| BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
|---|
| end name | MSMg01-313C19.T7 (MSMg01no313_c19.b1) | MSMg01-313C19.TJ (MSMg01no313_c19.g1) |
|---|
| ACC | AG435179 | AG435180 |
|---|
| length | 1,244 | 1,228 |
|---|
length of high quality
(start - end) | 412 (45 - 456) | 294 (84 - 377) |
|---|
| definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no313_c19.b1 PHD_FILE: MSMg01no313_c19.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:54:34 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no313_c19.g1 PHD_FILE: MSMg01no313_c19.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:54:34 2005 |
|---|
| singlet/doublet | singlet | --- |
|---|
| BLAST hit | unique | no hit data |
|---|
| sequence | NNGGATCATATGCXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGGA
ATTCATATATAAATATTCAGCATAGTTGTGGGTGGTGAGTTTCAGTATTA
TATAAAAGGTCTTTTAATTAGATGCACCATTATGGACACATTTGGAAGTG
ATTTCTGTAGTGTTGAAAATCTAAAATGGAAACTAAAATACCTAGGTAAG
TAAGGCTGGAAGAATCTTCTAAGCCCCAGTCCTTTACTGGTAGTTTGAGG
ATGGGAATACTTGAGGTTCTCTTTGTGTTTGTTCTTAAGATGTTAGAATG
AGTAAGCAATAAATCATATTACTATTTTTATTAGTATTGTATATATTTAT
ATCACTTCCAAGCTCTTTAAAAAATATAGGATATACAAAGTCTGATAAAT
AAGCTGTGTATATTTTCAGTTACAGATACTATAGACTGAAAAAATGTGTT
TTGAATTCTAAAACACCATTAATTGGTAATCTTACTTTTTATTTAGATCA
GAGAGTTATTGCCCTTTTTTCTCAGGGCTTAAAGTCAAAGTCAAAATGGC
CAAGTTCCTAGCTGAAGTTCCTATTACAGAATATATATATATATATATAC
ATATATACATATGTTTTTAATTTTCTTTCTTCTTTGTGGNTGTCAGACAC
AAGCACCTGCTTTCGTGGCAATTTCAGACTTAAGGTCATTCTTGATTTTG
AAGGGATGCCACATTTCTTGCCTCTGATTTTTGCAACCGAAATCTTCATC
AGCTTATCCAGCATTACCTTTTCTTTTTGTATTTACCATCTTAATTTGCT
TTTGTTGTTAATGCCCTCCTTTCTCCCCATCTTCCTGAATCCGTGTACAC
TTCCCTCCTTCCCTTCGATCTCCTTACCTTTCCCATTTCTCTTTCTTTTT
TTCCCTCCCCTCTCAATCTGCTTTTCCTTTTCCATCCTTTTTTTTTTCCC
CATTTCTCCCTTCACTTCCATCTTCTCTCACCCTCTTTCTTCTTCTTCTT
TTATCACATACTTTCACTTTCAACTCAAATTTATCTCTTATCTTTTCTTT
TATCTTCTTCCTATCCTTACTCTTTTACCTACCCCATCTTTCATATCACA
CCTCTTCTCTCCACTCCTTTATTCAATCTCTTTATTTCATCACAACTTCC
TTCTCCCTCTTTCCTTAATCTATTTCTTCTTTCTTCTCTCTCTTTCTTAT
ATCTATTTCCTTCCTACTTACTTCTACTCTTTCATTCTCTATAT
| NNAATTTTNNNNNAAACTGATAGGNAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTTTGTTTAGCTTTGTAC
CCCATAGGGTTATTTGATTTTCTGGAGTCCATCTTCTTGAGTTCCTCATA
TATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA
