BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-460K11.T7 (MSMg01no460_k11.b1) | MSMg01-460K11.TJ (MSMg01no460_k11.g1) |
ACC | AG545959 | AG545960 |
length | 714 | 2,073 |
length of high quality (start - end) | 410 (64 - 473) | --- |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no460_k11.b1 PHD_FILE: MSMg01no460_k11.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 19:33:58 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no460_k11.g1 PHD_FILE: MSMg01no460_k11.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 19:33:58 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGGAATTCAT
TTTTCTCCCAATTTTAGAGAGAAACACACACACACACACACACACACACA
CACACACACACACACACATACACAGAGAGAGAGAGAAAGAGAGAGAACAC
AAACACAAATTTGGGTCAGTAGGGATAGGGAGGTGGATAAATATGAGAGG
AGCTGTGAAAAAGGAACAATATGATACAATATATAAAAATTTATAGATAA
AATTTTAAAAATTACAAAACAAACCAACTTCTCTGCTCCCTTATTTTACA
AATATGTTTTTGGTAACATCAACTATTTTGTAATATATTTGAGGGTAACT
CTTTATAAGTATCAACTAAGATAACCTGTGGTGGTTTTTTTCTTTGCCTG
ACCCTGATGAAACATTCTGGTATGTTTCTATGCTCAGCAATATAATCAAG
CTTTAGAAAGTACGAGGTGATGGTATTAGCTTTATGTACAGGAAATGTTT
TGATCCTTAGCTACATATTACCAATTTCAAGGAGCAACTTCAGAGTGGAC
ACTAAGATAACAGCTCAATTAAATTGATGAATCCCCTAATATTGCGTATA
GCCAGGAAACCCTTAGCAGCATGAACATGTTCTTACTAGGTAATATCAGA
TGATTTCATTGAAGGAAAATCTCTGTAGATGACTTTCCCCATATCTGTAA
GCCATAATTCAATT
| GTGAGCGTTAACATATANACATCAGTNTTGTTNTTNNTNNTNNCTGCGNC
NCNCAAGCCCCACCCTCACTCTACACANACGGATGACTTGCGNCGATNNA
AACGCNCGTACGCGCGGACANAGGGACCGCGCTAGCGCTCGCGGCAGCAT
CAGTGAGGTGACTGTCGATCAAGAGTGCATTACAGCTCCATCGACGCGAG
ACGCTGCGTCGCGCTCTTTGCCTACACATATATCATACATCATCTNCTCT
CGTCNCACCTCAGCTCTNCTGCTCCACGNCTATNTNCTCTATCGCTCAGC
CCGCCGCTACGCTAGACGCACAACGNNGCACACCAGCCACGAGCAAGAGA
CGTGGGAGCGGAGCGTNGCACGACGNCTACGACAGCGGGCACTGACANGA
GCACGCGGACAGACGATATCAGCGAGTANAGATCATATATNAGGAAATCA
CGATNATCATGNAGACATCAGTACATANACACGTCATAGCAGCACAGACC
TGAGTCATCTACTACAACACTGATTGTCGTCGCAAGCGATGCGATGTGTC
GTCTCGTNTCNTTACATGACCTCCTCTCAATGTGGTGGACCGCGCTCGTC
TCGGCGTAATGGCGNTGCGTNCTATCCTCGGTGCGTCTCTNAGTTCTATC
GCAGCAAGACGGCTATGACTGCTGATCGCTCCNTACTCTCTTGCCTCGCA
CTTCAGNCCGTGCGCCCCTCGCGTCCGATATCGCACGCCGCTCGCGTCTA
CTCTCACACGCCTGAGCGCTGTTGTAGTGGGCTGCGTCNCGTCTCTCATC
CCTATGACANCAGCATCGCAGATGAGACTGAACGCGCGGCGCGCCAGCAC
ACGCGTGGCGCCGTGCGAGCGTAGTGGGCGCAATGTGTACTATCGTCCTG
TGTCGTCGTCGCGTCTGCTGTCTTCTGCATATGAGACGCACCGTCGTACG
ACACTTCGTGTTCTGACTTATCGATTGGACAGTAGACAGTCTATCGGTCT
GCGGTTCTGCGTGCTCACATATGTCAATGTGTATACTCGCGTCGTGACGT
GTACGACGCGCTGCCGTCGATCGCACGCTGCGGTGTGCGCATGCTGCAGT
GAGTAGTNATGTNATTTNTAAGNATACACGGCAAGCNGCCTGCCTACAGT
ATCTATGCATATTCGCTTCATATGCGNCGCTCGTTATACGCTGCTGCTCA
CGTCCGCNACNTGTCATCATCTCTATATCGCACTACGGTCCGCGACCGAC
TACCGATCTCATACAATACTCGNCGCGATGCGCTGCTGCGACTATGACTA
TAACTGANACNATAGACGTCTACAGATGTCGCGATGANTTGCCAGCAGCG
