MoG+ -Mouse Genome database with high added value-

BAC Information

BAC name
Region	Chromosome -
Gene	search by nearby gene name.
Format	rows / page	Page	1

BAC

Clone Name	B6Ng01-004C17
Chromosome	9 (Build37)
Map Location	94,988,689 - 94,989,592
singlet/doublet	singlet
Overlap gene	Slc9a9
Upstream gene	LOC384967, EG384968, 1190002N15Rik, EG667601
Downstream gene	Chst2, LOC667088, 2610101N10Rik, LOC100040097, Paqr9, Pcolce2, Trpc1, AI427122, 1700065D16Rik, Xrn1
Link	Open Mouse BAC browser

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BAC End Information

BAC end	BAC-end 1	BAC-end 2
end name	B6Ng01-004C17.b	B6Ng01-004C17.g
ACC	DH841655	DH841656
length	899	1,212
definition	DH841655\|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-004C17, 5' end.	DH841656\|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-004C17, 3' end.
singlet/doublet	singlet	---
BLAST hit	unique	no hit data
sequence	gaattcctctaatagactgaccgggtacatcctgtgtgcttctcaggatg tggcatggactggacagaaaggaagctggcactagggttgcacccagcca gagactggctgcatagccttgaggaagttatttatttactttgaaagatt cgggctactgatttatgacatggacaaagtactacttttcttgaaggggt gtagggaggattagcaatgagttttgggatgttcttggtgttaacaggca tccagtcaatcaaaggtaaacttaggtattgttacatagctgagcatgaa gatggaaattcagtgacagagtgccctcaataatgggtccattattgttg gagcatcttctcccctcctgcttctactttaccccggaaatgcccagaaa gggtgaggagtccatagaattgcaacctttgatgccctgttgctgtctcc agcacttaggaatcatgtgatcactttaacttttgttgggctttctattg ttccccctcagtggggtgataggtcttataattctgacttcacattgtgg taagaagcatggggatgcatatttgggggggggtcatatttgactggttc tacctgccagatgctgtacagagcaactgttcggtattcatttaaacatc acagccactctggtagcttgcaggggtaggtggggaaagcatttttaagt ccaaggaacaaggctcagagatgttgagtcagttgttcaaggttacatac caagtgaaaatccagtagttggccctggccctgtgttctgcctgctacac ttcatggcctctgaaatgttttatagctataaccattttagagttaaaaa aaccatgctgatcctacagagtacattagaatgcggctctcggtttctc	gaattccattcaatgtattttaatcacattccccaccccccaacttttct cagatcctccatcaaacccttacctgcccaacattgtgtcttcttctttt tttaaaaccttggattccaatttgtgctgttcttatattcttgaatgtgt agccttctaccagagcattcttaaagaaaatccaccaccaccaccaccac caccaccaccaccaccaccaccaccacccccactcctggcagcattcaat tgccaatagctcctcatgcagttgtgggacttggtgcccatctctccttt ccatgctagactttcgtatggctttagctggcataggtctcttgcatccc atcagccactgtaagttcatacatgcagctgccctgctgtgttcaggaaa ggattgaaccttgtagttatctctgcctctttcagcccttgagctttgag agaaggggttggcatatgcacatcccatttaggggtgagaaatatgcagt ttcttattctctgcaccttgaccagttgtgagcctgtgtgttaataacca cctactgcaaatagaagcttctctgataagggtttatatgcacattaata taggcttatgaagataagtcactaggagtcagtttaatagtatgttcgtt tagcagaatagtaccaagttctcccctagagactatgacctgtctaggaa tgggtttcaccttgtagagcaggcttaaatcaaatcagagagtgattggt tacacccattatgttcatgccactgtttgccccagtgagcatgtattgtt agatcagtcagtgctgtggctcccagagttcatagctggataagacagat gactcctttctcctccagtaggacgcatgcacaggaccttctaacactat gaaagctagtccatgtggatgaagcttgagttctctgagctctgtgattc agagattcagaggctgtcttcagaaatagggtcgaactatcaatcagtag cattgcatagtctgtattgtttagagtcttaggactcatagacaaacagc caaagagtatccacctctgaccctttcttcttgccttctttaccctgctg atcccaacctggctttaaacctctgttcattaaccctttaaatctttatt aactggttacccacctctgtagcctgcctaatggtcaaactctatgggga tctcccctacta
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Alignment Information

