BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-500D01.T7 (MSMg01no500_d01.b1) | MSMg01-500D01.TJ (MSMg01no500_d01.g1) |
ACC | AG576090 | AG576091 |
length | 684 | 689 |
length of high quality (start - end) | 244 (61 - 304) | 580 (59 - 638) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no500_d01.b1 PHD_FILE: MSMg01no500_d01.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 20:26:47 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no500_d01.g1 PHD_FILE: MSMg01no500_d01.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 20:26:47 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | CGCTAAACGACTCACTATAGGTTTCAGAATCCGCGGAATTCCAGACTTCT
TTCCGACAACAAGGAACCAAAATGAGCACCCAGAACCTGGCTCTGCCCTG
GCAGACATCTTGAGTTCTATGCTGGGCTTTGCAAAAAGCACTTAGCCTGT
GCCTAAACAGAATCTGTAAAATAAAACACCTATTGTGTTTAAAGCAACTC
AGTTTGTGCTGATTTGTGATGAGGAAACAGAAAATCAATCCCTGCTCCTT
ACACATGAATACATTAAATCTCAGATGACTCAAACAGGGAGACTGAGGCA
GCGGTATTCNTTAAGTTGGCCCAACCTGGGTTCCATGGGGAGTACCAGGA
AGCCCAGGGAGACTGCTAGGGCTAGCATACGAAGAGATTGGGTGGGGGGA
TGCATTTCTGCAGTAAAGCATAACTTGTCTTAGCCACTGCAATTTCAGGG
CAACTACAATTCATCTGGGTTTTTCTTCACATTCTGCTTCTAGCTCTGGA
AGCCTGAAGTAGGGCCCCGATTCGATTCGGCACCTAGGAGAAAAACTATT
GGTGGGGATGTTCAACATTTATTGGCTGTGCACACACCCCAATGCCCCTA
CTTATTGATCCCTATCCCAGCTACCCGTTTACAAAGGATCCCCAAGAGAC
TGAGTCAGGCATCTTTTTCCCTGCCACTCACCAN
| XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXTCACCTGAGGAATACCGAATGGCAGAGAAGCACCTGAAAAAA
TGTTCAACATCCTTAATCATCAGGGAAATGCAAATCAAAACAACCCTGAG
AATCCACCTCACACCAGTCAGAATGGCTAAGATCAAAAATTCAGGTGACA
GCAGATGCTGGTGAAGATGTGGAGAAAGAGGAACACTCCTCCATTGTTGG
TGGGATTGCAAGCTTGTACAACCACTCTGAAAATCAGTCTGGCGGTTCCT
CAGAAAATTGGACATAGTACTACCGGAGGATCCAGCAATACCTCTCCTGG
GCATATATCCAGAAGATGTCCCAACCGGTAAGAAGGACACATGCTCCACT
ATGTTCATAGCAGCCTTATTTATAATAGCCAGAAGCTGGAAAGAACCCAG
ATGCCCCTCAACTGAGGAATGGATACAGAAAATGTGGTACATTTACACAA
TGGAGTACTATTCAGCTATTAAAAAGAATGAATTTATGAAATTCCTAGGC
AAATGGATGGACCTGGAGGGCATCACCCTGAGTGAGGTAACCCAATCACA
AAGGAACTTGCACAATATGTACTCACTGATAAGTGGATATTAGCCCAGAA
ACTTAGGATACCCAAGATATAAGATACAATTTGCTAAAA
|
quality values | Open.Hide. 9 13 21 17 9 9 9 21 21 41 28 28 28 28 28 30 29 29 8 6 6 6 7 6 6 6 6 8 9 9 9 9 15 22 21 27 28 28 31 33 31 39 37 37 37 27 27 11 11 12
17 8 8 6 6 8 8 10 10 10 21 19 30 37 37 37 36 37 37 44 44 53 53 47 47 39 37 32 32 30 25 19 35 35 37 32 43 42 43 42 43 43 46 42 57 48 48 40 40 44
42 54 32 32 20 28 28 43 44 48 57 57 48 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 54 54 57 57 59 59 44 44 44 50 44 44 34 19 13 26 32 50 50
43 42 42 43 44 44 52 52 52 50 50 50 42 47 50 59 59 68 68 68 68 68 68 57 57 52 52 52 52 52 52 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 54 54 54 52 52 38 38
20 41 41 68 68 59 59 54 57 57 57 57 68 68 68 59 57 47 50 50 57 57 59 59 57 57 42 42 37 48 48 68 43 57 44 39 28 32 13 18 18 28 41 44 47 48 48 48 57 57
57 54 54 57 54 68 68 68 57 57 48 48 48 59 59 68 68 68 59 57 37 37 23 37 37 59 59 59 59 42 39 35 59 35 43 43 44 44 57 39 39 39 43 43 44 44 50 50 59 41
34 28 17 12 9 6 6 6 3 0 3 10 11 13 17 30 59 59 59 59 35 39 39 59 59 59 59 59 59 57 57 57 48 48 48 59 59 57 57 57 57 43 43 35 37 37 28 32 28 28
