| BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
|---|
| end name | MSMg01-176F01.T7 (MSMg01no176_f01.b1) | MSMg01-176F01.TJ (MSMg01no176_f01.g1) |
|---|
| ACC | AG371047 | AG371048 |
|---|
| length | 1,233 | 1,242 |
|---|
length of high quality
(start - end) | 663 (134 - 796) | 310 (503 - 812) |
|---|
| definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no176_f01.b1 PHD_FILE: MSMg01no176_f01.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:47:55 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no176_f01.g1 PHD_FILE: MSMg01no176_f01.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:47:55 2005 |
|---|
| singlet/doublet | singlet | --- |
|---|
| BLAST hit | unique | no hit data |
|---|
| sequence | CATTCTCCNNNNNNATCATTGGGCGCTATAGACTCCTATAGGGAGAGGAT
CCGCGGAATTCTGAGCCGTGCATGCTTACCTTTTAAACCCCCCAGAATAG
NCTTAGACCAAATTGGAATCTCTTTAACCTGACAGATTGGAGCCTTAGAA
CACATAGTACGGAACTGATGGGCTTTGGTTTTGATTATGAGAAATGGTCA
TGAATTCCAACTTGCCATCTTACCTGCTTTAAGCCTTGTATTATTAAGTT
ATCTTCACATTCGTTTATAGCTATGACCTTATTTTAAAAACAAGGATTTT
CTCATGTAAAAATAAAGTATGTGTATTAGAGAAAATAAAAAGGGACAAAA
TAGAATCTATTTGTGAGGTTCTCATAGTGAGCAACCCATCCACCTATGAT
TTTGTCTTTGGTATCTGCAGTTTAAAAGTTGACACATTTAGGTATATGAT
GCTTAACTTGTGATTTCATTTTCACATTATACTGTAAGTGCTTTTCCAAA
TTCCTGTTTTCTTGTTCAGTTTCATTCCCAAGTTTTCATTTTCAGAATGC
ACACAGATCAAAGCTCCAAAAAGGGTCATTGCTGAGACTGTCAGTATATA
ATGTAATATAATATAATATATACTGACAGTATATAATACAGATGTAGTAC
AAGTTCCCCAATATCCCTAGAGATAACCACAATTTCTGCTTCCTAGAATT
CGAATCACATCACTTGACAATATAGTCCTACTCTATCAGTGAAGGTTTAT
GACTGAAATGTGAGACATCACCATTGTTTGAGGAGCATTGCTCTCACAGA
GTGGGGGCCAGTGACTTCACGGCAAATACATAGGGAGCCCCACTCGTAAC
CCAGAAGGGTTTTTGCGGCTTCAGGCCTCCTCTTCCGTGGCGCTCACCCT
TACTGTGGGTCATTTTTTCAAAACAATTTGTTGTGTGAATAAAACCACCT
TTCCTTGGAGCTTCTGTGCTATCCATGGATAATTTTATTTGGATTTTTAT
TTTTTAGAATTATGCCAAAAAAGTTTTTTCTTTACCTTTCAATTTCCAGT
GGTTAGAAACCTTTTCCTTCCAATTTATAAAATTTTTTTTTTTTCCCCCA
AAAGCGTTTGACTTCAAACTTTCTCACTTTTTTCCCCCCCTCCTTAATAA
CTTTTATTTCTTACAAATTCTTCCTTTTGTAAAAACCTGCTTTTCCAATT
TCTCTTAACACAGGTCTCTTCTTGAAAAAGCAC
| NNNCCCTGCATGGAGNCTGGGGCGCCXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTCACCCGAGGAATACTGAATGGCAGAGAAG
CACCTGAAAAAATGTTCAACATCCTTAATCACCAGGGAAATGTAAATCAA
AACAACCCTGAGATTCCACCTCACACCAGTCACAATGGCTAAGATGAAAA
AATCAGGTGACAGCAGATGCTGGCGAGGATGTGGAGAAAGAGGAACGCTT
CTCCATTGTTGGTGGGATTGCAAGCTTGTACAACCACTCTGGAAATCAGT
CTGGTGATTCCTCAGAAAATTGGACATAGTACTACTGGAGGATCCAGCAA
TACCTCTCCTGGGCATATATCCAGAAGATGTTCCAACCGGTAAGAAGGAG
ACATGCTCCACTATGTTCATAGCAGCCTTATTTATAATAGCCAGAAGCTG
GATTTTTTTCTTCCGCCCCCCAACAGAGGAATGCATACAGAAAAAGAGAT
AATTTACACAATGGAGTACTACTCAGCTATTAAAAAGAATGAATTTATGA
AATTCCTAGGCAAATGGATGGACCTGGAGGGCATCATCCTGAGTGAGGTA
