BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-161D08.T7 (MSMg01no161_d08.b1) | MSMg01-161D08.TJ (MSMg01no161_d08.g1) |
ACC | AG360671 | AG360672 |
length | 1,260 | 1,236 |
length of high quality (start - end) | 422 (30 - 451) | 379 (73 - 451) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no161_d08.b1 PHD_FILE: MSMg01no161_d08.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:27:33 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no161_d08.g1 PHD_FILE: MSMg01no161_d08.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:27:33 2005 |
singlet/doublet | doublet | doublet |
---|
BLAST hit | unique | unique |
---|
Map location. | (77,373,622 - 77,374,028) | (77,463,753 - 77,464,131) |
---|
sequence | NNCCCACACTGCGCCTATAGACTCACTAAGGGAGAGGATCCGCGGAATTC
TGTTTCCACAACACGGTAGGCTGAAGCCCAAGGGTTGTCTTTCACTGCTA
GCACTGCGAACAAATACAAATCAAATACCTTAAAATGTGCCGTGACTGTC
TCTCAGTAAGATCAAGATCATACTGCCCAAAGCAAAAAAGTTTTTGAGGA
ACGTTTGCCCACTGACTGCTAGTGCCTTAATTTCCCTACAGGCACAAGGG
GATGCTGGTCTCGCTGTCCAGAGTCAGTTCCTGGGCCTTGGTGGGCCAGC
ATTATAAGCAAGTGTCACCATATTTCAATTCCCTGAACAGAGGGGACCTG
AGTTAAACCTCAGGTACTACAACAGCTCCTTAGAACACGCTCAGCTTGTG
TGCTCTCCCTTCCACTCTCCCTGCCCTGTGTGTGTATGTGTGTGCGTGCA
TTTTTTTTTCCCCCCCCCGGGTATGTGTCTATATATACACAAAAAAAGGA
GAAGAAACAAGAGTATAAGGCAGAGGCGAGAATCGTAAATCTCACTTAGG
AAACCATGAAGGGGAGCCTGACAGACTCCTGACTTGCAGTGACGTGACAC
TCTTTTATCACGGGCATGAAGGAGAACCATTACACCCAGAGTCTATGTGC
CTCATACAGTAGACTGTGTGCAAGCAACTGTAGTACAGGGTTCTTAGTCT
TGGGTGTTCTGTACTCCCTCTGACAAATGTATGAGCACTTGGGAAACTGG
AACCCTTTCTTTTCTGACAATAATTAGCATCAGAACAGAGCTGCAACAGA
GCTGGTGCTTTGTTTATAGTCACTGCAGTCCTCATAATGCCTGTGAGGAA
TTTATCATTTCTCACTTAAGGAAAAAAACCAACCAACTGAGGCTCAAAAA
TGTTAACTAGCTCTGCAGGATCACATCACCCTTAGGTAGTAAAAAATGGA
TACCAAACCTTCCTGTGTATAATACCCAAGGCCCAATACACCTATACCTT
CCAAAACAGGGGCCCCATGGAACATCTCCATTAACCCTAAAATGGTTTCT
CTAAAAACCACCCCTCTTAAACCCCCTGGTGCTGGTCCCTAAATTAATCT
ACCCCCAAGAAAGGATACCCCCCCTTTTGTTTTTTACAAAAATCTACTAA
TTCTTGCTGTGATACCCCCCTTATATGTCTCCTTCCTATGGTACTCCACC
AACTCTTGTGTTTTAATCCCCTCTCACAAAACCTCTCTCTGTTGTGTCCA
CCTCCTTTTA
| NNNCCTTCATTGGAGGCTGGGGXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTCTGTGAGGGAAGTCAGGACTATGCAGA
AATAAATTCTTCATTTTATTGTCATTGGGATGATCCCTAAACACAGTGCC
CTCTTGGCACCCTCTGAGGTCACCTGCTAAGAGCTGTGTAAGAACAGTTC
TGAGCTGGTCTCCGAGTCTCTCAAATATATGGGTTTTGTTTTATTTTTCA
GGTTCAGATGCACTAAACAGCAGCTCTTGCACCTGTTCTATTGGCCCTGC
CCAAAGGAAGGCCACTCTAAAAATAGATCCGAGGGAACAAATGGTTTGCA
TGGTTGACTATTTTGAGGTACCAAGGGAGAAGGAGTCAAAGCTGAAGTGT
ATTATTAAGGGGAATAAGTAGTGTAAGAACTGTGGAGACGTTTGGGGGTT
ATTTTTTTTTCCCCCCCCACCATAGAGACTGGCCTAAAAAAAAAAAATTT
CCAGTAACCCGATGGCTTAAATGTAGCTTTCTTGGGTGGTTTTACATACA
