BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-158D01.T7 (MSMg01no158_d01.b1) | MSMg01-158D01.TJ (MSMg01no158_d01.g1) |
ACC | AG358472 | AG358473 |
length | 733 | 720 |
length of high quality (start - end) | 314 (46 - 359) | 286 (81 - 366) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no158_d01.b1 PHD_FILE: MSMg01no158_d01.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:23:41 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no158_d01.g1 PHD_FILE: MSMg01no158_d01.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:23:41 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | plural | no hit data |
---|
sequence | TTATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGG
AATTCCCAGAGTTTCAGTTGTAAAGAAAATGACTGATAAAGTGTCATTCA
TAGTATTAGAAGAACTATCTTGTTGCTGCTTCATAACTGTAAATCTGCTA
CTGCTATAAATCATAATGTAATATCTGATATGCAGGATAGCAGACCCCAA
GAGGATCACTACCCACAGGTTAAGAATCTAGGATTTTCAAGTGTCCACTA
GCTGACAGCAATGCCCACCAAATGACTGTCTCAACTACAGAGAAATGGAT
ACACGCCCGGAGAAGGGAACTGGACAAAGACCCCTATCATAGCTAGTTTC
AGTTGCCAAATTGTTTTTTGTTTGCACCCCCCTGAAAGGGGTAACCTTAA
CTAAAGAACTGCCCCTATCAGATCGGCCAGATGTCATGTCTGTGGAAGAA
ACATTTCTTAATTTCTACTTGGTGCGAGAGGGCTCAGACCACTGTAGCCA
GTGCCCATCTTGCCCACATCTCTCCTGGGCTGTATCCTACAGCTGTCGCA
TTCACCCACCTATAGCAAGCCAGCATATCTTTCCCTCCCTGGTCTTTGTT
TCCCCTCCCTGCCTCTGTGTTCCCCGCCTTGACGCCCTTGCCACAAGCTC
TCCTTTGCATGGTACCACTGTCGACCTCACCCCCCCAAATTACCCCTCTC
CCTTCTTCCTACCCTGTTTTTTTCTGACGCATT
| NTTTCGATGAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCTAATTTATTATTTTTTTAT
TTGCTTTCTTAACTCTTACCTACTTATATATTAATTCATTTTTCATATTC
TTACTTCAAACAACAGCTTGTAGAGTTATTGTCTATGGTTTCATGGAGAT
CTTTGCTTTTAGTCTTTGGGTAAACTAAGGATAAATGTGGGATTTCATCT
AGACTACTTAAAATAGTAAAAACTCTAGTCTTCTTTCTTTCTCTCAGGGA
ACCAAGGCTAGTGACTAACAGTTGGAACCCATGAAACTAATCAATAAGGA
ACATGATGTCTCATAAGTCCTACGCACTCGCTGCAAAGAAACACCTTAAC
ACTGGGCTCAGTGATGCTGCGTAACATAGCCCAGCACTTCTTCCTTGCTC
TTTGTATTTACACTATAAATACTGCTTTATTCACTGAGTGTAAAAGCTAC
CATAAGATCCCTAGAGATGTAAGTAAGCATATTTTTACGAACATCATGTT
TAAATATACACAGGTCATGAATATTTCAATCCTGAATTTATCCTGTTTTT
CAGTAATTCAGGACGTGTGATTGTCCACTGAATCTTTGCACAAGTTTTGT
TCATCTTTCTAACTCCTCTGTTCACTCACTCAAAAAATTAATAGTACCTA
TTTAATGTGTTCAAAAAAGT
|
quality values | Open.Hide. 7 10 6 6 6 8 11 21 39 37 22 22 15 13 10 18 19 23 19 22 25 26 17 20 20 19 19 20 20 20 24 32 39 39 57 50 50 50 50 50 29 29 20 22 22 22 28 28 28 19
36 37 40 48 48 48 42 42 47 47 57 57 51 50 50 47 47 50 57 68 68 68 68 68 68 68 51 48 47 47 47 41 47 47 57 57 42 44 39 37 37 42 39 39 35 35 35 38 36 41
36 50 50 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 52 52 52 57 52 52 52 57 57 57 57 57 57 57 50 50 57 57 57 47 47 52 52
57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 45 45 45 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 43 43 57 57 43 57 57 43 43 35 43 43 57 43 43 57
57 57 57 57 57 57 57 45 45 52 52 57 57 52 52 52 52 52 43 59 41 43 27 33 43 43 57 57 57 59 57 57 52 57 57 57 57 52 52 52 52 52 57 42 42 37 37 27 38 30
20 20 32 38 50 52 52 52 52 52 52 52 59 41 43 27 23 20 38 38 50 57 59 59 54 54 54 57 57 57 57 57 54 54 54 57 57 43 43 43 46 46 47 38 38 39 37 37 43 42
43 43 43 42 42 42 44 44 40 40 36 32 32 15 15 14 14 24 32 44 48 40 37 28 28 25 33 25 25 25 40 40 48 48 48 33 32 32 29 29 36 48 48 57 57 59 59 50 50 47
