BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-305N05.T7 (MSMg01no305_n05.b1) | MSMg01-305N05.TJ (MSMg01no305_n05.g1) |
ACC | AG430670 | AG430671 |
length | 1,322 | 1,303 |
length of high quality (start - end) | 365 (30 - 394) | 384 (73 - 456) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no305_n05.b1 PHD_FILE: MSMg01no305_n05.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:46:14 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no305_n05.g1 PHD_FILE: MSMg01no305_n05.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:46:14 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | NNGGCCCGCATGGGCGCTAAGACTCCTAAGGGAGAGGATCCGCGGAATTC
CTGTTCATGCCTCTGGAAACAATGACCTGGCTGTTTTTCCACCATAGCAG
CCAGTCAACATGTCTAAGGCAGAGGAGAGTTAGGTAACACTAGCTATAGC
AGTGATCATCACCCCAGGCAGGGCAGTGGCGGGGAATAGTGGAAAGCCCT
TTCTGAGTTAACCCGGACAGCATGACTTCCTTCTGGCTTCCACTTAGTAA
AAACTAGTTGTGGAACTGCTATAGAAAGACCAGCAACGCTGGGCATGGTG
GCGCATGCCTTTAATCTGAGCACTCAGGAGGCAGAAGCAGAGGCAGGCGG
ATTTCTGAGTTCAAGGCCAGCCTGGTCTACGAAGTGAGTTCCAGGACTTT
TTGGACTATACAGAGAAACCCTGTCTCGAAAAAAAAGAAAAAAAAAAATT
TTTTTTTTCCCCCCCCCCAGNGGANAGAATGTCCCCTTAAAAAAAGGGGG
GGGGCNAACCCCATCTACACGGAAAATCACCAAAGCAACAAGTCAGGTGC
TCTCAGGGTGGGGTTTCAGACGCCTCTGTGATGTCGAGCCAGACACCGCA
AACATGTCCACTGACTCACGACTGACTCATTCATGGTGACAAGGGGGAAA
TGAACCAAAAACCTACAGAGTCAGCAGCATAAGGCAGGTGTTTTGGAATT
TCTCATCATATACATGAGCTGCAGACATCATGTCAGACAAAGAAACAGCA
ACCCAGGGCAGACGGGGGAGTTCCCACCAGGATACCCTGCTCCTGGGGGC
CTCAGATTTCCTTCTTCATTTAGACAGCAAATGGGTGAGGGTCCCTCCTA
AGAAGTTTTGCATCCCATGTTGATAAGGTCTGAACATTCTAATTTTTACT
TTCGGGAAAATGCAAAAGGGCCCAGTGCTGAAGAAAGAATTTTTGGCCCC
CAGTTCTAGGGGTGACTCCGGTTAGGTCATGAAAATGGAACCCAATTTTT
TGCTTCCAAAACTTGGATGGAAGATTTCCTCCCCCCCCTTTTATTAATAA
TAGTATTAATTACTTGAATAAATAGGTTCGATGATGATCCTCAAGGTTAA
AAATGAATTTTTAAAAACCAAAATTTTTCCTTAGTTGTTCTAAAAATCTA
AGTTTCATTCTCCACACTGGAGGGCAATAATCTTTTTTTAAAACACTTGG
ACCCTGTTGTCTATAACCTTAATTTACATATAACTAAAAAACTTCTGGGT
CCTTCTTAAGTAACCAATAGGAAATCTGTCCTCTATGCTGGGAATTTTCT
ACTAATTCTCTCCCATATTGGG
| NNGGAGGTGAGCGTGAGCTGGGGCGCCXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTAGACCAGCCTGGGCCATATGCAGAGAC
TCGATTGAAATGAAAATTTCTGGTTCATGTGGGAACTCAGTTATGTCATA
TGATGTTTTTTGGAACAGGCAAGAGAAAGGATATTGAAGAGACACATGGA