29 39 39 39 39 41 37 41 47 41 41 41 48 57 57 59 59 59 59 59 54 54 54 59 59 57 59 44 37 23 23 44 44 68 57 57 57 57 57 54 54 59 59 59 59 68 68 68 68 68
54 54 54 54 54 59 59 57 57 59 47 43 43 43 46 43 48 54 54 54 59 59 59 59 59 59 47 43 43 34 37 37 48 48 57 57 57 50 59 59 59 59 59 47 47 44 44 44 39 41
44 44 44 47 47 50 50 50 43 44 43 48 48 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 54 57 57 59 59 59 59 59 59 48 48 48 48 48 59 48 48 48 59 57
54 54 57 57 57 57 57 54 48 48 57 57 44 32 32 30 37 30 36 32 32 32 22 22 28 38 40 37 41 37 42 42 39 32 24 14 14 15 19 32 37 42 42 48 48 48 54 46 59 39
37 35 41 42 41 37 39 36 43 36 43 43 43 43 39 36 36 43 43 42 39 39 33 40 40 47 39 35 35 36 43 43 37 37 35 35 35 39 37 40 39 37 37 35 31 32 37 37 37 37
35 34 34 41 43 43 37 37 30 25 25 37 37 39 39 37 34 28 20 20 28 30 33 33 33 30 27 22 31 23 19 14 14 14 23 15 20 13 13 9 9 10 10 14 14 16 17 14 23 21
15 15 10 10 10 10 18 20 25 21 21 12 13 15 21 26 30 32 29 29 35 37 32 25 16 17 17 18 17 18 14 12 3 0 | Open.Hide.14 15 25 25 39 42 42 42 48 50 50 50 50 41 30 23 12 9 11 9 9 9 9 9 15 21 32 28 34 37 44 36 50 50 42 47 50 59 59 59 53 53 43 23 13 19 10 9 9 11
12 12 10 14 27 32 41 41 42 47 47 47 41 36 42 48 50 40 48 41 41 41 41 48 48 57 57 57 57 57 57 48 57 57 68 44 48 42 31 32 28 39 42 47 44 68 68 50 48 46
46 42 48 50 47 47 50 50 57 57 57 54 54 57 57 57 52 52 52 43 43 32 42 42 57 48 48 48 50 50 41 41 28 28 15 13 11 18 18 44 43 43 43 32 42 43 30 30 38 38
38 40 27 32 30 33 42 40 40 35 32 30 42 34 44 36 28 28 41 34 32 15 21 21 32 38 43 41 39 42 28 28 31 31 31 32 33 33 33 33 29 21 27 41 41 32 31 43 43 43
32 28 24 12 12 25 28 40 47 59 57 57 57 57 47 47 27 27 19 23 20 34 41 59 59 59 37 39 27 23 23 30 34 37 41 41 41 46 48 43 43 40 40 41 37 59 59 43 43 30
28 24 29 16 16 26 35 34 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 48 48 54 59 57 54 54 57 57 54 57 57 57 57 57 59 43 47 59 59 59 59 59 44 44 33 42 42 32
32 27 44 44 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 68 68 68 59 59 57 57 54 50 57 57 51 50 50 50 50 52 52 52 52 52 59 59 57 50 57 52 52 52 52 43 59 59 59
57 57 57 59 59 68 59 59 57 52 52 59 59 57 57 57 57 57 57 52 57 57 52 57 52 57 57 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 52 57 59 59
68 68 59 59 52 52 52 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 68 68 59 59 57 57 52 57 57 57 57 52 52 52 57 57 59 68 68 68 57 57 57 57 57 52 52 52
52 44 38 52 52 52 43 44 44 57 59 57 57 57 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 48 48 48 57 57 59 57 59 54 47 47 57 57 57 57 57 57 59 57 57 44 37 37 37 57
57 57 57 54 47 54 57 57 57 57 57 44 37 35 35 39 42 42 47 48 48 68 54 57 57 46 46 46 46 46 48 48 54 54 54 54 50 50 50 57 59 59 59 59 39 39 30 33 33 43
43 48 57 48 48 48 48 42 41 41 41 41 41 37 29 31 32 31 31 41 34 37 32 32 35 35 39 43 41 41 37 39 39 39 39 30 30 30 30 30 37 37 37 40 43 40 40 40 39 39
41 41 37 37 37 37 34 34 24 23 18 29 30 43 43 48 48 59 57 48 47 43 43 36 36 36 36 36 30 24 24 30 30 43 34 27 22 12 11 12 11 17 17 16 16 19 14 22 17 27
32 41 30 24 13 11 12 19 19 30 22 21 24 25 31 28 21 15 15 18 30 25 41 31 26 27 24 20 20 30 32 43 37 37 37 21 21 15 15 |