CGCACGTGCGATATCGTCTGTAGCATGTTGCTGTACGTAGCANCGAGGAT
CTGCGAACGTACGTNCAACTCCGCTGCATATCTGCTCGTCTCGTGATACG
TGCGTGCGNCGNTAGTGCACGACGTATNTGATATGAGTCGCGAGTGCACA
CTAGTCGCTGTCATATCNNATATAGTGTGTCATGATACTGCAGNATGNTA
ATGTGTCTGTAGTCCTGTCTGCCTGTCAGCTGAGCTTGAGCTGATGCTGT
GTGCACTGCGCGTGACGGCNCGTATGATGGGATGATGANNACGTGTCGTT
ATCNACCGAGCAGGCNACAAGNTATNCAGAGGATACNGCAGCAAGACCNT
AGATGCGNTACATCCGACGACGTTGANTTTGCATGTTNNTTCAGTGATCG
ACATCCCATGCCGTAGCGTCACGACGCGTCAGCAGCTACTCTACTCATCC
GTCGCGTACTGTAGCGCGACGCTGTATNCAGCNACNGNNGGGCGTCGTGN
TTNGATCNACGATGGNCTGATATGANGATAATGCAGCTAATAGAGCAGCA
NGATACNCACGTCATGTACCGTCAGCTGTNCTATCATCGGCGTGACCNNG
CGCGCNTACTTNCTGTCGTTGTCGATGTTCGTCNCATCATGCGACGCTGC
TGTGTGATGTTTGGNCACAGCAGACTANTGGTCGGAGTNCGAGNCTTTAT
ACGAGTATGCAGACGCGCCGCGC
|
quality values | Open.Hide.25 25 25 15 15 15 24 19 19 24 10 10 9 9 9 19 23 34 25 11 16 10 8 8 8 6 6 6 8 8 8 13 10 11 10 12 10 11 15 30 34 43 29 23 23 29 32 30 37 32
19 16 10 6 6 6 6 7 6 8 8 10 17 24 27 24 30 37 37 48 53 48 47 47 42 36 36 37 37 37 50 43 37 37 37 37 37 42 43 43 43 43 43 43 46 43 43 43 43 47
47 47 41 41 30 19 13 10 10 10 13 18 29 36 37 39 40 46 44 57 47 44 43 44 44 57 57 57 57 57 57 57 59 57 59 57 57 57 48 48 48 48 59 57 57 57 57 50 43 35
32 28 20 24 20 20 20 32 36 37 50 50 50 50 50 50 50 50 52 52 52 43 37 37 37 50 50 50 52 52 52 57 52 52 52 57 57 57 57 52 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59
59 57 59 59 44 43 35 42 42 52 52 52 57 52 42 42 43 39 39 43 43 57 57 52 57 57 52 43 44 43 43 52 52 43 32 30 13 13 18 24 38 57 52 52 52 57 57 43 43 35
42 42 43 43 52 57 52 57 52 52 57 57 59 44 43 33 33 35 43 43 52 57 57 52 52 43 57 52 57 59 59 59 68 68 59 59 57 59 59 59 59 52 52 52 52 52 57 57 68 57
44 44 27 27 15 15 24 32 33 24 24 12 11 24 27 43 39 44 44 44 44 48 59 57 57 57 59 59 47 43 43 42 44 42 43 44 46 59 59 57 44 37 37 37 39 39 43 43 43 48
48 48 48 42 42 37 32 32 30 32 32 34 33 25 28 28 36 37 28 28 28 40 34 43 43 59 47 39 37 37 35 30 30 17 17 17 41 41 48 59 47 35 35 21 27 11 11 11 23 25
41 39 40 37 37 37 37 24 24 19 16 16 24 29 39 47 43 36 37 28 32 32 31 23 25 34 40 48 54 54 57 47 47 33 28 18 21 21 30 37 36 43 37 37 37 37 37 39 37 37
39 40 34 28 13 12 12 19 12 15 16 15 15 15 25 25 25 28 28 23 15 10 9 9 9 19 21 12 11 11 12 27 18 18 18 18 17 17 19 19 21 24 28 28 24 24 24 30 17 17
16 19 18 20 30 32 21 19 10 10 10 15 15 10 13 21 26 15 19 14 19 18 22 31 21 24 19 17 17 24 25 32 18 18 14 14 14 12 19 18 11 11 12 18 20 12 11 11 15 16
23 21 22 15 14 11 9 9 9 9 8 8 8 13 14 10 11 11 12 17 15 22 17 18 12 12 11 18 18 33 28 25 20 22 25 25 22 16 15 9 10 14 13 9 9 10 10 11 11 10
13 11 12 12 14 18 21 20 19 12 18 18 15 21 12 11 11 11 11 11 16 16 28 19 18 12 12 11 12 11 13 13 11 11 11 18 20 15 14 14 19 13 8 9 9 13 12 10 10 8