47 47 32 26 14 14 14 21 30 27 30 15 18 10 11 11 11 16 12 12 12 25 21 19 13 13 13 22 25 27 27 14 12 12 19 16 18 19 12 13 12 10 10 18 21 30 29 28 24 25
25 23 41 41 59 57 57 43 43 22 21 14 20 20 24 37 39 28 28 18 18 11 21 21 18 12 11 11 12 12 12 12 12 12 12 21 28 31 39 39 39 30 28 15 13 13 13 15 15 30
28 18 18 17 30 22 28 22 26 18 18 14 15 21 23 16 10 10 10 17 18 30 19 21 12 14 14 14 12 18 12 12 11 15 15 11 11 11 14 12 24 24 30 28 15 8 8 8 8 8
8 10 19 8 8 8 8 8 8 15 15 22 19 19 17 17 14 13 18 19 15 15 12 13 11 12 16 10 10 10 15 17 17 19 15 10 8 8 8 10 8 10 10 15 10 11 22 12 12 12
12 11 11 12 10 11 8 8 8 13 11 8 8 8 8 10 12 15 11 15 10 8 11 12 15 13 11 10 10 10 11 11 11 10 9 9 9 11 9 11 9 11 12 12 19 21 24 18 14 13
14 10 9 8 9 12 10 12 10 8 8 8 15 15 19 23 16 15 14 17 15 17 10 10 8 8 8 11 18 19 15 8 8 8 8 9 15 18 24 13 13 6 6 8 8 8 8 8 6 6
6 10 12 16 21 17 9 9 9 12 10 6 13 6 6 13 10 12 8 8 8 11 15 10 13 9 15 14 10 9 11 14 18 15 9 9 9 9 9 21 12 10 10 11 10 9 16 12 10 13
19 14 8 8 11 8 9 12 12 12 10 8 8 8 8 8 8 8 10 22 10 10 6 6 6 6 8 8 8 8 9 9 9 | Open.Hide. 0 3 6 6 6 8 8 12 8 8 8 8 8 7 7 9 9 14 19 32 32 35 36 37 43 43 46 43 43 43 37 37 39 37 37 36 33 25 28 28 37 33 32 34 36 36 48 42 42 36
44 43 43 42 42 42 37 37 42 44 44 54 57 59 59 40 40 40 30 33 33 42 44 42 50 50 48 48 48 48 54 48 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57
57 57 57 57 57 59 54 54 50 57 57 50 50 43 43 46 57 59 54 52 52 52 52 52 59 52 54 54 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 57 57 59 50 50 50 57 57 57 57 52 52
52 57 57 57 57 57 52 52 57 57 57 57 57 57 57 52 52 52 57 38 57 57 57 57 59 57 57 59 59 59 57 41 39 43 59 59 59 59 59 57 43 43 43 57 43 57 57 43 43 43
43 52 59 59 52 52 52 59 44 59 38 38 20 23 38 44 41 57 59 59 59 44 44 43 52 43 44 44 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 47 47 47 42 38 46 43 43 35 32 38
38 38 29 43 43 52 52 43 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 57 48 44 43 44 44 29 31 43 43 47 47 59 48 48 48 59 48 48 48 48 42 44 42 57 57 68 57
57 46 54 54 59 59 43 43 43 59 57 44 44 37 37 43 46 43 48 48 57 57 57 54 43 42 37 39 43 43 43 46 57 57 57 46 46 46 59 59 43 43 43 59 43 59 59 59 59 59
43 48 48 57 48 50 41 41 22 22 24 22 23 21 15 12 12 12 21 18 10 8 8 8 8 10 10 12 8 8 8 8 10 17 24 26 33 37 43 44 39 39 39 35 39 39 43 37 43 43
43 43 40 43 43 32 28 29 40 28 43 43 59 43 43 43 43 39 44 42 54 57 48 48 48 47 59 36 36 23 36 37 39 42 42 37 37 42 44 44 48 48 48 54 47 57 47 47 43 44
44 44 44 54 57 57 57 57 57 57 47 47 47 50 50 50 50 51 57 57 48 47 47 50 50 54 59 59 59 59 43 35 35 43 44 57 57 57 57 57 59 59 59 44 44 33 33 38 43 50
52 52 44 44 57 44 44 38 38 52 32 32 32 32 52 57 57 57 57 57 59 57 57 57 59 57 52 52 52 59 59 59 68 68 59 59 47 35 35 43 44 44 57 52 45 45 57 57 57 57
68 68 68 68 68 59 59 57 43 43 43 43 59 59 41 39 43 50 57 68 57 57 59 59 57 52 52 43 50 37 42 43 52 59 59 54 54 54 59 59 50 48 43 43 50 59 59 59 44 43
43 27 44 44 57 44 44 36 36 28 44 44 57 57 48 48 48 57 57 57 57 44 44 37 37 42 39 43 47 59 59 39 37 37 39 59 44 57 48 47 47 47 47 47 47 48 57 57 48 43
40 43 43 54 48 57 57 48 42 42 42 43 40 43 43 41 43 39 39 37 37 28 28 28 37 37 30 30 30 37 30 30 25 30 39 39 39 39 37 37 37 37 37 37 34 28 25 25 41 43
41 41 41 41 39 39 30 30 30 31 22 27 25 27 30 32 29 27 24 22 |