BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-217C16.T7 (MSMg01no217_c16.b1) | MSMg01-217C16.TJ (MSMg01no217_c16.g1) |
ACC | AG396788 | AG396789 |
length | 1,289 | 702 |
length of high quality (start - end) | 425 (28 - 452) | 240 (128 - 367) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no217_c16.b1 PHD_FILE: MSMg01no217_c16.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 20:44:32 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no217_c16.g1 PHD_FILE: MSMg01no217_c16.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 20:44:32 2005 |
singlet/doublet | doublet | doublet |
---|
BLAST hit | unique | unique |
---|
Map location. | (70,343,139 - 70,343,545) | (70,401,421 - 70,401,657) |
---|
sequence | NNTTCCTATGGGCCTATAGACTCCTAAGGGAGAGGATCCGCGGAATTCTA
TATAACATACAACCAGGTCCTGATGTGCTTGGACATTAAGATATTGGGCT
GCTGCCCCCCTCTGTTAACCAGCCCAGGGAAAGGGAACTCTGGAGCCTTT
GATTTTCTGATATCATGACAGGCTGCGTTCCACTTCCCTTCACTGTCCCC
ACCTTTTCTCTGAAGCCTCAGGGCGCCAACTATTCTATAAGCACACTGAC
AAATGTGAGTGGAATTTGGTTTAAAATAATAATAGAAAATAAATTTAGAA
GCACTTAGGGCTCAGCTGCCTCTAGGGATGCATGGAGTTCAGAGTCTATG
CTATCATTTTGTCTTCTTCCAGGCATGCCTTTCTCACCTCAAGTTATTGG
TTAGGAATGTAATGGCTTTATAGTTTATAGAGCATGTTTCAAAGATATAT
TTTTATGTCCCCCCCCCCGTGCAATAATGCTAATCGTTAATAAAATAAGC
AATTGTAGCTAGAGCATATTATAACCATTTCTATCCACTGTAACATTCAA
GGTGGGACCACAAAGATTCTGCATCACAACAGAGTCCAAGCAGCACACTG
CATATAAATGGAGTCTCCTCAGAGAGGGCAAAACAGACAGCACTTATTAT
TTAAGCCTATGTATATTTGCCAGTCTCCATAGATGGCTTTAGAATTTCTC
CTGAGGTGGTTTTCTTTTCTCTAACAAGTGGTTACTAAAACCAGTGAGAA
AGAAAAATATATCTGATAATATGACATCCAACTCCACTTCTGGGAGAAAT
GGAAGGAATGTATTATTTTTGTCCCATTGCTGCTCAACTGGTATAAGCTA
GCCTTTACCTCTAATAATTTATACCCACTTGCATCTGCTTAATACCTACA
ACACCATCACCTGTAAGATAAGGAAGGTCAGTCTAGGATGCTTAAAACAA
CTAAATCCAGCCCTTAATGCTGTACTACATGATAGGGTAAATCTCCCCAA
AACTGCAAATGCGTGTAACTTTCTCCACCCGGATTTTGGGTTCCAAACCC
TTACCCTTGTTCGGTCAAGGCCTTCTCAGTCTCATGACCATAACTAAAGG
GTCCCCTAATCCTCCTAGCTCCCGAAAAACCTATCCCCTTTGAATCCGGA
GGCCTCCAACTCCTTTGTGTCCTGGTTCTCTTATTTGCATTCCTATACCC
ATCACTCCCTCCCCTCCGTTATAATCCCATATTTTATTCCTAATTATTCT
TTCAATTATAACTTCTCTCACCCTATATATCTTCTTACC
| AACGATGAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTCAAAACTGCTTGATCTGAGTTAT
ATCCGGAGTATGTAGTTGTATAATCCCAACTTATGGGTGGTATTTAAGTG
TAGCTATAAAAAGAGCATCAACTGCTGCCTGGAGTAGGTGAGCTCTCAAA
GAGAAGGTCATGTAAACCTGGTAGCAACAGTATCTATGGAGGAAAGGGCT
TTCGAAGCTTGTGCTAGTATAAGGAGGAGAGCCTTTGAAACAAAAAGCTA
TGGTAGTGAGCTTTTTCTAGAGAACAGCATTAACGGTGATGGCTCAAAAT
ACAGACGCTCCCTGTCTCTTTTCACCGCGCCCCCCCCAGCTGAGCGGTGG
GATGAAAGGCGTGTTTCTGTTTCTGCCTTCTCTCCACGGAAGTCTGGAAG
CACGCTGCTGCCTTCAGGCCTGAGACCATCACGGACAAGATAATGATAAT
TTGTATGGCTCAGAGCTCGAATGAAAGATGGAGATGAGAATGAGGATGAG
TCCTTGAAGTAGCTGAAAATCTGCAAATCATGGTATACTTACTAAATAAA
AGGTCCTCCATAGAAGAAGCCTGTTAGAACAGTAGGGTAGAACAAATGCT
GCGTACAGAGTGCAGACAGGTTCTTTTTTCACCAAAAGGAAACTTTGGGT
