| BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
|---|
| end name | MSMg01-111A07.T7 (MSMg01no111_a07.b1) | MSMg01-111A07.TJ (MSMg01no111_a07.g1) |
|---|
| ACC | AG323794 | AG323795 |
|---|
| length | 1,170 | 1,156 |
|---|
length of high quality
(start - end) | 697 (87 - 783) | 684 (115 - 798) |
|---|
| definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no111_a07.b1 PHD_FILE: MSMg01no111_a07.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:14:48 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no111_a07.g1 PHD_FILE: MSMg01no111_a07.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:14:48 2005 |
|---|
| singlet/doublet | singlet | --- |
|---|
| BLAST hit | unique | no hit data |
|---|
| sequence | CAATTTTNNNNNNGAATCAATGGGCGCTAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXCGCGGAATTCTAGAGTGCCTCACCTTCCTTTACCGACCTGTGCTGTAG
ATTTCTAGATCAAAATACCGCTTTAATTTGCAGCAAGTTTGCTACCTTCT
CAGCATCTGCAGAATACTAGAGGAAGCAGCAAAGAAAATAAATAAAAAAA
GTAATTATATTAAAAGTGCATGAAAGCAAACTCAAGGACATATTATCACA
AAACTGAAAATGTCACATACCTTTGATAGTAACATAGGAAGTGTAATGAT
AAAATGTTCAGTTAATTTGTTCCTATCATCAATTTGAGTTTTCCTTTCTT
TGGCTGTTAGCACCTAGAAATAAATTGAAATGGTAAAAGAATGTTATTTG
GTAGTTTAGAAATTGAAACTGTTAACATAAAAAAAAAAAAAAACATTGGC
AGATGACATACCAAGAAATTTAAGAGGAATATAAGACTTCGTTTAAGATG
ATTTTGACTTCCAAGTTATAAAAATTGTTTAGTTCAACAATGTAAAAATA
AAATTAACAATTGTTAGGATATACTCAAGTCAGAGAATTATGAATGTAAA
GTTGTATTTATATAAACATTTTTAGGGATACAGACACCAGTAAAGTATCA
AGAGTCTAGAGTTAATGACATCAATAAGTTTACTATAGGCTTTTTACTAA
TTGAAAACTTACTCTCTTGCCAGTACCCCTTCCCACTGGAGGATGTGCCT
CAGCTGCCTGACGAATTGTACAGACCATTAGCTCTATAAGAGCACTCTCT
TGACGGTCAGACATTGCTGAAATGAACAAAGTGTATGAATGGTTTCATAA
TCATATCTTAAAAATAAGAACATGATTTATCAAAAACTGAAAACACATAC
AACTTTATTATGGAAAACTAATGTAAGACTCTAATTTTGATACTTCCCCC
TTCTATTTAATAATAAGCGGAAGCTATCTTTAACCAAATAAAAAAAAGCC
CTTAAGGTAAGCTCTTTTGCCCCTTCTAACATCAAGTTTCCTTTAATTTC
CCACTTTTTGAGTAAGGTAAAAACAAAAATTTTTACCTGGTATTTTCCTT
CCCCATAAAATTTCCAAAACCCCAAAAATAAAAAATTCCCTTTTTGGTTC
TTCCCAAGAAATAGAAAAAA
| NNNNAACACATGGATGCTGGGGCGCCXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXCCTTTTAAGCTCAACCACCCGGCCCTGGGCTTTTT
TGTTGGCATACTTTTAATGGCTGCCTATATATCACTAGGTGGTAAAGGTC
TGTTTAAATTGTTTGTTTGATCTTGATTTAACTTTTGTAAGTGGTGTCTA
TTGAGAAAATTATCCATTTATTTTAGATTTCCCAGTTTGGTGGAATACAG
GTTTTTAAAGTACATCCTTATGAGTCTCTAGATGTCCTCAGTCTCACTTG
GTATGTCCCCTTTTCATCTCTAATTGTGTCATTTGAATATTCTCTCTCCG
CCTTTTAGTTAACTTGGGTGAAGGCTTATCAATTTTGGTGATTTTCTCAG
GAACCAACTCTTTGTTTCAGTAATTCATTGTTTTTGTCTTGTTTGTTCAT
TTTCTTTTTCCTTTTTTCTGAGACAGGGTTTCTTTGTGTAGCCCTGGCTG
TCCTGGAACTCACTTTGTAGACCATGTTGGCCTCGAACTCAGAAATCCAC
CTGCCCTCTGCCTCCCGAGTGCTGGGATTAAAGGCGTGCGCTACCACTGC
CCGGCTGTTTGTTCATTTTCTATCATGTTTATTTTTGTTCTGAGTTTGAC
TATTTCTTGCCATCTTTTCCTTTTGGGTGTGGGTTTTTTTTCTTTCTTTC
TTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTT
TCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCCCCTCTCCCCCT
CCCTCTCACCCTTCCCCCTTCTCCTTCTCCCTCTTTTCCCCCCTTTTTGT
TTTACAACTTTCCAGTGTGCTGCTTAATCACTAATATCTCCTATTTCTTT
TTAATGTTTGGCCCTTATTGCCATGAATTTTCCTCCTTAAGGCCCCCTTT
CTTTTTTGCCCGGTTAATTTTGGGGGCGGTATGGAATTCCATTTTCCATT
CCCTTTGAAAAAAAGTCCTTTTTTTTTTCTTTTCCAGAAATGGATATTTC
TTTCCCCTCCCACTTGGGAAATTGTTTTAACTTTTCCCTGAATTTTCTTC
GTCTTTTTCTTCCTGGGGTGAATACCCCTCTCTTTTTTTTACCCTTGTTT
GGGACC
