BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-381O04.T7 (MSMg01no381_o04.b1) | MSMg01-381O04.TJ (MSMg01no381_o04.g1) |
ACC | AG485921 | AG485922 |
length | 1,304 | 753 |
length of high quality (start - end) | --- | 360 (70 - 429) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no381_o04.b1 PHD_FILE: MSMg01no381_o04.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 23:23:26 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no381_o04.g1 PHD_FILE: MSMg01no381_o04.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 23:23:26 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | CCGCATACCTTTCAATTTCGTAACCCATAAATGCCACCACCGACAGTCAA
ATTGACCCCGGCATTTAACCACCCCGATATCATCAATAAAACAATATCCC
CGCGGTACATTAACTTTACATATTATCCATATAATGTAACCTACGCGCTC
GCCTTGCCGCCTCGCTCGGTATAACCGATGATATACGATATCAGTATTAC
GCACACCAACCTGTCGCATTGAGCAGCCAAACTCTGCGATTACGGAGGCA
CAACAGCCGCCCCGCCCGGGAGGACAGTAAGAAGAAAAAGAAAATAGAAA
CGCGCCAGAAAAATCAGTCCACCTGATTATTACCCGATCCCGTCGTTTCC
GGGTCTATTAATTATATGTGGACTTCAATCACGCGGGCGGCTTAATATAT
ACGGCGTAAATAAGAAAACATCCTCAAACAAAATCAGACCTAATANTCCC
GCCGCGGTGTAGCCGAGGAGCGACGTTTATCACAAATATGGGCGCGTTAT
GCACAGCGGACGCCGCGAAACGATATATATCGGACACAACCAATACGCGC
GGGGCTGCATAGCACAGCCCTATTACTGCCGGCATTATGGCACCGTATCA
TCACTCACAGAATTATTGTTGCACCGGCGCACTTTTGTGCGTGCGGCGCC
CCCCCACCACCACCCGCGCCTGTTTTACCACACCACGCCGGCCCGTGGAA
TCGCGATGGAGATTATAATGCGCGCCTGACGGCGCTAGATAACGCCGCAC
GGTCTTGAAACGGTTAATAGTATATACACAACCACCGCCCGTTCGATACA
CATATACCACGGCCGTTATTAACTTTCGTAGAGGCACCACTACTACGCGA
CGAGGCCGGCGGCGCGCGGCAATTTTGTATATATATTAACGGACACCTTA
GTGTTGCATCGCCGCGACTCACTCGACAAAATTATCTGATACGCCGCGTA
ATGTGCGGTGATATTATGTGTATACATAACATGTATATCGCGACGCGGTA
AATACAGTGACGGTGCGCGCGAATATTCCGGAACCATATAAGCCGGCACT
AGTGGGCGGTGCGCTATTATTTACACCCGCCCCATACACGAGACGACTTT
CGTACGTAAAGCGCCGCGCAGTGTATACGTCAGATAATCGTGGATATTTT
ACGACACGCGCGCACGACCGATATATGCGGCGTTTATCGCGCTTTCACGC
CCACTCACCTTTCGTTATATTTCGTGGCGAAACACGTATCGCACTCATAA
CAACATCTAATTGTGTCGTGATAGAGGAATCGCGCCACGCATGTCTGCGC
GAGT
| ACXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXAGGATGCAGGGTTGACTCCCAGCTCCTGCTC
TTACCAATGAATTGGTAGATATCCGATGAGCTTTGATGACATGCTCCGAT
CTTAAAGTACAGCAAGGAAAGGTGTAGGACCAAATTTGAGCTCTACTAAA
AACACATTTTAAAAAGAAGAAAAAGGAGGAGAAGGAAGAGGAGGAGAGGA
AGAAGAAGCAGAAGTAGCAGCACATATTTCCATGGGGTGAAACACTAGAA
ATATAACCATTCCATAAATTTTATCAACAGTAAGCTATACCATTCATTCC
TGGATCATTTAAGTGATGGAGAGAGTAAGAATAGGTACCAGAGTCTGGGG
ATTTCATCCAGGGTTGATGGGGACCCAGAAGAGGTAGCAGCTTCAGAGTC
TTGGAGGATCCTTGATGGGCACTACTGGGAAACCAGTTTGTGTTTGAAAA
GAAAAAGAATTGGTGTAATCAGACTTATCCGTGCGGGATCTTTCTGTCTC
GTCTCTCCCTCCTTTCTTTTTTCCCCTTTTCTCCCACTGCTTCTAATTTT
CCTCTCTCCACCCTTCCCTGCCGTCCTTTTTCTTTTGTCCTCCTGTCACA
CACTATTTACTTGCTCTCCCTTTCTTACCCCTTTTTTCCGCTTTTGCGCT
CTCCCCCTCTATCTTATTGTTGCCCCGCTCCCCCCTTATTAACTTTTCAC
AAA
|
