BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-482A16.T7 (MSMg01no482_a16.b1) | MSMg01-482A16.TJ (MSMg01no482_a16.g1) |
ACC | AG562306 | AG562307 |
length | 706 | 757 |
length of high quality (start - end) | 243 (47 - 289) | 560 (79 - 638) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no482_a16.b1 PHD_FILE: MSMg01no482_a16.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 20:02:52 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no482_a16.g1 PHD_FILE: MSMg01no482_a16.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 20:02:52 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | CTCAAATACGAAACAGGATCCGCGGAATTCCCAATACCCTAAATTCTGGT
TCTCTCCTGTACCAGTGCTTCTATGCAAGATTTAAAACACACACACACAC
ACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACATTA
ACATGCCACAGAGGGTGTGTGGACATTGCAGGACAACTTTCTGGAGTCCA
TTCTCTCCTTCTACCATGAAAGACCGCATGTGGAACTCAGGCCATCAGTT
TTGGTGGCAGGTACCTTTACCCACTGACCCATCTTGCTGTTTTCTGTAAC
CTAGTTTATATACATGCATATTGAGGGTTATACGAACAGTTTTTTGGGTG
CAAAGCAGTTATGAGCGGAACAACCTAAAGGAGCCGTGGTCTATGGGATT
TTACCGCTGCCATCCTGCAGACACAAACTGCCAGGACTGGACAAAACTAG
GTTTTGGCTTTGTTTTGTTTTGCTTTTTGCCTTTTTTGGTTAGAGAAATC
TCAAATAACAGTTTTCCCCCCTTTACCAAACAAGATGAACACAGCCTCCC
GAAGAACTAACTGGAAAACCTAAGCATGTTGGGCAGGTGATTTCCAGGTC
ATTTTCCACAGGAGCCCAATGACGCCTTGAAAACGTACCACCAAGACATC
CCCACCGGGCACAGCTCAGAATTTTTCTTCTTTCAACACAACCAATCCGT
GGCGAG
| CCATGAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXAGCACTTGACTCCCCCCCTCCC
CCCACACACACACCCCAGCCTCTGAGTCCCAGGGTCACCTTCAGACATGG
CATTGCCTGGTCAGTGAGGATGGAAAAGTCAAGGCCACCACCACAGCAGA
AGTAGGGCCACCACCACCTAAAACTTAAAACAAAGCAAAGGCCCTCTCAC
TCTCCCCCATGCTGTCTTTTTGGTCTTTGAGCAGCATTTATTTCTGTGTA
GCATTAATGATAATTATACCCCCACACACACTGTGGTGGGGCACTCAGAG
TTCTTTGTGTCTTGCTCATTGCTAAACACCCCCGCCCTCCGCCACATCTA
ACAGATGACCAAGTAGACATCAGACCAAACCCACGCGTCAGTCAGCGCTA
GAGCTCGGAGTGAGGTCTGTCTAGGGTGTGCTTGTTTTGACTGCCATTTA
GCTAGCTGTTCATGGTGAATTACCTGGAGACGGAACAGAAGCAAGAGAGA
GGCAGATTCACAAGCGCTGGGATGATTAGAGATTGTGAACACCCAGCTGT
CAATCTCATTACTGACGTTAGTATTTTCAGTCCCATTTAGAACACAGGGG
GCAAAGTCTGAAAGGGGGAGACATTTCTGAGACTGTTGAACAGGCACATC
AGTGACTCACCGGCTGTTGCCTTGAGCTGTCTTGATCCGGCCTCTTTTAA
CCTCCTG
|
quality values | Open.Hide. 6 8 8 6 6 6 6 6 6 6 6 7 6 6 6 6 6 11 10 10 19 32 39 39 37 32 32 25 22 10 10 9 9 9 9 10 10 15 12 15 21 31 20 17 19 15 22 22 28 34
47 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 47 47 42 42 47 57 57 57 57 57 57 57 53 50 50 50 50 54 57 68 68 68 68 57 44 40 28 25 25 25 24 27 36 42 30 30 31 44 44
57 57 57 48 48 44 37 42 42 47 47 47 47 47 57 57 47 47 47 47 47 47 57 57 57 57 57 50 48 43 44 35 32 28 23 23 25 32 32 43 27 21 20 17 17 17 17 17 17 24
32 42 43 42 42 43 44 27 18 11 11 26 27 24 42 42 44 44 52 52 52 52 52 57 57 57 57 43 43 27 27 27 44 44 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 50 43 42 35 43 43
57 48 50 50 57 50 50 48 47 47 47 47 47 48 47 47 57 57 59 47 28 24 13 15 13 12 13 13 24 32 32 48 47 47 57 57 32 32 12 12 12 25 27 43 36 31 22 22 22 44
34 42 35 35 35 35 28 34 30 35 32 37 28 32 32 42 40 48 48 48 48 48 48 39 39 39 39 33 33 39 37 37 37 40 40 23 25 12 11 11 9 11 9 9 9 9 11 16 16 27
23 30 25 23 28 23 26 31 32 32 37 39 39 43 39 43 39 43 43 43 43 43 59 59 43 37 32 32 24 26 24 21 11 11 11 21 22 16 19 19 23 23 25 24 24 32 24 30 31 31
