BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-010D22
Chromosome9 (Build37)
Map Location 64,034,464 - 64,056,982
singlet/doubletdoublet
Overlap geneMap2k1
Upstream geneMap2k5, 2300009A05Rik, Iqch, LOC621763, 2310007F21Rik, Smad3, LOC100040009, Smad6, 2600006L11Rik, Lctl, Zwilch, Rpl4, Snapc5
Downstream geneUchl4, Tipin, Dis3l, Megf11, Rab11a, AI115600, F730015K02Rik, Slc24a1, 2010321M09Rik, Ptplad1, Dpp8, Nope, Punc
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-010D22.bB6Ng01-010D22.g
ACCDH845967DH845968
length1,004993
definitionDH845967|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-010D22, 5' end.DH845968|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-010D22, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(64,055,973 - 64,056,982)(64,034,464 - 64,035,453)
sequence
gaattctgcttctcaacagagaaatgactggatgagttctctagggcccc
tctccgagcttacactgtttccatggtttggggcacttgtagccagtcac
gatttacactagttaatcagcatggcccagtttcataaacttacttttag
tgcttattatgtgcattgtcacatgaattgccctgagaactgggaggata
gagctctgcacagctggtggttgtgctctcacgttagccgtcagagctgc
tgagcaccaggtatgctgtttcaagcccactctgctgaagcatcacaagt
tctgtccctagttccatgcactcaaatgtctcccgctaatatgggatcaa
agaggtggtttgtgggtgaatggggctgcactcctggaagcttacttcag
gggctaaagttaggccccaaacattgataatgggtttaatggtctggact
ggggcttggagggagagagctaactaagctttggaagcagcaacaaggcc
tttgcctcacttgctctaataaagaacagtatcttttcctactttcattt
tattttgtaagtttttttctctttgtaactcagtgttttgcccatgctgg
gtaccactgagtgacacctcctgtcatggaccagtgtttttatactagag
aagaactcatcctgtcctgaaggtctaacaggactctgttgcaagtagct
gttgttagaaggccatgcagccataagagccacaagaggtctttcccaga
ctcgggtctctgccaggcctcctatatcagagccccttactgcaaaaact
ggctgccacttgcctccagggtgggtcatgtgaagaactctgccctgtag
tcacaatcccagcttctaaaaggtttgattggtccccacttgtcacagtc
tgtttgatatctatgtcattacatgccattccagcagtgattagattgca
agcttataagctccaagaatttacatcgtacagaactatcacctcagttc
tgca
gaattcctctttgctgcttcctaaaggctcagatgctggcagcgtgggtt
ggtgtgctgggctggttaagcccaatggtggagcagagccagcctgcgaa
gtctacctcctcggcgtcagatcttttgatgaaagcatgtacctgtgcag
gaaacaaggaaaggggattctgttaaaaatggccaagaaggaaaagcgag
gtggcctggggaccgcgcagaagatgcctctagtgctcactcttgagcag
caagtaggccagctgcagcccagagaccccctctgccaaacagagaagct
gtgaggccctgggcaacttgttagaaagtacactacactcaaggctacac
agggcatggccttgtctggacattacagtaccacgtgtgtgtcactgcca
tcaaactagaaccagttggagagtaactcaggatactggatatgtgaggt
gaactagtcagaactaaggctgcggggaagtccctccctgactgcatcgc
aggtgcccctgaaacccacaggacagaggagtttgatccctggcactgtg
aaaccctaaacctgactgaagtataaggagtgggaatgagcagaaaaatg
gctcagatgaacaaacaggctctgtaagactcaccatgagctgcttcaga
tctgctctctctgcagggttctttattaagctgaaaagaagataaataat
gttaggagtgctacttcccagtccctgcttatgtttgtctgcctgcctct
tatgaaggctgagggccagtgcctgcaatcaccccccattataggcacac
catcattacgccaaacacacaaaagtcttgctgagctaaatcaaggtcag
aaagcaacaggatggtctctgaaattcagggggagagtggcacccagaat
cagatagtcacgagtctcagcatcacaagggatatgaggtatgggcagca
gccaaggttaataggggataagggtagggcaggggggaggggg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr9_64055973_64056982
seq2: B6Ng01-010D22.b_47_1051 (reverse)

seq1  TGCAGAACTGAGGTGATAGTTACTGTACGATGTAAAATTCCTTGAGCTTT  50
      ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | |||| ||
seq2  TGCAGAACTGAGGTGATAGTT-CTGTACGATGT-AAATTCTTGGAGC-TT  47

seq1  ATATGCTTGCAATCTAATCACCTGCTGGAATGGCATGTTAATGACATAGA  100
      ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| 
seq2  ATAAGCTTGCAATCTAATCA-CTGCTGGAATGGCATG-TAATGACATAG-  94

