BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-205J19
Chromosome9 (Build37)
Map Location 22,024,496 - 22,148,568
singlet/doubletdoublet
Overlap geneZfp809, BC050092, Zfp810, LOC100041826, EG625603, Anln
Upstream geneKeap1, Edg8, Atg4d, BC021438, Cdkn2d, Ap1m2, Slc44a2, Ilf3, Qtrt1, Dnm2, Tmed1, AB124611, Carm1, Yipf2, 1810026J23Rik, EG666043, Smarca4, Ldlr, Spc24, Ankrd25, Dock6, EG624219, Rab3d, BC010787, 2510048L02Rik, BC018242, 2310047B19Rik, Epor, Rgl3, C330001K17Rik, Prkcsh, Elavl3, Zfp653, Ecsit, EG625409, Cnn1, Elof1, Acp5, Pigyl, LOC100034724, 9530015I07Rik, 1810064F22Rik
Downstream gene9530077C05Rik, rp9, LOC100041870, Bbs9, LOC100040805, Bmper
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-205J19.bB6Ng01-205J19.g
ACCGA025248GA025249
length1,0941,079
definitionB6Ng01-205J19.b B6Ng01-205J19.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(22,147,478 - 22,148,568)(22,024,496 - 22,025,594)
sequence
gaattccaagtatggtctctgcttattgcatagcacagttgtaagtatca
aacaccataaactgtgtcgttgtaacctgttaagaatatttcttatgtgt
ttaaatttcttccctttcaaacaaacttgtttttcttatgaaaattatgt
acacaaaagctagtctacagcaatagaaagtagccacatttccctggaga
ttgacacaggaggatgtaagaggccataagaatgtctgagactgactggt
catgctatgtatactcaaagagccgaaacactgtattcaaggggcaggca
agatggcttagcatgaagcactggctgtaccagccttaggacctgggttt
gacgggaacagactccagagtcattctctgagctctgtaactgtgcatgc
gtggacacatgcatgcttgtgtcaagatggtaaaggaaaaagtacatgta
aagaaagatcttaaggcacagttgaatgggctttgtcacagccaacagca
ttctgtcactcgcttatagtcagtcccaactgcacacagttcttcccact
cctgtcctacattggttttgcttgttgttcactttctgtaaatggaacta
catgcatgatcttctaagtgtaaccagttttgctcaacatgatgcccttt
gaaatgcactcatgatatgtattaggagttcattgcttctaaaatgatca
gctgggggtagtggttcacatttttaatttgagaacttaagaaagctgca
aataggtctcttgagttcaaggtcagcctgggggatatatactgaggcct
tgtctgcaaaaaaggaaaaggaaaaaaaaggaaaaacaacctttccacac
aaatacacccacagcttagtaagtaaacaatgattcactaaggtaaaact
cactcaacaaaaacagaagttttgacatgaatagtctggcggctcttacc
cattcatgatgttgtacagtgctgtcttcaaaaagtggaaggaagcctct
ctgacacatttgagtgacttctgacgtcttggcttgcttctgtgaaatat
gcacatgcaatgtatgagtatgaagtgcctttgtatgccttttt
gaattcagagagagaaaaccagagagagagagagagagagagagagagac
agagacagagacagagacagagacagagacagagacagagacagagacag
agacagacagagacagagacagagagagagacagacagatagacagagac
agagagagacagagacagagagagagacagacagagatagagagagacag
acagacagagacagagagagacagacagacagagacagagacagacagac
agagagacagacagagacacagagagagacagagagagagagactgcagg
ctatctccaagtgcagcctcagaacaacaatgggtcacctgtcagcttgc
atctgcattcttgccggagagtctgatttagtagctacccaatgagcttc
taaacatgtttggcctaaattatgtgccctctatgaagcaggcctgattc
tggacttgcataagtttcaaccaggagacttggtctatgtaaggaaattt
ctccaagatggtttgaacccaggtggaagggaccccttacatcatcccgt
tgacaactgccatcaaagtggatggaatcaccaactaggtgcactatact
cacacaggacctgctaacctgttctttactgaagactacctgactccagc
cacgccagagtggagggttctaaagagcaccaagcccctcacgtgaaaat
tgactctgtcctgtgtctacatctccgctgactgtacatattgcagtccc
taacccacaccaaccttttgatttcactagggtaattggcaatcccaaga
ctggctattgcacccaactggcctatacaaaagggccaatcagaacttcc
tggttcccaaacttgagttttgatttgtgctggctgatagttcatggccc
aacacccagcagtctcctcaagattcatacctagatgccgacggaggact
ttatgtatgtccagggaaaagagctacaatgtggggtcctgaagagttta
ctgtgctgctggatggaaacatcactcacggaatggggaatgaaggttca
ggagattctgacgctggcaggtctgcaga
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr9_22147478_22148568
seq2: B6Ng01-205J19.b_49_1142 (reverse)