AGAATATTTTGCTGAAGCAGACACATGAAAGGACATATGATTCTTACAAA
GAGCATAAATGACCCCCAGACAATGTGAGGAAGCTATCACATTGGTTTAC
TTTGTTCCACTGAGGACGCTCGTATATTGGTCCGTCTTGCATTGAGTTGC
TGATCTTTTCCTGTCTTCACTTAGTAGAGAGTAACTCACCAACGAACTTT
TTGTTTTATTCCAGTGGCTTCTTGCTGTATCCAAAGACTTGGGCAGATTG
GTGTTTTTTTTTCCCCCCCCCCGGATGAAANTGCCACTGAAAAATAAAGA
GGGGGGGTTGCCAAATGGACTGGACTGCTGCTGCTGATTCGTGTTGGTGT
TTTGCTAGAGAACTGGACTGCTGTCACTGAAGATTGGAATGGCCCCAATG
AACTATTACTAATCAGGTCCACAACCCTTATTTCCTATTAATTTTTCTTT
TTCCACTTCCTCTGATGGGTGGTGGACTAGAAGGGAGTTTGAAGGATTTA
AGAAACCTAATTAAAGTAGGTTTTGAAAAATCTAAGCCTACATTCCATCC
ATAAAAACCCCAAAGAAAAGCAAGTAGGTGCATACCAGAGAGAAAATCAA
GAGCAGTCTTGCTTTGCACACCCATTCTCCTGACAAACCTGCACCTGCTA
GTGTGAGCACTCACTATGGCCACAATTAACCTACCCCAGGGTGAGAAAGA
CCTTAATCCCTCTTAGCGACCCTACCGTTTTCTGAAACACCCACCTTCAA
CTCTGCTGCCTGCTTTCGAGGACAAGTCCTATTCCGGGGTGGGACTTCAT
TAAGCTCTCTTTTATAAAAAATTGTGGAAATGTCCGCCTGCCTATTGCCA
AAAAGGCCCAAAAAGGAATTGGGATCCCTTACTCTGGGGGTGCTGGGGCT
TGGGACCCCCAGTGGGGTGTCGGAAACACAGCCTGGTTTCTCACAAACTC
TCAAGTTTTAGAAATCATTTCCTTCCCCTTTCGATTTCAAATAAAAAAAG
CAATCTGTTTTACAAAACATTTTATATTTATACCCTGGATAGGCGAAAGA
CCCCCCCCTCCGGGGAAAAAACTGTTTGCCCTCCTGAGATTGTTATTTCT
TTC
|
quality values | Open.Hide. 0 0 3 6 6 6 6 6 6 6 7 10 8 12 15 13 10 8 8 8 8 15 19 15 8 8 8 8 8 22 22 28 30 30 30 30 33 33 37 37 37 37 37 37 37 32 32 37 44 41
33 33 33 20 22 20 20 20 24 33 39 39 47 43 43 43 32 24 10 10 10 10 11 32 30 39 39 42 35 32 29 36 28 34 20 23 13 14 15 10 15 19 25 25 25 25 25 25 30 25
30 26 42 26 12 10 10 11 16 25 38 42 41 32 41 41 37 39 44 42 33 35 42 42 43 43 42 42 37 37 37 43 43 43 43 43 32 24 28 28 43 32 35 35 41 50 50 52 52 43
50 50 52 57 57 38 38 20 20 21 38 43 33 38 27 43 38 52 52 57 52 57 43 57 35 35 35 32 43 35 41 31 31 27 41 38 38 27 38 38 31 33 33 43 43 57 44 44 42 39
43 57 57 57 52 45 45 39 43 35 35 35 57 57 57 57 57 57 57 52 45 45 45 62 57 57 57 57 59 59 52 52 43 38 38 20 20 20 38 38 57 57 57 57 57 46 45 39 36 34
33 39 39 43 43 33 28 22 24 18 18 18 38 28 35 35 47 44 52 52 43 43 32 32 32 44 44 43 42 42 42 43 38 38 33 29 29 38 44 38 43 28 27 27 31 43 43 35 43 35
43 43 43 44 59 59 57 57 57 35 35 19 15 15 24 32 44 44 57 57 44 32 27 28 17 17 16 21 26 33 30 31 33 28 28 20 19 19 26 19 25 32 36 32 41 41 37 37 28 36
