BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-392A22.T7 (MSMg01no392_a22.b1) | MSMg01-392A22.TJ (MSMg01no392_a22.g1) |
ACC | AG493683 | AG493684 |
length | 788 | 1,204 |
length of high quality (start - end) | 342 (75 - 416) | --- |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no392_a22.b1 PHD_FILE: MSMg01no392_a22.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 23:36:28 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no392_a22.g1 PHD_FILE: MSMg01no392_a22.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 23:36:28 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | NNTTCTATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTTCCAGAGGATCCG
CGGAATTCTAAATGATACACCCAGGAATTAAGTGGATTACTCTTGACTGA
AGTCATTTGCAAACTGAATTTGGTGACAACTTACAAAATGTCTCTCGGGT
CCCTTCAAAGAGGTAAGCATAATTCAGTCTGTGCCAGAGACAGCATCCAC
CCAGAGTAGTGCTCCATCCAGACTGAGACAAAGCAGGGGAGAAGGCTCTA
CAGAGTTCTGGAAGTTCTGAAAACACTGCCTTTCCATGTAATCAGAGAAT
TTGTGAGGGTCCCGGGGGGTACAGTCGTGAAAATGAGCTGTCATCAGCTA
TTCTCATTAGAATATGCAATTGCATATTAGCAAAATGTGTTTGGAATAAT
AACCAGCAGGCATTTCAACATGCTCCAAAACTGTAAGGCATCAGGCAAGA
ATTATGTTTTAAAAAAAAAATGGGAGAAAACCTCTCATTAGACAGTTCAC
TTTGATTTCAGTCTCCATAGAAACGGGATATTCCGATACACGGAGATATC
TTTGCCTCTGGAATTTTTTGCATGCCTTGGAATTTGCACATGTGCCCCGA
CAAAAAGCCCGATGTGATGCCTAGCGGATGAAGTTGCCACCACACGAGCC
CGCGCCCCCCAATGGAACTCTCCCTGTCGAACCGCCCATTCCAAACCTTT
TCTCTGGCAGCACCAACCCTGCGCCTCTTTTGGTAATACAAACACCCGCC
CTCTTTAACTGGCATTATACGCCCCTCCCCCGCCTTTG
| AAGCGCTGCCGGCGATATTCGCGCTCACGCCGCGCCCGGGCCCCGTACCA
CGACGCGCGACGTTACTAGAGACGAGCTCTGTCGCGACCGCGGCGCCGTA
CGCGGCGCGCCGCGCGCCCCGCCGCAGCCTCGGCGCGTAATACGCGCGAC
ACCCGACACGTATACCGGCGAACAACGTGCCGCGCCGATGCGGCTTTCCG
TGGTCGGGCGTGCTGGGTGTCCCGGGAGCGTTTCTGTTCGCCACAAAACA
AAACGCGATGCGCGGGGGACGCGGACACGCGCACGAAGACCAGCGCAAGA
GGTGTGTTCTTTCCCCGCGCGGGCGCCATATCGAAGCGCCGCGCCGCTAG
ACGGCAAACGCCTTCCCGCGCGGGCCCACCACCGCGCGGCACGCGGAGTA
ACGCGACTCCACCAACTTCCCCGCCTATGCGGTGGCGTACAACCCGCGGC
GGTCTCCTCGCCACGCAGCCATCGCGGGCGGCGCCCGGTACGTTCTCTGC
TCAATCGCCCCTTCCAATATGCAGCCGTGCCGCGTGCCGATTGTACGCGC
CTGGTCTTACACGCCCACGCGGCACCGCCCTCGTACCATCCCTTATACGC
CGTCCACTTCGCGCGCCGCCGCGTCGTTCGCCGACCGCCGCGGCGGGGCC
GTCATCACTCGCGTATTGCCCGGTAATGCGCTTTCGGCCCCGCAAGGTGC
GCGCGGAGAGAGCGATATCAGACACGGACACGGCGCGCCCCGCGCCACAN
ACAGAGAGGCGCGAGCGGCCGCGCTCTCTCTCGAATGAACGCGCGCGACG
ATCTAGCGAGCTCGCNCNGCGACGCCGACTGCGCGCGCGCGCCGTAGAGT
GGCGCGNTGATGCCGGTCCCATCCCGCCNACAAGGCATCCGCAGTGTGAG
CTGCGCGCTGCTCCGCGCGAGTCACGCCGTGCTCATAGCGCGCCGTCCCG
ATCATATCGCGCCACGCACGCGCTCTGCGGCTCNANTTGCAGTCCNGTGC
GTGGTGCGGTATAGAGCTGAACAGGTGCACGACGGCGCGTCGAGACACAG
AGACGCACCTGAGCAGAGAACCGCACGCAGCCGCGACTGGCGAGGAGAGG
TGATCACGCGCGCGCCGTAGACACAGACGAGACACAGGCGGCGCCATACC
GAGCGTCGCCCGTTGTTCTACGCGCGCGGGCGTATACGCACACCGACATA
