BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-109P23.T7 (MSMg01no109_p23.b1) | MSMg01-109P23.TJ (MSMg01no109_p23.g1) |
ACC | AG323036 | AG323037 |
length | 727 | 737 |
length of high quality (start - end) | 316 (48 - 363) | 239 (76 - 314) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no109_p23.b1 PHD_FILE: MSMg01no109_p23.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:13:25 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no109_p23.g1 PHD_FILE: MSMg01no109_p23.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:13:25 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | CCCTCATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGC
GGAATTCATTTATTTATCCAGTTTTGCTTTTGTAGGACAAGGTCTCAAGT
AGCCCAGGCTAGTTTTAATCATATGATGTAACCAAGGCTATCCTTCATAT
CGCGCTCCTCCTGCTTTCACTTACCCCTAACATACACACACACCTGCTAG
GATTACAGGTAAGCACCAGCCCAGCTGGCTTACATTCATTATTTTTCCAT
TATATAACAATAGAGCCAGGAAGGGGACTCCCAACCTTGTGGCACAGCCT
GTGATGCCAGCTACATGGAACACTGATACAAAAGGATGACACGTTCAAGA
CATGACTGGGCTACACTGTAAGTTGAATCCAGCAAGCCTGTCTCAAAACA
AAAATAGGCCAGTTTGCACCAGTTTACCTTGTGTTGGGTGCAAACTCCTC
AGCCAGTGCCACAGCACACAGAGGAGGCTCCACTCCCAGGCGCTCTAGCA
CACCCAAGATCTTAGTATCAGAGGTAAGTAGGACACCTGTTCTGCTGAGA
AGGATATCTGTTCCAACACCACCAGGAATAACTGGTACCAGCGTTGTTCA
GAGATGTAAGAACCCTATCAGATCAGTGTCAAGGATTCCTATCCAGCCAG
TGCCCTTAATTGTCATCTATCACCCATAAGAGGTCCCAAACCCAGCCATG
TTATACACCAAAATACTACACTATCCT
| NATCGATGTAGTXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCATAGGCCCTTGTCCATACGGACAC
TCAAAAGACCATTCCTGTGGACTAACATCAGGTTAGTAAAGCCCATGAAC
TCAAGGCTTGAAAATATGCATCTACTTTAGAGGGTAAAACAAAGCCCCAC
ACAAGACCCAGGGCCTTGACATGTTATCAGGTTGTGTGGTGTCCATGTAG
AGTACAAGTTAACATGCACAAAAGTTCTGTGTTCTTGGATAGAATGACCT
GATGCTATCACTGCGCAGCACAGATTTGTTGGCAGGCCTAGAACAAAGGG
GCGTGGGGTTCCATAGTGTTTTCCGGATAGGCCAGAAATCCTGCCACGCA
TGTGAGGTTGAGTGTTATTCCTGTTGTAGAGAATACCGTGTCTGTTTCCT
ACCCCTCGTTCCCAGTTGTTATTTCCCACTCTCTAATATACTATGCTCTC
TCCCTTAAATTAATTTGTTTATATTTTCTTCTTTCATAATTATCTCTCGC
CTATTAACCTCCTATTTTCTTTATTCTTCTCCTTCCTCCCTCTCCCCTTT
CTATATATTATTTTATCCCCCTATCATTTTTTTCAATCACTACACCTCTT
CTGTTTTGTTTCTATTTAATTTTTTATCTACTTATCACCTCCTTCTTATC
TATAACTTTAAAATACTACCTAATTTAAATAAACCCA
|
quality values | Open.Hide. 9 9 9 9 10 8 8 13 11 18 30 30 30 22 19 14 10 11 19 21 18 9 9 9 23 23 37 22 17 17 17 14 22 23 11 14 11 14 11 10 9 16 9 10 9 11 15 19 32 34
34 33 33 33 33 50 33 33 33 33 42 41 30 27 18 11 11 10 10 9 9 12 12 22 30 33 33 33 39 33 33 29 34 36 33 33 20 24 24 28 28 34 42 34 37 34 36 36 42 43
48 48 43 42 42 36 32 42 44 50 46 48 39 39 47 48 54 46 46 41 44 42 47 47 47 37 42 37 37 42 43 43 37 48 48 41 39 39 57 57 57 47 47 42 42 37 37 37 43 42
44 43 50 50 57 57 57 57 57 57 57 47 47 35 35 35 43 43 57 57 57 57 57 57 57 57 57 50 43 35 35 43 43 57 57 57 52 57 52 54 54 57 57 57 57 52 57 57 57 47
47 47 57 57 57 57 57 57 39 39 39 57 57 57 57 57 57 57 45 39 39 43 43 39 44 44 57 52 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 52 57 52 52 52 57 57 57
57 54 38 38 15 12 12 32 32 50 50 52 52 52 52 52 52 57 52 52 52 59 59 35 35 35 37 43 50 57 57 52 52 52 50 44 50 50 44 44 43 33 33 36 43 43 43 43 43 59
43 39 36 39 39 46 46 54 54 54 54 57 57 48 40 36 23 22 22 27 27 28 24 22 30 14 14 14 14 14 15 30 41 39 43 43 41 41 41 39 41 41 42 42 35 36 36 43 43 47
