BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-332G04.T7 (MSMg01no332_g04.b1) | MSMg01-332G04.TJ (MSMg01no332_g04.g1) |
ACC | AG448432 | AG448433 |
length | 1,379 | 1,280 |
length of high quality (start - end) | 516 (218 - 733) | 620 (135 - 754) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no332_g04.b1 PHD_FILE: MSMg01no332_g04.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 22:18:46 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no332_g04.g1 PHD_FILE: MSMg01no332_g04.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 22:18:46 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | GGGGNNNTTACGGGGGNNNNTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTAGGAGA
ANNNTANNNNNNNNNNNCAGNNNCNNNNNNNNNNNCCGACCCANNNNNNN
CCATGTGGCGCTAAGACCACANAGGGAGAGGACCGCGGAATTCTAAAATT
CCTAGGCACTCTCACACTAACCCGGAGGGNANNANNNNGAGTGAGGNAAN
ACCTTTACAAAAGACCTCAAATAATATGGACTCACTGATAAGTGGATATT
AGCCCAGAATCTTAGAATACCCAAGATACAAGATACAATTTGCAAAACAC
ATGAAACTCTAGAAGAACAAAGTCCAAAATGTGGACAATTTGCCCCTTCT
TGTAATTGGGAACAAAACACCCATGGAAGGAGTTACAGAGACAACGTTTG
GAGCTGAGACGAAAGGATGGACCATCTAGAGACTGCCATACCTGGGGATC
CATCCCATAATCAGCGTCTAAACGCTTACACCATTGCATACACTATTTTG
ATTTTGCTGAAAGGACCCAGATATAGCTGCCTCTTGTGAGGCTATGCCGG
GGCCTAGCAGACACAGAAGTGGATATTCACAGTCAGGTATTCGATGGATC
ACAGCGCCCCCAATGGAGGAGCTAGAGAAAATACCCATGGAGCAAAGGTG
TCTGAGGCCCTATGAGTGGAACAACAACATGAACTAATCAGTACCCCTCC
CCGCCCCCAGATCTCATGTCTCTAGCTGCATTGTATCAGAGGATGGCCTA
GTAGGCCATCGTTGGAAGGAGAGGCCCATTAGTCTTGCAAACCTTATATG
CCTCGGTACAGGGGAAGGCCAGGGCCAAGAAGTGGGAGGGGGTGGGGGGA
TGGTAGGGAGGNNNNTNNTTTTTTTTTTTTTTTTGNNGNNGGNNANNNNT
TNNNTTTNNNNGGGCNNNNNNTGGGNNNNNNGGGGNNNNNGGNNNNNNNN
NNNNTTTTTTGGTGTNNNGGNNNNNNNNNNNNNNNGTNGGTTGTTTNTTT
TTTNNTNTTTGAATNNNNTAATTTAAATTTTTNGATTNAGAATNTNTNNN
NTTANNAAGGTAANATNTAAGGTANTTTTTTTTATAAATNAGAAAAAAAG
GANAAANNTTATTTTGAAAATNATNAAATAATANAAANAAAATANTTTTA
TANNAATANNATAAATGAATNATNTNTNATTAGTAAATAANNAANAAAAT
TTTNTGATTTTATTTATGTNAAAAGATAATNAATCAAAANNAANTNGGAT
AATTNTAAATAAAANNNNATAAANTANATGTGGTTAAAAGGTANNTTNAA
AATTNNAAAAAATNNAATAAATNNNNAGANNNNTAAATTTANTTNNANNN
TGANNATTAAGAAATGTATATATAGTAAG
| CCCGTTTTCTTNNNNAACGAGGTGAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCTTTTAAAGCCCACANTCCAG
NTACATTCATTCTCTAAATGCCTTTAAGAACCCCTGAGAATGGGTCTTGA
CATATTTGTAGGATTCACCTGAGAGACTATTTGAGTCTAATGTAAATTTT
AGCGCTCACTTTATTATTTACTTTATTTTAGTGACATGTTTTTTTGGGGA
ATTTCTGATTTTATTTGACTTTTAAAATTTACTTATAACACTTTTTTATT
AGTTTTATTTTAAATTATGAATCTCTTGTGTTACAATATTTTTGTGGGGG