ACCCAATCAAAAAGGAACTCACACAATATGTACTCACTAATAAGTGGATA
TTAGCCCAGAAACTTAGGATACCCAAGATATAAGATACAATTTGCTAAAC
ACATGAAACTCAAGAGAACGAAGACCAAAGTATGGACACTTTGCCCCTTC
TTAGAATAGGAAACAAAACACCCATGGAAGGAGTTACAGAGACAAAATTT
GGAAGTGTGACGAAAGGATGGACCATCTAGTGATTGCCATATCCAGAGAT
CCATCCCACGATCATCTTCCAAACGCTGACCCCATTGCATACACTAGCAA
GATTTTGCTGAAAGGACCCAGATATAGCTGTCTCCTGTGAGACTATGCCA
GGGGCCTACCATACACAGAAGTGGATGCTCACAGTCAGGTATTGAATGGA
TCACGGGGCCCCCCATGGAGGAGCTAGAGAAAGCCCCCCAGGGAACTAAG
GGGACATGCCACCCTATAAGTGGAACACCAATATTAAATTAACCCGGTCC
CCCGGGAGCTTTTGTTCCAAACTGGCAATGGATCCCAAAAATGGCCTATT
TGCCCCCCCCTTGGAAAAAGAGGCCCCTTAAAATTGGGACCTTCCACTCT
TTTTATTCCCCCCTAACCGGGGAAACCCCCGGGCCACAAGGC
|
|---|
| quality values | Open.Hide. 8 8 8 8 8 8 8 3 0 0 0 0 0 0 3 8 6 7 7 6 6 9 10 13 11 8 8 8 6 6 8 15 15 8 8 8 11 13 10 19 19 35 28 28 28 28 30 31 31 29
29 28 21 21 22 22 29 30 34 39 37 37 30 32 32 26 16 10 10 15 22 28 31 27 21 15 10 10 10 10 12 11 14 10 10 12 11 18 18 25 23 16 12 14 22 27 34 23 23 3
0 3 19 19 30 30 33 37 37 36 36 44 44 44 44 39 37 21 21 10 9 9 9 9 15 8 8 8 11 11 13 10 10 10 19 27 39 46 46 46 48 41 34 28 24 24 27 28 44 44
34 43 39 39 33 42 42 42 42 42 43 48 57 57 54 54 57 57 57 57 42 44 35 37 42 44 44 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 59 57 57 43 44
44 57 59 59 59 59 59 43 43 43 48 48 68 57 57 43 43 43 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 59 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 57 57 52 52 52 57 57 57 52 52 52 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 68 68 59 59
57 57 54 52 52 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 68 68 68 59 59 44 43 43 44 44 48 44 57 46 54 54 57 59
59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 59 68 68 68 68 68 68 57 57 59 59 59 57 59 59 59 57 54 54 54 54 54 54 54 59 59 43 48 43 59 43 57 57 59 59 57 53 53 53 53
53 53 59 59 59 59 59 41 36 20 20 11 12 11 12 12 20 12 18 28 41 50 50 59 59 59 59 59 59 59 59 59 48 48 48 48 48 59 59 57 59 57 57 57 68 68 68 68 68 68
68 68 59 59 59 59 43 47 47 43 39 39 46 48 57 57 48 48 59 59 59 59 48 48 48 48 48 57 59 59 59 57 57 47 57 57 57 59 59 47 44 44 48 59 44 44 35 35 35 44
59 59 59 59 57 48 48 59 59 68 68 68 68 68 57 57 57 57 52 57 57 57 52 52 52 59 59 59 59 59 59 59 59 68 59 59 54 57 57 59 59 57 39 39 59 59 59 59 59 59
52 52 52 52 52 52 59 57 52 52 57 45 43 44 43 43 26 35 43 44 59 59 59 47 47 35 39 39 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 44 57 52 52 52 57 59 59 59 59 59 59
59 54 57 57 54 57 57 57 57 54 54 54 59 59 59 57 54 57 57 59 59 59 52 57 43 44 43 50 54 57 57 57 57 54 59 59 54 57 54 57 57 48 57 48 57 59 59 59 42 35