28 39 39 47 47 41 36 33 42 29 29 20 20 20 28 41 41 41 33 30 30 30 32 32 20 20 20 41 32 17 17 17 24 29 39 44 43 48 34 34 30 28 19 23 12 11 10 10 10 10
10 11 11 11 22 23 37 40 47 47 48 48 39 39 39 39 36 43 43 44 39 43 43 43 43 43 43 59 48 48 43 59 23 21 12 11 11 13 33 33 59 59 59 36 27 18 11 11 11 17
17 24 29 31 29 32 28 25 19 24 26 21 19 9 8 8 9 9 9 3 0 3 29 3 0 3 12 18 16 10 10 10 8 8 8 8 9 9 9 12 12 17 16 14 14 14 16 9 9 8
8 8 19 21 3 0 3 29 27 59 59 59 59 47 59 39 39 35 39 39 34 41 30 30 30 37 40 43 43 37 47 47 47 43 43 43 43 43 39 40 30 22 22 17 14 14 30 30 35 39
39 46 43 43 30 30 17 17 17 34 34 57 48 42 42 42 35 35 42 42 44 44 48 48 48 44 44 39 39 36 37 37 36 36 28 28 30 42 37 35 28 27 21 14 15 17 30 29 25 25
25 44 23 22 22 20 20 23 32 37 46 39 39 39 29 29 28 40 40 39 32 35 35 43 40 43 43 40 40 39 36 33 25 25 34 34 36 33 37 34 34 39 37 37 37 31 29 29 29 32
37 32 29 19 21 15 26 19 13 19 18 22 26 21 19 13 18 19 34 34 18 12 12 19 21 20 22 22 24 28 33 28 29 22 22 15 15 11 10 8 13 9 11 16 13 17 17 17 19 22
23 31 31 30 30 30 23 23 23 32 29 37 37 37 39 43 35 35 35 39 37 33 30 28 28 37 28 28 13 13 13 25 25 28 24 19 19 19 19 30 30 23 16 11 13 10 10 17 16 16
16 17 21 23 22 21 26 22 14 14 12 15 11 9 9 14 18 10 10 11 10 10 10 11 17 16 19 22 23 19 18 17 21 19 15 15 19 19 20 32 22 22 18 18 15 16 16 11 10 10
8 10 9 19 13 8 8 8 8 8 11 10 10 8 8 8 8 10 9 8 10 7 7 7 8 10 13 10 10 9 9 14 11 14 13 12 13 18 14 14 10 13 9 8 8 8 8 8 8 8
10 8 8 8 14 14 9 11 13 17 12 11 9 12 11 13 11 11 10 15 10 13 9 8 8 9 6 9 10 10 12 12 10 12 20 18 22 22 19 15 18 18 19 14 10 10 8 8 8 8
8 8 8 8 10 13 9 9 10 10 8 8 8 8 8 8 8 10 10 21 14 13 9 9 9 10 10 11 10 10 9 9 9 11 16 13 8 8 7 8 8 12 10 11 11 14 17 24 17 8
8 8 8 8 9 10 13 13 15 14 14 11 11 8 8 8 8 8 8 9 9 10 10 10 13 11 10 12 8 8 6 9 9 9 9 9 9 9 9 13 9 10 8 8 8 15 19 19 14 10
10 8 6 6 6 6 6 8 10 11 9 9 9 11 7 6 6 6 6 6 10 6 6 6 6 6 6 6 7 7 10 13 16 22 22 19 19 15 14 11 12 11 9 9 12 15 15 10 10 8
8 8 10 10 8 9 12 15 12 12 16 12 10 9 10 10 10 10 25 15 12 12 11 8 6 6 6 6 6 8 10 10 10 10 8 8 10 8 11 8 8 8 8 8 8 8 9 12 11 13