TTTTCCCCATACTTTTTTTGGAAAGAGAGTCAAGTCAATTTTATCCAAGG
TTAATAATTATTTTTTGTTTAGAAAATGCAGCATTAGAAATTTTCCTTAT
TTAATATGTGTATTTAATATGTCTGAATAGCTATTTAAATTTTCTTTCTT
TCTATGTTATTCTACTTATTTTGGCTTTTTGGGAACAATCATCAGAAAAT
TCCTTAGCTTGATGTTTATTTCAATTACTTTCCTGTCTGTGCTGGAAGCA
TTAGAACACTGTGCTTCCTCTTCTGCTGGGCAACTTTCATTTTACGCTAC
AAGTGCAGACTTCTAGATAGAAATCTCAGGACAAACTTTTGCCTTTCTAT
CTGTCTTGTAGTTCTAAAGTTTCATTTCATGGGAAAACATAGGCCTTTTT
TAAGGCAGTGCTAACTGCTCAGCTATTGCACTGGCCTTACAAAGCTATGT
TGGCTCCTTTTCCCTCAAGAGAGCCCATCTCTGTGTGGCTTGCCTGATCT
TCATGTTGCATATGGACCCTCTGGGAATATTTGGCAACTTCCAGATCTAC
AGGGAACAGACCCTGCAATCTCTGAAATTCCCACTCATCTATTCTTTCTT
TTGCAGATCTCATCCGCCTTTAAATGTGATTTTTGCCCTTTACTAAAAAA
ATTCTGAAGTGGATGTTGGGAACTTGTCATCCGGTACTTTTACCACGAAT
TACTAAGCAAAGTCCACGTTAAACCTCCCTTTTTTTAAAATTATACTTAT
TTTGGGATCTCTCTTTTTAAACCCCAATTTCATTCCTGTCCCACTTAACC
TCCAATGGTTCCAATTCTTAATTCCTTTCTCCCCTCCTCCCTTTTTTTTT
TGTAAGATTTTTCTTCTACCCCACCTTACCTATATTTCCTGGTGCGCCCT
TTTTTTGGGTATATGTTTCTTCTTTTAACN
|
quality values | Open.Hide. 7 7 7 3 0 0 0 3 8 6 6 6 7 8 8 3 0 0 0 0 3 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3 8 8 9 11 9 27
3 0 0 0 3 3 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3 9 3 0 0 0 3 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3 9 7 9 9 8 7 3 0 0 0 0 0 0 0
3 8 6 6 6 6 6 6 8 6 8 6 6 8 8 10 10 10 8 8 3 0 3 10 19 12 10 10 15 15 20 20 33 33 30 29 29 28 22 11 13 8 8 8 22 22 30 31 31 31
29 28 25 24 19 21 9 9 9 10 6 6 6 6 6 6 9 11 11 10 8 8 8 7 7 8 15 17 3 0 3 0 0 3 0 0 0 0 3 17 19 25 25 19 21 3 0 3 3 0
3 9 17 17 17 11 8 8 8 11 8 8 8 8 8 8 13 15 29 29 37 37 37 37 37 19 9 9 9 9 19 23 39 37 37 37 33 33 33 36 36 38 53 53 53 53 53 57 57 57
57 57 57 59 57 57 57 47 51 51 47 47 47 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 44 44 32 31 31 32 44 44 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59
59 59 59 59 59 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 44 44 48 48 44 44 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 22 22 12 12 17 16 20 13 15
11 12 24 33 59 59 59 50 53 53 57 57 57 57 57 57 57 53 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 54 59 59 59 59 48 43 43 48 27 44 23 23 23 23 23 36 44 59 59
59 59 68 68 68 68 68 68 57 57 47 43 43 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 68 68 68 57 59 44 44 30 42 42 57 57 43 43 43 57 47 48 48
57 59 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 59 59 59 57 54 54 48 48 48 48 48 53 53 53 53 57 59 57 57 57 57 57 48 48 48 48 48 48 48 40 41 59 47 59 26 28 13