seq1  AAAAAAGCATACACAGGCAC-TCATACTCATACATTGCATGTGCATATAT  49
      ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
seq2  AAAAAGGCATACAAAGGCACTTCATACTCATACATTGCATGTGCATAT-T  49

seq1  CCACAGAAGCAAGCCAAGACGTCAGAAGTCACTCAAATGGTGTCAGAGA-  98
       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| 
seq2  TCACAGAAGCAAGCCAAGACGTCAGAAGTCACTCAAAT-GTGTCAGAGAG  98

seq1  GCTTCC-TCCAC-TTTTGGAGACAGCACTGTACAACATCATGAATGGGTA  146
      |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTCCTTCCACTTTTTGAAGACAGCACTGTACAACATCATGAATGGGTA  148

seq1  AGAGCCGCCAGACTATTCATGTCAAAACTTCTGTTTTTGTTGAGTGAGTT  196
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGCCGCCAGACTATTCATGTCAAAACTTCTGTTTTTGTTGAGTGAGTT  198

seq1  TTACCTTAGTGAATCATTGTTTACTTACTAAGCTGTGGGTGTATTTGTGT  246
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACCTTAGTGAATCATTGTTTACTTACTAAGCTGTGGGTGTATTTGTGT  248

seq1  GG-AAGGTTGTTTTTCCTTTTTTTTCCTTTTCCTTTTTTGCAGACAAGGC  295
      || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAAGGTTGTTTTTCCTTTTTTTTCCTTTTCCTTTTTTGCAGACAAGGC  298

seq1  CTCAGTATATATCCCCCAGGCTGACCTTGAACTCAAGAGACCTATTTGCA  345
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAGTATATATCCCCCAGGCTGACCTTGAACTCAAGAGACCTATTTGCA  348

seq1  GCTTTCTTAAGTTCTCAAATTAAAAATGTGAACCACTACCCCCAGCTGAT  395
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTTCTTAAGTTCTCAAATTAAAAATGTGAACCACTACCCCCAGCTGAT  398

seq1  CATTTTAGAAGCAATGAACTCCTAATACATATCATGAGTGCATTTCAAAG  445
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTTTAGAAGCAATGAACTCCTAATACATATCATGAGTGCATTTCAAAG  448

seq1  GGCATCATGTTGAGCAAAACTGGTTACACTTAGAAGATCATGCATGTAGT  495
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCATCATGTTGAGCAAAACTGGTTACACTTAGAAGATCATGCATGTAGT  498

seq1  TCCATTTACAGAAAGTGAACAACAAGCAAAACCAATGTAGGACAGGAGTG  545
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCATTTACAGAAAGTGAACAACAAGCAAAACCAATGTAGGACAGGAGTG  548

seq1  GGAAGAACTGTGTGCAGTTGGGACTGACTATAAGCGAGTGACAGAATGCT  595
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAGAACTGTGTGCAGTTGGGACTGACTATAAGCGAGTGACAGAATGCT  598

