BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-134K23
Chromosome9 (Build37)
Map Location 32,211,076 - 32,329,839
singlet/doubletdoublet
Overlap geneFli1
Upstream geneNfrkb, Tmem45b, LOC666558, EG666576, Barx2, LOC100042266, Tpi-rs4, LOC666619, LOC666622, Grit, Kcnj5, Kcnj1
Downstream geneLOC669759, LOC100041398, Ets1, LOC100041426
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-134K23.bB6Ng01-134K23.g
ACCDH934920DH934921
length1,0901,115
definitionDH934920|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-134K23, 5' end.DH934921|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-134K23, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(32,211,076 - 32,212,170)(32,328,726 - 32,329,839)
sequence
gaattctgggaaccttgtcctgtagcttttgccacttaacagtttctccc
aaggatgatcactttttagatagatcactatatagggatacttgctgagg
gtgccaacatctgtggaacccccctcttatgtttcttcatatcactttgg
agtagctgctaagacccagccctgctgttctgaacataagagactctaac
tgtggctgtctggtgtctgaaagccttgttccttttgcaaagcttactct
gcccacccaccctaagatgaagctggaatcttagaacgagagttcccagg
gtgagatagaatatctggggctagcagcttttcaaggttcaaatctgggc
tagttgaaaagtcaggacagatgtttctactccagtacaggggaaggctt
ggcttgggagaagggggtggggttcatttccatggttctcttgataatta
ccctttaattagggtccataaacgtttggggtttctaacgtttgggggtt
tctactactgtaaaattttatgttcaagtatatcacaattaaaataaaag
aaactggtaacatgaataaatgctaaaaaatgaaatataaaaaaatgtca
agtgaggtggaggaagagagggcgtgagcagttaatctggactcattgag
aggggtaaaacttgaaataaggaaaggtgagggggtacagagctggacca
ccaggtagatacatcatgcctcagactaacataactgaggaggggttctg
ggaaatgatggacaggcttgagtgggcagagcatcgcatgtggatggata
tgatgtcaaaacaggttttgggtcagtcaactgcctgctcaacgaagctg
agtacccgagggacagtgacctgactgtgcagttctatatattctacaca
agagagtttaacatcaacatttagggacagatagagggagactgagcaga
atcagactttctagagaacaggttagttttgcaattctagtcttttcagg
agttaacctaggctccgaggtttttcaacacacctggatgccggcctctc
aaagaaggcaagttgggttggagttcgggcttccacattc
gaattcaattctgtatctaccactgaatctctaacacggacttgtgagtt
gggttatttgaaactgagatggatagcctcttccaagaaaatgaggtcaa
gttcacctgaggtctaaactctacctaacagtttttagggtggcagacta
ttgtggttctgattcatacgaaaacaagcctgcaggaagaataaaatata
cacctacccacaggccaccatgagtgtccagtgcccaaccgtctcatcct
ggttaactgtagaatgtactgtagttctgtagctgtgaaccttcacaact
tctcccacctcaaaatactttccctcggttccttcagatcgcatgctgca
tggggtgaaggggctgcctggctttcaggatccgaatgctgttttgcaag
gcttgccctgagctctgagggctcggacttctccagtttttctttgtaca
gtcagcacatggcatatgttcatggatggactgatcagttccagaggcca
gggaccaaggtgcaggagtaagaaagatagctgcggctcctgctttggca
gaagtgaagctgtagctgagcaagcaggtattcagtccaaagagttctgt
gtgaaacgggaactggggagtgccttttgagagtctgccatggggaccta
acctagtctcagaggtcaaaggcttccctaaggaagtaacattcaggctg
aaccctgagtgataagtgagagaatgtatgaaagagaacagacttgtgat
aagtctctgctagtgagtggatagctgatatgtctgcttcactccatggt
aagtcactccagggccttgctaaattaggtgtcagaagcttagtcattct
aaccatggtccttgaaggcacgatctgtgtggctgcaaagtcatcctctc
tgccactttcttatttgataaaggcaagtagagtgtaatgaagatatatg
aaggacattatccttgcatgtgttatcagactagcattcactgaggtaca
tgaagagggttgtttaggctaatcatcataccccctcctaacattgtagt
gcatcagaggacccccacgggtaagaagcctcttgaagcctgactccttt
ctgtctggaaggcgc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr9_32211076_32212170
seq2: B6Ng01-134K23.b_48_1137