35 42 47 47 48 57 47 47 37 37 47 47 59 47 47 47 31 31 20 34 32 54 48 57 54 48 48 48 48 48 48 59 59 59 59 54 54 54 59 48 48 48 40 43 40 43 47 53 43 47
42 48 43 59 43 43 43 47 34 34 25 25 25 41 34 39 39 30 31 31 44 59 43 39 39 37 37 37 39 43 43 43 43 36 37 30 34 35 35 39 37 32 32 28 28 32 39 44 47 47
41 41 37 37 32 25 28 37 43 47 41 46 39 39 28 25 15 15 10 10 10 12 13 17 30 30 37 37 41 59 47 37 37 33 33 33 33 33 37 25 32 20 20 18 10 10 10 10 17 17
14 14 14 14 27 30 29 19 24 28 28 20 20 11 11 17 17 11 12 11 12 11 9 9 9 9 17 15 10 12 13 13 12 21 17 15 11 8 8 8 8 15 10 15 10 19 15 12 9 9
9 9 9 10 8 10 11 12 9 15 10 10 10 16 22 23 22 21 37 25 25 11 11 11 13 16 10 15 10 10 8 8 9 15 12 8 10 8 9 11 13 17 16 13 10 9 9 10 12 17
28 28 32 32 15 10 9 8 8 8 9 13 10 17 16 15 17 12 9 10 11 10 10 10 13 10 11 10 14 10 10 10 10 10 11 11 10 9 9 10 8 9 9 8 13 16 10 9 9 9
8 11 8 9 10 17 8 11 9 9 9 10 10 7 7 8 8 9 15 9 11 10 15 10 10 10 8 8 8 8 8 9 15 13 8 8 8 10 12 18 15 13 13 13 15 15 22 15 9 9
13 28 23 15 12 9 8 8 8 8 8 8 9 10 12 12 12 9 13 14 16 11 10 9 9 10 14 10 11 10 10 10 10 12 11 10 9 9 9 9 9 10 12 10 14 9 9 10 10 13
11 10 9 9 9 11 9 11 11 10 10 13 15 22 12 8 8 8 8 8 8 8 8 11 14 9 9 10 10 13 10 11 10 19 13 15 10 13 9 9 12 12 11 12 12 13 13 10 12 13
10 10 10 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 7 7 8 8 8 8 8 8 11 17 17 17 15 13 11 19 17 28 9 10 9 7 12 10 10 6 8 8 8 10 8
10 9 9 9 9 10 10 11 6 6 6 8 6 8 8 8 8 8 11 6 6 6 6 10 10 10 6 6 6 8 10 17 10 10 8 8 8 10 8 8 10 17 13 11 10 10 10 10 10 11
12 8 8 10 17 8 8 8 6 6 8 6 7 8 8 10 6 6 8 6 6 6 6 6 8 8 11 10 8 6 6 8 6 | Open.Hide. 0 0 0 3 6 6 6 6 8 8 8 8 9 10 3 0 3 6 6 6 7 8 12 13 9 8 9 8 11 9 17 19 19 8 9 10 22 21 31 30 30 35 36 35 35 36 37 37 37 37
37 42 42 47 53 53 53 53 54 54 54 48 48 48 48 48 40 40 43 43 43 43 46 57 48 54 54 54 57 57 50 50 50 46 50 50 50 50 50 50 42 36 32 28 28 44 43 57 43 43
37 37 37 48 46 50 48 48 57 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 41 41 41 41 47 57 57 57 57 57 57 68 68 68 54 54 54 54 54 54 54 54 48 48 43 43 43
59 59 48 54 48 57 48 57 48 43 43 43 57 57 43 47 47 42 42 38 57 50 50 59 59 59 37 37 37 25 19 9 9 9 12 18 26 30 39 41 41 35 32 32 34 34 37 35 35 43
59 59 57 57 48 48 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 54 54 59 57 57 57 57 57 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 48 48 48 57 57
48 44 44 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 57 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 57 57 68 68 68 68 59 59 57 57