GG
|
quality values | Open.Hide. 0 0 3 6 6 6 7 8 10 8 9 10 8 8 10 8 9 9 9 14 19 10 8 8 8 8 8 21 21 36 33 34 34 34 34 37 37 40 50 47 57 57 43 43 43 47 68 54 50 42
42 42 42 42 42 42 43 43 43 53 68 68 54 48 42 37 37 43 57 57 57 57 47 41 41 41 50 50 68 68 68 68 68 68 68 57 57 46 44 39 40 46 57 48 43 43 39 36 36 50
50 68 68 68 68 68 68 68 50 50 50 50 50 50 50 50 50 57 43 44 28 28 28 44 43 43 37 50 50 57 57 57 59 54 57 57 57 57 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57
57 57 57 57 59 59 68 59 57 57 57 57 68 68 68 68 57 57 68 68 68 68 68 68 57 57 57 45 45 46 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 52 59 59 59 57 57 57 57 52
57 57 59 59 59 59 68 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 43 43 35 43 42 52 52 57 57 52 52 52 57 50 57 57 57 57 52
52 54 59 57 57 57 57 46 46 44 44 47 57 57 57 48 57 57 59 57 57 57 57 57 48 48 48 48 57 59 59 54 54 54 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 68 57 57 59 59
57 57 59 59 59 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 57 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 57 57 57 57 57 50 59 48 50 50 50 47 47 33 29 19 11 11
11 23 15 20 24 24 37 37 36 43 43 53 57 43 43 39 43 47 47 48 43 59 47 48 59 59 57 48 48 48 48 48 48 48 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 47 30 30 14 11 9
9 10 10 9 9 9 10 10 9 13 11 13 15 31 19 21 14 12 11 11 17 27 34 59 47 48 48 48 48 46 46 46 40 34 28 16 10 10 10 10 10 11 14 14 18 18 14 13 15 21
24 32 30 31 22 22 32 32 44 57 46 48 48 48 48 59 59 59 59 59 48 48 54 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 50 50 50 50 50 50 47 47 44 23
17 8 8 8 13 19 30 39 39 41 41 41 40 43 43 43 43 44 57 59 57 57 57 48 48 43 48 48 43 43 43 43 48 48 57 48 57 54 54 54 54 54 54 54 57 59 57 57 48 48
48 50 50 57 57 57 57 39 39 37 46 46 59 59 59 57 57 57 59 59 47 47 43 47 47 57 47 47 43 46 46 54 54 54 57 57 57 57 48 48 48 48 57 57 57 57 57 59 59 59
59 57 48 48 48 48 57 48 54 57 59 59 57 57 48 54 48 48 48 48 59 48 54 54 57 59 59 59 59 59 39 39 35 42 39 43 43 43 44 48 39 39 32 39 39 39 37 36 36 37
36 26 26 22 26 37 32 34 34 39 39 41 41 44 37 37 43 43 41 41 46 47 39 37 24 20 20 22 25 22 31 39 39 39 41 41 25 25 27 27 24 22 25 22 27 28 33 33 37 37
35 17 15 10 9 9 17 17 24 22 30 30 37 37 37 33 28 30 30 28 34 34 47 43 40 40 40 47 43 39 37 37 30 37 30 33 26 26 19 12 10 11 14 14 14 12 9 13 14 14
11 11 14 19 21 18 18 17 21 19 25 25 29 29 33 33 33 36 36 39 35 35 24 25 16 22 15 24 24 21 14 13 13 10 10 8 8 8 13 9 10 10 8 12 10 9 13 9 17 13
16 8 8 8 8 15 8 7 8 8 8 8 8 8 8 8 8 15 30 22 12 12 10 10 10 16 10 10 13 15 11 10 8 8 8 16 13 14 19 14 19 18 23 21 25 13 11 11 13 11
12 10 10 8 8 8 13 12 12 12 22 14 13 9 9 9 9 10 12 15 14 11 10 10 10 8 6 8 6 6 8 6 8 10 17 13 10 10 10 11 19 14 11 11 10 15 10 9 8 8