TCCN
|
quality values | Open.Hide. 0 0 3 7 6 8 10 11 11 21 20 24 34 33 34 34 19 15 11 15 10 22 17 20 24 21 23 27 21 10 19 17 17 19 13 10 11 10 10 15 15 20 20 18 18 21 20 20 22 32
32 28 22 29 29 32 33 29 28 25 25 25 11 9 9 9 9 9 10 10 19 22 19 19 19 21 28 28 31 32 47 47 53 36 36 36 37 37 42 32 32 28 28 28 32 32 48 48 57 57
57 42 42 29 29 29 42 39 36 25 25 25 42 40 48 54 54 54 54 54 57 46 57 37 37 42 39 37 37 37 42 42 42 32 35 35 48 42 41 41 41 36 36 32 32 26 26 21 42 44
44 44 50 38 36 30 30 35 43 44 68 68 68 68 57 50 50 37 37 43 50 52 52 52 43 43 32 38 18 32 23 44 44 59 43 35 35 44 44 57 52 52 52 52 52 52 59 52 52 52
59 57 57 57 57 57 68 68 68 57 57 57 52 57 52 52 52 57 52 52 57 57 52 52 57 57 57 52 52 50 57 57 54 54 54 57 57 68 68 68 57 57 50 44 39 28 28 36 36 42
42 42 48 57 57 47 44 43 43 43 57 44 68 68 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 59 54 59 59 57 57 54 54 54 54 57 57 57 43 43 36 36 43 42 57 57 48
48 43 43 43 43 43 48 48 48 48 48 57 59 47 43 47 47 32 29 19 12 12 12 12 12 12 13 15 25 25 41 41 50 50 50 48 59 46 46 43 57 43 46 43 57 43 43 43 46 48
59 59 57 57 48 48 32 35 41 68 43 43 42 54 32 32 17 17 17 27 30 47 39 47 47 57 44 43 59 59 54 59 59 57 48 48 46 59 43 43 43 57 47 57 57 48 48 48 48 48
48 48 48 43 43 43 43 43 41 41 37 37 37 21 25 11 11 11 11 14 15 24 24 22 22 15 15 20 29 32 37 39 35 39 59 43 43 39 37 47 39 37 35 39 39 36 36 36 33 33
36 33 33 33 37 31 31 32 37 39 31 31 41 41 41 41 39 39 35 32 31 22 18 20 23 24 30 37 27 25 18 18 21 23 23 19 23 20 23 13 12 12 16 16 19 17 17 12 12 14
26 30 37 37 30 30 17 19 12 12 11 12 11 16 13 12 12 12 16 23 18 11 13 10 8 8 10 19 24 24 28 20 10 10 10 10 13 17 11 11 11 14 14 24 28 25 25 13 10 11
11 11 14 18 13 8 6 6 6 8 8 19 24 22 15 19 12 13 14 10 10 10 12 11 9 10 14 16 15 15 12 12 12 12 8 6 6 6 8 8 10 13 13 14 14 11 9 9 9 9
11 11 11 12 8 8 8 8 8 8 10 10 12 11 11 12 13 12 14 12 12 10 10 9 9 9 9 9 9 9 10 10 8 6 6 6 6 6 10 9 9 10 8 8 6 6 6 6 6 6
9 10 10 11 10 9 12 10 10 9 9 10 16 10 9 10 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 10 8 8 8 6 6 6 7 15 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 11 9
9 9 8 8 8 8 6 6 6 6 10 14 11 8 8 6 6 8 10 8 8 8 8 8 9 9 9 11 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 8 8 8 8 8 13 10 10 9 8
9 8 10 8 8 8 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 6 6 8 8 11 11 10 10 10 10 10 18 15 8 8 8 8 8 8 8 8 | Open.Hide. 8 8 8 8 8 8 6 6 10 10 8 8 8 8 8 11 11 8 8 8 6 6 6 6 6 6 8 7 8 8 15 13 9 9 9 13 8 8 8 8 11 17 10 10 6 8 8 8 10 8
8 6 6 6 10 8 8 8 9 13 13 10 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 7 7 9 9 9 9 8 10 10 10 8 10 8 8 8 8 8 8 6 8 8 8
