 8 8 8 10 10 11 10 11 11 13 13
13 10 9 9 6 8 6 7 8 8 9 12 12 12 9 11 9 12 9 11 11 10 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8
8 8 8 8 8 8 8 8 8 12 19 15 14 14 15 13 11 13 12 16 15 18 13 13 13 21 17 11 10 10 7 6 6 6 6 6 6 8 8 12 9 11 13 11 10 8 8 8 8 13
9 9 9 8 8 9 8 10 9 10 9 9 9 9 9 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 10 8 8 10 8 8 8 10 6 6 6 6 11 10 10 8 7 6 6 6 10 6 6 6
6 9 8 8 8 6 6 | Open.Hide. 9 9 9 11 11 9 17 11 23 21 3 0 3 0 3 7 7 8 8 8 6 6 6 3 0 3 6 6 6 8 15 9 10 13 8 8 9 8 11 10 18 19 19 8 8 11 19 21 28 20
20 20 28 29 35 35 36 37 35 35 35 35 35 36 36 33 33 33 37 37 47 27 27 9 9 9 16 13 12 11 11 10 8 8 9 10 9 10 10 21 21 25 28 31 31 31 31 36 53 53
53 50 53 53 53 53 36 33 31 31 31 28 25 21 14 10 10 12 12 15 15 12 16 16 30 32 37 37 37 37 25 25 11 16 10 10 10 11 11 14 23 28 41 59 59 48 48 47 47 47
50 50 50 47 53 50 48 57 47 36 36 36 37 36 43 39 42 43 43 43 54 48 50 50 48 57 57 57 57 48 48 48 48 48 54 54 54 48 47 47 47 47 57 57 57 57 57 57 57 57
57 57 57 57 68 68 57 57 57 57 57 54 54 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 57 57 52 52 52 59 59 59 59 57 57 57 57 57
57 57 57 52 52 57 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 54 57 57 57 52 52 50 50 57 57 57 52 52 52
52 52 59 59 59 59 57 57 57 57 57 68 68 59 59 57 54 54 57 57 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 54 54
54 57 57 68 68 68 68 68 68 59 59 57 59 54 57 59 54 54 57 57 57 57 57 54 54 54 54 54 68 57 57 57 57 57 50 50 48 50 50 57 57 57 57 57 59 47 48 48 59 59
59 41 32 23 18 19 17 9 9 9 12 24 27 39 41 41 43 43 43 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 48 48 54 57 59 57 68 68 68 68 68 59 59 54 59
48 47 47 47 47 48 54 57 54 54 54 59 59 59 54 59 59 68 59 59 54 54 54 54 54 54 59 59 59 57 54 57 57 57 57 57 57 59 57 43 43 50 44 44 57 43 43 47 59 59
59 59 57 57 52 52 52 57 59 59 59 59 57 57 59 59 68 68 68 68 68 59 59 59 59 57 57 57 59 59 59 59 59 59 57 57 57 59 52 37 37 50 50 57 57 57 57 57 59 68
68 59 59 59 59 59 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 44 44 36 36 23 38 36 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 59 59 43 43
43 59 48 68 68 68 68 68 59 59 57 57 48 57 48 48 48 48 48 48 54 54 57 57 59 59 57 57 59 59 59 43 43 43 59 59 59 59 48 48 47 36 36 31 31 31 33 41 41 40
39 41 37 37 43 44 44 47 47 47 47 59 59 59 48 48 48 57 44 48 48 48 48 48 57 57 57 48 48 57 48 48 54 59 59 57 57 57 57 57 57 57 59 59 57 57 57 43 43 37
43 43 48 48 48 48 59 59 59 37 37 24 24 18 24 28 39 40 41 47 47 35 32 37 39 40 40 37 36 25 25 25 36 33 33 43 43 39 43 43 48 48 48 48 46 41 41 39 39 23
19 13 13 16 16 30 31 34 41 46 39 39 32 32 30 30 24 28 20 14 14 15 19 19 20 25 37 37 30 37 37 34 30 47 27 18 17 16 14 19 21 28 28 41 34 46 48 28 23 11
11 11 11 15 15 8 8 8 11 21 31 37 30 19 19 17 18 19 32 29 16 18 15 15 15 16 22 30 28 28 30 30 28 30 24 32 21 24 19 28 30 37 33 35 33 32 27 25 32 28
24 19 19 17 21 17 30 14 17 8 8 8 15 16 10 10 10 18 19 23 25 11 11 10 12 15 16 16 16 20 10 10 10 12 17 15 14 10 11 12 15 16 23 18 18 18 24 24 20 20
22 21 17 12 10 8 10 8 10 13 15 15 9 9 9 10 10 15 11 11 11 9 12 12 12 13 22 12 10 9 9 12 9 9 9 11 11 17 11 11 11 10 9 9 9 9 10 12 12 17
19 28 22 19 19 14 21 15 11 15 19 14 27 16 12 11 12 10 14 21 24 22 15 15 16 15 10 9 9 9 9 9 10 11 11 12 10 10 8 9 8 8 8 8 9 10 9 10 8 6
6 8 8 11 10 11 8 8 6 6 6 6 8 8 10 10 10 8 11 14 15 9 10 10 14 14 15 15 15 11 16 10 12 13 15 12 15 14 13 8 8 8 8 8 9 13 11 10 10 10
10 9 8 10 10 15 11 9 12 12 19 13 13 12 9 8 8 6 6 6 7 10 10 6 6 8 8 9 11 10 10 10 11 11 11 12 9 11 11 8 8 8 8 8 10 8 8 6 6 6
6 11 10 15 8 8 8 8 10 13 14 27 28 34 24 23 20 20 20 16 16 13 19 16 19 14 14 14 18 7 10 6 6 8 6 12 12 12 18 11 14 17 12 11 6 6 6 7 8 8
8 8 8 8 8 7 9 9 15 10 8 10 10 6 6 6 7 7 8 10 10 6 8 6 6 8 6 6 8 8 10 10 8 8 8 |
|---|