GCAAAGTTCTCAGTATCTGAGGGACACAATTTAAATCTCTTTCAGAATAG
ACCAGAGTTTTAAAAATAGGGTCAGTGTCCAAGTTTTTCGACTCACCTGA
AAACATTTGGTTCCTGAGACTCTGTTGATTAGCACAGTACAATCTGACTC
CTAGCCCAGGCTGTAATACAACCCTGGCTGTGTTTGTGAGCTCACAATCC
AATGTCTTACCTAGGAGTTTCCACCTTCAGTGGGCTCTGACGGCTTCCCT
TTTGCTTGGTAGCTGGTATGAACTAAACAAGAGGGAATTAAATTTATGCC
AGTCGAACACAATCCCTATGAGTGGAACTCCCCAGTGCTCATAATTTTTT
TTCAGCTTTAATGAATTCTTTTTAAGGTTTTGTGCCAGCTTATTTTATAT
ATTGAGCCACTTCCTTTTTTAATTTCCCGTTTCAGCCCCCTTCTTTTGGC
TGGGAAAAAAACCCTTGGGCCACGGACCTGGGAATTTTTTTTTAAACAAA
GTTTTTTTTAGGGGCCTTGGTTTCACGTTTCAAAGGTTTAGGCTCTTTTT
TTCTTATAAGGAAATTGGTGGTGTGTCCTGTTCTTTAAACTTTCCCCAAA
TTATAAACTCTTTGTTTTTTTTTGTCCTTTCTTAACTTCTTTTCCCTCTA
CCNTATTCTTTCCTTTTCCTTTCTTATTCTTACTCG
|
quality values | Open.Hide. 0 0 3 6 6 6 9 9 9 7 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 12 18 24 28 15 14 8 8 8 15 21 33 24 33 30 32 37 42 42 42 42 42 42 42 41 42 42 42 54 50
57 57 53 50 42 50 47 47 41 48 48 68 68 48 48 42 37 32 36 30 42 42 44 42 37 37 37 57 57 57 57 50 57 51 51 51 50 57 47 57 57 57 50 50 50 50 50 50 50 50
50 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 50 68 68 68 68 68 68 68 68 43 57 43 32 32 19 20 27 38 44 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 57 57 57
57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 59 59 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 62 68 68 68 62 62 62 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62
62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 59 59 57 57 57 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 59 59 68 68 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 57 57 57 57 57 57
54 57 57 68 57 57 57 57 59 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 41 44 24 24
15 13 13 13 28 30 47 47 59 59 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 57 50 50 50 50 50 57 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 30 30 18 15
10 12 12 20 18 23 20 18 19 18 16 20 17 19 10 10 9 11 11 9 12 27 33 59 59 59 47 43 37 32 28 20 20 20 20 20 20 20 12 12 12 19 16 16 14 14 18 15 24 15
15 24 19 28 41 41 59 59 57 57 59 59 59 48 48 57 59 57 48 48 48 57 57 57 57 57 57 57 48 48 48 48 48 54 54 57 57 48 48 47 48 54 59 54 54 44 44 44 48 48
57 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 44 44 42 44 47 59 59 57 54 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 54 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57
57 57 59 59 57 57 57 57 57 57 57 50 47 57 57 57 57 57 57 57 57 57 37 37 30 35 32 37 37 44 44 48 43 37 39 47 48 42 47 44 46 44 48 57 59 59 59 59 59 59
59 48 48 54 47 59 46 48 37 44 28 28 28 40 40 48 48 54 59 59 48 48 48 47 47 43 43 43 43 43 48 39 27 26 19 24 28 34 34 35 34 25 31 30 30 22 22 28 34 34
