| BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
|---|
| end name | MSMg01-107D18.T7 (MSMg01no107_d18.b1) | MSMg01-107D18.TJ (MSMg01no107_d18.g1) |
|---|
| ACC | AG321102 | AG321103 |
|---|
| length | 1,318 | 1,324 |
|---|
length of high quality
(start - end) | 327 (132 - 458) | 279 (129 - 407) |
|---|
| definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no107_d18.b1 PHD_FILE: MSMg01no107_d18.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:08:49 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no107_d18.g1 PHD_FILE: MSMg01no107_d18.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:08:49 2005 |
|---|
| singlet/doublet | singlet | --- |
|---|
| BLAST hit | unique | no hit data |
|---|
| sequence | NNCCGGTTTGTNNNNAGGCACTGCGCGCTAACGACTCCTATGGGAGAGGA
TCCGCGGAATTCTTATGTCCAAGAATGCCCTTCAAGCCAGGCAATATGGT
AACACTTTGTCTCAGACCCCTTTAAGGGGCAGGCATCTTTGGGAAGGCAT
GTGTGTGAGGAAGCCATTGGAGGGGCTGGTTTCTGGGGAAAAGAGACCCC
AGAACAAGGCCACCAGTCTGGCTTGAGGGCTTCAGAAGAGAACAGTGCCC
CCCCCCCCCCCTGCAGTGCCCTCTCTAGGTCCATGGAGGTTCATGTAAAA
GGTTTTGTTGTCCTTCCAGAACTCTACTATGACCGTGGGAACCACCATGA
GTTTGTGTCTTTGGTGAAGGACCTGGCTCGGCCAGGAGAGATCACCCAAT
CGCAGGCCTTCTTCTTTGAGTTCACCCATGTGGAAAAGCCGTATGAATCC
TACACCGGATTTTTTGCCCCCCCCCCGTGAGTGTCTCTGCTGTTCCTGAA
GGGGGCGGGGTCCTGTCTCACAGGGCAGGGTCTCAAGCTCCGTGGCTTTT
AATGGTCTCTGTGCAGCAACTAAGGTAGAGCACGGTCAGCTTCAGTGCGC
TAGTCCGTGTTACCACTGGTCTCCCCTGGGTAAAGCCTGCTGACTGATCT
TCTCTTGGCCGCCCTCAGATCTGATCGCAGCCTCCTTACCGTTTACATCT
CACGGAATTCCTTCAAGACCCTAGTCCTCCTAGATTTCGCCAGATGACGA
CGAATCCAATTTGATTTCTAACATTATCAGGCCTCTTACTTTATTTGCTT
CATTTCATAGCTCTCTTCACTTAACCTTCTTCACTTTTTTGGTCAATCCT
TTCCTAAAAACTCCCTTCTGACATTTTCCTCAATTGGTCTTACTCTTTTT
TACGTCGCCCTGCTCGCTTCACCCCCTCCTCTCTTTTCCTCCTTAGGTCA
ATTCGAACTCTCTTCTTAATTCTTTCTCTCCCCGTCTTATCCTTCCCTAT
CCCCTTTCTGTCTCTCTTTCTCCTTTAATTGTCCCTCTCTACCTTAACAT
TTCTTCTTCTTTACTCCTTACACTCTTTTCATCTGCTCCCTCTCCTCTTT
CTCTTCTTATCTGTTCCACTCCTCCGTGTCCTTTCTCCCTCCCCTATTCC
ATTCCTCCCTCTTCTTACGTATGTGCTCCTTCGATCTCCNCTATCCCCTT
TTCACCATCTGCTCCTCTCAGTTTCTGCATGCTACTGTTCTTTCCTGTGG
TTCCTTTCTCCTCTTCTTCTCCCTTCCCTACTATCCGTCTCCTCCCACTC
TTCTATAATCCTCACAAC
| NCCAAAAATTTNNNACACATGTGAGCCTGGGGCGCCXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCTTTTAAAGAGCCATGGCTACATA
GAGAGACCTTGCCTCACCTTTTTGTCTCAAAATTCAAGATAAATAAATAA
ATATTTTTAAATTTTTTTAAATTGCTCCTTGAGTCTGGGCAGGTGCCCTG
AGCAGACCTTGGGTGCAAACTCCACAGCCAATCCCACAACACCCAGAAGA
AGCTCCACTCCCAAGCACTTTAACACACTCAGGATCATAGGATCAGAGGT
GAGAGCACAACATCTGCCCCAACACGAGGAGTAACTGGGAGCAGCGGGAC
CCAGGCACCCAGGAACTCCACCTGACAAGTGCACATGTCTGAGCAGGTGC
ACTGAGTATATTTTGGGTGAGAATTCTGCAGCCAGCCCAATAACAGCCAG
CAGAAGCTCTATTCCCAGCACCTCTAACATGCCCAGGACCACAGGATCCC
ATGATCCCAGGAGCTTGGTCACTCTAGGACCTCAGGGTCCCAGAGGTAGG
CTGACTCCCAGGAGCTCTGACACACCCGGAATCTCAAGATCACAGGATCA