29 29 22 20 18 18 16 16 23 21 30 19 19 12 12 12 18 10 11 8 6 8 6 6 8 12 16 30 28 19 19 17 17 17 26 26 28 28 28 28 37 41 57 47 39 37 24 24 24 24
30 33 33 37 37 37 39 43 32 31 30 30 24 30 28 32 19 15 8 8 8 8 15 26 26 26 21 24 28 28 23 24 12 11 11 17 25 28 29 32 35 37 28 24 18 20 15 23 23 20
20 20 18 19 24 30 22 25 25 31 34 19 19 15 15 15 19 15 21 19 19 18 14 20 20 17 10 9 10 12 10 10 10 11 10 10 10 17 16 14 14 14 18 14 15 14 28 21 23 15
15 14 15 16 18 15 15 13 21 21 21 33 23 23 19 24 22 28 31 28 28 28 10 9 12 9 7 8 12 10 6 6 6 10 10 17 24 16 16 10 10 9 9 10 10 11 12 9 8 10
11 10 9 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 12 19 15 20 16 20 24 21 18 18 8 6 6 7 6 8 14 16 15 13 8 8 6 6 8 10 12 22 10 8 8 8 9 9 10 10
10 10 13 12 13 7 6 6 6 6 6 10 10 13 15 19 10 10 8 8 8 10 10 10 8 8 10 13 10 12 12 14 12 15 8 8 7 6 6 6 7 6 10 8 6 6 6 8 8 9
9 13 13 17 16 9 9 9 11 12 9 8 8 8 8 8 8 8 10 12 10 10 11 16 12 11 11 9 9 10 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 7 6 6 6 8 8 8 10 8 11
10 10 10 10 9 9 | Open.Hide. 9 9 9 14 15 8 8 8 8 17 3 0 3 23 23 37 37 37 37 41 41 43 39 39 37 32 31 37 32 30 25 18 9 9 9 12 12 10 11 13 19 19 27 28 37 30 25 19 21 11
11 10 21 21 41 42 41 37 23 23 10 9 10 10 11 10 18 18 30 21 19 18 21 28 27 39 46 59 41 50 50 47 47 50 50 53 50 50 50 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59
53 50 48 48 48 42 42 42 47 42 50 50 50 50 50 50 50 50 50 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 54 54 68 68 68 68 51 50 50 50 50 50 50 50 43 51 50
68 68 68 68 50 57 57 57 57 50 53 50 50 50 53 53 50 36 36 36 36 36 36 59 50 39 37 37 37 37 37 41 37 37 39 41 39 41 47 47 47 48 48 48 48 48 48 47 42 42
41 39 39 39 37 39 39 39 39 39 42 47 47 48 59 48 48 59 59 59 57 57 57 57 57 48 48 48 57 57 57 57 57 57 59 59 57 57 59 59 59 68 68 68 57 57 57 57 57 59
59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 48 59 59 59 59 59 59 44 43 43 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 57
57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 54 54 57 57 57 54 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 68 59 59 57 52 52 57 59
59 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62
62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 43 44 39 39 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 52 52 62 59 59 68 68 68 59 59 59 59 45 57 57 57 57
57 57 57 57 57 57 57 57 57 54 57 57 59 59 59 59 57 57 57 57 52 52 52 57 57 57 59 59 57 57 57 59 57 52 52 57 59 57 57 57 57 57 52 57 52 57 57 57 57 52
43 44 43 43 52 59 57 52 52 52 57 57 52 57 37 37 37 57 44 57 54 54 54 50 50 44 57 57 57 57 48 48 48 44 44 32 27 23 44 44 57 57 57 57 59 59 59 43 44 44
57 44 44 43 57 44 32 32 20 20 20 32 32 48 48 44 44 36 39 30 43 42 46 46 42 32 32 29 32 26 27 26 37 37 31 32 35 40 40 28 28 25 32 32 43 43 39 39 37 37
35 39 39 34 34 33 25 24 20 20 30 32 41 34 34 28 28 28 31 31 35 35 35 39 36 39 39 30 30 37 35 37 39 35 30 30 24 25 15 15 14 16 21 24 24 19 20 22 24 28
28 27 30 30 39 32 26 24 24 30 22 29 32 22 22 28 29 29 30 28 28 33 20 24 24 20 16 13 19 15 17 15 23 24 31 30 30 30 25 10 10 8 7 6 6 6 10 14 19 12
12 24 18 17 19 13 15 12 15 10 11 10 10 10 13 15 11 11 9 9 9 15 28 34 23 22 20 21 19 19 21 15 18 24 23 23 20 17 15 12 11 11 10 10 14 17 34 23 17 11
10 8 9 11 13 10 10 |