BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-158E15
Chromosome9 (Build37)
Map Location 26,108,214 - 26,233,726
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneSept7, EG666327, 2310005P05Rik
Downstream geneB3gat1, BC038479, Glb1l3, Gm1110, LOC330907, Acad8, Thyn1, Vps26b, Ncapd3, Jam3, Igsf9b, Spata19
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-158E15.bB6Ng01-158E15.g
ACCDH952283DH952284
length1,2281,063
definitionDH952283|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-158E15, 5' end.DH952284|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-158E15, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(26,232,498 - 26,233,726)(26,108,214 - 26,109,300)
sequence
gaattctaaaggcaaagtgaggagatacacacaaggtatgtctcgtcagt
gacccttaataacaatagaggtatcagtccagcatgcggaagcagttgct
gggcttatggccacacaggtggataaggttgaagtgaccttttttaaggt
tataatttttgagatattcttagaatagttcatcacaagtaggtttgtgt
gttcaaggaaacagggaagatccttccagggatagaaagtagcccagttc
acaggagggatttgagcctgtggttgaagaaagactgggaatacctgtgt
gtagacctaagtcagcttagtgttcctggagcaagtaaaaaggcattgtt
agagaatgctgggacacaggcaatgacctcatggagaacaagctattccc
tcatgggacacaggcgatgctttcaggggcacaagtggtcccttcatggg
gcataggcaatgctcccatggggcacaagcaatccccttaaggggcatgg
tcaatgccctcaaaggagcaaagtaagtgtccataagagggcacaggcaa
tttcctcaggaggcagcccctctggcttcctcttctcggtaagttggctc
ttgaggacttacttttccagagccttgctgtctggactatgatttctgtt
gttgatcttcttgcattaaagactatttgttctacaattccactacaact
ctcagcttactctttctacaaagggtaaatgagtgttttaattgcccagg
aaaaatttaagacacttgagatgtacagctatgaagtaaaaatttgaccc
atgagtaacaccaggcattatgtaatatatgaatattttgaaaaaaaccc
cagtgcatctctaccttattcatgctaacatagagctctacacactgatg
aaaacaagatgcatccctttggagaagttccatctgaagccaggctttgg
tccattgaggcagcttgctccagtcttgatttgaggcttctccaggttca
tcatctggaaagtcttccttgtctgttggagctacttggaggaatgtcta
aagagggtttagaatgtttatcagatgcctctgaaacctgactagaaaag
ctgctgttccaagctggagtggacatttacttgacttactgctgaagttt
tctttcctgaggggagcttgcctcctggatacccaggatcactgacgtga
tccatttgtctggtcagcccttattgcc
gaattcagaacaaaaactcaaagaaggcaggagcctgaagacaggaatta
atgcagataccatgaggattttgcttttgatggcttgctcagtctatttt
cttatagagcttaggaccaccaatacagggatagaagcactcacaatggg
attgatccaccatcaatcactaatttaaaaaaatgccctaaagcaggaat
ttatgagggtactttctgtttgaagttctcaactatgactttagcttgtg
ttagcatgacataacactatccaaccatactattaagtattttctactaa
aatggacagttgtactctaacagcctttcttagaggaatggatatttgct
ttactataaattataagattccactgaagtgtgctggaggctcaagggag
ggcataagctcatgttcttgagaatctttagaagcactgggaggtaccaa
gtaataagagtgatattaattctctcagatacaagaggcctctgagatat
gggaaatccaagatgtctctaacttctccttttgtgacattatttcacct
gcaaagagaaatttgtcctggtggagctccatgaaagcctggccaaaaca
gagttcatatcatttctcctatagaaaatatttaactggataatggtatt
atacttgaactgacatcttctggtcatctctctgtctcccacttagtgtt
gaggctagaccatgttactgtaaagatgtacttgttcctaagtttatcta
ggtcaatttttcctctagttacaactttctacatttgagaaagaggccag
gtggaacatatagtgatttccctatgatgacctatagtggaaggaaagaa
aagaaaaattactatgaatttgaccttcccaacaatattccactgagaga
gagagtagaatggatttgaagaactcagagcatagagagatactggcatc
tttagctttacgaaacatagtgcttctttaaagggtgtctactaattatg
tctatctgtatgaaatactctgactgtgaacagaagcttcatctcctttc
agttgagacttgt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr9_26232498_26233726
seq2: B6Ng01-158E15.b_45_1272 (reverse)

