BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-305B23
Chromosome9 (Build37)
Map Location 60,656,793 - 60,793,033
singlet/doubletdoublet
Overlap geneUaca, ENSMUSG00000052143
Upstream geneMyo9a, LOC100040361, Nr2e3, EG665389, Thsd4, LOC100039792, EG384942, Lrrc49, Larp6, LOC100040447
Downstream geneA430102L10, LOC100040481, Tle3, LOC100039851, Rplp1, Kif23
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-305B23.bB6Ng01-305B23.g
ACCGA098493GA098494
length606467
definitionB6Ng01-305B23.b B6Ng01-305B23.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(60,656,793 - 60,657,398)(60,792,561 - 60,793,033)
sequence
gaattccatgttcagcacagttttcataggtttctgggatctccagtgag
agcagatttgagagggtcaagcttggagcagttccgagcatttgaaatgg
tgcagcctggagccgatgagggcccagagcatgcaatgctggagagactg
gagagttaggcgcctaagacctatacaagtgaccatcaaagccatccagt
caacagacagattgtcagaatcctacccacccctagcccgagagagtccc
acaagccctgtgtttgaagccagtctgtgagtacctggtaattatgctct
tagtaggtaaccacacatcagcagcccaggtgggtgtttaaatatcctta
tctgtagtcagatgaatggctcagggtgctgttggactttggaaaaatac
ctcggacagctaaacttagtaagcacagacagagtaagcagaccggtgct
tgatgaaaagttgaaacacgattaaagagactagcacaacgagcgagggt
gagcttgcctgctagattcagaagcagatgtttggctgtattttctcttc
aacttctgttttctagattgtgtgttctctgtgtgtgtgtgtctgtatgt
ggtgtg
cagcagagggctgacttatggctgtgagagaacaccataaccaagagcac
cttgaagaggaaaggatttatttctgcttcagtgtagtccagcatgaagg
gaagggagtcaggacaggaactgttgcagaggtcacagggatgctgctta
ctggctcttacccttgacttgctcattgtgcttttgtacatatcccaggt
tacccaagggtggcattgtctacagtcaactatgccactttccaccaatc
ttatagtcaagaaaatgcctccacaggctaatctgatagggggatgcttc
ttaattgagtgtccctcttctcagatgaccctagtttggataaagttgac
caaaatctacccagcataggggccggcagcaggggctgacagaagctgga
gattcaggagttggcttgggccaggagagacttcatttgaactaccagga
aagaagagtggggagga
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr9_60656793_60657398
seq2: B6Ng01-305B23.b_48_653

seq1  GAATTCCATGTTCAGCACAGTTTTCATAGGTTTCTGGGATCTCCAGTGAG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCATGTTCAGCACAGTTTTCATAGGTTTCTGGGATCTCCAGTGAG  50

seq1  AGCAGATTTGAGAGGGTCAAGCTTGGAGCAGTTCCGAGCATTTGAAATGG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAGATTTGAGAGGGTCAAGCTTGGAGCAGTTCCGAGCATTTGAAATGG  100

seq1  TGCAGCCTGGAGCCGATGAGGGCCCAGAGCATGCAATGCTGGAGAGACTG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCAGCCTGGAGCCGATGAGGGCCCAGAGCATGCAATGCTGGAGAGACTG  150

seq1  GAGAGTTAGGCGCCTAAGACCTATACAAGTGACCATCAAAGCCATCCAGT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAGTTAGGCGCCTAAGACCTATACAAGTGACCATCAAAGCCATCCAGT  200

seq1  CAACAGACAGATTGTCAGAATCCTACCCACCCCTAGCCCGAGAGAGTCCC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACAGACAGATTGTCAGAATCCTACCCACCCCTAGCCCGAGAGAGTCCC  250

seq1  ACAAGCCCTGTGTTTGAAGCCAGTCTGTGAGTACCTGGTAATTATGCTCT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAGCCCTGTGTTTGAAGCCAGTCTGTGAGTACCTGGTAATTATGCTCT  300