47 43 43 43 47 47 47 47 43 34 23 23 22 15 15 11 11 11 18 18 19 19 13 13 13 18 15 20 26 19 22 25 28 28 32 31 31 32 37 35 35 35 39 39 39 40 40 47 47 48
48 47 47 47 48 39 39 43 37 33 40 28 28 37 37 39 48 48 48 59 47 48 43 39 39 39 41 41 22 14 9 9 9 9 22 15 15 18 13 21 28 33 37 43 43 48 48 48 47 32
28 20 20 20 32 30 39 35 36 36 43 42 37 32 24 24 20 24 24 31 18 19 17 22 24 28 19 20 20 32 28 37 37 39 39 39 30 34 32 42 42 30 32 28 38 30 35 35 35 28
32 28 32 37 35 42 35 30 33 30 30 28 22 15 15 15 15 25 19 17 17 24 19 23 23 25 26 36 26 21 11 11 11 16 23 32 25 25 20 28 31 37 37 43 43 32 28 13 11 11
11 11 11 12 18 16 24 19 19 10 10 10 15 10 12 15 19 19 19 18 17 17 12 17 11 10 10 18 22 25 23 21 14 9 9 9 8 12 15 13 8 8 8 8 8 8 8 11 12 20
19 20 17 17 11 11 10 10 9 9 10 15 13 18 12 12 9 9 9 12 12 11 13 10 10 10 10 8 8 8 8 8 9 9 9 9 9 8 8 8 9 12 13 11 10 10 10 6 8 6
6 8 8 8 10 10 8 8 8 8 8 8 9 9 7 8 8 10 10 8 8 9 9 10 9 11 12 12 7 7 6 6 6 6 8 8 11 12 12 12 12 19 19 10 10 6 6 6 6 8
8 10 8 8 8 10 8 8 8 10 11 11 11 11 10 10 11 8 8 8 10 10 10 15 17 17 17 | Open.Hide. 0 3 6 6 8 7 10 10 6 6 8 19 19 10 10 12 17 24 28 26 30 37 37 23 21 28 28 29 29 41 32 27 15 9 6 6 8 6 6 6 8 10 19 18 23 20 22 23 22 10
10 12 27 26 36 38 38 42 26 23 13 11 11 13 17 13 18 15 15 10 10 20 20 29 36 42 41 41 41 39 41 39 44 42 42 42 37 26 31 36 36 48 40 57 43 37 37 57 46 47
57 44 37 37 30 42 42 37 37 37 48 48 50 54 46 46 36 44 44 47 47 57 57 50 50 50 50 42 48 48 46 46 47 46 50 43 43 43 35 35 35 43 43 57 52 52 57 52 57 50
50 50 50 35 36 43 50 57 57 57 57 50 50 50 57 57 57 57 57 57 52 57 57 57 57 57 57 57 39 57 43 46 26 26 23 35 57 57 57 52 52 52 50 43 37 37 43 43 52 52
52 52 52 52 52 52 52 57 50 50 43 38 41 41 43 50 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 50 43 37 37 43 43 57 42 37 36 36 42 48 47 48 57 57 57 47 42 35 35
42 42 26 32 15 15 15 32 32 43 43 43 46 48 57 48 47 47 47 42 46 41 41 47 41 42 48 48 48 48 48 48 48 54 47 47 23 23 11 12 12 28 24 47 47 47 47 48 48 48
48 48 48 48 39 47 35 35 35 37 18 18 8 8 8 15 16 16 23 18 23 8 8 8 8 8 6 6 6 10 8 9 12 16 19 23 28 32 37 32 30 30 34 34 35 30 24 24 14 14
14 23 28 28 14 14 14 14 28 25 25 28 24 23 14 14 12 12 11 12 11 10 8 8 8 8 8 12 15 11 12 14 18 16 23 23 23 34 28 36 39 43 39 43 34 25 16 11 11 10
11 11 15 15 21 18 8 8 6 6 8 8 10 10 8 8 8 9 9 12 20 15 11 10 13 9 9 10 12 10 11 11 11 11 11 12 12 9 10 10 8 8 8 10 11 10 12 12 14 17
11 11 11 15 16 18 12 8 8 10 8 8 8 10 10 8 8 6 6 7 7 8 10 10 13 12 11 9 9 9 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 9 8 8 8 8 8 8 8
8 8 8 8 10 10 9 10 10 8 11 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 10 11 15 10 12 10 10 8 8 9 10 10 10 10 10 10 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 6 6
8 8 8 6 8 8 8 8 8 6 6 8 10 11 11 23 21 15 15 10 10 10 10 9 9 11 11 11 11 12 10 10 10 9 8 10 10 10 8 8 8 8 10 10 10 14 14 10 13 9
8 8 8 8 10 10 9 9 8 8 8 11 8 8 8 8 8 9 9 10 10 10 8 8 6 6 8 8 9 21 11 11 18 18 12 12 12 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8
8 8 11 11 15 14 11 11 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 9 9 10 10 10 10 10 8 8 10 10 8 8 9 11 11 8 7 6 8 8 10 8 8 8 8 8 8 11 12 12
12 16 17 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 6 6 11 8 11 10 10 10 10 |