TATATATTGGATATTAGNCCCCTATCTGATTTAGGATTGGTAAAGATCCT
TTCCCAATCTGTTGGTGGCCTTTTTGTCTTATTGACAGTGTCTTTTGCCA
AAAAGAATCTTTGCAATTTTATGAGGTCCTATTTGTCGATTCTTGACCTT
ATAGCACAAGCCATTGCTGTTCTGTTCAAGAATTTTTTACATGTGTACAT
ATCTTTTTTTTTTTTCCCCACCTTCTCCTCTATAAGTTTCAGTGTCTCGG
GNNNNATGTTTTTTTTTCTCCCCCCCCCCAAANNNGANNNNCCCCCAAAA
AAAAAGGGGGGGGNNNNNNNNNNNNNNCNNNNNNNNNCNNCCNNNNNNCC
NNCNCCNNNNNNNNNNNNNCCNNNCNCCNCCCCCCNNCNNNNNNNNCCCC
CNNNNCCNNNNNCNNNNNCCCCCCNCCNNNNCNCCCCCNNCCCCNCNCCN
CCCNCCCNNCCCCCNNNCCCNCCNNCCCCNCCCCNCNNNNCCCCCNCCNN
CCNNNCNNCCNNCCNCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCNNCNNCCNCCCCCN
NNCNCCCCNCCCCCCCCCCCCCCCCNNCNNCCCNNNNNNCNNNCNNNNCC
CCNNNNNNNCCCNNNCNCNCCNNCCCCCCCCCCCCNNCCCNNCCCCCCNC
CCCNNCNNCCCCCCCCCCCNNNCCCCCCCCCCCCCNNNNCNCCCCCCNCC
CCCCCCNNCCCCCNNCNNCCCCNNCCCCCNCCCCCCCCCCCCCCCCNCCC
CCNNNNCCCCNCCCCNCCCCCCCCCCCCCCCNCCCNNCCCCCCCCCCNCC
CCCCCNCNCCCCCCCCCCCNCCCCCCCCCCCCCNCCCCCCCCCNCNCCCC
CCNNCCCCCCCCCCCCCCCCCCNCCCCCCCCNNNNCNCCCNCCNCNCCCC
CCCNCCCCCCCCCCCCCCNCCCCCCNNNCCNNNNCCNCCCCCCCCNNCCC
CCNCNCNCCNCCCCNNCCCCCCCCCCCNCCCCCCNNCCCCCNCCCCCCCC
NCCCCCCCCNNNNCCCCCCCCCCCCCCC
|
|---|
| quality values | Open.Hide. 0 0 3 6 6 6 6 6 6 6 8 8 8 3 0 3 11 8 8 8 10 10 8 8 10 14 16 21 13 12 8 8 8 17 21 30 24 28 28 32 37 42 42 42 50 48 57 57 47 51
51 42 51 42 47 47 50 50 51 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 50 48 48 48 50 51 51 51 51 68 68 68 68 68 51 51 51 50 50 50 50 50 50 50 50 50 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 43 57 50 50 57 68 50 50 50 50 50 50 34 27 18 11 11 11 24 24 43 38 43 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 68 68 68 57 57 41 34 24 34 19 24 43 44 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 44 44 24
24 17 17 17 27 41 44 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 30
29 18 15 12 12 12 12 12 12 12 12 10 10 10 10 10 11 13 15 25 21 32 41 59 59 59 57 57 57 57 57 48 59 48 48 47 59 47 32 30 15 14 12 12 9 9 9 16 16 28
28 33 32 41 37 50 59 59 59 59 59 59 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59
59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 57 53 50 50 50 48 57 59 59 59 59 59 59 59 59 50 41 41 41 23 27 3 0 3 27 25 34 34 25 25 28 31 28