seq1  TAGTAGGTAACCACACATCAGCAGCCCAGGTGGGTGTTTAAATATCCTTA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTAGGTAACCACACATCAGCAGCCCAGGTGGGTGTTTAAATATCCTTA  350

seq1  TCTGTAGTCAGATGAATGGCTCAGGGTGCTGTTGGACTTTGGAAAAATAC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGTAGTCAGATGAATGGCTCAGGGTGCTGTTGGACTTTGGAAAAATAC  400

seq1  CTCGGACAGCTAAACTTAGTAAGCACAGACAGAGTAAGCAGACCGGTGCT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCGGACAGCTAAACTTAGTAAGCACAGACAGAGTAAGCAGACCGGTGCT  450

seq1  TGATGAAAAGTTGAAACACGATTAAAGAGACTAGCACAACGAGCGAGGGT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATGAAAAGTTGAAACACGATTAAAGAGACTAGCACAACGAGCGAGGGT  500

seq1  GAGCTTGCCTGCTAGATTCAGAAGCAGATGTTTGGCTGTATTTTCTCTTC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCTTGCCTGCTAGATTCAGAAGCAGATGTTTGGCTGTATTTTCTCTTC  550

seq1  AACTTCTGTTTTCTAGATTGTGTGTTCTCTGTGTGTGTGTGTCTGTATGT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTTCTGTTTTCTAGATTGTGTGTTCTCTGTGTGTGTGTGTCTGTATGT  600

seq1  GGTGTG  606
      ||||||
seq2  GGTGTG  606

seq1: chr9_60792561_60793033
seq2: B6Ng01-305B23.g_71_543 (reverse)

seq1  TCCTCCCCACTCTTCTTTCCTGGTAGTTCAAATGAAGTCTCTCCTGGCCC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTCCCCACTCTTCTTTCCTGGTAGTTCAAATGAAGTCTCTCCTGGCCC  50

seq1  AAGCCAACTCCTGAATCTCCAGCTTCTGTCAGCCCCTGCTGCCGGCCCCT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCCAACTCCTGAATCTCCAGCTTCTGTCAGCCCCTGCTGCCGGCCCCT  100

seq1  ATGCTGGGTAGATTTTGGTCAACTTTATCCAAACTAGGGTCATCTGAGAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCTGGGTAGATTTTGGTCAACTTTATCCAAACTAGGGTCATCTGAGAA  150

seq1  GAGGGACACTCAATTAAGAAGCATCCCCCTATCAGATTAGCCTGTGGAGG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGGACACTCAATTAAGAAGCATCCCCCTATCAGATTAGCCTGTGGAGG  200

seq1  CATTTTCTTGACTATAAGATTGGTGGAAAGTGGCATAGTTGACTGTAGAC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTTTCTTGACTATAAGATTGGTGGAAAGTGGCATAGTTGACTGTAGAC  250

seq1  AATGCCACCCTTGGGTAACCTGGGATATGTACAAAAGCACAATGAGCAAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGCCACCCTTGGGTAACCTGGGATATGTACAAAAGCACAATGAGCAAG  300

seq1  TCAAGGGTAAGAGCCAGTAAGCAGCATCCCTGTGACCTCTGCAACAGTTC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAAGGGTAAGAGCCAGTAAGCAGCATCCCTGTGACCTCTGCAACAGTTC  350

seq1  CTGTCCTGACTCCCTTCCCTTCATGCTGGACTACACTGAAGCAGAAATAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTCCTGACTCCCTTCCCTTCATGCTGGACTACACTGAAGCAGAAATAA  400

seq1  ATCCTTTCCTCTTCAAGGTGCTCTTGGTTATGGTGTTCTCTCACAGCCAT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCTTTCCTCTTCAAGGTGCTCTTGGTTATGGTGTTCTCTCACAGCCAT  450

seq1  AAGTCAGCCCTCTGCTGGAATTC  473
      |||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTCAGCCCTCTGCTGGAATTC  473