BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-263G07
Chromosome9 (Build37)
Map Location 32,605,789 - 32,714,462
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC100041426
Upstream geneBarx2, LOC100042266, Tpi-rs4, LOC666619, LOC666622, Grit, Kcnj5, Kcnj1, Fli1, LOC669759, LOC100041398, Ets1
Downstream geneLOC100042343
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-263G07.bB6Ng01-263G07.g
ACCGA067574GA067575
length9141,114
definitionB6Ng01-263G07.b B6Ng01-263G07.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(32,713,549 - 32,714,462)(32,605,789 - 32,606,907)
sequence
gaattcctgttagtccttttggaactctttttgcttatgaagcagatatg
gattggagggcacactggtccctattgttgttctgcaggcttgcttgtgt
taggtcagcatattagttcccctacctctgtaaagactgagaaccacatt
tggaatcaggacaggaagtacaccccctccttaaaccctttactttctgg
agaagtcacgggtggtgaagatgtttcctgccattctttacagaagcaag
agtcgctttagggttgtttcattatcagtggagtagttgtcccgtggacc
tctgcccttgaagagtgaaagagcagtcaagacagagcccactagcctca
cgtcgtcacagttgcaagcaagcaaacctgtcatcttcctgtattatcta
caaatggtgtttgtttcctttgacgtatattctaacacttggggcaggag
ggatttctcgaaaaaacaatattgttgagtataccaattccctgccccca
gccatcctttctgtttccttttcaaggctccaggaattgctaaatggcat
atcctggacaaccaacactcttcagctaaaaataccagagggtgagctta
tctcgagcaatgcttcctctccagggggttcatagacattatctcattta
ttcttaaaaacaccctgtgaggtagggcatggccaaagaactggatccca
gaaaggtaaggaagctttaagacaaaaggtcactggcagaggttcgattc
tgaagcccggcagaacagctcagatgtgtaactttcaagctgtaaaatct
actcaccaggcatcaataacttgactgcaggagcccagagacccccttat
taaatagatatagatataggagatagagatagatagagatagagatagag
atagagatagagat

gaattcttctgtctccatcttctgtctctccatgggagaggtgagattgc
agatgctcacaccatgtgcctggatttttatgtgggttctggggattgga
tctcaggtcctcacatttgcatagcaaggactcttatctacgaactcagt
ctattatgatgtttctatgatgagattatacagaaaacaaatatctctat
gtacagaccacatcctgttgattgttttgacaactcttacacattcatat
agcttgattgctgtactggctagttttgtgtcaacttggcacagctggag
ttatcagagagaaagtagcttcagttgaggaaatgcctccatgacatcca
actgtaaggcattttctcaattagtgatcaagggggaaaggccccttgtg
ggtggaaccatctctgggctggtagtcttggttctataagagagaaggct
gagcaagccaggggaggcaagccagtaaagagcatccctccatggcatct
gcatcagctcctgcttcctgacctgcttgagttccagtcctgacttcctt
ggtgatgaacagcagtatggaagtgtaagccaaataaaccctttcctccc
caacttgcttcttggtcatgatgtttgtgcacgaatagaaaccctgacta
agacaattgcatattcttcagactgatggtaagacattgaaataaacaca
gcctaattcagaaagtagtcacttcatgtgccagcctaatattaattgtc
cacagcaactataacttacaagtaaatgaaccggctttggtattcatagg
acaaactgggaactagttgataattgctcatgcataggcatctttttttt
ttttttagaattatttttttattaggtattttcctcatttacatttccag
tgctatccaaaagttcccaatacactacccccccccccccaaaaagaaca
ctcccctacccaaccaactcccacttttggccttggcgtttccccttgta
ctggggcatatgaagtttgcaagtccaatggggcctcttctttcaagtga
tgctgactagcatctttgatacattgcagctagagtcagagctctggtac
tgttagttctaatg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr9_32713549_32714462
seq2: B6Ng01-263G07.b_43_956 (reverse)

seq1  ATCTCTATCTCTATCTCTATCTCTATCTCTATCTATCTCTATCTCCTATA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTCTATCTCTATCTCTATCTCTATCTCTATCTATCTCTATCTCCTATA  50

seq1  TCTATATCTATTTAATAAGGGGGTCTCTGGGCTCCTGCAGTCAAGTTATT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTATATCTATTTAATAAGGGGGTCTCTGGGCTCCTGCAGTCAAGTTATT  100

seq1  GATGCCTGGTGAGTAGATTTTACAGCTTGAAAGTTACACATCTGAGCTGT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGCCTGGTGAGTAGATTTTACAGCTTGAAAGTTACACATCTGAGCTGT  150