14 8 7 8 8 8 11 12 12 15 14 15 10 10 6 7 10 8 8 8 11 12 10 13 11 14 9 9 10 10 8 6 8 8 8 8 10 13 10 9 10 13 21 18 17 9 10 10 10 10
12 12 9 8 6 6 6 6 8 8 9 9 6 8 6 6 8 6 6 8 8 7 8 9 9 8 8 8 10 8 8 10 11 12 17 20 13 13 10 10 8 15 10 14 14 11 11 10 15 12
13 10 8 8 10 8 8 6 7 9 9 9 9 9 9 10 14 16 10 10 8 10 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 13 11 10 9 9 6 8 6 6 8 8 10 6
8 8 6 8 10 10 11 13 9 7 6 8 8 8 8 10 10 10 8 8 8 8 11 9 9 12 10 11 10 8 8 8 6 6 8 10 10 8 8 8 6 8 8 8 8 6 7 6 6 6
6 8 8 10 10 12 10 9 9 9 12 12 11 15 10 10 8 8 8 8 8 8 | Open.Hide. 0 0 3 6 6 6 9 9 9 6 6 6 6 6 6 8 10 8 6 6 6 6 9 10 13 9 8 9 8 15 15 19 23 22 22 10 13 13 30 27 36 30 35 28 39 34 36 37 37 37
37 37 37 42 42 48 57 48 57 57 57 68 68 57 57 48 44 40 36 33 43 36 40 31 31 19 25 25 27 29 32 39 39 39 44 57 43 37 32 24 14 12 8 8 8 10 17 29 37 37
37 35 35 39 42 42 57 44 44 32 36 36 35 32 43 43 50 57 50 50 50 46 50 36 36 35 35 35 37 38 32 28 28 24 43 32 43 32 32 28 35 28 36 43 37 43 43 42 35 37
37 50 50 43 38 38 38 43 43 43 44 57 57 57 57 52 52 52 52 57 57 43 43 31 33 33 43 43 52 52 43 52 45 52 52 43 43 44 35 35 43 43 43 43 35 39 39 39 38 38
27 20 20 35 43 43 43 62 43 43 39 62 44 44 43 26 26 26 43 43 52 43 62 39 39 39 62 62 62 62 57 43 43 35 35 43 43 43 39 39 39 43 43 52 43 43 26 26 27 43
44 57 39 39 39 42 33 33 33 43 44 43 52 52 57 44 57 52 52 38 38 19 23 28 38 38 38 57 43 52 52 52 52 52 52 52 52 52 57 57 57 52 52 52 52 52 52 52 52 57
57 57 57 52 57 52 52 43 50 57 57 57 43 43 31 42 35 43 43 57 50 43 43 43 48 47 42 44 35 35 35 42 47 43 43 43 43 43 43 43 43 43 46 57 57 57 57 57 48 57
47 47 47 48 48 57 59 59 59 57 42 42 31 36 28 32 41 41 24 30 30 32 30 43 43 43 43 43 34 34 30 30 30 39 39 47 47 47 48 47 43 39 39 43 59 46 46 46 47 27
23 10 8 8 8 8 10 11 12 30 30 47 47 40 39 39 43 43 43 59 43 43 43 47 39 48 48 48 48 43 59 39 39 36 43 43 48 48 48 48 48 57 48 53 59 59 59 59 41 30
17 8 8 8 8 9 11 14 14 15 13 14 11 13 14 27 19 19 19 17 14 11 12 20 20 12 12 12 27 3 0 3 25 22 11 11 11 17 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9
10 16 16 13 19 22 34 34 43 59 59 59 59 59 59 59 59 37 37 37 37 35 59 47 48 48 48 57 57 57 57 43 37 41 28 28 28 28 28 43 43 43 43 43 44 41 30 30 44 44
