BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-332N14
Chromosome9 (Build37)
Map Location 29,086,977 - 29,232,656
singlet/doubletdoublet
Overlap geneHnt
Upstream geneOpcml, LOC625222
Downstream genenone
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-332N14.bB6Ng01-332N14.g
ACCGA118832GA118833
length1,09584
definitionB6Ng01-332N14.b B6Ng01-332N14.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(29,086,977 - 29,088,076)(29,232,573 - 29,232,656)
sequence
gaattcaagtccatctcatagaattttgtgttctagctcttaagcagatt
tttgtttagaaagagaacatcctttcttttcttgggtatggacaatgtct
gaccacaacagctaacagcctttgctcggcctgtctccaaaacatttaaa
ggatccactgagatgacagactgatgctccaggacaaagacaaggccagt
ggttgtcttagggcttctattgctgcaaggaacacaccatgaccaatatg
caagttgggaaggaaagggttgatttgccttaaaattccagatcatagtc
gatcactggaaaaagtcaggcacgctctcactcaagcaggggtggaacct
agaggcaggagctgataaagaggtcatggaagggtgttgtttactggcag
gtttacatggattgctaagcctgctttcttatggaacccaggattactgt
ctcagggatgacaccacttacaatgggccctctctttaattactaatttg
agaaaatgacttagagctggatctcagggaggcattttcttaactgtggc
tcctttctctataatgatgcgagcttgtgttgagtggacacccagaacca
gccatcacaggggtgttcataattcacatcggctttcttaaaggagcata
ggggaggatgtcaagttgttctttgccagcagaaagcaacacagggctat
acatctggaactactgcagacctacaattgactaccacaatgttttaaac
ttccattgggtttgtttggtttttttagtgaaagagcccatatttattct
tatatgcagaccaaaatgtctctcttacacagaacaaagaggaaaggtaa
gctatttggcttttaaggttaaagtgaagtcctctatgttagactcaact
ggattctttattaatatgtagagtaaaatgcctggctgtagacttgctaa
gagaattatgaaaaaagtcaatttattaatgctcttaacagtgatctaaa
catgatccatggggagttgggggaatgacgataccagggactcctggatc
ttccttagctaaagagcactgtcagttcagggaaactagcagcaa
taactgtggctattgatcatctgtgtaatgatgatcaacatatatatgtg
tgtgtgtgtgtatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr9_29086977_29088076
seq2: B6Ng01-332N14.b_50_1144

seq1  GAATTCAAGTCCATCTCATAGAATTTTGTGTTCTAGCTCTTAAGCAGATT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAAGTCCATCTCATAGAATTTTGTGTTCTAGCTCTTAAGCAGATT  50

seq1  TTTGTTTAGAAAGAGAACATCCTTTCTTTTCTTGGGTATGGACAATGTCT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGTTTAGAAAGAGAACATCCTTTCTTTTCTTGGGTATGGACAATGTCT  100

seq1  GACCACAACAGCTAACAGCCTTTGCTCGGCCTGTCTCCAAAACATTTAAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACCACAACAGCTAACAGCCTTTGCTCGGCCTGTCTCCAAAACATTTAAA  150

seq1  GGATCCACTGAGATGACAGACTGATGCTCCAGGACAAAGACAAGGCCAGT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATCCACTGAGATGACAGACTGATGCTCCAGGACAAAGACAAGGCCAGT  200

seq1  GGTTGTCTTAGGGCTTCTATTGCTGCAAGGAACACACCATGACCAATATG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTGTCTTAGGGCTTCTATTGCTGCAAGGAACACACCATGACCAATATG  250

seq1  CAAGTTGGGAAGGAAAGGGTTGATTTGCCTTAAAATTCCAGATCATAGTC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGTTGGGAAGGAAAGGGTTGATTTGCCTTAAAATTCCAGATCATAGTC  300

seq1  GATCACTGGAAAAAGTCAGGCACGCTCTCACTCAAGCAGGGGTGGAACCT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATCACTGGAAAAAGTCAGGCACGCTCTCACTCAAGCAGGGGTGGAACCT  350