quality values | Open.Hide. 9 9 8 8 10 10 10 11 11 12 12 12 8 8 8 8 8 8 10 9 9 9 8 9 8 8 8 8 8 8 10 8 8 10 10 15 10 8 8 12 12 11 6 6 6 6 8 10 12 12
10 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 10 8 9 10 10 10 8 10 7 7 7 10 12 10 8 8 8 8 8 8 10 10 10 6 6 6 9 8 6 6 6 6 6 11 8 8 8 10 13
7 9 9 9 9 9 8 6 6 6 6 6 8 12 8 8 8 8 8 8 11 8 8 8 8 8 8 9 9 9 8 7 6 6 6 8 8 8 8 6 6 6 6 6 11 10 10 6 6 6
6 6 10 8 8 8 8 8 11 11 12 17 11 10 10 11 11 10 10 11 10 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 10 10 8 8 6
6 7 6 8 6 7 7 8 9 10 8 10 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 9 9 7 7 10 8 8 7 9 9 10 18 18 10 9 9 9 8 8 8 8 8 8 10 8 8 10
12 10 8 8 6 6 6 6 9 10 10 8 8 8 9 9 9 11 11 11 11 11 10 10 10 9 9 9 9 9 8 10 8 9 9 9 13 12 8 6 6 10 10 10 10 8 8 8 19 17
8 9 9 9 10 10 8 9 10 10 10 11 8 8 6 6 8 8 8 8 11 8 6 6 6 8 6 6 8 8 8 8 10 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 11 11 12 16 11 10
8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 6 6 6 6 6 6 8 6 6 8 8 9 10 10 9 9 9 8 8 8 8 10 7 9 7
10 12 13 12 8 8 8 10 15 9 9 8 10 8 9 12 9 14 10 9 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 6 7 6 6 8 8 9 9 8 8 8 8 8 8 3 0 3 8 8 8
8 8 8 11 6 6 6 6 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 9 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 10 10 21 19 8 8 6 8 8 6 8 6 8
8 8 10 6 6 8 6 8 8 8 9 8 8 6 6 6 6 8 7 8 8 8 8 8 9 8 8 8 8 10 9 10 8 8 8 8 6 6 6 6 6 8 9 9 9 9 9 10 10 8
8 8 8 8 8 8 8 8 10 6 9 8 8 11 6 6 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 6 6 6 8 9 9 13 8 8 8 8 8 8 10 10 8 8 8 8 8 8 10 9 9
10 9 11 11 11 11 12 13 9 9 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 11 8 8 8 9 9 9 8 8 6 6 7 7 6 6 6 8 8 8 10 8 8 10 8 6 6 7 11 9
9 9 7 13 6 9 6 7 8 10 9 9 7 13 7 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 6 6 6 6 8 11 10 11 10 8 6 7 6 6 8 8 10 11 17 10 8 8
8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 9 10 6 6 6 6 6 6 8 9 9 8 10 8 9 9 9 9 13 8 9 9 9 9 8 6 6 6 6 6 6 10 10 8 8 6 6 6 8
8 8 8 8 8 9 8 8 6 7 8 6 6 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 10 9 9 9 9 10 14 16 13 8 8 8 8 10 16 10 8 8 8 8 8 6 8 7 7
8 8 6 6 6 6 6 6 12 8 6 6 6 6 6 13 6 9 10 6 8 8 8 8 8 12 13 12 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 10 8 10 8 7 7 8 8
9 9 9 8 8 8 8 10 8 8 8 6 9 7 10 8 9 6 6 6 6 8 6 11 13 8 8 8 6 6 6 8 8 9 10 9 9 9 10 10 6 6 8 8 8 8 9 8 7 8
8 8 8 8 10 10 10 10 10 11 11 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 7 7 6 6 6 6 6 7 7 9 9 7 8 8 9 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 10 10
10 13 8 8 6 8 8 6 6 6 8 8 10 9 9 10 10 8 8 8 8 7 8 7 9 9 10 9 10 10 12 8 8 6 6 6 6 8 6 8 8 8 8 8 8 8 8 10 9 6
6 6 6 6 6 8 8 6 6 6 6 10 8 8 8 8 6 10 8 9 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 9 9 10 10 10 10 8 8 6