GATAATCACAGAATCACAGAGACAGCTGAACTCTGATGAGTTCCGAAACT
AACCAGTATCACAGGAAGGACAGGTTCCAGTCAGATATTTCAAGGGCAGG
TATCACTACAGATAATTAGATGTCATGAGGCAAAAGTAATAACTCAAGCA
ACAGAAACCCATCTTACTTGGCATCATCAAAATCTAATTCTCTCCTCATA
ACAAGATCCTGGACACACCATCACTACCATATCAAGCATGATTCAGATTC
TAAATCAATTTCTCGTGATGGTTGACAAAGGAATTTTTAAAAGGCACATT
AATTATTCCTTTTAAAAAAAAAATTTAATAATTCCTCGTTAACCATCTAA
ATATTCTTTTATGAAATAATCCCCTAATAATATTCCCTTTTTAAAATTTA
CATGGAAAAACCCAAAACCTTTGTTAGGCATTTTGAATTAAAATTTATTC
AAATTTCTATAAAATGGTATTTATACTAACTCTTTAAAGTAAATTCGTTA
TTTGGCCAAACAACCTCTCTTAGTTATTAAATTCCTTAAATAAAAATATT
CTGGTAGTTCTTAATTATGCTTATTTTTCTCTCTATCTTAATATTCTCTA
AATTCTGAATATTATAAAATATCCTACGTGTGTCTATAATAAATCCTCAT
CTAATAACATTTTGTATCTCTGCACTACACATCTCAATTAAATTTCTTCC
TAATATGCTAAATATTTTTTCCTT
|
|---|
| quality values | Open.Hide. 0 0 3 8 8 8 8 6 6 6 3 0 0 0 0 3 7 6 6 6 6 8 8 8 8 15 19 17 15 8 8 8 10 21 22 10 15 12 14 8 8 8 23 23 40 47 40 40 42 42
50 50 48 48 47 47 47 53 42 42 42 35 35 35 33 33 22 22 22 24 28 28 28 33 21 19 8 8 11 8 10 8 8 8 8 10 10 10 12 12 24 28 39 43 43 43 37 33 32 34
36 36 34 39 39 35 35 31 31 31 29 28 30 29 25 27 16 16 21 21 15 10 8 8 8 8 10 9 11 11 11 13 22 29 33 33 36 36 50 53 57 57 57 57 48 48 48 59 43 43
43 43 43 43 43 46 46 59 57 57 57 48 42 41 41 41 41 41 47 48 48 57 57 54 54 54 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 48 44 30 30 27 28 33 33 44 47 59 59 57 47
47 47 47 48 48 48 57 57 57 43 43 43 43 43 44 43 57 57 57 57 48 48 52 57 57 57 59 54 54 54 52 57 52 52 52 52 52 52 52 57 57 57 57 44 44 34 34 43 44 57
59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 43 43 33 33 43 44 57 57 57 57 57 52 52 43 44 57 52 52 47 43 52 57 57 57 52 37 43 52 57 57 52 52 52 57 59 52 52
52 52 52 52 44 43 33 33 33 43 43 43 52 52 57 57 57 54 54 54 57 57 57 57 57 54 54 54 54 54 54 54 57 46 42 42 35 33 32 32 37 39 42 42 43 41 43 42 57 47
47 47 48 44 39 39 37 43 43 59 59 44 31 26 26 30 40 42 43 46 43 43 43 43 37 37 35 32 37 32 30 30 30 36 33 25 25 25 25 37 37 47 43 43 43 43 39 39 43 47
37 43 35 25 21 12 12 11 13 9 8 8 8 8 10 19 28 40 40 40 40 43 43 46 48 59 43 43 37 33 32 30 32 32 39 42 35 32 29 34 25 25 29 37 43 43 43 40 40 43
39 37 21 14 10 10 10 10 9 9 9 8 8 8 10 15 10 12 10 10 10 23 21 19 17 11 9 9 16 18 17 19 28 24 24 29 29 25 25 28 28 23 23 18 18 11 11 9 12 9
9 9 13 13 11 10 10 10 10 15 15 18 28 25 31 31 31 29 25 25 25 21 28 23 16 16 15 15 15 19 24 28 28 30 30 30 28 32 23 32 28 21 28 18 23 23 28 32 34 17
10 8 8 8 10 10 25 29 25 26 14 14 12 12 11 12 12 16 18 20 21 15 12 8 8 8 8 8 10 16 13 11 11 10 10 10 13 11 10 9 9 9 9 9 9 10 10 9 9 9
11 13 9 10 10 17 12 12 13 13 8 8 8 8 8 8 9 11 10 9 9 10 16 19 33 33 28 18 15 13 13 15 18 15 20 20 20 21 21 14 14 14 28 26 29 19 13 10 10 10