6 8 6 7 10 12 8 8 8 10 10 12 11 11 15 18 20 26 32 30 27 12 10 10 9 10 9 12 12 18 10 8 8 8 8 8 12 13 13 11 10 9 10 9 9 9 10 12 12 19
18 18 12 12 10 8 8 8 10 8 10 12 10 10 | Open.Hide. 8 8 8 8 6 6 6 6 7 7 6 6 6 6 6 6 3 0 3 6 6 6 6 6 8 3 0 3 11 17 17 3 0 3 3 0 0 3 0 0 3 0 0 3 17 15 9 3 0 3
0 3 0 3 6 6 6 6 6 7 6 6 6 7 6 7 7 7 7 6 9 8 8 8 8 8 3 0 3 6 6 6 6 6 8 8 10 8 9 9 9 3 0 3 8 8 3 0 0 3
8 6 6 6 3 0 3 6 6 6 7 9 10 8 6 6 6 6 8 3 0 3 8 8 8 8 8 8 8 10 13 10 10 7 7 10 10 10 10 10 10 8 8 8 8 6 6 6 6 6
6 10 10 11 11 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 6 6 6 6 6 6 8 10 10 6 6 6 6 6 6 9 9 10 8
8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 8 8 9 7 7 7 7 7 8 10 9 9 10 6 6 6 6 6 6 3 0 3 6 8 10
10 8 8 3 0 3 6 6 6 8 8 8 8 8 8 9 3 0 3 9 11 9 6 6 6 6 6 3 0 3 9 9 3 0 3 0 3 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8
8 8 8 8 8 8 10 10 10 10 9 9 8 8 8 10 10 10 12 12 9 9 9 11 3 0 0 3 6 6 6 10 10 7 6 6 6 8 8 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8
8 8 8 9 9 9 9 6 6 6 6 6 6 8 6 3 0 3 10 10 10 12 13 9 3 0 3 9 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 3 0 3 12
9 9 9 10 10 8 8 6 6 6 6 10 8 8 8 8 6 8 6 9 8 8 9 9 9 9 9 3 0 3 6 8 8 8 7 7 8 8 7 3 0 3 9 8 8 8 8 6 6 8
8 8 8 3 0 3 6 6 6 8 3 0 3 6 6 6 6 6 8 8 6 6 8 8 9 9 3 0 3 6 6 6 6 7 7 8 8 10 10 9 10 10 10 8 8 8 6 6 6 8
8 9 8 8 6 6 6 6 6 6 8 8 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 7 7 9 10 10 11 10 10 10 11 8 8 8 8 8 8 8 8 6 8 8 8 8 10 9 11 15 11
11 11 10 9 8 7 3 0 3 3 0 3 6 6 6 6 6 8 10 10 9 10 9 9 13 11 11 10 9 9 9 11 6 6 6 6 8 8 7 7 6 6 9 9 10 10 12 18 18 8
7 7 8 6 6 8 8 8 8 6 6 8 6 3 0 3 6 6 6 3 0 3 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 6 6 8 8 11 12 3 0 3 8 8 8 8 11 15 14 10
9 8 10 7 7 7 8 6 8 8 8 8 8 8 8 8 9 8 8 8 9 10 11 11 8 8 7 8 8 8 8 3 0 3 8 6 6 6 6 6 6 6 6 7 6 8 8 8 8 6
8 8 8 7 8 3 0 3 10 10 10 11 11 11 11 11 9 9 9 9 10 9 8 8 8 8 7 7 7 9 8 8 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 11 11 8 9 9 9
9 8 8 10 10 10 11 9 9 9 11 9 9 9 9 9 10 13 12 11 11 12 8 8 6 6 8 6 6 8 8 10 8 10 10 6 6 3 0 3 8 9 9 9 9 9 7 8 10 8
6 8 6 6 8 6 8 8 3 0 3 6 8 8 8 8 6 6 6 6 9 9 9 9 9 9 8 8 6 7 10 10 8 8 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8
10 10 14 14 10 9 8 12 8 8 8 7 6 6 6 7 8 9 9 10 10 6 8 6 6 8 10 9 7 7 6 6 8 8 8 12 11 11 10 10 10 8 8 8 8 6 6 6 6 6
6 6 8 8 8 8 10 12 8 9 6 13 7 6 8 8 6 6 7 7 8 8 8 10 10 6 6 8 6 8 10 8 8 9 9 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8
8 8 9 8 8 10 8 8 8 10 9 9 8 8 9 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 8 6 8 10 10 10 8 6 6 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 10 8