6 6 6 8 10 8 6 6 8 8 8 9 9 8 6 6 6 6 6 11 11 10 10 10 10 9 9 9 8 8 7 8 8 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 12 12 11 6
6 6 7 8 6 8 8 10 8 8 8 8 8 8 7 8 8 10 10 8 8 8 6 6 6 6 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 13 10 10 11 11 12 8 8 6 6 6 8 6
8 8 8 10 10 10 13 15 12 12 9 9 9 10 6 6 6 6 8 8 8 8 10 7 8 8 8 8 8 8 8 10 9 11 11 11 11 11 11 6 8 6 6 6 6 9 9 9 9 11
13 11 11 9 6 6 7 6 8 6 8 6 7 6 6 6 6 6 6 6 9 10 8 7 6 6 6 6 8 6 8 8 13 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6
6 6 6 6 6 6 6 8 8 10 10 8 8 10 8 8 8 10 10 10 8 6 6 6 6 6 8 10 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 13 8 8 8 8 8
8 8 8 8 | Open.Hide. 8 8 8 8 17 8 8 7 8 10 34 34 47 39 41 39 43 43 44 44 41 41 44 37 23 23 9 9 9 9 9 9 9 11 9 14 10 15 18 14 17 25 25 11 11 11 21 21 41 41
39 23 25 12 9 6 6 6 6 6 8 12 12 10 10 20 20 25 25 28 31 31 31 33 36 36 53 53 53 57 57 53 53 53 53 53 50 50 43 43 47 47 57 57 57 57 57 57 68 68
68 68 47 50 50 50 50 50 68 68 48 48 42 32 31 31 37 37 47 57 57 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68
68 68 68 59 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 57 57 68 50 57 57 57 57 52 52 47 50 50 50 50 68 68 59 59 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 59 59 68 68 68
57 57 57 57 54 57 57 57 57 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 50 50 54 59 59 59 54 57 57 57 57 57 57 54 54 57 47 43
43 42 42 42 42 57 57 57 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 54 48 57 57 57 57 57 57 59 48 48 48 59
59 59 59 59 59 50 50 50 50 50 50 42 47 40 21 18 10 10 10 9 12 15 15 11 12 12 22 25 28 48 50 50 57 57 57 57 57 57 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59
59 54 54 57 57 57 57 59 59 59 59 59 57 57 57 59 57 48 48 48 48 48 57 57 57 57 57 57 47 54 54 59 59 59 48 48 43 48 48 43 48 57 59 59 57 59 59 54 54 54
48 50 53 57 59 59 59 59 59 43 39 39 30 30 30 37 37 43 39 35 28 33 33 28 22 20 15 14 12 19 28 15 10 8 8 8 13 12 17 13 14 11 13 10 9 10 9 9 9 9
10 12 8 8 8 8 8 8 10 8 11 8 8 8 8 8 8 9 8 8 8 8 8 8 8 8 11 12 12 9 7 8 8 8 8 10 8 10 6 6 6 6 8 8 8 11 11 11 12 9
9 9 15 13 10 8 9 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 12 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 8 8 9 9 9 8 10 15 6 7 7 7 8 8 6
6 8 8 11 11 16 10 9 9 8 8 15 13 11 8 10 11 14 20 21 21 25 16 17 19 19 16 16 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 8 6 6 8 8 10 10 10 12
12 16 16 23 26 19 11 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 13 13 21 13 10 13 8 8 8 8 8 8 9 9 14 9 10 8 8 8 8 8 8 9 9
8 8 6 6 8 8 10 13 10 10 10 8 8 8 8 12 10 10 8 11 8 8 8 8 8 6 6 8 8 12 16 16 8 10 8 8 8 8 8 8 10 19 12 8 8 8 8 8 8 8
8 10 10 13 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 9 10 10 10 9 10 10 6 6 6 6 8 6 12 21 18 19 15 12 8 8 8 8 8 8 12 13 13 11 8 6 6
6 8 6 |