BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-392J14.T7 (MSMg01no392_j14.b1) | MSMg01-392J14.TJ (MSMg01no392_j14.g1) |
ACC | AG494096 | AG494097 |
length | 775 | 803 |
length of high quality (start - end) | 450 (77 - 526) | 303 (70 - 372) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no392_j14.b1 PHD_FILE: MSMg01no392_j14.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 23:37:10 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no392_j14.g1 PHD_FILE: MSMg01no392_j14.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 23:37:10 2005 |
singlet/doublet | doublet | doublet |
---|
BLAST hit | unique | unique |
---|
Map location. | (115,542,687 - 115,543,135) | (115,706,821 - 115,707,123) |
---|
sequence | NNNATCTATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTCCAAGAGGATC
CGCGGAATTCTATATTTTCTCTAACAAAGAAAACGGAAAATTTACACAAA
CTCTGACCTTTAGACCAAACCTGGTAGGAATTTTAAAAAAGTAAAACTCT
GGGTAAAAAGGAGGCTCATGAGGTAAAGGTGTTTGCCACAAGCCTGAGGA
CCTGATATCAATTCATCACCCACATGTGGAAGGAGAGAACTGACTTCTAC
AAATTGTTCTCTGACCTTTATACACAAACCACTGTGGCATGTCTCAATGC
ATATAAACACATATATGTATATACTTTTACAGGCACACAAACAACAAATG
AGTACAAGCAAAGAAAAAGAATAAAGAAAAGAAAAACCAAAAAGCCCAAA
TTGCTAAATAGTAGCAAAACAAATTCATAATTGTATTCATGATTAAGGGC
AGAATATTCAGGGGACCAAAACCAGCTTAATATGCAAAATATCTTTCAAC
ACAATTTATTATTAAAATGGAACAATGAAGACATAAGGCTAGGGGTGGGG
CTAATTTGGCAGAAAGCTTGCTTACCATTCAGGAAACTCTACCCTTGATC
TCCCTACTTGCAGGGCATTTTTGTGACAGTCCGCAACCCCTGAATTGAAC
AGGCGCATGAATGATTATCCCCAACTCCTGGCCCCTCCTTAAGTCACTTA
CGAACCAACGGAACTAACCCGGCGCCACCTGGACAGACCCCGGTTACTCC
CCCCTTTACAGTCCACAACAACCCG
| CCXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXACTCTTCATCCAGCCTCCTGTCTCTGATGGC
TCCTTATTTACCAGTTCCTTTGGTTCTTACTCCTCCTCGTGGGGGAACAT
CTCCAGTGAAGCTATATCACCTCAGCGGGAAGCAAAAAGAATCAAACAAG
GACAAACATCAAACCACAGAAACAGCACCAAGTTCTTGCCTAATTTTATC
CCAGGAGTAAAAAACAAAAACAAAAACAAAAACACAAAACTAGCCTTAAA
GGAAAATTAAATACAATGGCTTATTGCTGAATGGTGTAGTTTGCTTAAGG
ATTCAGTCGTTTGTCTTTGCCTCCCACATATGAGAAAGGAGTTTAGTAAC
AACCACTAGTCCGCACCAAAAACTCACTCTCTGGTTTCACACATTTCCGA
TTGTATCGCTGCGGTCACAGTTATTCCCCATTTACCGATCCTGCGGCTTC
CGTTATTCGGCTAGTGACCCTTCAGTTTATCCCCTTGCCTCTCTATTGTT
TCCCCGCCTGCCTTCCTTTACCTCCCCCGCCCCCACTTCCCCCCGCTTTT
TCTTCTGTCGCCTCCGCTCCCCTTCGCCTTTGTTCTTCTCTCCTCCCCTC
TCCTCCCCCCCTCTTCCCTCTTCCCCCTCTTTCTTCTTATTCGCTACTTA
TACCTCCCCCCCCTCAACCTCATTTTTTCCCCCCCTTCTTTTCTTCCCCC