seq1  GGCAATAAGGGCTGA-CAGGCAAAGTGGCTCA-GTCAGATGGAGTCTGTG  48
      ||||||||||||||| ||| |||| ||| ||| |||||   ||  ||| |
seq2  GGCAATAAGGGCTGACCAGACAAA-TGGATCACGTCAG--TGATCCTGGG  47

seq1  TGATTCAGAGAGGCAAAGGCTCACTCTGAGG-AAGAAAAC-TCAGCAGTA  96
      | || ||| |||||||  |||| | || ||| |||||||| |||||||| 
seq2  T-ATCCAG-GAGGCAA--GCTC-CCCTCAGGAAAGAAAACTTCAGCAGT-  91

seq1  AAGTCAAGGTAAATGGTCACTCAGACTGGGAACAGCAGC-TTTCTTGTCA  145
      ||||||| |||||||  |||||   || ||||||||||| ||||| ||| 
seq2  AAGTCAA-GTAAATGTCCACTCCAGCTTGGAACAGCAGCTTTTCTAGTC-  139

seq1  AGGTTTCAGA-GCATCTGATAAACATTCTAAAACCCTCTTTAGACATTCC  194
      |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
seq2  AGGTTTCAGAGGCATCTGATAAACATTCT-AAACCCTCTTTAGACATTCC  188

seq1  TCCAAGTAGCTCC-ACAGACAGGGA--GCTTTCCAGATGATGAACCT-GA  240
      ||||||||||||| ||||||| |||   ||||||||||||||||||| ||
seq2  TCCAAGTAGCTCCAACAGACAAGGAAGACTTTCCAGATGATGAACCTGGA  238

seq1  GGAGCCTCAAATC-AGACTGGAGC-AGCTGCCTCAATGGACCAAAGCCTG  288
      | ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGCCTCAAATCAAGACTGGAGCAAGCTGCCTCAATGGACCAAAGCCTG  288

seq1  GCTTCAGATGGAACTTCTCC-AAGGGATGCATCTTGTTTTCATCAGTGTG  337
      |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTCAGATGGAACTTCTCCAAAGGGATGCATCTTGTTTTCATCAGTGTG  338

seq1  TAGAGCTCTATGTTAGCATGAATAAGGTAGAGATGCACTGGGGTTTTTTT  387
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
seq2  TAGAGCTCTATGTTAGCATGAATAAGGTAGAGATGCACTGGGG-TTTTTT  387

seq1  TCAAAATATTTCATATATTACATAATGCCTGGTGTTACTCATGGGTCAAA  437
      |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAAAATA-TTCATATATTACATAATGCCTGGTGTTACTCATGGGTCAAA  436

seq1  TTTTTACTTCATAGCTGTACATCTCAAGTGTCTTTAAATTTTTCCTGGGC  487
      |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
seq2  TTTTTACTTCATAGCTGTACATCTCAAGTGTC-TTAAATTTTTCCTGGGC  485

seq1  AATTAAAACACTCATTTACCCTTTGTAG-AAGAGTAAGCTGAGAGTTGTA  536
      |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
seq2  AATTAAAACACTCATTTACCCTTTGTAGAAAGAGTAAGCTGAGAGTTGTA  535

seq1  GTGGAATTGTAGAACAAATAGTCTTTAATGCAAGAAGATCAACAACAGAA  586
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGAATTGTAGAACAAATAGTCTTTAATGCAAGAAGATCAACAACAGAA  585

seq1  ATCATAGTCCAGACAGCAAGGCTCTGGAAAAGTAAGTCCTCAAGAGCCAA  636
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCATAGTCCAGACAGCAAGGCTCTGGAAAAGTAAGTCCTCAAGAGCCAA  635

seq1  CTTACCGAGAAGAGGAAGCCAGAGGGGCTGCCTCCTGAGGGAATTGCCTG  686
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
seq2  CTTACCGAGAAGAGGAAGCCAGAGGGGCTGCCTCCTGAGGAAATTGCCTG  685