39 31 24 25 16 16 16 20 25 37 30 30 29 32 31 43 43 41 41 41 39 32 32 30 25 29 34 32 25 25 34 30 41 36 36 35 47 37 43 39 31 31 39 39 37 25 27 21 16 16
30 23 25 25 37 30 37 30 18 17 28 24 17 18 25 23 27 23 33 30 30 40 41 34 25 14 10 10 13 10 12 10 17 12 26 29 32 39 39 40 39 39 39 32 28 28 33 24 21 18
18 18 21 20 25 38 39 41 41 39 39 39 24 19 21 19 19 19 19 28 21 22 28 39 34 22 16 10 10 8 8 9 12 12 12 8 8 8 13 16 31 37 37 24 24 15 15 12 13 10
10 10 13 16 14 16 16 22 14 13 17 17 14 14 14 11 10 8 10 10 10 11 14 8 8 9 12 15 14 14 14 21 18 15 13 9 10 10 17 10 11 11 19 24 37 39 39 28 28 10
10 8 8 6 7 7 7 14 8 9 9 9 10 15 13 10 8 8 8 8 15 11 12 12 18 18 14 14 14 15 13 12 12 9 9 9 14 8 8 8 8 8 8 9 10 10 15 12 15 10
8 9 9 10 11 11 10 10 8 8 8 9 8 8 8 10 10 10 15 13 12 10 15 14 10 9 11 11 17 13 9 10 9 9 10 10 12 11 11 11 11 9 9 8 10 10 11 11 10 9
10 9 9 9 9 6 8 6 6 7 7 20 20 13 15 10 9 9 10 14 10 9 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 10 12 12 10 10 10 9 9 9 9 9 10 18 8 8 8 8
8 8 8 10 10 18 10 10 8 8 8 8 8 8 7 7 8 9 12 12 12 12 21 17 17 23 12 8 6 6 6 8 8 8 8 8 9 14 15 15 10 11 8 8 6 6 6 6 8 6
8 8 11 11 11 11 12 9 9 9 18 10 9 9 9 9 9 9 10 14 18 8 11 8 8 8 10 9 9 11 14 18 20 15 11 8 9 8 11 11 13 13 11 8 8 6 6 8 7 6
6 6 10 9 8 8 8 6 6 8 7 7 12 12 20 16 12 10 8 6 6 8 8 8 10 9 8 8 8 8 8 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 10 9 8 8 8 8
8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 8 8 8 8 11 10 10 12 10 8 8 8 8 8 6 6 6 6 7 7 14 8 8 8 8 9 10 10 10 10 6 6 8 6 6 6 6 8 8 8
8 8 8 8 8 8 8 11 8 6 | Open.Hide. 0 0 0 3 6 6 6 7 6 6 6 7 6 6 6 8 8 6 6 6 6 8 10 13 7 8 8 6 8 10 14 21 23 23 25 22 22 22 33 32 32 24 24 24 34 28 35 33 33 33
37 37 37 37 43 47 48 48 57 57 57 57 48 43 43 43 46 43 48 46 57 48 54 48 48 47 47 47 48 48 47 54 54 57 57 57 57 57 47 57 47 47 47 47 42 36 28 36 36 43
46 46 54 57 57 57 48 57 47 47 47 47 50 50 50 50 50 50 50 50 35 50 50 57 37 50 43 43 43 42 38 38 35 35 35 43 43 57 52 57 57 59 59 57 57 37 37 37 57 37
50 50 50 50 38 32 44 44 57 57 57 57 57 57 57 57 52 57 57 57 57 57 57 45 52 45 57 43 43 35 35 35 43 43 52 52 57 52 57 57 39 39 39 57 57 57 57 57 57 57
57 57 35 43 43 52 52 52 52 52 62 62 52 52 52 62 62 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 43 43 59 59 59 59 43 52 52 59 57 57 57 57 57 57 68 59 59 57 57
57 57 57 44 44 35 35 35 44 43 57 39 39 57 57 57 57 57 57 57 57 57 38 38 43 44 57 47 42 43 43 43 43 43 52 57 57 57 57 57 43 43 35 59 59 43 50 52 52 57
57 57 57 57 57 52 52 52 57 57 57 57 57 57 50 54 57 50 57 57 57 54 57 57 47 43 43 44 44 43 43 42 47 42 47 47 57 57 57 57 43 44 43 57 57 47 47 43 47 43