BAC End 1	BAC End 2
seq1: chr9_94988689_94989592 seq2: B6Ng01-004C17.b_44_942 (reverse) seq1 GAGAAACCGAGAGCCTGCATTCTTAATGTACTCTGTAGGATCAGCATGGT 50 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 GAGAAACCGAGAGCC-GCATTC-TAATGTACTCTGTAGGATCAGCATGGT 48 seq1 TTTTTTTAATCTCTAAACTGGTTATAGCTATAAAACATTTCAGGAGGCCA 100 \|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| seq2 TTTTTT--AACTCTAAAATGGTTATAGCTATAAAACATTTCA-GAGGCCA 95 seq1 TGAAGTGTAGCAGGCAGAACACAGGGCCAGGGCCAACTACTGGATTTTCA 150 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 TGAAGTGTAGCAGGCAGAACACAGGGCCAGGGCCAACTACTGGATTTTCA 145 seq1 CTTGGTATGTAACCTTGAACAACTGACTCAACATCTCTGAGCCTTGTTCC 200 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 CTTGGTATGTAACCTTGAACAACTGACTCAACATCTCTGAGCCTTGTTCC 195 seq1 TTGGACTTAAAAATGCTTTCCCCACCTACCCCTGCAAGCTACCAGAGTGG 250 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 TTGGACTTAAAAATGCTTTCCCCACCTACCCCTGCAAGCTACCAGAGTGG 245 seq1 CTGTGATGTTTAAATGAATACCGAACAGTTGCTCTGTACAGCATCTGGCA 300 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 CTGTGATGTTTAAATGAATACCGAACAGTTGCTCTGTACAGCATCTGGCA 295 seq1 GGTAGAACCAGTCAAATATGACCCCCCCCCAAATATGCATCCCCATGCTT 350 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 GGTAGAACCAGTCAAATATGACCCCCCCCCAAATATGCATCCCCATGCTT 345 seq1 CTTACCACAATGTGAAGTCAGAATTATAAGACCTATCACCCCACTGAGGG 400 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 CTTACCACAATGTGAAGTCAGAATTATAAGACCTATCACCCCACTGAGGG 395 seq1 GGAACAATAGAAAGCCCAACAAAAGTTAAAGTGATCACATGATTCCTAAG 450 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 GGAACAATAGAAAGCCCAACAAAAGTTAAAGTGATCACATGATTCCTAAG 445 seq1 TGCTGGAGACAGCAACAGGGCATCAAAGGTTGCAATTCTATGGACTCCTC 500 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 TGCTGGAGACAGCAACAGGGCATCAAAGGTTGCAATTCTATGGACTCCTC 495 seq1 ACCCTTTCTGGGCATTTCCGGGGTAAAGTAGAAGCAGGAGGGGAGAAGAT 550 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 ACCCTTTCTGGGCATTTCCGGGGTAAAGTAGAAGCAGGAGGGGAGAAGAT 545 seq1 GCTCCAACAATAATGGACCCATTATTGAGGGCACTCTGTCACTGAATTTC 600 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 GCTCCAACAATAATGGACCCATTATTGAGGGCACTCTGTCACTGAATTTC 595 seq1 CATCTTCATGCTCAGCTATGTAACAATACCTAAGTTTACCTTTGATTGAC 650 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 CATCTTCATGCTCAGCTATGTAACAATACCTAAGTTTACCTTTGATTGAC 645 seq1 TGGATGCCTGTTAACACCAAGAACATCCCAAAACTCATTGCTAATCCTCC 700 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 TGGATGCCTGTTAACACCAAGAACATCCCAAAACTCATTGCTAATCCTCC 695 seq1 CTACACCCCTTCAAGAAAAGTAGTACTTTGTCCATGTCATAAATCAGTAG 750 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 CTACACCCCTTCAAGAAAAGTAGTACTTTGTCCATGTCATAAATCAGTAG 745 seq1 CCCGAATCTTTCAAAGTAAATAAATAACTTCCTCAAGGCTATGCAGCCAG 800 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 CCCGAATCTTTCAAAGTAAATAAATAACTTCCTCAAGGCTATGCAGCCAG 795 seq1 TCTCTGGCTGGGTGCAACCCTAGTGCCAGCTTCCTTTCTGTCCAGTCCAT 850 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 TCTCTGGCTGGGTGCAACCCTAGTGCCAGCTTCCTTTCTGTCCAGTCCAT 845 seq1 GCCACATCCTGAGAAGCACACAGGATGTACCCGGTCAGTCTATTAGAGGA 900 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 GCCACATCCTGAGAAGCACACAGGATGTACCCGGTCAGTCTATTAGAGGA 895 seq1 ATTC 904 \|\|\|\| seq2 ATTC 899