seq1  GTTGGCTGTGACAAAGCCCATTCAACTGTGCCTTAAGATCTTTCTTTACA  645
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTGGCTGTGACAAAGCCCATTCAACTGTGCCTTAAGATCTTTCTTTACA  648

seq1  TGTACTTTTTCCTTTACCATCTTGACACAAGCATGCATGTGTCCACGCAT  695
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTACTTTTTCCTTTACCATCTTGACACAAGCATGCATGTGTCCACGCAT  698

seq1  GCACAGTTACAGAGCTCAGAGAATGACTCTGGAGTCTGTTCCCGTCAAAC  745
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACAGTTACAGAGCTCAGAGAATGACTCTGGAGTCTGTTCCCGTCAAAC  748

seq1  CCAGGTCCTAAGGCTGGTACAGCCAGTGCTTCATGCTAAGCCATCTTGCC  795
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGGTCCTAAGGCTGGTACAGCCAGTGCTTCATGCTAAGCCATCTTGCC  798

seq1  TGCCCCTTGAATACAGTGTTTCGGCTCTTTGAGTATACATAGCATGACCA  845
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCCCTTGAATACAGTGTTTCGGCTCTTTGAGTATACATAGCATGACCA  848

seq1  GTCAGTCTCAGACATTCTTATGGCCTCTTACATCCTCCTGTGTCAATCTC  895
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCAGTCTCAGACATTCTTATGGCCTCTTACATCCTCCTGTGTCAATCTC  898

seq1  CAGGGAAATGTGGCTACTTTCTATTGCTGTAGACTAGCTTTTGTGTACAT  945
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGGAAATGTGGCTACTTTCTATTGCTGTAGACTAGCTTTTGTGTACAT  948

seq1  AATTTTCATAAGAAAAACAAGTTTGTTTGAAAGGGAAGAAATTTAAACAC  995
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTTTCATAAGAAAAACAAGTTTGTTTGAAAGGGAAGAAATTTAAACAC  998

seq1  ATAAGAAATATTCTTAACAGGTTACAACGACACAGTTTATGGTGTTTGAT  1045
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAGAAATATTCTTAACAGGTTACAACGACACAGTTTATGGTGTTTGAT  1048

seq1  ACTTACAACTGTGCTATGCAATAAGCAGAGACCATACTTGGAATTC  1091
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTACAACTGTGCTATGCAATAAGCAGAGACCATACTTGGAATTC  1094

seq1: chr9_22024496_22025594
seq2: B6Ng01-205J19.g_69_1147

seq1  GAATTCAGAGAGAGAAAACCAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAGAGAGAGAAAACCAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAC  50

seq1  AGAGACAGAGACAGAGACAGAGACAGAGACAGAGACAGAGACAGAGACAG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGACAGAGACAGAGACAGAGACAGAGACAGAGACAGAGACAGAGACAG  100

seq1  AGACAGACAGAGACAGAGACAGAGAGAGAGACAGACAGATAGACAGAGAC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACAGACAGAGACAGAGACAGAGAGAGAGACAGACAGATAGACAGAGAC  150

seq1  AGAGAGAGACAGAGACAGAGAGAGAGACAGACAGAGATAGAGAGAGACAG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGAGAGACAGAGACAGAGAGAGAGACAGACAGAGATAGAGAGAGACAG  200

seq1  ACAGACAGAGACAGAGAGAGACAGACAGACAGAGACAGAGACAGACAGAC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGACAGAGACAGAGAGAGACAGACAGACAGAGACAGAGACAGACAGAC  250

seq1  AGAGAGACAGACAGAGACACAGAGAGAGACAGAGAGAGAGAGACTGCAGG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGAGACAGACAGAGACACAGAGAGAGACAGAGAGAGAGAGACTGCAGG  300

seq1  CTATCTCCAAGTGCAGCCTCAGAACAACAATGGGTCACCTGTCAGCTTGC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATCTCCAAGTGCAGCCTCAGAACAACAATGGGTCACCTGTCAGCTTGC  350