|
|---|
| quality values | Open.Hide.12 12 11 12 11 11 3 0 0 0 0 0 0 3 6 6 6 6 6 8 8 8 8 10 13 10 8 8 8 8 8 13 17 19 8 8 8 13 13 20 24 24 35 35 34 34 34 36 36 40
48 53 48 48 57 57 57 57 43 50 37 36 36 36 35 35 35 35 31 31 33 37 37 27 23 10 8 7 8 8 10 10 10 11 11 13 22 30 33 26 29 31 35 35 35 35 35 35 35 37
43 57 57 42 42 38 38 36 36 44 44 50 37 33 33 25 21 10 10 10 10 10 9 11 11 28 25 41 47 47 46 43 43 46 43 57 57 50 50 50 37 37 42 47 47 47 57 48 48 48
47 48 48 68 48 48 48 48 48 54 59 57 50 53 51 50 50 50 50 50 50 59 59 59 57 57 57 54 57 59 59 57 57 59 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59
59 59 59 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 57 59 59 59 57 59 59 59 59 59 59 59 68 68 59 57 54 57 57 54 57 59 59 59 59 59 59 59 57 57 68 68 68 68 68 68 68
59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 57 57 57 57 57 59 59 57 57 57 59 59 68 68 57 57 57 57 59 59 59 59 57 57 57 68 57 57 59 57 57 57 57 57 62 62 62 62
68 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 62 62 62
62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62
62 62 62 62 62 62 62 62 43 43 39 39 39 44 44 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 43 43 39 43 39 44 44
39 39 43 43 43 62 52 52 43 43 43 39 31 31 31 39 43 43 43 43 39 29 23 29 29 43 43 62 62 62 62 43 44 35 35 35 44 43 62 41 62 62 62 43 43 21 21 21 39 39
43 62 62 52 52 52 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 43 43 39 62 43 43 41 62 43 52 52 52 52 43 44 39 39 35 44 44 62 62 62 62 62 62
62 62 62 62 62 62 62 62 43 43 35 43 35 44 43 57 57 57 57 57 57 57 57 43 43 35 44 43 52 43 43 39 39 39 57 57 57 57 59 57 57 57 57 52 52 45 57 59 57 57
57 52 43 43 39 39 57 59 59 59 59 59 59 59 52 52 52 52 52 57 57 57 57 57 57 52 52 52 52 52 52 52 43 43 35 35 35 50 50 50 50 50 50 50 47 50 47 50 44 44
43 43 50 43 43 43 47 59 43 43 47 47 57 57 43 43 42 44 42 35 35 37 47 47 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 54 54 54 54 54 54 54 59 59 57 48 48 47 47 47 47
43 43 46 46 59 59 54 54 54 48 47 43 43 39 39 43 43 47 37 59 39 25 25 12 12 18 28 34 48 48 41 41 41 39 37 28 31 18 18 19 29 32 37 37 30 30 30 31 28 31
30 30 17 17 25 30 39 36 36 28 28 23 31 31 36 34 34 33 37 30 32 32 39 43 43 43 48 40 43 32 21 15 21 21 24 23 15 24 15 16 18 28 18 24 24 28 28 30 30 30
37 29 28 29 21 22 20 28 28 23 23 13 8 8 8 8 13 15 32 17 15 18 22 22 23 34 34 36 30 30 22 22 20 20 14 18 18 17 19 25 23 9 15 8 8 8 12 17 25 20
24 14 14 14 21 20 28 30 15 15 9 9 9 12 16 18 10 13 8 8 8 8 8 8 10 11 18 10 11 11 16 10 10 10 16 19 22 18 15 12 12 17 19 16 25 15 15 12 10 10
13 10 11 11 18 15 9 9 9 8 11 11 13 12 11 8 8 10 14 12 12 12 10 10 8 8 8 6 8 8 8 13 13 21 19 19 12 13 13 11 11 11 16 15 17 14 19 22 17 17
16 9 10 8 8 8 8 10 12 11 11 11 12 13 10 10 10 10 10 12 11 12 12 16 14 13 13 13 12 11 14 10 9 9 9 11 8 8 8 15 12 10 10 18 13 11 8 8 10 12
12 15 15 10 9 12 9 11 8 9 9 9 10 12 12 28 21 19 10 10 9 9 12 13 13 11 6 6 6 6 8 8 8 8 10 10 10 11 10 10 9 9 9 9 9 10 12 8 11 10
10 6 6 8 8 8 14 12 10 10 10 10 8 8 8 8 9 11 8 8 8 8 9 9 11 11 23 21 32 32 32 25 25 13 10 9 9 8 6 7 6 6 6 6 13 10 10 8 8 8
8 8 10 12 10 10 8 12 9 9 8 9 7 9 9 12 9 9 10 10 10 9 11 11 10 8 8 8 8 8 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 15 14 9 10 10 11 11 6 6