seq1  ATATCAAACAGACTGTGAC-AGTGGGGACCAATCAAAACCTTTTAGAAGC  149
      ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||
seq2  ATATCAAACAGACTGTGACAAGTGGGGACCAATC-AAACCTTTTAGAAGC  143

seq1  TGGGA-TGTGACTACAGGGCAGAGTTCTTCACATGACCCACCCTGGAGGC  198
      ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGATTGTGACTACAGGGCAGAGTTCTTCACATGACCCACCCTGGAGGC  193

seq1  AAGTGGCAGCCAGTTTTTGCAGTAAGGGGCTCTGATATAGGAGGCCTGGC  248
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTGGCAGCCAGTTTTTGCAGTAAGGGGCTCTGATATAGGAGGCCTGGC  243

seq1  AGAGACCCGAGTCTGGGAAAGACCTCTTGTGGCTCTTATGGCTGCATGGC  298
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGACCCGAGTCTGGGAAAGACCTCTTGTGGCTCTTATGGCTGCATGGC  293

seq1  CTTCTAACAACAGCTACTTGCAACAGAGTCCTGTTAGACCTTCAGGACAG  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCTAACAACAGCTACTTGCAACAGAGTCCTGTTAGACCTTCAGGACAG  343

seq1  GATGAGTTCTTCTCTAGTATAAAAACACTGGTCCATGACAGGAGGTGTCA  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGAGTTCTTCTCTAGTATAAAAACACTGGTCCATGACAGGAGGTGTCA  393

seq1  CTCAGTGGTACCCAGCATGGGCAAAACACTGAGTTACAAAGAGAAAAAAA  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAGTGGTACCCAGCATGGGCAAAACACTGAGTTACAAAGAGAAAAAAA  443

seq1  CTTACAAAATAAAATGAAAGTAGGAAAAGATACTGTTCTTTATTAGAGCA  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTACAAAATAAAATGAAAGTAGGAAAAGATACTGTTCTTTATTAGAGCA  493

seq1  AGTGAGGCAAAGGCCTTGTTGCTGCTTCCAAAGCTTAGTTAGCTCTCTCC  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGAGGCAAAGGCCTTGTTGCTGCTTCCAAAGCTTAGTTAGCTCTCTCC  543

seq1  CTCCAAGCCCCAGTCCAGACCATTAAACCCATTATCAATGTTTGGGGCCT  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCAAGCCCCAGTCCAGACCATTAAACCCATTATCAATGTTTGGGGCCT  593

seq1  AACTTTAGCCCCTGAAGTAAGCTTCCAGGAGTGCAGCCCCATTCACCCAC  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTTTAGCCCCTGAAGTAAGCTTCCAGGAGTGCAGCCCCATTCACCCAC  643

seq1  AAACCACCTCTTTGATCCCATATTAGCGGGAGACATTTGAGTGCATGGAA  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACCACCTCTTTGATCCCATATTAGCGGGAGACATTTGAGTGCATGGAA  693

seq1  CTAGGGACAGAACTTGTGATGCTTCAGCAGAGTGGGCTTGAAACAGCATA  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAGGGACAGAACTTGTGATGCTTCAGCAGAGTGGGCTTGAAACAGCATA  743

seq1  CCTGGTGCTCAGCAGCTCTGACGGCTAACGTGAGAGCACAACCACCAGCT  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGGTGCTCAGCAGCTCTGACGGCTAACGTGAGAGCACAACCACCAGCT  793

seq1  GTGCAGAGCTCTATCCTCCCAGTTCTCAGGGCAATTCATGTGACAATGCA  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCAGAGCTCTATCCTCCCAGTTCTCAGGGCAATTCATGTGACAATGCA  843

seq1  CATAATAAGCACTAAAAGTAAGTTTATGAAACTGGGCCATGCTGATTAAC  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATAATAAGCACTAAAAGTAAGTTTATGAAACTGGGCCATGCTGATTAAC  893

seq1  TAGTGTAAATCGTGACTGGCTACAAGTGCCCCAAACCATGGAAACAGTGT  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTGTAAATCGTGACTGGCTACAAGTGCCCCAAACCATGGAAACAGTGT  943

seq1  AAGCTCGGAGAGGGGCCCTAGAGAACTCATCCAGTCATTTCTCTGTTGAG  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCTCGGAGAGGGGCCCTAGAGAACTCATCCAGTCATTTCTCTGTTGAG  993

seq1  AAGCAGAATTCC  1010
      ||||||||||||
seq2  AAGCAGAATTCC  1005

seq1: chr9_64034464_64035453
seq2: B6Ng01-010D22.g_63_1055

seq1  GAATTCCTCTTTGCTGCTTCCTAAAGGCTCAGATGCTGGCAGCGTGGGTT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCTCTTTGCTGCTTCCTAAAGGCTCAGATGCTGGCAGCGTGGGTT  50