13 8 8 8 8 10 12 12 15 15 22 15 13 10 8 8 8 8 9 10 9 8 8 6 6 8 8 9 11 11 12 10 10 10 10 10 20 12 12 15 12 13 10 8 8 8 8 8 8 8
8 8 9 12 10 10 10 10 12 16 10 9 9 9 11 10 10 11 12 8 8 8 8 8 8 8 8 18 15 11 9 9 12 9 10 9 10 8 7 6 8 8 9 9 9 9 9 10 9 9
9 8 8 8 8 8 8 8 8 9 12 19 10 8 8 10 8 9 9 8 8 8 8 10 10 10 13 8 8 8 8 8 8 10 10 10 8 8 8 8 8 8 10 11 14 10 8 8 8 8
8 10 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 12 10 13 9 10 8 10 8 8 9 8 8 8 8 8 8 10 8 13 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 10
8 10 6 6 8 8 8 10 11 11 11 12 12 10 8 8 7 7 6 8 8 8 6 7 10 10 10 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 12 13 13 12 12
8 8 8 8 6 6 8 8 10 8 10 10 10 8 8 9 8 8 6 6 8 8 10 10 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 10 11 12 12 11 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8
8 8 9 9 9 9 8 8 8 8 11 11 13 9 6 6 8 12 8 8 11 11 10 10 10 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 8 8 8 9 9 10 10 8 8 6 6
8 8 10 10 9 8 12 7 6 8 8 8 8 10 12 7 7 8 8 10 10 11 11 8 13 13 8 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 11 8 8 8 10 8 8 6 6 8 8
8 13 13 10 8 8 8 8 8 8 10 11 11 11 12 11 11 11 11 10 8 8 8 8 8 8 8 8 7 6 8 8 6 6 6 6 10 8 8 7 7 9 8 8 10 12 10 8 9 11
8 8 10 12 10 7 6 8 8 8 8 6 6 8 6 6 8 6 7 8 8 10 14 9 9 9 9 9 10 15 15 10 8 8 10 8 8 8 8 11 11 11 11 8 8 6 6 8 8 9
9 9 8 8 8 8 8 10 6 7 8 11 8 8 8 8 9 8 8 10 8 8 6 6 8 8 8 8 10 13 10 8 8 7 7 8 13 8 3 0 3 8 8 8 10 9 10 10 10 10
16 12 12 10 8 8 6 6 10 6 8 8 10 11 11 13 10 10 8 8 8 8 10 7 7 8 8 6 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 9 9 9 11
7 6 8 10 8 8 8 9 8 8 8 15 8 8 8 8 8 8 12 10 8 8 8 10 6 7 8 10 8 8 8 6 8 8 8 6 6 6 6 8 8 9 9 9 11 9 9 8 10 7
9 9 9 12 10 10 8 8 8 8 13 15 7 6 8 8 8 6 | Open.Hide. 0 3 11 11 11 9 9 9 9 13 3 0 0 0 3 9 9 9 6 6 6 6 6 8 10 6 6 6 6 8 8 10 10 13 8 8 9 8 10 9 15 15 17 8 8 10 15 14 14 8
12 17 24 28 32 32 36 37 37 35 35 28 33 36 36 33 37 41 41 41 47 27 27 9 9 9 9 11 8 9 9 8 8 8 10 17 23 33 33 33 33 29 23 18 18 25 30 33 36 36
36 36 50 36 36 31 31 31 28 28 25 23 21 21 11 11 11 12 12 12 16 11 10 10 10 15 19 22 19 19 26 32 39 47 47 48 48 47 50 53 53 50 50 57 53 48 48 48 54 54
68 68 68 68 68 68 68 68 50 50 50 68 68 68 68 50 51 50 50 43 50 57 57 57 57 57 57 50 57 57 48 48 41 41 41 42 44 43 36 32 36 36 35 42 44 57 57 48 48 48
41 42 43 35 28 27 32 32 43 38 36 43 43 44 44 52 52 52 52 57 57 57 57 52 52 52 52 52 52 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 54 57 57 57 42 42 33 35 35 42
43 39 39 43 57 52 57 57 57 57 57 57 57 52 52 52 57 59 57 57 57 57 57 52 52 52 52 52 43 43 43 57 52 57 57 57 50 50 37 37 37 50 50 57 43 50 39 43 43 50
43 42 35 35 43 43 43 43 43 43 43 52 52 59 59 57 57 54 54 57 57 50 57 57 43 43 43 43 39 41 44 42 42 35 35 27 26 14 21 19 24 24 24 25 23 32 30 29 19 29