seq1  TGCCCTCTTATGGACACTTACTTTGCTCCTTTGAGGGCATTGACCATGCC  736
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCCTCTTATGGACACTTACTTTGCTCCTTTGAGGGCATTGACCATGCC  735

seq1  CCTTAAGGGGATTGCTTGTGCCCCATGGGAGCATTGCCTATGCCCCATGA  786
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTAAGGGGATTGCTTGTGCCCCATGGGAGCATTGCCTATGCCCCATGA  785

seq1  AGGGACCACTTGTGCCCCTGAAAGCATCGCCTGTGTCCCATGAGGGAATA  836
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGACCACTTGTGCCCCTGAAAGCATCGCCTGTGTCCCATGAGGGAATA  835

seq1  GCTTGTTCTCCATGAGGTCATTGCCTGTGTCCCAGCATTCTCTAACAATG  886
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTGTTCTCCATGAGGTCATTGCCTGTGTCCCAGCATTCTCTAACAATG  885

seq1  CCTTTTTACTTGCTCCAGGAACACTAAGCTGACTTAGGTCTACACACAGG  936
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTTTTACTTGCTCCAGGAACACTAAGCTGACTTAGGTCTACACACAGG  935

seq1  TATTCCCAGTCTTTCTTCAACCACAGGCTCAAATCCCTCCTGTGAACTGG  986
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTCCCAGTCTTTCTTCAACCACAGGCTCAAATCCCTCCTGTGAACTGG  985

seq1  GCTACTTTCTATCCCTGGAAGGATCTTCCCTGTTTCCTTGAACACACAAA  1036
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTACTTTCTATCCCTGGAAGGATCTTCCCTGTTTCCTTGAACACACAAA  1035

seq1  CCTACTTGTGATGAACTATTCTAAGAATATCTCAAAAATTATAACCTTAA  1086
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTACTTGTGATGAACTATTCTAAGAATATCTCAAAAATTATAACCTTAA  1085

seq1  AAAAGGTCACTTCAACCTTATCCACCTGTGTGGCCATAAGCCCAGCAACT  1136
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAGGTCACTTCAACCTTATCCACCTGTGTGGCCATAAGCCCAGCAACT  1135

seq1  GCTTCCGCATGCTGGACTGATACCTCTATTGTTATTAAGGGTCACTGACG  1186
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTCCGCATGCTGGACTGATACCTCTATTGTTATTAAGGGTCACTGACG  1185

seq1  AGACATACCTTGTGTGTATCTCCTCACTTTGCCTTTAGAATTC  1229
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACATACCTTGTGTGTATCTCCTCACTTTGCCTTTAGAATTC  1228

seq1: chr9_26108214_26109300
seq2: B6Ng01-158E15.g_69_1131

seq1  GAATTCAGAACAAAAACTCAAAGAAGGCAGGAGCCTGAAGACAGGAATTA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAGAACAAAAACTCAAAGAAGGCAGGAGCCTGAAGACAGGAATTA  50

seq1  ATGCAGATACCATGAGGATTTTGCTTTTGATGGCTTGCTCAGTCTATTTT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCAGATACCATGAGGATTTTGCTTTTGATGGCTTGCTCAGTCTATTTT  100

seq1  CTTATAGAGCTTAGGACCACCAATACAGGGATAGAAGCACTCACAATGGG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTATAGAGCTTAGGACCACCAATACAGGGATAGAAGCACTCACAATGGG  150

seq1  ATTGATCCACCATCAATCACTAATTTAAAAAAATGCCCTAAAGCAGGAAT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGATCCACCATCAATCACTAATTTAAAAAAATGCCCTAAAGCAGGAAT  200

seq1  TTATGAGGGTACTTTCTGTTTGAAGTTCTCAACTATGACTTTAGCTTGTG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATGAGGGTACTTTCTGTTTGAAGTTCTCAACTATGACTTTAGCTTGTG  250

seq1  TTAGCATGACATAACACTATCCAACCATACTATTAAGTATTTTCTACTAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGCATGACATAACACTATCCAACCATACTATTAAGTATTTTCTACTAA  300