57 59 59 59 54 54 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 68 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 52 59 59 59 59 59 57 57 57 68 57 57 57 57 57 59 59 68 59 59
59 59 59 59 59 59 57 57 57 59 57 54 57 57 68 68 68 68 68 57 59 59 59 57 57 57 57 54 57 57 57 59 57 54 54 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 44 44 26
19 18 18 14 15 15 18 34 30 48 59 59 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 36 29
20 11 11 11 11 11 14 8 6 6 6 7 7 8 8 8 19 27 13 12 11 15 15 34 32 41 39 34 26 24 16 10 10 10 10 10 10 12 12 12 12 25 23 22 11 11 11 11 9 12
12 15 15 24 24 30 32 47 48 59 59 59 57 57 57 57 59 48 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 59 59 59 57 57 57 57 57 57 44 44 32 32 32 44 44 59
59 59 59 43 57 39 39 35 44 44 57 54 54 57 57 57 57 57 57 57 57 54 54 46 57 57 57 57 57 57 48 48 48 57 50 50 48 50 50 50 50 50 57 57 57 57 57 52 52 52
57 52 57 52 57 59 57 54 54 59 59 59 59 68 68 59 59 57 57 54 54 57 59 59 57 57 59 59 57 57 57 52 52 52 57 57 57 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59
59 59 50 43 37 50 50 37 37 44 50 50 57 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 57 48 42 35 35 42 44 44 59 57 57 57 57 57 44 44 23 23 23 32
32 47 47 47 57 57 57 48 46 42 39 35 42 43 39 39 39 48 42 42 43 39 34 29 34 34 34 39 39 39 39 39 47 48 41 41 20 20 20 32 32 43 39 37 37 39 39 39 39 35
24 25 21 24 30 37 37 48 48 39 39 34 28 24 24 35 24 30 23 23 23 34 28 30 32 28 29 32 37 37 37 36 30 30 28 31 20 23 32 34 37 31 31 24 26 36 32 25 26 24
25 22 32 35 35 36 36 28 21 25 13 13 14 24 20 28 19 15 17 20 19 25 29 21 21 18 19 19 17 10 9 9 12 11 11 19 27 14 16 14 14 16 24 17 13 12 12 12 12 20
25 32 32 30 34 25 20 22 18 25 15 19 13 12 10 13 14 16 12 13 9 11 11 11 19 31 19 17 9 8 8 10 13 12 14 21 26 16 14 12 19 14 15 12 23 12 23 11 13 13
27 27 27 24 31 31 35 37 37 19 19 17 17 16 17 39 17 15 13 9 9 9 16 15 13 10 10 10 10 19 16 13 13 8 8 8 8 10 10 12 11 10 14 10 10 10 10 12 10 12
9 12 9 9 11 9 8 8 8 8 7 7 7 8 8 8 9 8 8 6 6 6 6 8 10 18 12 11 11 8 8 9 10 10 15 10 11 10 12 12 8 8 8 8 9 8 10 10 15 15
17 10 10 10 10 11 15 12 11 9 8 8 7 8 12 11 11 12 9 8 8 8 8 8 8 7 6 8 8 8 8 10 15 15 14 16 23 22 18 28 18 18 9 8 8 8 8 8 17 20
24 19 8 6 6 6 8 6 8 8 8 8 10 8 8 8 8 7 8 7 7 7 9 11 10 10 10 13 13 8 8 8 6 6 6 6 6 6 6 6 8 10 12 13 7 6 6 8 12 10
12 10 10 9 8 8 9 9 10 11 8 8 12 8 8 8 9 10 10 10 6 6 6 6 6 8 10 10 8 8 8 8 9 8 8 8 8 13 15 11 8 8 8 8 10 8 9 9 9 9
9 11 11 15 26 26 31 30 20 12 12 10 11 11 15 16 15 15 10 10 8 8 8 11 7 9 7 6 8 8 12 12 10 10 10 12 10 10 8 8 8 8 8 8 8 7 9 9 9 9
15 11 11 9 6 6 6 6 9 11 17 17 8 6 8 6 6 6 7 19 12 14 8 9 9 9 9 14 8 8 8 8 8 8 12 8 8 8 10 11 10 10 |
|---|