seq1  TCTGCCGGGCTTCAGAATCGAACCTCTGCCAGTGACCTTTTGTCTTAAAG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGCCGGGCTTCAGAATCGAACCTCTGCCAGTGACCTTTTGTCTTAAAG  200

seq1  CTTCCTTACCTTTCTGGGATCCAGTTCTTTGGCCATGCCCTACCTCACAG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCCTTACCTTTCTGGGATCCAGTTCTTTGGCCATGCCCTACCTCACAG  250

seq1  GGTGTTTTTAAGAATAAATGAGATAATGTCTATGAACCCCCTGGAGAGGA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGTTTTTAAGAATAAATGAGATAATGTCTATGAACCCCCTGGAGAGGA  300

seq1  AGCATTGCTCGAGATAAGCTCACCCTCTGGTATTTTTAGCTGAAGAGTGT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCATTGCTCGAGATAAGCTCACCCTCTGGTATTTTTAGCTGAAGAGTGT  350

seq1  TGGTTGTCCAGGATATGCCATTTAGCAATTCCTGGAGCCTTGAAAAGGAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTTGTCCAGGATATGCCATTTAGCAATTCCTGGAGCCTTGAAAAGGAA  400

seq1  ACAGAAAGGATGGCTGGGGGCAGGGAATTGGTATACTCAACAATATTGTT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGAAAGGATGGCTGGGGGCAGGGAATTGGTATACTCAACAATATTGTT  450

seq1  TTTTCGAGAAATCCCTCCTGCCCCAAGTGTTAGAATATACGTCAAAGGAA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTCGAGAAATCCCTCCTGCCCCAAGTGTTAGAATATACGTCAAAGGAA  500

seq1  ACAAACACCATTTGTAGATAATACAGGAAGATGACAGGTTTGCTTGCTTG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAACACCATTTGTAGATAATACAGGAAGATGACAGGTTTGCTTGCTTG  550

seq1  CAACTGTGACGACGTGAGGCTAGTGGGCTCTGTCTTGACTGCTCTTTCAC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACTGTGACGACGTGAGGCTAGTGGGCTCTGTCTTGACTGCTCTTTCAC  600

seq1  TCTTCAAGGGCAGAGGTCCACGGGACAACTACTCCACTGATAATGAAACA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTCAAGGGCAGAGGTCCACGGGACAACTACTCCACTGATAATGAAACA  650

seq1  ACCCTAAAGCGACTCTTGCTTCTGTAAAGAATGGCAGGAAACATCTTCAC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCCTAAAGCGACTCTTGCTTCTGTAAAGAATGGCAGGAAACATCTTCAC  700

seq1  CACCCGTGACTTCTCCAGAAAGTAAAGGGTTTAAGGAGGGGGTGTACTTC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCCGTGACTTCTCCAGAAAGTAAAGGGTTTAAGGAGGGGGTGTACTTC  750

seq1  CTGTCCTGATTCCAAATGTGGTTCTCAGTCTTTACAGAGGTAGGGGAACT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTCCTGATTCCAAATGTGGTTCTCAGTCTTTACAGAGGTAGGGGAACT  800

seq1  AATATGCTGACCTAACACAAGCAAGCCTGCAGAACAACAATAGGGACCAG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATATGCTGACCTAACACAAGCAAGCCTGCAGAACAACAATAGGGACCAG  850

seq1  TGTGCCCTCCAATCCATATCTGCTTCATAAGCAAAAAGAGTTCCAAAAGG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGCCCTCCAATCCATATCTGCTTCATAAGCAAAAAGAGTTCCAAAAGG  900

seq1  ACTAACAGGAATTC  914
      ||||||||||||||
seq2  ACTAACAGGAATTC  914


seq1: chr9_32605789_32606907
seq2: B6Ng01-263G07.g_68_1181

seq1  GAATTCTTCTGTCTCCATCTTCTGTCTCTCCATGGGAGAGGTGAGATTGC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTCTGTCTCCATCTTCTGTCTCTCCATGGGAGAGGTGAGATTGC  50

seq1  AGATGCTCACACCATGTGCCTGGATTTTTATGTGGGTTCTGGGGATTGGA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATGCTCACACCATGTGCCTGGATTTTTATGTGGGTTCTGGGGATTGGA  100

seq1  TCTCAGGTCCTCACATTTGCATAGCAAGGACTCTTATCTACGAACTCAGT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCAGGTCCTCACATTTGCATAGCAAGGACTCTTATCTACGAACTCAGT  150

seq1  CTATTATGATGTTTCTATGATGAGATTATACAGAAAACAAATATCTCTAT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATTATGATGTTTCTATGATGAGATTATACAGAAAACAAATATCTCTAT  200