8 8 6 8 7 10 6 6 6 6 6 6 8 9 15 6 6 8 6 12 8 8 8 8 8 8 8 8 15 10 10 10 13 12 13 13 11 10 8 6 8 6 6 8 8 8 8 10 8 6
6 6 12 12 6 6 6 6 8 8 6 6 6 6 6 11 6 6 6 7 7 10 10 11 11 11 9 9 9 8 8 8 8 12 12 8 6 6 6 6 6 10 12 10 8 8 9 8 8 8
8 8 8 8 8 8 10 6 6 6 8 8 9 9 9 12 8 7 6 6 6 8 10 10 17 10 8 7 7 7 7 8 9 9 8 8 8 9 9 9 6 7 6 7 7 7 7 6 6 6
6 6 8 8 8 8 7 7 7 7 8 8 9 9 13 7 6 6 6 6 6 6 6 6 8 11 11 12 12 9 9 9 9 9 10 7 6 6 6 8 6 6 8 8 8 6 6 6 6 8
6 9 9 9 9 9 6 6 6 7 6 6 8 7 8 9 9 8 8 6 6 8 10 18 12 8 8 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 6 8 7 6 10 8
8 8 8 8 7 6 8 10 9 10 8 10 8 8 8 8 8 8 6 6 7 7 12 10 10 10 11 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 8 10 11 11 12 9 10 10 9 9 9
9 9 11 12 11 11 11 11 10 10 8 8 8 8 10 8 8 8 10 8 8 9 8 8 8 8 8 6 6 6 7 6 6 6 10 8 8 8 10 8 8 8 8 6 6 7 6 6 8 8
8 8 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 9 9 9 8 8 8 8 10 8 11 10 11 11 13 9 9 9 9 9 10 10 10 11 13 13 8 8 8 8 8 6
6 6 7 7 7 7 8 9 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 8 8 7 8 8 8 8 8 8 8 9 9 10 10 11 10 8 8 8 8 8 8 9 10 8 8
8 8 8 8 8 8 10 8 10 8 8 8 8 8 10 8 8 8 6 6 6 6 6 8 8 7 7 6 6 6 10 6 6 6 6 8 8 8 9 9 9 8 11 8 8 8 8 8 8 8
8 8 8 6 6 6 6 6 9 12 13 10 10 10 21 8 8 8 8 10 11 10 8 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 6 6 6 6 6 11 7 10 8 8 6 6 6 7 8 8 8
8 8 8 8 8 8 11 8 9 10 10 15 8 8 8 8 8 9 9 9 8 8 7 7 8 7 8 7 7 7 8 9 9 9 8 8 8 8 8 8 6 8 8 8 8 8 8 8 7 7
7 7 9 9 13 8 6 6 6 6 8 8 8 6 6 6 6 8 8 6 6 6 8 6 6 7 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 8 8 13 13 11 8 7 7 7 8 8 11 3 0
3 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 6 6 7 13 15 10 10 10 9 8 8 8 8 8 10 9 9 9 11 11 13 12 11 8 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6
6 8 6 6 6 6 8 8 8 9 6 6 6 7 3 0 3 0 3 10 6 6 6 6 6 6 10 10 10 8 7 8 8 6 6 6 7 8 8 6 6 6 6 6 6 8 6 6 8 6
6 6 6 8 8 3 0 3 6 6 6 8 10 8 8 6 6 7 8 7 7 7 6 7 6 6 6 3 0 3 13 9 6 6 6 6 8 6 6 6 6 9 8 8 8 6 8 10 8 8
8 7 7 6 6 6 7 6 6 6 6 6 7 8 8 10 8 8 8 8 9 9 6 8 6 6 6 6 8 8 10 6 7 6 8 6 6 6 8 8 8 8 6 6 6 6 6 8 9 9
8 8 8 8 8 8 10 12 8 8 8 8 8 8 10 12 9 8 7 7 6 6 6 7 7 7 7 8 7 7 10 9 3 0 3 0 3 9 9 8 8 8 8 8 3 0 3 9 7 10
8 8 8 6 6 6 6 6 6 8 6 6 6 8 8 8 6 6 6 6 6 6 6 6 8 6 8 8 8 6 6 8 6 6 8 8 8 8 9 9 9 9 7 7 8 8 8 8 8 8
8 8 8 6 9 7 13 8 8 6 6 10 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 6 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 9 8 8 8 8 8 8 10 11 13 12 7
7 7 6 7 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 6 6 6 7 8 8 9 8 6 8 6 7 8 8 8 8 8 6 6 8 6 8 8 8 6 6 6 11 8 6 6 6 8
8 8 8 7 7 7 8 11 10 7 6 6 6 8 6 8 8 8 11 11 6 6 6 8 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8
10 10 3 0 |