6 6 8 6 9 9 12 9 9 10 8 19 10 10 8 8 8 10 10 10 12 10 6 6 8 8 6 6 8 8 19 15 6 6 6 7 12 13 10 8 8 8 8 10 11 13 15 10 10 10
10 8 8 8 12 8 8 6 6 6 6 8 8 8 9 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 6 8 10 8 10 10 10 10 11 11 11 11 13 10 13 8 8 6 6 7 6 10 8 8
8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 6 6 6 8 6 7 10 9 9 12 7 7 8 8 8 9 9 10 15 10 9 9 8 8 8 10 8 10 10 8 10 8 9 9 9 10 12 11 10
8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 11 6 6 8 8 9 9 9 11 9 8 8 8 8 8 10 12 12 11 11 11 11 11 13 18 13 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 8 8 8 8
8 8 8 8 10 8 8 10 7 7 9 13 10 9 11 9 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 10 8 8 9 9 11 11 11 8 8 8 8 6 6 8 8 10 10 10 8 7 7 8 8
8 8 8 8 6 6 10 8 8 8 8 8 8 9 9 9 9 9 9 9 9 9 10 18 12 15 10 10 10 10 10 9 11 8 8 12 12 11 11 14 6 6 6 6 6 7 8 8 8 8
11 11 8 8 8 8 8 6 6 6 8 8 8 10 10 9 8 10 8 8 8 8 10 11 8 8 6 6 8 8 10 10 10 10 8 8 8 8 8 | Open.Hide. 6 6 6 6 7 11 10 10 9 8 7 7 6 6 8 19 19 47 41 50 50 50 50 53 48 48 48 48 48 48 43 43 48 48 48 57 43 43 42 34 34 34 42 36 57 57 57 57 54 54
54 54 54 50 48 48 48 48 57 57 57 33 33 30 28 35 33 41 36 40 30 48 41 41 43 43 50 50 50 50 68 57 54 54 54 54 59 53 68 68 53 53 53 57 57 57 57 57 57 53
53 53 57 57 53 53 53 53 53 50 50 50 50 47 31 22 10 13 10 10 11 8 9 9 9 9 14 15 20 32 34 40 40 41 48 48 48 48 48 50 53 53 53 53 53 59 57 53 53 53
53 53 53 53 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
57 59 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 59 59 44 36 23 28 23 25 23 28 23 30 43 59 59 59 59 59 59 57 50 50 50 50 53 57 59 59 59 59 48 48 57 57
57 57 59 59 59 59 59 59 59 41 25 25 8 10 8 8 8 10 12 33 27 25 15 10 8 6 8 8 8 8 12 15 15 12 12 12 11 11 11 21 29 31 46 46 47 48 48 48 48 48
48 48 48 48 57 57 57 57 48 48 48 57 59 59 59 59 59 59 57 57 41 41 20 20 20 32 30 29 28 28 28 28 25 17 17 12 16 12 13 18 34 44 57 59 59 59 59 59 59 48
48 48 48 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 43 37 41 41 32 32 14 15 15 32 38 57 59 59 59 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57
57 57 48 48 48 57 57 48 40 28 28 14 14 21 34 44 59 47 47 48 48 59 59 54 59 46 46 43 48 43 46 46 42 42 40 40 28 28 28 40 40 42 39 40 39 39 39 39 30 35
35 43 43 57 46 43 37 32 28 32 28 35 39 43 44 41 32 37 37 37 37 37 37 37 30 30 32 37 34 34 28 22 22 34 34 47 39 40 41 41 41 39 47 39 41 41 39 39 31 26
8 9 6 6 6 15 18 27 24 23 22 20 20 23 32 33 22 20 18 14 14 18 31 32 34 38 36 28 28 33 37 30 30 28 24 16 20 15 17 15 20 20 28 36 35 43 39 26 26 18
15 14 16 16 9 9 9 23 23 41 47 34 28 25 25 25 28 28 31 31 22 22 22 19 22 29 32 21 24 14 14 14 22 22 36 37 35 31 31 37 37 37 37 37 37 34 28 23 16 16
15 15 |