seq1  GAATTCTGGGAACCTTGTCCTGTAGCTTTTGCCACTTAACAGTTTCTCCC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTGGGAACCTTGTCCTGTAGCTTTTGCCACTTAACAGTTTCTCCC  50

seq1  AAGGATGATCACTTTTTAGATAGATCACTATATAGGGATACTTGCTGAGG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGATGATCACTTTTTAGATAGATCACTATATAGGGATACTTGCTGAGG  100

seq1  GTGCCAACATCTGTGGAACCCCCCTCTTATGTTTCTTCATATCACTTTGG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCCAACATCTGTGGAACCCCCCTCTTATGTTTCTTCATATCACTTTGG  150

seq1  AGTAGCTGCTAAGACCCAGCCCTGCTGTTCTGAACATAAGAGACTCTAAC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTAGCTGCTAAGACCCAGCCCTGCTGTTCTGAACATAAGAGACTCTAAC  200

seq1  TGTGGCTGTCTGGTGTCTGAAAGCCTTGTTCCTTTTGCAAAGCTTACTCT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGGCTGTCTGGTGTCTGAAAGCCTTGTTCCTTTTGCAAAGCTTACTCT  250

seq1  GCCCACCCACCCTAAGATGAAGCTGGAATCTTAGAACGAGAGTTCCCAGG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCCACCCACCCTAAGATGAAGCTGGAATCTTAGAACGAGAGTTCCCAGG  300

seq1  GTGAGATAGAATATCTGGGGCTAGCAGCTTTTCAAGGTTCAAATCTGGGC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGAGATAGAATATCTGGGGCTAGCAGCTTTTCAAGGTTCAAATCTGGGC  350

seq1  TAGTTGAAAAGTCAGGACAGATGTTTCTACTCCAGTACAGGGGAAGGCTT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTTGAAAAGTCAGGACAGATGTTTCTACTCCAGTACAGGGGAAGGCTT  400

seq1  GGCTTGGGAGAAGGGGGTGGGGTTCATTTCCATGGTTCTCTTGATAATTA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTTGGGAGAAGGGGGTGGGGTTCATTTCCATGGTTCTCTTGATAATTA  450

seq1  CCCTTTAATTAGGGTCCATAAACGTTTGGGGTTTCTAACGTTTGGGGGTT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTTTAATTAGGGTCCATAAACGTTTGGGGTTTCTAACGTTTGGGGGTT  500

seq1  TCTACTACTGTAAAATTTTATGTTCAAGTATATCACAATTAAAATAAAAG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTACTACTGTAAAATTTTATGTTCAAGTATATCACAATTAAAATAAAAG  550

seq1  AAACTGGTAACATGAATAAATGCTAAAAAATGAAATATAAAAAAATGTCA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACTGGTAACATGAATAAATGCTAAAAAATGAAATATAAAAAAATGTCA  600

seq1  AGTGAGGTGGAGGAAGAGAGGGCGTGAGCAGTTAATCTGGACTCATTGAG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGAGGTGGAGGAAGAGAGGGCGTGAGCAGTTAATCTGGACTCATTGAG  650

seq1  AGGGGTAAAACTTGAAATAAGGAAAGGTGAGGGGGTACAGAGCTGGACCA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGGTAAAACTTGAAATAAGGAAAGGTGAGGGGGTACAGAGCTGGACCA  700

seq1  CCAGGTAGATACATCATGCCTCAGACTAACATAACTGAGGAGGGGTTCTG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGGTAGATACATCATGCCTCAGACTAACATAACTGAGGAGGGGTTCTG  750