9 6 6 6 6 8 8 8 8 6 6 9 9 8 8 8 8 8 10 16 11 11 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 6 6 6 8 8
8 9 8 9 9 9 8 8 9 12 8 8 6 6 7 6 6 6 6 7 7 8 10 8 9 9 9 12 11 11 8 8 8 6 6 6 12 12 16 11 11 10 10 8 7 7 7 9 9 8
8 8 8 8 6 6 3 0 3 8 8 3 0 3 8 6 3 0 3 6 6 3 0 3 8 6 6 6 6 6 8 10 10 9 9 3 0 3 6 6 7 8 6 6 6 8 8 8 8 8
8 8 8 8 8 8 8 8 10 11 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 11 9 9 9 3 0 3 11 11 6 8 6 6 8 8 10 11 6 8 6 6 6 8 10 10 10 12 9 6
6 6 6 8 6 9 3 0 3 3 0 3 11 9 8 8 8 8 8 10 12 11 11 10 8 8 8 6 6 6 6 8 6 8 8 8 6 6 6 6 8 8 6 6 6 7 6 6 6 6
8 6 9 9 9 9 9 9 9 10 6 6 6 6 6 6 8 8 8 10 12 3 0 3 11 10 10 8 6 6 6 6 6 6 6 6 6 7 6 6 6 10 10 11 9 9 9 9 8 8
10 10 11 8 9 9 3 0 3 3 0 3 12 10 8 10 8 8 8 7 9 9 10 10 9 10 10 8 6 6 6 6 6 6 8 8 3 0 3 9 8 8 6 6 6 8 8 8 8 8
8 6 6 6 6 6 10 8 10 11 13 9 9 6 6 6 6 6 6 7 8 8 8 8 10 8 8 6 6 6 6 8 6 6 6 6 6 6 7 7 8 3 0 3 9 8 8 9 9 6
6 6 6 10 6 8 10 8 8 6 6 6 6 3 0 3 8 8 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 10 10 10 10 10 10 8 8 8 7 7 7 7 8 8 8 8 8 8 8 8 8
8 7 8 8 8 6 8 3 0 3 3 0 3 6 8 8 8 8 8 11 10 6 8 6 6 6 3 0 3 9 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 11 8 11 8 8 6 6 6 6 9
8 8 9 9 8 8 10 10 10 8 8 8 8 12 8 11 3 0 0 3 8 8 6 6 6 6 7 6 6 6 7 6 6 6 8 10 8 8 10 8 8 9 3 0 3 8 3 0 3 6
6 6 9 6 10 9 9 9 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 9 6 7 6 6 8 6 6 7 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 6 6 7 12 12 12 11 11 11 10 10
13 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 8 11 12 12 10 3 0 3 8 8 8 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 8 8 6 3 0 0 3 8 8 8 8 8 8 8 6 6
6 6 3 0 3 6 6 6 6 6 8 9 9 8 3 0 3 6 6 6 3 0 3 8 3 0 3 8 8 6 6 6 6 8 6 3 0 3 6 6 8 8 8 8 8 6 6 3 0 3
8 8 14 11 9 9 3 0 3 9 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 10 6 6 6 6 3 0 3 8 8 8 7 6 6 6 7 3 0 0 3 9 9 9 6 6 8 8 8 8 8
8 8 8 8 6 8 6 6 6 6 6 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 8 7 9 7 8 10 9 9 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 8 6
6 6 6 6 6 8 8 6 6 8 10 8 6 6 6 8 10 8 8 8 8 8 8 8 11 11 3 0 3 9 9 3 0 3 3 0 3 0 0 3 8 8 8 6 7 7 8 6 3 0
3 3 0 3 6 8 3 0 3 6 6 6 8 8 3 0 3 6 6 8 8 8 10 10 3 0 3 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 9 9 9 9 9 8 11 8 8 8 8 3
0 3 6 6 6 3 0 3 11 9 8 7 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 11 11 11 11 11 3 0 3 7 8 6 6 6 6 6 6 6 6 6 10 8 8 6 3 0 0 3
10 8 8 10 3 0 3 6 6 6 3 0 3 6 6 6 6 6 7 8 8 6 6 6 6 6 6 9 11 8 8 8 3 0 3 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 6 6 8 8
8 9 12 10 6 6 6 6 6 7 6 6 6 3 0 3 13 10 9 9 9 9 9 9 9 9 3 0 3 6 6 6 6 6 8 8 8 3 0 3 8 8 3 0 3 6 6 6 6 6
6 6 6 6 8 10 11 11 11 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 10 12 9 9 |