43 43 59 43 43 47 47 48 48 57 59 59 59 54 54 48 59 48 54 54 57 57 54 48 48 48 48 43 43 43 57 48 48 48 48 48 48 59 59 48 46 48 43 43 37 43 39 21 23 15
15 15 12 11 11 11 11 18 22 36 37 41 41 48 48 48 48 57 57 57 48 48 48 47 47 35 35 35 39 39 43 39 47 43 43 43 43 43 48 43 48 48 47 39 59 59 41 23 23 11
11 11 15 12 14 14 14 11 9 14 14 19 23 27 16 12 12 9 9 9 27 23 39 36 26 22 22 15 23 22 14 13 13 13 19 19 21 15 15 14 18 19 21 28 14 16 11 12 12 15
12 12 16 18 41 41 59 59 59 59 59 48 47 43 47 47 48 59 59 59 43 43 37 43 40 35 35 39 43 47 54 47 42 41 43 30 30 41 44 59 59 59 59 59 54 54 48 59 48 54
54 57 59 57 57 57 57 43 44 42 47 47 57 44 43 43 46 46 47 43 57 57 48 48 48 44 44 43 43 44 59 59 59 59 57 42 42 42 43 47 59 41 44 33 33 33 42 42 35 42
42 59 44 35 35 35 42 44 59 59 59 57 59 57 57 54 54 47 48 48 54 54 42 44 30 30 30 44 42 54 54 54 57 59 59 59 47 47 43 43 43 40 40 30 30 30 40 39 57 48
57 57 48 48 48 48 59 59 48 59 46 41 41 41 30 30 17 17 17 30 30 39 39 32 39 37 37 47 37 39 27 30 13 18 18 32 32 48 43 43 43 48 43 47 47 48 46 46 46 46
34 34 32 36 26 31 39 37 37 39 36 36 39 29 29 28 28 28 29 37 59 59 37 37 34 30 18 24 22 22 22 28 33 33 37 37 43 43 36 36 33 37 37 33 22 20 20 25 37 37
59 41 41 41 43 43 46 47 48 48 37 37 37 37 37 32 32 28 31 34 37 30 30 25 28 20 22 24 25 14 9 9 9 9 14 18 39 41 46 36 37 28 28 28 33 36 39 41 39 37
32 28 32 30 30 23 28 12 20 25 22 22 17 27 22 24 30 30 21 15 8 8 10 19 9 10 10 10 19 20 32 27 26 13 14 14 14 19 19 39 39 39 30 31 23 23 13 13 8 8
8 8 10 11 11 18 28 25 19 21 12 14 13 14 11 14 16 17 18 21 10 10 10 10 12 9 11 11 11 13 27 30 12 10 10 10 10 10 10 17 14 14 10 10 10 10 24 26 27 21
13 12 10 10 10 11 11 21 10 13 10 14 14 16 18 21 28 22 18 17 25 21 18 9 9 9 9 17 22 8 8 8 8 8 9 9 8 10 8 8 8 14 12 12 12 8 8 8 8 9
8 8 13 8 8 8 8 6 8 8 8 10 10 16 12 9 9 9 8 8 10 10 11 11 10 10 9 9 9 9 8 10 9 9 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 9 9
9 9 9 11 16 16 25 33 13 12 6 6 6 6 11 11 13 12 12 12 9 9 9 11 11 11 9 9 9 9 9 13 14 10 10 10 10 15 16 11 14 12 10 12 15 11 11 11 13 13
14 15 11 17 14 15 15 8 8 8 8 8 15 15 10 10 10 10 10 10 10 11 10 8 8 8 8 8 10 12 8 8 6 7 6 10 10 13 13 8 8 8 10 8 8 8 10 10 12 15
8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 9 9 9 8 8 10 8 8 6 9 8 8 6 6 8 8 8 9 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 9 9 9 9 10 10 13 8
8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 12 10 6 6 6 8 11 9 9 9 6 8 9 9 9 9 11 10 13 8 6 6 6 6 8 8 9 9 8 6 7 7 6 7 8 8 8 10 9 9
10 3 0 3 6 8 8 11 8 8 6 7 7 9 12 10 9 9 9 11 10 10 10 10 10 10 11 11 11 9 9 9 6 8 6 6 |