25 25 30 30 37 37 40 40 40 40 40 41 41 39 39 30 21 14 11 11 20 25 33 33 33 28 36 43 43 43 43 37 37 37 27 27 22 33 27 31 34 34 28 28 28 37 32 37 44 48
43 37 37 28 28 28 27 27 30 23 24 14 10 8 19 15 20 16 19 30 15 13 14 14 14 14 21 21 24 34 21 23 10 10 10 13 15 22 30 30 29 15 17 18 12 8 8 8 8 11
8 8 8 8 13 10 12 12 13 16 14 24 21 20 15 8 8 8 8 21 10 10 10 10 10 10 11 28 29 19 16 8 6 8 8 8 8 8 8 9 9 8 6 6 6 10 10 11 11 12
25 19 21 18 21 21 19 19 10 10 10 13 9 8 8 8 10 8 9 9 8 8 10 10 10 8 14 15 28 20 13 8 8 10 13 15 13 13 8 7 8 8 8 10 10 8 8 8 8 8
13 10 10 8 8 9 9 8 10 13 10 9 9 9 8 8 6 6 8 8 10 10 9 8 8 6 6 8 8 10 10 10 8 8 11 8 10 8 7 6 8 8 8 10 8 8 8 9 9 8
8 8 8 8 13 10 8 8 8 6 7 13 17 13 8 8 8 12 8 8 8 13 15 15 9 9 9 9 10 10 10 10 13 19 8 8 7 8 8 8 9 9 10 10 10 9 9 9 11 16
11 13 10 10 9 10 9 6 6 6 6 8 8 9 10 11 11 9 9 9 9 10 9 9 21 29 9 9 9 9 11 15 15 13 13 10 10 15 8 8 8 8 10 8 8 9 11 11 9 8
8 6 6 8 6 8 8 10 10 13 8 8 8 13 8 8 8 13 8 8 7 7 8 7 9 9 8 8 7 7 14 8 9 11 13 14 8 8 8 8 8 8 6 8 8 8 8 13 15 13
8 8 8 8 8 8 9 10 15 10 13 10 10 9 9 8 8 8 8 8 8 9 9 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 9 8 8 6 6 8 10 11 11 10 10 10
12 10 8 8 8 9 10 10 10 10 9 9 9 11 8 10 8 8 10 10 10 8 8 8 9 10 10 11 8 8 8 8 8 8 9 13 13 9 6 6 6 6 8 8 8 6 6 8 10 10
10 10 7 7 8 8 9 12 9 9 10 9 9 8 8 6 6 8 8 7 6 8 8 12 18 17 8 8 8 8 8 9 11 9 9 9 9 9 9 15 17 8 8 8 8 8 8 11 8 8
6 6 8 8 8 10 10 10 10 12 12 10 10 10 9 15 15 9 9 11 15 8 8 8 8 8 10 8 11 8 13 11 9 7 8 8 8 8 8 11 9 9 9 9 | Open.Hide. 0 0 3 6 8 11 8 3 0 0 0 0 0 3 6 6 9 9 6 6 6 6 6 3 0 3 3 0 3 6 6 6 7 8 9 10 11 8 6 9 8 9 10 18 19 19 8 9 9 22
19 29 20 23 20 24 24 28 28 36 42 37 40 40 42 37 34 37 37 48 50 54 54 54 68 68 68 68 68 68 53 51 50 41 41 41 41 41 32 36 41 48 48 48 48 48 48 48 48 48
57 57 57 57 57 57 48 42 36 28 35 38 57 57 57 57 57 68 68 50 50 50 50 50 50 50 50 51 51 51 48 50 50 42 42 30 30 28 36 36 42 43 43 42 47 47 47 47 47 47
50 50 51 51 51 51 68 68 68 68 68 68 68 68 51 50 50 50 50 50 50 50 50 51 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 48 44 40 37 28 28 28 40 40 48 48 48
48 48 48 48 43 43 33 33 25 31 34 41 59 44 27 27 3 0 3 27 25 39 39 39 36 36 36 32 37 28 19 21 21 21 24 28 32 28 19 13 13 21 30 42 43 48 43 43 43 43