TCCTTTTTTCCCTTCCCCTCCTCTGACCTTTCCCTTTCCTCATTTTCCCG
TCT
|
quality values | Open.Hide. 0 0 0 3 6 8 8 6 6 6 14 17 23 37 41 30 30 18 17 16 23 25 19 16 14 20 12 17 9 9 9 9 18 19 15 7 10 10 12 11 10 9 9 10 10 10 10 13 15 17
19 34 37 43 29 23 23 30 30 30 39 39 30 30 19 18 8 8 8 8 8 10 15 12 12 13 18 24 28 32 47 59 59 39 39 43 44 36 36 38 42 50 32 43 22 22 22 22 22 33
29 37 37 37 39 43 43 35 42 28 34 34 43 29 29 24 32 32 33 39 37 42 32 42 42 48 48 41 42 42 50 50 50 59 59 59 68 59 57 57 57 57 57 57 44 48 39 47 57 42
42 42 44 57 57 57 68 68 68 59 59 59 59 50 43 42 50 50 50 50 44 57 52 52 52 52 52 52 57 57 68 68 68 57 44 50 35 35 35 43 43 57 52 52 50 50 50 50 51 57
57 50 50 50 50 50 50 57 52 52 52 44 44 28 28 28 43 43 52 57 52 52 52 57 57 57 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 50 57 37 37 46 57 57 57 57 54 42 42 42
42 54 43 44 44 44 47 57 57 57 57 57 57 57 57 43 46 46 57 57 57 57 37 37 37 37 37 48 44 54 54 54 54 57 57 54 54 57 57 57 57 59 57 48 48 43 43 48 59 59
59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 48 48 59 59 59 59 59 59 28 23 11 10 10 10 13 13 15 13 11 15 21 32 37 44 37 48 48 48 39 47 42 42 42 47 57 57 57 59 59
57 48 43 47 43 43 43 48 43 48 43 46 41 39 35 35 35 39 39 47 48 47 43 43 47 47 48 59 59 68 59 59 59 54 46 57 46 44 43 46 57 59 46 46 42 40 32 28 28 43
44 68 68 68 68 68 68 59 68 68 68 68 34 34 12 18 18 35 35 18 20 20 20 19 19 22 22 28 44 44 57 68 59 59 48 43 37 28 28 28 43 37 43 37 40 37 43 43 43 41
43 43 59 47 47 48 47 40 32 30 28 37 37 39 32 32 23 23 23 32 34 39 40 39 39 32 37 33 31 31 41 44 41 59 47 47 59 59 59 48 37 37 33 37 21 24 19 22 20 20
28 13 13 12 25 25 37 37 37 37 33 30 27 17 16 18 18 28 22 25 24 28 14 14 14 28 23 28 17 19 19 19 19 23 32 18 16 14 14 13 18 15 15 15 13 19 17 24 28 28
25 34 34 25 22 22 30 12 12 10 8 8 8 10 9 15 25 24 22 17 17 11 16 11 11 10 11 11 8 8 8 9 11 10 9 10 9 9 9 9 12 18 18 23 23 23 34 24 28 28
28 12 14 11 10 10 13 17 21 14 15 14 18 10 11 13 8 8 8 19 17 30 12 12 8 6 6 6 8 10 8 8 8 10 10 16 17 14 13 7 7 9 9 9 10 10 10 9 9 14
9 9 8 9 9 8 8 8 9 9 10 10 10 8 8 8 8 8 10 8 6 6 6 8 8 9 11 9 9 9 10 10 8 12 8 9 9 13 19 14 12 10 9 9 10 10 10 8 10 8
8 7 8 6 6 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 9 9 11 7 7 6 6 8 8 12 12 12 10 12 12 11 9 9 9 9 9 15 19 19 10 9 8 8 8 10 8 8 8 10