37 47 47 54 47 44 36 28 28 25 30 36 42 57 46 43 43 43 47 43 42 42 40 40 43 57 57 57 57 57 47 47 47 57 57 57 44 37 37 37 43 43 43 43 46 46 57 54 42 47
35 35 35 43 42 48 54 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 35 35 36 43 43 57 57 59 59 59 57 53 53 50 50 47 59 47 47 47 41 37 32 32 37 37 41 59 59 59 59 59 44
44 39 39 35 39 47 59 59 59 59 59 59 48 41 40 40 39 37 39 39 31 31 32 24 25 23 26 25 14 14 16 27 24 29 29 35 39 34 41 39 39 35 39 33 33 33 33 33 30 37
37 25 19 14 15 20 28 26 23 23 26 26 19 16 19 18 25 22 37 37 37 37 48 48 48 48 41 40 40 39 39 41 39 32 28 39 26 27 30 29 15 13 11 18 18 16 21 28 39 35
36 39 39 39 19 15 16 16 17 14 10 13 14 15 11 11 11 11 14 14 14 10 10 10 13 10 11 11 19 22 14 15 11 17 13 10 8 12 19 28 30 30 19 23 11 11 13 17 17 18
20 24 24 22 13 10 8 8 8 8 8 13 19 22 18 12 11 11 14 16 16 16 16 18 15 15 17 35 23 25 16 16 11 13 11 21 24 18 19 21 22 9 8 8 8 10 15 10 13 11
16 16 24 28 28 19 19 17 17 19 23 16 14 14 19 19 28 16 14 14 11 11 11 13 13 19 11 12 10 10 9 10 17 15 13 12 10 8 8 8 8 8 8 10 9 9 9 8 10 8
8 8 8 8 9 11 12 28 26 19 18 18 12 12 9 10 8 10 10 14 12 9 14 14 8 9 8 9 7 8 8 11 8 8 8 8 10 12 12 12 11 10 14 12 11 10 9 10 10 15
15 11 12 12 11 9 9 9 9 9 12 10 10 11 12 10 7 7 7 7 7 8 8 6 7 6 8 7 11 10 11 15 14 11 11 11 8 8 8 8 8 10 10 10 10 15 19 8 8 8
8 8 8 9 9 10 10 8 10 8 16 10 10 6 6 6 8 8 9 9 13 10 10 8 8 8 8 8 10 10 10 9 8 8 8 8 8 8 17 10 8 8 8 8 8 8 10 11 10 11
11 11 10 10 8 8 11 10 13 15 17 16 18 13 11 11 11 12 8 8 9 8 8 8 8 8 9 8 8 8 8 8 8 9 9 11 11 16 16 20 14 13 13 13 10 8 8 8 10 10
10 9 9 10 10 10 8 8 11 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 11 12 18 13 12 11 10 10 10 10 10 10 9 9 10 10 11 13 12 10 8 8 10 10 10 10 8 8 8
8 9 9 10 10 10 8 8 8 6 6 6 11 12 12 11 10 10 17 11 20 15 15 12 10 9 11 11 10 11 8 9 9 9 8 8 8 8 8 8 10 12 15 14 19 23 14 8 8 8
8 8 12 10 10 8 8 8 10 8 10 10 12 12 18 7 8 6 6 6 8 8 6 6 8 8 8 10 9 11 11 11 22 16 17 13 13 10 8 8 8 11 8 9 9 6 7 6 9 10
10 13 11 22 13 12 10 9 9 7 8 8 8 8 8 13 13 29 21 19 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 6 9 10 10 13 8 8 8 8 11 6 6 6 8 6 10 10 6 6 6
8 11 8 |