seq1  GGAAATGATGGACAGGCTTGAGTGGCCAGAGCATCGCATGTGGATGGATA  800
      ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAATGATGGACAGGCTTGAGTGGGCAGAGCATCGCATGTGGATGGATA  800

seq1  TGATGTCAAAACAGGTTTTGGGTCAGTCAACTGCCTGCTCAACGAAGCTG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATGTCAAAACAGGTTTTGGGTCAGTCAACTGCCTGCTCAACGAAGCTG  850

seq1  AGTACCCGAGGGACAGTGACCTGACTGTGCAGTTCTATATATTCTACACA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTACCCGAGGGACAGTGACCTGACTGTGCAGTTCTATATATTCTACACA  900

seq1  AGAGAGTTTAACATCAACA-TTAGGGACAGATAGA-GGAGACCAGAGGCA  948
      ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | || |||
seq2  AGAGAGTTTAACATCAACATTTAGGGACAGATAGAGGGAGA-CTGA-GCA  948

seq1  GAATCAGACTTCCTAGAGAGACAGGGTTAGTTTTGCAATTCTAGTC-TTT  997
      ||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||
seq2  GAATCAGACTTTCTAGAGA-ACA-GGTTAGTTTTGCAATTCTAGTCTTTT  996

seq1  CAGGAGTTAAACTAAGGCTCCGAGGCTATTACAACACACCTGGATGCCAG  1047
      |||||||||| || ||||||||||| | || ||||||||||||||||| |
seq2  CAGGAGTTAACCT-AGGCTCCGAGG-TTTTTCAACACACCTGGATGCCGG  1044

seq1  CACTC-CAAAGAAGGCAAGTAGGGGTTGGAGTTCGGGGCTTCCACATTC  1095
      | ||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||
seq2  C-CTCTCAAAGAAGGCAAGT-TGGGTTGGAGTTC-GGGCTTCCACATTC  1090

seq1: chr9_32328726_32329839
seq2: B6Ng01-134K23.g_68_1182 (reverse)

seq1  GCGCCTTCCAAGACAGAAAGAAGTCAGCTTTCAGGAGGCATCTTACCCGT  50
      ||||||||| |||||||||| ||||||  |||| ||||| ||||||||||
seq2  GCGCCTTCC-AGACAGAAAGGAGTCAGGCTTCAAGAGGCTTCTTACCCGT  49

seq1  GGGG--TCTCTGGATGCACTAC-ATGTTAG--AGGGGTATGATTGATAGC  95
      ||||   |||| |||||||||| |||||||   ||||||||||   ||||
seq2  GGGGGTCCTCT-GATGCACTACAATGTTAGGAGGGGGTATGATGATTAGC  98

seq1  CTAAAC-ACCCTCTTCATGTA-CTCAGTGAATGCTAGTCTGATAACACAT  143
      |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAAACAACCCTCTTCATGTACCTCAGTGAATGCTAGTCTGATAACACAT  148

seq1  GCAAGGATAATTGTCTTTTCATATTATTCTTCATTACACTCTACTTGCCT  193
      |||||||||| ||||  |||||||   |||||||||||||||||||||||
seq2  GCAAGGATAA-TGTC-CTTCATAT--ATCTTCATTACACTCTACTTGCCT  194

seq1  TTATCAAATAAGAAAGTGGCAGAGAGGATGACTTTGCAGCCACACAGATC  243
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATCAAATAAGAAAGTGGCAGAGAGGATGACTTTGCAGCCACACAGATC  244

seq1  GTGCCTTCAAGGACCATGGTTAGAATGACTAAGCTTCTGACACCTAATTT  293
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCCTTCAAGGACCATGGTTAGAATGACTAAGCTTCTGACACCTAATTT  294

seq1  AGCAAGGCCCTGGAGTGACTTACCATGGAGTGAAGCAGACATATCAGCTA  343
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAAGGCCCTGGAGTGACTTACCATGGAGTGAAGCAGACATATCAGCTA  344

