seq1: chr9_27964174_27965317
seq2: B6Ng01-205I20.b_44_1185
seq1 GAATTCTTCCATAAAACTTTGGGGAAAGACAAGCAGTCTTAGATCTTGGC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GAATTCTTCCATAAAACTTTGGGGAAAGACAAGCAGTCTTAGATCTTGGC 50
seq1 AGTGAAATTCTCCCTAGACAATCAAGCATCAGACACAAGAGCAAACAGTC 100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 AGTGAAATTCTCCCTAGACAATCAAGCATCAGACACAAGAGCAAACAGTC 100
seq1 AAGTCTGGGGCTTCCTGTGGGATATTGATCTTTCCTCTCTGCTACAGCAT 150
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 AAGTCTGGGGCTTCCTGTGGGATATTGATCTTTCCTCTCTGCTACAGCAT 150
seq1 TTCCCTCATCCTCCCGGCATCCAGGGGAAAAATGGAACATGAGATTTCAA 200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TTCCCTCATCCTCCCGGCATCCAGGGGAAAAATGGAACATGAGATTTCAA 200
seq1 AACTAAAGATACTGAAAGTGACAGGCTATTCTGGAATCATGGATTATGGG 250
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 AACTAAAGATACTGAAAGTGACAGGCTATTCTGGAATCATGGATTATGGG 250
seq1 AGACTGCCAGTGGAGAGGAGACCAGTGGAGCCTACTCGTCTCCTTCAGGG 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 AGACTGCCAGTGGAGAGGAGACCAGTGGAGCCTACTCGTCTCCTTCAGGG 300
seq1 GTCACTGATTGAACTTTAAGACTCTGGGGCAGAGCTAGGTAAATAATAGG 350
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GTCACTGATTGAACTTTAAGACTCTGGGGCAGAGCTAGGTAAATAATAGG 350
seq1 TATTAGTGGTGGCGAGATAAGAGCCTTTTGGAAAAGAGGGCTAGCAGAGC 400
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TATTAGTGGTGGCGAGATAAGAGCCTTTTGGAAAAGAGGGCTAGCAGAGC 400
seq1 ATCGAGAAGGCAATCTGACAGGATAACTGAAGGCAGAGATAATGGCCCAT 450
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 ATCGAGAAGGCAATCTGACAGGATAACTGAAGGCAGAGATAATGGCCCAT 450
seq1 CTGGAAATACCTTCCTCAATTGCTCTTATAGCCATGGAACAGGGAATGCA 500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CTGGAAATACCTTCCTCAATTGCTCTTATAGCCATGGAACAGGGAATGCA 500
seq1 GACAGGTGGAAAATGCGCATTTGGATGACCAACTCATAAACGAAACAATG 550
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GACAGGTGGAAAATGCGCATTTGGATGACCAACTCATAAACGAAACAATG 550
seq1 AGCTATGTGGCTGCCCTGCTCCCTGAAAACCTCATCATCAACTTGGCCTT 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 AGCTATGTGGCTGCCCTGCTCCCTGAAAACCTCATCATCAACTTGGCCTT 600
seq1 TATCTGCGAATGGCATCATTTCTACTTAGGTTTCCATCATCCAAGCCAGA 650
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TATCTGCGAATGGCATCATTTCTACTTAGGTTTCCATCATCCAAGCCAGA 650
seq1 GCGCCAGCCAGGTCCACAGTCCAGATGGTGACAGGACAGGGCTGGGGAGC 700
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GCGCCAGCCAGGTCCACAGTCCAGATGGTGACAGGACAGGGCTGGGGAGC 700
seq1 CCATGCTGGATGCCTGGGAATTCGTTTTACGCTCTGGTTTGCTACCTGGA 750
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CCATGCTGGATGCCTGGGAATTCGTTTTACGCTCTGGTTTGCTACCTGGA 750
seq1 ACAAGCTTTAAAGGAAGCACTGGCTTTCAATCAGAAGATCAAGAAGGGAT 800
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 ACAAGCTTTAAAGGAAGCACTGGCTTTCAATCAGAAGATCAAGAAGGGAT 800
seq1 AATACTTGCAAGACATATCTGTTTCTCACAGTTGCACTCCTGTCTAAACA 850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 AATACTTGCAAGACATATCTGTTTCTCACAGTTGCACTCCTGTCTAAACA 850
seq1 GTGATCATGTTTTTCCATCTTAGCAAATGAGTGCCTATACGAA-TTCTTC 899
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
seq2 GTGATCATGTTTTTCCATCTTAGCAAATGAGTGCCTATACGAATTTCTTC 900
seq1 CCAGCACTTTACCTCCTTTAAAAGGGCATCATCCTGAGTGAGGTAACCCA 949
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CCAGCACTTTACCTCCTTTAAAAGGGCATCATCCTGAGTGAGGTAACCCA 950
seq1 ATCACAAAAGAACTCACATGATATGTACTCACTGATA-TGTGGATATTAG 998
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
seq2 ATCACAAAAGAACTCACATGATATGTACTCACTGATATTGTGGATATTAG 1000
seq1 CCCAAAAACTTAGTATACCCAAGATACAAGATACAATTTGCAAAA-CACA 1047
||| ||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| ||||
seq2 CCC-AAAACTTAGTATA-CCAAGATAC-AGATAC-ATTTGCAAAACCACA 1046
seq1 TGAAACTCAAGAACGAAGACCAAAGTGTGGACAC--TGTGCCCCTTCTTA 1095
||||||||| ||| ||| | ||||| ||||| |||||||||||||
seq2 TGAAACTCA--GACG-AGA-CTAAGTGGTGACACCTGGTGCCCCTTCTTA 1092
seq1 GAATTGGGAACAAAACACCCATGGAA-GGAGTTACAG-AGACAAAGTTTG 1143
||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||
seq2 GAA-TGGGATCAAAACACCATGGGAAGGGAGTTACAGAAGACAAGGTTTG 1141
seq1 G 1144
|
seq2 G 1142
| seq1: chr9_28065827_28065897
seq2: B6Ng01-205I20.g_72_142 (reverse)
seq1 ACACACACACACACACTCACTCAGTACTCAAGTAGACATTGTTGGTGAGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 ACACACACACACACACTCACTCAGTACTCAAGTAGACATTGTTGGTGAGA 50
seq1 CTATTAAAAACACAGGGAAAA 71
|||||||||||||||||||||
seq2 CTATTAAAAACACAGGGAAAA 71
|