seq1  AGAGGCAGGAGCTGATAAAGAGGTCATGGAAGGGTGTTGTTTACTGGCAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGGCAGGAGCTGATAAAGAGGTCATGGAAGGGTGTTGTTTACTGGCAG  400

seq1  GTTTACATGGATTGCTAAGCCTGCTTTCTTATGGAACCCAGGATTACTGT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTACATGGATTGCTAAGCCTGCTTTCTTATGGAACCCAGGATTACTGT  450

seq1  CTCAGGGATGACACCACTTACAATGGGCCCTCTCTTTAATTACTAATTTG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAGGGATGACACCACTTACAATGGGCCCTCTCTTTAATTACTAATTTG  500

seq1  AGAAAATGACTTAGAGCTGGATCTCAGGGAGGCATTTTCTTAACTGTGGC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAAATGACTTAGAGCTGGATCTCAGGGAGGCATTTTCTTAACTGTGGC  550

seq1  TCCTTTCTCTATAATGATGCGAGCTTGTGTTGAGTGGACACCCAGAACCA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTTTCTCTATAATGATGCGAGCTTGTGTTGAGTGGACACCCAGAACCA  600

seq1  GCCATCACAGGGGTGTTCATAATTCACATCGGCTTTCTTAAAGGAGCATA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCATCACAGGGGTGTTCATAATTCACATCGGCTTTCTTAAAGGAGCATA  650

seq1  GGGGAGGATGTCAAGTTGTTCTTTGCCAGCAGAAAGCAACACAGGGCTAT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGAGGATGTCAAGTTGTTCTTTGCCAGCAGAAAGCAACACAGGGCTAT  700

seq1  ACATCTGGAACTACTGCAGACCTACAATTGACTACCACAATGTTTTAAAC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATCTGGAACTACTGCAGACCTACAATTGACTACCACAATGTTTTAAAC  750

seq1  TTCCATTGGGTTTGTTTGGTTTTTTTAGTGAAAGAGCCCATATTTATTCT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCATTGGGTTTGTTTGGTTTTTTTAGTGAAAGAGCCCATATTTATTCT  800

seq1  TATATGCAGACCAAAATGTCTCTCTTACACAGAACAAAGAGGAAAGGTAA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATATGCAGACCAAAATGTCTCTCTTACACAGAACAAAGAGGAAAGGTAA  850

seq1  GCTATTTGGCTTTTAAGGTTAAAGTGAAGTCCTCTATGTTAGACTCAACT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTATTTGGCTTTTAAGGTTAAAGTGAAGTCCTCTATGTTAGACTCAACT  900

seq1  GGATTCTTTATTAATATGTAGAGTAAAATGCCTGGCTGTAGACTTGCTAA  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATTCTTTATTAATATGTAGAGTAAAATGCCTGGCTGTAGACTTGCTAA  950

seq1  GAGAATTATGAAAAAAGTCAATTTATTAATGCTCTTAACAGTGATCTAAA  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAATTATGAAAAAAGTCAATTTATTAATGCTCTTAACAGTGATCTAAA  1000

seq1  CATGATCCATGGGGAGTGGGGGAATTGACGATAACCAGGGACTCCTGGAT  1050
      ||||||||||||||||| |||| | ||||||| |||||||||||||||||
seq2  CATGATCCATGGGGAGTTGGGGGAATGACGAT-ACCAGGGACTCCTGGAT  1049

seq1  CTTTCCTTTAGCTAAAGAGCAACCTGTCAGTTCAGGAGAACTAGCAGCAA  1100
      |||  | ||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||
seq2  CTT--CCTTAGCTAAAGAGCA--CTGTCAGTTCAGGGAAACTAGCAGCAA  1095

seq1: chr9_29232573_29232656
seq2: B6Ng01-332N14.g_75_158 (reverse)

seq1  CACACACACACACACACACACATACACACACACACACATATATATGTTGA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACACACACACACACACACACATACACACACACACACATATATATGTTGA  50

seq1  TCATCATTACACAGATGATCAATAGCCACAGTTA  84
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATCATTACACAGATGATCAATAGCCACAGTTA  84