13 13 28 21 37 37 30 37 37 47 47 48 57 43 43 39 43 47 59 59 59 59 59 59 48 48 48 48 34 34 28 31 32 34 28 28 28 30 30 39 37 37 46 59 43 48 48 48 48 48
59 59 43 41 41 59 41 39 34 34 19 19 20 32 32 25 23 11 11 11 27 25 36 33 35 30 25 22 22 22 21 27 9 9 9 23 23 25 25 13 21 21 11 11 12 11 11 11 12 12
11 11 12 14 14 14 14 12 12 12 12 12 14 28 24 22 23 17 16 18 18 13 15 11 12 12 19 15 15 22 18 12 12 11 13 13 12 11 11 23 27 23 12 12 12 21 19 25 28 19
16 8 8 8 11 7 8 8 13 8 9 12 29 29 36 14 20 11 12 12 21 18 23 23 21 11 12 11 19 16 17 19 22 26 19 17 12 9 9 8 9 19 24 32 27 28 32 25 25 11
10 10 9 8 8 8 8 13 10 15 3 0 0 0 0 3 0 0 3 23 23 11 11 11 10 22 19 12 8 8 8 15 8 10 3 0 0 3 0 0 3 3 0 0 3 0 0 0 0 3
3 0 0 0 3 23 3 0 0 0 0 3 7 7 3 0 0 0 0 0 0 3 6 7 3 0 0 0 0 0 0 3 8 8 3 0 0 0 0 0 3 3 0 0 0 0 0 0 0 0
0 0 0 0 3 17 8 11 13 11 8 6 6 6 3 0 0 0 3 3 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3 3 0 3 7 6 7 12 7 7 3 0 3 6 6
7 14 3 0 0 3 0 3 17 8 6 6 7 3 0 0 0 0 3 7 7 8 6 6 7 8 7 6 8 9 11 3 0 3 6 8 3 0 3 11 11 11 3 0 3 0 3 0 0 0
0 3 7 3 0 0 3 17 19 8 8 8 3 0 3 3 0 3 16 13 11 9 17 3 0 3 7 7 9 9 9 9 15 8 8 8 8 6 3 0 3 14 8 9 8 9 8 8 6 6
8 3 0 3 7 3 0 0 3 14 14 8 8 8 8 9 12 10 10 8 3 0 3 3 0 3 10 8 17 9 7 7 3 0 3 7 3 0 3 7 7 7 7 3 0 3 7 8 8 6
6 3 0 0 3 6 6 3 0 0 3 7 7 6 6 6 8 15 8 3 0 3 3 0 3 0 3 0 3 6 6 6 6 6 8 10 6 6 8 3 0 0 3 3 0 3 8 8 6 6
6 6 3 0 3 6 8 6 7 8 6 6 8 21 22 8 6 6 3 0 3 14 7 9 9 6 6 8 10 3 0 3 18 9 9 9 23 23 3 0 0 3 3 0 3 0 3 7 6 8
16 7 7 3 0 3 7 7 16 8 8 6 8 3 0 0 0 0 3 6 6 7 3 0 3 3 0 3 21 14 9 6 6 6 16 16 9 9 9 9 7 7 3 0 0 3 3 0 3 7
7 7 14 3 0 0 3 6 7 7 7 8 3 0 0 3 8 8 8 19 17 3 0 0 0 0 3 12 3 0 0 0 0 3 6 7 6 9 8 8 3 0 3 3 0 0 3 0 0 0
3 10 3 0 0 3 14 6 6 6 6 9 6 7 6 7 8 6 8 8 8 11 11 10 10 9 9 9 9 | Open.Hide.14 14 12 11 9 8 8 7 7 8 3 0 0 0 0 3 9 7 7 6 6 6 6 6 8 9 6 6 6 6 6 10 17 10 12 13 7 7 9 9 16 9 15 17 15 15 8 10 10 19
19 15 16 24 28 35 35 35 37 37 36 28 28 33 33 36 36 36 44 44 39 37 42 41 27 27 9 9 9 9 16 7 8 6 6 6 6 10 11 11 9 9 9 3 0 3 25 23 21 3
0 3 21 21 37 41 37 37 39 33 31 31 31 31 31 29 21 17 9 10 9 10 9 9 9 11 11 13 10 10 10 12 15 28 22 22 19 27 37 50 50 47 53 53 53 53 53 50 50 50
53 47 47 47 47 47 53 50 53 53 68 68 68 53 54 54 43 43 47 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 43 37 37 44 59 57 57 57
57 57 54 57 57 57 57 57 57 50 50 51 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 54 54 54 57 57 57 68 59 68 59 59 59 59 59 59 59
59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 68 59 59 59 59 59 68 68 68 68 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68
59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59
59 59 59 59 59 39 23 22 9 8 8 9 10 9 12 22 25 32 32 41 50 50 50 48 48 50 57 57 57 57 57 48 57 59 57 57 57 53 53 53 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68
68 68 59 59 59 47 47 39 41 37 37 42 59 59 59 54 54 54 59 59 54 54 54 57 57 48 48 57 57 59 57 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 57 57 68 57
57 57 59 59 59 59 59 59 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68
57 57 52 52 52 57 57 57 57 59 59 59 59 68 59 59 59 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57
57 57 57 57 57 57 54 54 54 59 59 57 44 42 42 42 47 50 50 50 54 54 54 54 57 57 57 54 54 54 54 68 68 68 68 68 68 68 53 53 50 50 50 50 57 59 57 57 59 59
59 59 59 59 48 47 47 47 47 47 59 59 59 59 59 44 41 41 44 59 59 59 46 46 46 41 36 28 28 22 28 28 41 44 59 59 59 59 47 41 39 37 37 31 31 41 43 44 39 39
34 24 19 20 20 28 25 19 19 12 19 18 23 23 23 34 34 30 18 12 11 11 21 21 39 39 41 21 19 9 9 10 11 12 17 17 30 30 28 23 32 41 30 18 20 20 24 19 27 23
28 22 27 35 27 28 24 17 17 21 32 28 28 13 10 8 8 8 12 10 10 14 10 10 9 9 9 14 25 12 10 10 9 15 20 35 22 22 24 13 12 10 9 9 17 19 29 16 16 14
20 13 23 23 31 34 30 31 14 14 14 28 30 29 34 23 21 14 24 13 14 14 8 11 9 8 8 8 13 21 28 21 10 10 14 11 10 10 11 11 10 10 10 10 10 15 15 12 8 8
8 9 9 9 13 8 8 8 10 10 9 13 17 16 10 22 22 13 13 10 10 11 23 23 21 10 10 12 13 14 17 15 20 12 15 13 11 12 16 11 11 10 10 10 13 16 12 12 12 15
17 17 18 16 11 11 9 10 10 10 8 8 9 8 8 8 8 8 8 10 13 11 14 13 11 10 9 8 10 8 9 9 19 17 28 15 10 10 12 15 13 9 9 9 8 8 11 11 8 8
8 7 7 6 6 8 10 8 9 9 9 9 9 9 11 8 8 8 9 11 11 10 10 9 9 10 10 10 10 12 16 12 11 10 10 11 9 9 11 23 10 8 9 9 9 8 8 8 8 13
15 12 12 8 8 7 7 6 8 8 8 10 9 11 9 8 8 10 10 8 8 8 8 8 8 10 13 10 10 14 26 23 30 25 23 22 17 22 18 15 10 12 6 6 8 8 9 9 9 9
10 10 10 8 8 8 13 8 8 8 10 8 8 8 14 7 10 8 8 6 6 8 16 12 11 11 11 11 13 8 8 8 8 8 12 10 10 8 8 8 15 8 8 6 6 8 8 8 8 7
6 8 8 8 8 10 8 8 12 17 13 16 16 10 10 10 6 6 8 8 10 10 6 6 6 6 8 12 8 8 8 8 8 6 6 6 10 13 19 10 10 10 12 13 21 13 12 10 10 10
8 8 8 8 8 10 12 13 13 13 8 10 11 15 8 8 8 8 8 8 8 8 13 10 10 9 9 8 8 8 8 8 8 17 10 8 8 8 8 8 8 6 6 6 11 8 8 8 10 10
19 19 23 16 16 12 14 14 15 19 19 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 15 12 12 8 8 8 3 0 |