43 51 48 48 43 48 48 50 50 48 47 46 46 39 43 43 43 43 43 43 57 57 57 44 44 37 32 32 42 42 48 48 44 42 42 42 35 35 39 42 44 44 44 57 41 41 15 15 11 12
12 12 15 15 27 27 33 33 35 47 41 44 27 23 23 43 43 43 44 44 48 43 43 44 42 35 28 32 28 28 33 44 42 41 41 28 28 28 36 36 37 37 37 32 33 40 25 25 32 36
32 32 25 36 28 30 32 37 39 35 35 37 39 41 40 25 25 23 32 28 35 30 30 18 15 10 10 10 14 12 20 11 12 13 13 14 18 12 19 9 9 9 9 11 11 11 11 11 26 25
26 19 15 15 13 13 15 20 20 31 37 39 32 30 39 36 32 32 30 30 32 32 39 39 43 43 47 47 48 48 59 57 53 53 53 53 30 34 24 23 23 25 25 35 37 22 18 9 7 7
3 0 0 0 0 3 9 9 9 16 16 19 21 26 17 15 9 11 9 10 12 23 30 19 19 9 10 9 9 9 9 3 0 0 0 3 3 0 0 0 0 3 11 12 12 14 17 18 17 19
19 20 15 11 9 9 9 10 12 12 12 16 3 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3 0 0 3 3 0 0 0 0 0 0 3 3
0 0 3 0 3 3 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3 3 0 0 0 3 0 3 3 0 3 6 8 8 8 3 0 0 3 0 0 0 0 0 0 0 0 3 6 6 6
3 0 0 0 0 3 3 0 0 0 0 0 3 0 0 0 0 0 3 6 8 8 9 3 0 3 3 0 0 0 0 3 0 3 6 6 6 3 0 0 3 6 6 3 0 3 0 3 3 0
3 6 3 0 3 8 3 0 0 3 7 7 8 3 0 0 0 3 7 3 0 3 3 0 0 3 6 7 3 0 3 7 8 3 0 3 0 0 0 0 3 8 6 6 3 0 3 3 0 0
3 3 0 0 0 3 0 0 3 3 0 0 3 3 0 3 8 6 6 6 6 6 6 6 8 8 15 6 6 6 6 7 8 8 9 3 0 0 3 0 0 3 3 0 3 8 8 8 3 0
0 0 3 0 3 6 7 3 0 3 7 7 15 15 6 6 6 7 8 8 6 6 6 6 3 0 0 3 0 0 3 6 3 0 0 0 0 0 0 3 0 0 0 3 0 0 0 0 3 7
6 3 0 0 0 0 0 0 0 3 8 3 0 0 0 3 0 3 0 3 3 0 0 3 6 6 6 6 8 10 8 7 7 7 3 0 0 3 6 3 0 0 3 6 6 7 6 3 0 3
8 8 3 0 0 3 0 0 3 6 8 6 6 6 6 9 7 6 3 0 0 0 3 6 6 6 6 6 8 8 8 8 6 6 3 0 0 0 0 3 0 3 7 8 6 6 3 0 3 6
6 6 7 7 8 3 0 0 3 6 6 7 3 0 0 3 0 0 3 6 6 3 0 0 3 7 6 6 3 0 3 7 6 6 8 6 7 6 6 8 8 6 6 6 6 3 0 3 7 6
6 3 0 0 0 0 3 6 6 3 0 3 6 6 3 0 3 8 8 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 3 0 3 6 3 0 0 3 10 8 9 9 6 6 7 6 3 0 3 10
10 9 9 9 3 0 3 0 3 9 9 10 10 10 10 9 9 9 3 0 3 8 6 6 6 6 8 8 9 8 7 7 3 0 3 9 9 9 9 9 8 11 3 0 3 0 3 8 8 8
9 3 0 0 3 6 8 8 6 6 6 6 6 6 6 7 6 8 6 6 6 3 0 3 8 6 6 6 6 8 3 0 0 0 0 3 0 3 6 3 0 3 3 0 3 0 3 7 7 6
6 8 3 0 3 8 8 6 7 10 10 9 9 9 7 8 7 3 0 3 6 6 6 6 3 0 0 0 3 3 0 0 0 0 3 3 0 3 6 6 7 8 6 6 3 0 0 3 6 6
9 3 0 3 0 3 0 3 3 0 3 6 6 3 0 0 3 6 6 8 9 6 8 6 6 6 3 0 3 7 8 6 6 3 0 0 3 9 8 8 3 0 3 6 8 7 6 6 6 3
0 3 9 10 10 8 7 6 3 0 0 0 0 3 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 7 8 6 |
|---|