seq1  AATGGACAGTTGTACTCTAACAGCCTTTCTTAGAGGAATGGATATTTGCT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGGACAGTTGTACTCTAACAGCCTTTCTTAGAGGAATGGATATTTGCT  350

seq1  TTACTATAAATTATAAGATTCCACTGAAGTGTGCTGGAGGCTCAAGGGAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACTATAAATTATAAGATTCCACTGAAGTGTGCTGGAGGCTCAAGGGAG  400

seq1  GGCATAAGCTCATGTTCTTGAGAATCTTTAGAAGCACTGGGAGGTACCAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCATAAGCTCATGTTCTTGAGAATCTTTAGAAGCACTGGGAGGTACCAA  450

seq1  GTAATAAGAGTGATATTAATTCTCTCAGATACAAGAGGCCTCTGAGATAT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAATAAGAGTGATATTAATTCTCTCAGATACAAGAGGCCTCTGAGATAT  500

seq1  GGGAAATCCAAGATGTCTCTAACTTCTCCTTTTGTGACATTATTTCACCT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGAAATCCAAGATGTCTCTAACTTCTCCTTTTGTGACATTATTTCACCT  550

seq1  GCAAAGAGAAATTTGTCCTGGTGGAGCTCCATGAAAGCCTGGCCAAAACA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAAAGAGAAATTTGTCCTGGTGGAGCTCCATGAAAGCCTGGCCAAAACA  600

seq1  GAGTTCATATCATTTCTCCTATAGAAAATATTTAACTGGATAATGGTATT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTTCATATCATTTCTCCTATAGAAAATATTTAACTGGATAATGGTATT  650

seq1  ATACTTGAACTGACATCTTCTGGTCATCTCTCTGTCTCCCACTTAGTGTT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACTTGAACTGACATCTTCTGGTCATCTCTCTGTCTCCCACTTAGTGTT  700

seq1  GAGGCTAGACCATGTTACTGTAAAGATGTACTTGTTCCTAAGTTTATCTA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGCTAGACCATGTTACTGTAAAGATGTACTTGTTCCTAAGTTTATCTA  750

seq1  GGTCAATTTTTCCTCTAGTTACAAC-TTCTACATTTGAGAAAGAGGCCAG  799
      ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTCAATTTTTCCTCTAGTTACAACTTTCTACATTTGAGAAAGAGGCCAG  800

seq1  GTGGAACATATAGTGATTTCCCTATGATGACCTATAGTGGAAAGGAAAGG  849
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
seq2  GTGGAACATATAGTGATTTCCCTATGATGACCTATAGTGG-AAGGAAA-G  848

seq1  AAAAGAAAAATTACTATGAATTTGACCTTCCCCAACAATATTCCACTGAG  899
      ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
seq2  AAAAGAAAAATTACTATGAATTTGACCTT-CCCAACAATATTCCACTGAG  897

seq1  AGAGAAGAGTAGAATGGATTTGAAGAACCTCAGGAGGCATTAGAAGAGAT  949
      |||| |||||||||||||||||||||| |||||   ||| ||| ||||||
seq2  AGAG-AGAGTAGAATGGATTTGAAGAA-CTCAG--AGCA-TAG-AGAGAT  941

seq1  ACTTGGCATCTTTAGCTTTACGAAAACATTAGTGCTTCTTTTAAAGGGGT  999
      || ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||  
seq2  AC-TGGCATCTTTAGCTTTACG-AAACA-TAGTGCTTC-TTTAAAGGG--  985

seq1  TGTCTACATAATTTATGTCCTATCTGTATTTGAAATACTCCTGACTGTGA  1049
      ||||||| ||| |||||| |||||||||  ||||||||| ||||||||||
seq2  TGTCTAC-TAA-TTATGT-CTATCTGTA--TGAAATACT-CTGACTGTGA  1029

seq1  ACAGAAGCTTTTCATCTCCTTTCAGTTGGAGGACTTGT  1087
      ||||||||  ||||||||||||||||||   |||||||
seq2  ACAGAAGC--TTCATCTCCTTTCAGTTG--AGACTTGT  1063