seq1  GTACAGACCACATCCTGTTGATTGTTTTGACAACTCTTACACATTCATAT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTACAGACCACATCCTGTTGATTGTTTTGACAACTCTTACACATTCATAT  250

seq1  AGCTTGATTGCTGTACTGGCTAGTTTTGTGTCAACTTGGCACAGCTGGAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTTGATTGCTGTACTGGCTAGTTTTGTGTCAACTTGGCACAGCTGGAG  300

seq1  TTATCAGAGAGAAAGTAGCTTCAGTTGAGGAAATGCCTCCATGACATCCA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATCAGAGAGAAAGTAGCTTCAGTTGAGGAAATGCCTCCATGACATCCA  350

seq1  ACTGTAAGGCATTTTCTCAATTAGTGATCAAGGGGGAAAGGCCCCTTGTG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGTAAGGCATTTTCTCAATTAGTGATCAAGGGGGAAAGGCCCCTTGTG  400

seq1  GGTGGAACCATCTCTGGGCTGGTAGTCTTGGTTCTATAAGAGAGAAGGCT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGGAACCATCTCTGGGCTGGTAGTCTTGGTTCTATAAGAGAGAAGGCT  450

seq1  GAGCAAGCCAGGGGAGGCAAGCCAGTAAAGAGCATCCCTCCATGGCATCT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCAAGCCAGGGGAGGCAAGCCAGTAAAGAGCATCCCTCCATGGCATCT  500

seq1  GCATCAGCTCCTGCTTCCTGACCTGCTTGAGTTCCAGTCCTGACTTCCTT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATCAGCTCCTGCTTCCTGACCTGCTTGAGTTCCAGTCCTGACTTCCTT  550

seq1  GGTGATGAACAGCAGTATGGAAGTGTAAGCCAAATAAACCCTTTCCTCCC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGATGAACAGCAGTATGGAAGTGTAAGCCAAATAAACCCTTTCCTCCC  600

seq1  CAACTTGCTTCTTGGTCATGATGTTTGTGCACGAATAGAAACCCTGACTA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACTTGCTTCTTGGTCATGATGTTTGTGCACGAATAGAAACCCTGACTA  650

seq1  AGACAATTGCATATTCTTCAGACTGATGGTAAGACATTGAAATAAACACA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACAATTGCATATTCTTCAGACTGATGGTAAGACATTGAAATAAACACA  700

seq1  GCCTAATTCAGAAAGTAGTCACTTCATGTGCCAGCCTAATATTAATTGTC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTAATTCAGAAAGTAGTCACTTCATGTGCCAGCCTAATATTAATTGTC  750

seq1  CACAGCAACTATAACTTACAAGTAAATGAACCGGCTTTGGTATTCATAGG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAGCAACTATAACTTACAAGTAAATGAACCGGCTTTGGTATTCATAGG  800

seq1  ACAAACTGGGAACTAGTTGATAATTGCTCATGCATAGGCATC-TTTTTTT  849
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
seq2  ACAAACTGGGAACTAGTTGATAATTGCTCATGCATAGGCATCTTTTTTTT  850

seq1  TTTTTTAGAATTAATTTTTTTATTAGGTATTTTCCTCATTTACATTTCCA  899
      |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTTTAGAATT-ATTTTTTTATTAGGTATTTTCCTCATTTACATTTCCA  899

seq1  GTGCTATCCAAAAAGTTCCCAATACACTACCCCCCCCCCCC--ACACACA  947
      ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  | |   |
seq2  GTGCTATCC-AAAAGTTCCCAATACACTACCCCCCCCCCCCCAAAAAGAA  948

seq1  CACTCCCCTACCC-ACCCACTCCCACTTTTTGGCCCTGGCGTT--CCCCT  994
      ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||| |||||||  ||| |
seq2  CACTCCCCTACCCAACCAACTCCCAC-TTTTGGCCTTGGCGTTTCCCCTT  997

seq1  GTACTGGGGCATATGAAGTTTGCAAGTCCAAT-GGGCCTC-TCTTTCCAG  1042
      |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||
seq2  GTACTGGGGCATATGAAGTTTGCAAGTCCAATGGGGCCTCTTCTTTCAAG  1047

seq1  TGATGGCTGACTAGGCCATCTTTTGATACATATGCAGCTAGAGTCAAGAG  1092
      |||| |||||||||  |||| |||||||||| ||||||||||||| ||||
seq2  TGAT-GCTGACTAG--CATC-TTTGATACAT-TGCAGCTAGAGTC-AGAG  1091

seq1  CTCTGGGGTACTGGTTAGTTCATAATG  1119
      ||||  |||||| |||||||| |||||
seq2  CTCT--GGTACT-GTTAGTTC-TAATG  1114


| Home | SequenceCutter | Blast | Download |