seq1  TCCACTCACTAGCAGAGACTTATCACAAGTCTGTTCTCTTTCATACATTC  393
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCACTCACTAGCAGAGACTTATCACAAGTCTGTTCTCTTTCATACATTC  394

seq1  TCTCACTTATCACTCAGGGTTCAGCCTGAATGTTACTTCCTTAGGGAAGC  443
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCACTTATCACTCAGGGTTCAGCCTGAATGTTACTTCCTTAGGGAAGC  444

seq1  CTTTGACCTCTGAGACTAGGTTAGGTCCCCATGGCAGACTCTCAAAAGGC  493
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTGACCTCTGAGACTAGGTTAGGTCCCCATGGCAGACTCTCAAAAGGC  494

seq1  ACTCCCCAGTTCCCGTTTCACACAGAACTCTTTGGACTGAATACCTGCTT  543
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCCCCAGTTCCCGTTTCACACAGAACTCTTTGGACTGAATACCTGCTT  544

seq1  GCTCAGCTACAGCTTCACTTCTGCCAAAGCAGGAGCCGCAGCTATCTTTC  593
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCAGCTACAGCTTCACTTCTGCCAAAGCAGGAGCCGCAGCTATCTTTC  594

seq1  TTACTCCTGCACCTTGGTCCCTGGCCTCTGGAACTGATCAGTCCATCCAT  643
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACTCCTGCACCTTGGTCCCTGGCCTCTGGAACTGATCAGTCCATCCAT  644

seq1  GAACATATGCCATGTGCTGACTGTACAAAGAAAAACTGGAGAAGTCCGAG  693
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACATATGCCATGTGCTGACTGTACAAAGAAAAACTGGAGAAGTCCGAG  694

seq1  CCCTCAGAGCTCAGGGCAAGCCTTGCAAAACAGCATTCGGATCCTGAAAG  743
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTCAGAGCTCAGGGCAAGCCTTGCAAAACAGCATTCGGATCCTGAAAG  744

seq1  CCAGGCAGCCCCTTCACCCCATGCAGCATGCGATCTGAAGGAACCGAGGG  793
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGGCAGCCCCTTCACCCCATGCAGCATGCGATCTGAAGGAACCGAGGG  794

seq1  AAAGTATTTTGAGGTGGGAGAAGTTGTGAAGGTTCACAGCTACAGAACTA  843
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGTATTTTGAGGTGGGAGAAGTTGTGAAGGTTCACAGCTACAGAACTA  844

seq1  CAGTACATTCTACAGTTAACCAGGATGAGACGGTTGGGCACTGGACACTC  893
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTACATTCTACAGTTAACCAGGATGAGACGGTTGGGCACTGGACACTC  894

seq1  ATGGTGGCCTGTGGGTAGGTGTATATTTTATTCTTCCTGCAGGCTTGTTT  943
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGTGGCCTGTGGGTAGGTGTATATTTTATTCTTCCTGCAGGCTTGTTT  944

seq1  TCGTATGAATCAGAACCACAATAGTCTGCCACCCTAAAAACTGTTAGGTA  993
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCGTATGAATCAGAACCACAATAGTCTGCCACCCTAAAAACTGTTAGGTA  994

seq1  GAGTTTAGACCTCAGGTGAACTTGACCTCATTTTCTTGGAAGAGGCTATC  1043
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTTTAGACCTCAGGTGAACTTGACCTCATTTTCTTGGAAGAGGCTATC  1044

seq1  CATCTCAGTTTCAAATAACCCAACTCACAAGTCCGTGTTAGAGATTCAGT  1093
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCTCAGTTTCAAATAACCCAACTCACAAGTCCGTGTTAGAGATTCAGT  1094

seq1  GGTAGATACAGAATTGAATTC  1114
      |||||||||||||||||||||
seq2  GGTAGATACAGAATTGAATTC  1115