seq1  GGTGTGCTGGGCTGGTTAAGCCCAATGGTGGAGCAGAGCCAGCCTGCGAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGTGCTGGGCTGGTTAAGCCCAATGGTGGAGCAGAGCCAGCCTGCGAA  100

seq1  GTCTACCTCCTCGGCGTCAGATCTTTTGATGAAAGCATGTACCTGTGCAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTACCTCCTCGGCGTCAGATCTTTTGATGAAAGCATGTACCTGTGCAG  150

seq1  GAAACAAGGAAAGGGGATTCTGTTAAAAATGGCCAAGAAGGAAAAGCGAG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAACAAGGAAAGGGGATTCTGTTAAAAATGGCCAAGAAGGAAAAGCGAG  200

seq1  GTGGCCTGGGGACCGCGCAGAAGATGCCTCTAGTGCTCACTCTTGAGCAG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGCCTGGGGACCGCGCAGAAGATGCCTCTAGTGCTCACTCTTGAGCAG  250

seq1  CAAGTAGGCCAGCTGCAGCCCAGAGACCCCCTCTGCCAAACAGAGAAGCT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGTAGGCCAGCTGCAGCCCAGAGACCCCCTCTGCCAAACAGAGAAGCT  300

seq1  GTGAGGCCCTGGGCAACTTGTTAGAAAGTACACTACACTCAAGGCTACAC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGAGGCCCTGGGCAACTTGTTAGAAAGTACACTACACTCAAGGCTACAC  350

seq1  AGGGCATGGCCTTGTCTGGACATTACAGTACCACGTGTGTGTCACTGCCA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGCATGGCCTTGTCTGGACATTACAGTACCACGTGTGTGTCACTGCCA  400

seq1  TCAAACTAGAACCAGTTGGAGAGTAACTCAGGATACTGGATATGTGAGGT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAAACTAGAACCAGTTGGAGAGTAACTCAGGATACTGGATATGTGAGGT  450

seq1  GAACTAGTCAGAACTAAGGCTGCGGGGAAGTCCCTCCCTGACTGCATCGC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACTAGTCAGAACTAAGGCTGCGGGGAAGTCCCTCCCTGACTGCATCGC  500

seq1  AGGTGCCCCTGAAACCCACAGGACAGAGGAGTTTGATCCCTGGCACTGTG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTGCCCCTGAAACCCACAGGACAGAGGAGTTTGATCCCTGGCACTGTG  550

seq1  AAACCCTAAACCTGACTGAAGTATAAGGAGTGGGAATGAGCAGAAAAATG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACCCTAAACCTGACTGAAGTATAAGGAGTGGGAATGAGCAGAAAAATG  600

seq1  GCTCAGATGAACAAACAGGCTCTGTAAGACTCACCATGAGCTGCTTCAGA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCAGATGAACAAACAGGCTCTGTAAGACTCACCATGAGCTGCTTCAGA  650

seq1  TCTGCTCTCTCTGCAGGGTTCTTTATTAAGCTGAAAAGAAGATAAATAAT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGCTCTCTCTGCAGGGTTCTTTATTAAGCTGAAAAGAAGATAAATAAT  700

seq1  GTTAGGAGTGCTACTTCCCAGTCCCTGCTTATGTTTGTCTGCCTGCCTCT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTAGGAGTGCTACTTCCCAGTCCCTGCTTATGTTTGTCTGCCTGCCTCT  750

seq1  TATGAAGGCTGAGGGCCAGTGCCTGCAATCACCCCCCATTATAGGCACAC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGAAGGCTGAGGGCCAGTGCCTGCAATCACCCCCCATTATAGGCACAC  800

seq1  CATCATTACGCCAAACACACAAAAGTCTTGCTGAGCTAAATCAAGGTCAG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCATTACGCCAAACACACAAAAGTCTTGCTGAGCTAAATCAAGGTCAG  850

seq1  AAAGCAACAGGATGGTCCCTGAAATTCA-GGGGAGAGTGGCACCCAGAAT  899
      ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||
seq2  AAAGCAACAGGATGGTCTCTGAAATTCAGGGGGAGAGTGGCACCCAGAAT  900

seq1  CAGATAGTCACGAGTCCCAGCATCACAAGGGATATGAGGTAT-GGCAGCA  948
      |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||
seq2  CAGATAGTCACGAGTCTCAGCATCACAAGGGATATGAGGTATGGGCAGCA  950

seq1  GCCAAGGTTAATAGGGGATAGGGTAAGGGCA-GGGGGAGGGGG  990
      |||||||||||||||||||| ||  |||||| |||||||||||
seq2  GCCAAGGTTAATAGGGGATAAGGGTAGGGCAGGGGGGAGGGGG  993