BAC End 1

BAC End 2

seq1: chr9_94988689_94989592
seq2: B6Ng01-004C17.b_44_942 (reverse)

seq1  GAGAAACCGAGAGCCTGCATTCTTAATGTACTCTGTAGGATCAGCATGGT  50
      ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAAACCGAGAGCC-GCATTC-TAATGTACTCTGTAGGATCAGCATGGT  48

seq1  TTTTTTTAATCTCTAAACTGGTTATAGCTATAAAACATTTCAGGAGGCCA  100
      ||||||  | ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||
seq2  TTTTTT--AACTCTAAAATGGTTATAGCTATAAAACATTTCA-GAGGCCA  95

seq1  TGAAGTGTAGCAGGCAGAACACAGGGCCAGGGCCAACTACTGGATTTTCA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAGTGTAGCAGGCAGAACACAGGGCCAGGGCCAACTACTGGATTTTCA  145

seq1  CTTGGTATGTAACCTTGAACAACTGACTCAACATCTCTGAGCCTTGTTCC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGGTATGTAACCTTGAACAACTGACTCAACATCTCTGAGCCTTGTTCC  195

seq1  TTGGACTTAAAAATGCTTTCCCCACCTACCCCTGCAAGCTACCAGAGTGG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGACTTAAAAATGCTTTCCCCACCTACCCCTGCAAGCTACCAGAGTGG  245

seq1  CTGTGATGTTTAAATGAATACCGAACAGTTGCTCTGTACAGCATCTGGCA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTGATGTTTAAATGAATACCGAACAGTTGCTCTGTACAGCATCTGGCA  295

seq1  GGTAGAACCAGTCAAATATGACCCCCCCCCAAATATGCATCCCCATGCTT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTAGAACCAGTCAAATATGACCCCCCCCCAAATATGCATCCCCATGCTT  345

seq1  CTTACCACAATGTGAAGTCAGAATTATAAGACCTATCACCCCACTGAGGG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTACCACAATGTGAAGTCAGAATTATAAGACCTATCACCCCACTGAGGG  395

seq1  GGAACAATAGAAAGCCCAACAAAAGTTAAAGTGATCACATGATTCCTAAG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAACAATAGAAAGCCCAACAAAAGTTAAAGTGATCACATGATTCCTAAG  445

seq1  TGCTGGAGACAGCAACAGGGCATCAAAGGTTGCAATTCTATGGACTCCTC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTGGAGACAGCAACAGGGCATCAAAGGTTGCAATTCTATGGACTCCTC  495

seq1  ACCCTTTCTGGGCATTTCCGGGGTAAAGTAGAAGCAGGAGGGGAGAAGAT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCCTTTCTGGGCATTTCCGGGGTAAAGTAGAAGCAGGAGGGGAGAAGAT  545

seq1  GCTCCAACAATAATGGACCCATTATTGAGGGCACTCTGTCACTGAATTTC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCCAACAATAATGGACCCATTATTGAGGGCACTCTGTCACTGAATTTC  595

seq1  CATCTTCATGCTCAGCTATGTAACAATACCTAAGTTTACCTTTGATTGAC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCTTCATGCTCAGCTATGTAACAATACCTAAGTTTACCTTTGATTGAC  645

seq1  TGGATGCCTGTTAACACCAAGAACATCCCAAAACTCATTGCTAATCCTCC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGATGCCTGTTAACACCAAGAACATCCCAAAACTCATTGCTAATCCTCC  695

seq1  CTACACCCCTTCAAGAAAAGTAGTACTTTGTCCATGTCATAAATCAGTAG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTACACCCCTTCAAGAAAAGTAGTACTTTGTCCATGTCATAAATCAGTAG  745

seq1  CCCGAATCTTTCAAAGTAAATAAATAACTTCCTCAAGGCTATGCAGCCAG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCGAATCTTTCAAAGTAAATAAATAACTTCCTCAAGGCTATGCAGCCAG  795

seq1  TCTCTGGCTGGGTGCAACCCTAGTGCCAGCTTCCTTTCTGTCCAGTCCAT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCTGGCTGGGTGCAACCCTAGTGCCAGCTTCCTTTCTGTCCAGTCCAT  845

seq1  GCCACATCCTGAGAAGCACACAGGATGTACCCGGTCAGTCTATTAGAGGA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCACATCCTGAGAAGCACACAGGATGTACCCGGTCAGTCTATTAGAGGA  895

seq1  ATTC  904
      ||||
seq2  ATTC  899

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