29 36 25 25 25 25 30 37 37 39 37 39 37 39 43 40 43 43 43 43 47 46 57 48 43 43 43 43 43 43 48 48 48 48 48 48 48 48 48 32 32 18 17 17 22 30 37 37 32 35
35 37 32 22 8 8 8 8 8 6 6 8 8 13 10 19 24 28 39 31 31 24 27 27 39 37 39 28 28 32 34 25 30 28 30 30 30 30 32 32 37 30 23 23 32 23 20 19 30 24
15 12 12 15 19 12 14 21 26 24 31 26 17 14 13 14 12 10 10 10 10 10 13 12 18 16 15 24 13 15 13 26 24 31 26 19 19 12 21 21 24 17 17 24 21 21 15 12 12 12
12 15 15 15 19 19 28 21 26 18 20 23 28 28 37 37 37 39 31 32 28 32 43 40 43 43 30 30 17 18 18 25 23 17 17 17 18 18 20 30 31 20 25 25 36 36 37 28 28 28
37 30 36 30 30 30 42 32 29 17 17 21 19 19 22 32 36 36 33 25 25 28 33 30 32 28 37 31 31 25 29 29 40 33 36 35 36 36 39 37 37 28 28 28 20 18 19 15 15 10
19 17 16 15 23 15 14 13 16 15 12 12 19 15 12 12 12 12 12 11 11 11 12 12 12 16 9 8 7 8 8 10 19 18 18 11 10 8 8 10 22 17 11 11 11 11 12 12 14 14
12 12 10 12 11 12 11 13 16 16 15 15 16 12 13 13 13 13 19 28 24 25 25 30 28 28 23 20 20 26 22 22 12 11 10 16 13 13 10 15 11 11 12 16 12 12 13 18 17 10
11 7 6 8 8 8 12 12 10 8 8 8 13 10 10 10 10 9 10 10 17 18 23 19 16 17 18 10 8 8 8 8 10 13 19 19 25 24 24 23 23 24 24 19 16 12 10 10 10 10
10 11 11 18 11 11 10 8 8 8 8 8 8 11 11 10 14 19 15 14 14 14 16 20 12 12 12 11 11 16 11 11 11 11 13 12 18 11 13 10 10 8 8 12 15 15 14 14 14 11
10 10 8 10 6 6 8 10 8 10 11 8 8 8 8 8 8 10 10 10 10 9 9 11 11 10 10 11 8 8 8 8 8 11 8 8 8 8 8 8 11 11 21 11 11 10 9 10 10 8
8 10 10 10 8 8 8 8 8 10 13 13 12 8 9 9 12 10 8 10 11 8 8 8 8 6 6 8 6 8 8 9 9 9 8 8 10 6 7 8 8 8 8 8 8 8 13 7 9 10
8 10 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 13 11 12 11 11 11 18 16 8 8 6 6 8 6 8 8 10 13 11 14 10 10 9 9 10 12 12 12 12 11 11 11 11 11 11 9 10 7
6 6 8 8 10 10 10 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 6 6 8 8 9 9 13 24 19 13 21 24 23 23 24 16 12 11 8
8 8 8 9 11 11 13 13 10 8 8 8 8 10 10 9 8 8 8 10 8 8 6 6 6 8 10 10 10 9 10 8 10 6 6 6 6 10 10 8 8 8 14 8 10 6 6 8 8 12
15 13 14 8 10 13 8 8 8 8 8 9 12 15 8 8 8 10 8 8 11 8 6 6 8 8 8 10 8 9 8 10 8 8 8 8 11 11 11 10 10 10 16 14 10 9 7 6 8 8
8 8 8 11 12 17 12 12 15 11 10 9 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 10 13 14 11 11 8 8 6 6 8 8 7 8 9 13 12 12 10 12 10 9 8 8 8 8
8 8 8 8 10 8 8 8 13 13 14 14 15 15 12 8 8 8 8 8 8 8 10 9 9 10 8 8 10 8 6 6 11 10 10 10 10 10 10 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8
8 6 6 8 8 9 11 8 8 6 6 8 8 6 6 8 10 10 9 9 8 10 10 8 8 6 6 8 10 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 10 11 16 12 16 9 8 10 8 8 8
8 10 8 8 7 7 10 7 6 8 8 10 9 8 8 8 8 8 8 7 6 8 8 8 8 8 8 8 8 7 10 6 6 6 6 8 8 10 9 8 8 8 8 8 8 8 10 6 6 8
6 6 8 6 8 9 6 6 6 6 8 12 9 9 7 9 9 11 11 16 19 15 14 14 |
|---|