seq1  ATCTGCATTCTTGCCGGAGAGTCTGATTTAGTAGCTACCCAATGAGCTTC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTGCATTCTTGCCGGAGAGTCTGATTTAGTAGCTACCCAATGAGCTTC  400

seq1  TAAACATGTTTGGCCTAAATTATGTGCCCTCTATGAAGCAGGCCTGATTC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAACATGTTTGGCCTAAATTATGTGCCCTCTATGAAGCAGGCCTGATTC  450

seq1  TGGACTTGCATAAGTTTCAACCAGGAGACTTGGTCTATGTAAGGAAATTT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGACTTGCATAAGTTTCAACCAGGAGACTTGGTCTATGTAAGGAAATTT  500

seq1  CTCCAAGATGGTTTGAACCCAGGTGGAAGGGACCCCTTACATCATCCCGT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCAAGATGGTTTGAACCCAGGTGGAAGGGACCCCTTACATCATCCCGT  550

seq1  TGACAACTGCCATCAAAGTGGATGGAATCACCAACTAGGTGCACTATACT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACAACTGCCATCAAAGTGGATGGAATCACCAACTAGGTGCACTATACT  600

seq1  CACACAGGACCTGCTAACCTGTTCTTTACTGAAGACTACCTGACTCCAGC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACACAGGACCTGCTAACCTGTTCTTTACTGAAGACTACCTGACTCCAGC  650

seq1  CACGCCAGAGTGGAGGGTTCTAAAGAGCACCAAGCCCCTCACGTGAAAAT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACGCCAGAGTGGAGGGTTCTAAAGAGCACCAAGCCCCTCACGTGAAAAT  700

seq1  TGACTCTGTCCTGTGTCTACATCTCCGCTGACTGTACATATTGCAGTCCC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACTCTGTCCTGTGTCTACATCTCCGCTGACTGTACATATTGCAGTCCC  750

seq1  TAACCCACACCAACCTTTTGATTTCACTAGGGTAATTGGCAATCCCAAGA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAACCCACACCAACCTTTTGATTTCACTAGGGTAATTGGCAATCCCAAGA  800

seq1  CTGGCTATTGCACCCAACTGGCCTATACAAAAGGGCCAATCAGAACTTCC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGCTATTGCACCCAACTGGCCTATACAAAAGGGCCAATCAGAACTTCC  850

seq1  TGGTTCCCAAACTTGAGTTTTGATTTGTGCTGGCTGATAGTTCATGGCCC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTTCCCAAACTTGAGTTTTGATTTGTGCTGGCTGATAGTTCATGGCCC  900

seq1  AACACCCAGCAGTCTCCTCAAGATTCATACCCTAAATGCCGACGGAGGAC  950
      ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||
seq2  AACACCCAGCAGTCTCCTCAAGATTCATA-CCTAGATGCCGACGGAGGAC  949

seq1  TTTTTATGTATGTCCAGGGGAAAAAGAGCTACCAAATGTGGGGGTCCTGA  1000
        |||||||||||||||||  |||||||||||  ||||| ||||||||||
seq2  --TTTATGTATGTCCAGGG--AAAAGAGCTAC--AATGT-GGGGTCCTGA  992

seq1  AGAGTTTTACTGTGCTGCCTGGGGATGTGAAACATCACTCACCGGAAATG  1050
      |||| |||||||||||||    ||||| ||||||||||||||  | ||||
seq2  AGAG-TTTACTGTGCTGC---TGGATG-GAAACATCACTCAC--GGAATG  1035

seq1  GGGGATGGAGGGTTTCAAGAGATTCCTGAACGCTGGCAGTGTCTGCAGA  1099
      ||| ||| |||  |||| |||||| ||| |||||||||| |||||||||
seq2  GGGAATGAAGG--TTCAGGAGATT-CTG-ACGCTGGCAG-GTCTGCAGA  1079