6 10 7 9 7 7 7 7 13 7 7 6 6 6 7 8 18 21 19 15 | Open.Hide. 0 0 0 0 3 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 6 6 6 8 9 9 19 19 8 9 8 15 12 22 21 21 9 9 10 21 21 31 28 28 28 38 36 36 50 43 37 37 39
39 50 50 50 53 53 59 59 59 59 59 31 23 12 9 9 10 11 13 11 9 9 9 10 12 9 11 11 17 21 37 37 37 37 59 59 53 53 38 38 42 42 38 50 59 59 59 59 50 50
47 34 27 16 10 10 10 10 10 10 18 22 22 22 28 24 24 24 39 39 39 47 47 43 43 43 47 47 53 53 53 53 50 42 42 47 47 47 42 50 50 50 54 54 54 54 57 57 57 57
57 57 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 57 59 59 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57
57 57 59 52 52 52 59 59 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 57 57 52 52 52 59 59 59 57 57 57 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 68 68 68 68 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62
62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 68 62 62 62 62 62 62 62 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62
62 62 62 62 62 62 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 43 43 43 62
62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62
62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 45 62 59 59 59 59 57 57 57 59 57 57 59 59 59 57 57 59 59 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 59
59 59 59 59 57 57 57 59 59 59 59 59 59 68 68 68 59 57 37 37 37 57 57 57 59 59 59 59 59 59 52 57 57 52 57 57 57 57 59 59 52 52 52 57 57 68 68 57 59 54
57 57 59 59 48 48 48 50 50 59 59 59 59 59 57 54 54 54 57 57 68 68 59 59 54 54 54 57 57 68 68 59 59 48 48 48 59 59 59 57 57 57 57 57 48 50 57 57 57 57
57 57 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 47 44 44 44 37 37 41 43 47 59
59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 43 43 43 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 54 54 40 40 30 30 28 32 32 48 48 48 57 57 59 54 54 54 59 54 54 54 59 59 59 59
59 57 59 59 59 59 68 57 54 54 54 54 54 57 57 57 59 54 54 54 59 59 68 68 68 59 59 57 50 50 50 47 47 47 47 42 47 47 50 50 57 57 48 48 48 48 47 46 46 47
41 43 43 37 19 25 12 12 12 30 30 59 59 59 43 40 40 33 33 33 33 32 28 20 18 20 21 34 37 33 33 33 33 41 47 48 48 48 40 40 40 39 43 23 19 19 9 9 9 12
25 15 8 8 8 8 10 10 10 11 11 13 13 18 8 8 8 8 9 22 22 17 11 11 12 18 18 12 14 10 19 16 22 19 22 8 8 8 8 8 8 8 14 14 24 23 30 21 19 10
8 8 11 11 10 9 8 15 8 8 6 6 6 8 8 8 8 15 10 10 8 6 6 8 8 8 9 9 9 9 9 10 10 11 11 11 10 17 17 16 16 18 18 23 16 12 10 9 9 19
17 9 10 9 9 9 9 19 15 9 9 12 11 11 13 18 9 9 9 11 11 9 8 8 8 8 8 15 14 9 9 8 8 8 8 10 10 8 8 8 8 8 18 12 10 10 10 6 6 8
8 6 6 17 17 8 8 8 10 9 10 8 8 8 8 8 10 10 11 11 11 11 11 10 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 9 10 14 19 15 13 11 12 16 15 21
12 15 12 17 11 13 11 9 10 8 8 8 8 8 8 6 6 10 8 23 28 30 30 37 27 16 13 13 12 12 12 14 14 11 10 8 8 8 10 13 16 12 8 8 8 8 8 13 11 11
11 24 18 15 12 11 11 11 13 8 7 7 9 13 8 8 9 9 13 19 16 10 10 8 8 10 8 13 10 10 11 11 10 15 8 8 8 8 10 10 10 10 11 11 17 13 8 8 6 6
8 8 8 8 10 10 10 8 6 8 8 8 8 8 11 11 11 8 8 8 8 6 6 8 12 13 13 9 7 10 6 6 6 9 9 12 14 13 12 12 12 16 16 10 10 6 6 8 10 8
8 8 8 12 12 12 |
|---|