20 13 15 6 9 11 10 12 8 7 8 8 8 9 10 13 8 8 8 8 8 10 10 9 9 | Open.Hide. 9 9 9 23 14 11 11 12 25 23 25 25 28 28 28 23 37 39 39 39 33 33 41 27 25 9 9 9 9 9 15 12 12 8 8 11 8 8 8 11 20 28 26 15 15 15 30 30 50 50
50 59 59 59 33 22 19 10 10 9 9 11 11 10 16 12 12 18 21 18 29 29 57 36 36 38 38 42 42 42 47 40 40 57 57 57 57 57 48 54 54 59 59 68 68 68 68 54 50 54
54 54 54 68 68 68 68 68 68 50 50 47 47 47 48 57 59 59 68 68 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 57 57 57 48 48 57 59 59 59 57 57 57 68 57 57
57 57 57 57 57 46 52 37 57 52 57 57 57 57 57 57 57 52 52 52 52 52 52 52 52 52 54 54 52 57 57 57 57 57 59 59 57 52 57 57 57 57 57 47 52 57 57 57 57 57
57 57 52 52 52 52 52 52 57 52 52 52 52 59 57 57 54 54 54 57 57 57 57 57 54 54 54 57 57 57 57 59 59 59 57 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 44
42 42 35 35 33 36 36 36 44 59 59 59 57 57 57 57 57 57 48 46 43 43 43 43 43 43 43 43 43 43 46 46 43 48 43 46 43 43 43 46 48 48 48 57 57 59 59 59 48 48
59 59 48 48 48 48 47 43 43 43 43 47 43 41 41 36 28 25 13 8 8 8 8 8 13 9 11 16 23 24 30 29 30 30 30 39 41 43 33 33 25 28 28 40 37 35 35 35 39 37
43 39 40 39 25 23 11 11 11 25 29 43 40 39 34 34 25 25 19 28 13 13 13 23 23 18 14 12 18 15 12 12 12 19 21 30 32 32 39 29 23 14 14 13 15 15 12 10 10 10
9 8 8 10 10 8 8 10 9 9 10 8 8 8 8 8 8 17 18 23 23 31 28 32 28 31 25 25 28 37 37 28 30 25 33 20 16 13 10 9 9 15 22 13 8 8 8 8 10 11
11 11 11 11 11 10 8 8 8 15 10 12 19 19 16 13 10 10 10 10 10 12 16 18 14 13 11 9 9 9 8 8 8 8 8 8 10 11 9 8 8 8 8 6 6 8 6 10 8 9
9 9 9 9 9 9 9 9 10 10 10 10 10 10 10 8 8 8 8 8 11 11 11 12 12 11 9 8 8 8 8 10 10 16 13 10 8 8 8 15 10 15 12 8 8 8 8 6 6 8
8 10 10 7 6 6 6 11 11 12 12 12 12 10 10 10 10 13 10 8 8 10 10 12 12 12 11 9 9 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 10 8 6 6 6 6 6 8 11 8 8
8 8 8 8 10 8 6 6 6 6 8 10 13 8 6 6 6 8 8 8 8 12 10 8 8 8 8 10 10 8 8 11 12 12 13 16 16 14 16 13 10 8 10 15 19 19 24 29 19 19
13 15 15 18 15 18 15 12 12 12 14 16 13 13 8 12 13 11 9 9 11 15 16 22 11 10 9 10 10 11 15 12 11 8 8 8 10 10 10 8 6 8 6 6 6 6 8 8 8 8
8 8 8 8 10 11 12 12 15 24 16 14 10 10 8 6 6 12 8 8 8 8 9 9 9 10 11 11 18 24 30 13 12 9 13 10 10 8 8 8 8 10 8 8 8 9 19 18 9 9
9 9 9 12 19 21 21 15 11 12 13 9 13 10 8 8 8 9 8 8 8 8 8 8 8 10 10 12 13 18 18 17 15 13 13 16 23 20 17 11 11 8 10 15 14 14 8 10 8 8
8 8 8 |