| BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
|---|
| end name | MSMg01-176G20.T7 (MSMg01no176_g20.b1) | MSMg01-176G20.TJ (MSMg01no176_g20.g1) |
|---|
| ACC | AG371129 | AG371130 |
|---|
| length | 1,234 | 1,209 |
|---|
length of high quality
(start - end) | 662 (133 - 794) | 331 (122 - 452) |
|---|
| definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no176_g20.b1 PHD_FILE: MSMg01no176_g20.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:48:09 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no176_g20.g1 PHD_FILE: MSMg01no176_g20.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:48:10 2005 |
|---|
| singlet/doublet | singlet | --- |
|---|
| BLAST hit | unique | no hit data |
|---|
| sequence | NCCTTTCTNNNNNNNATCACTGGGCGCTATAGACTCCTATAGGGAGAGGA
TCCGCGGAATTCTCTATCACCCTTAGATGCCCCTTATAACATCCATACAA
CCATATCTTAAGGGCAGCTACTGCTCCTGCTAAGTGAGGAGAGTGATTAC
AGTCTTCCAAGGCACTCCTGAGTATACTTAGTATGTACTTTAAGAAACAC
ATTCTGCCTGCAACCTACCCTAAACATCCATGATGAAGAAATACAAATGG
CAAAACAGGTAGGGAGAAGTCCTATGTATCATTGTGTCAAGACAAATGGA
GGCCCTATTTATCATTTGGATTACTTACATATTCTTGGTAATGGCCATGA
CCATCATAGGTGTAGAAGCTAAAATCTGATTAAGTGTTAAAAGGTGATAG
CAAATTCTCAGAGAATTATACCTAGACACCATCAGTGAACAGTATTCTGC
AAGATTTCTGAGAACTCTTTGTTTTCACTGTGTTTTAGTGAAATAAGTGG
TAAAGGATGTCCTGGTGGCAGAATCTGACCTCCTACAAGCCAGGCTTGGC
TGACCCCCATAGTCAACTCAGTGTCATCTCTCTCTGTCTCTTTAAATTCT
TCCAGTATTTGGTTAACTGTTCTATGTGTGAGCCCATGGTAACAAATTTA
CTGTATTATTATGTGGGTTCTTGTCTTTTTCAAAATATTTGTATATGTTC
ATTGGCAGCTTCACACTTGTAAATCATATAATTTGATCATATTAATCCCC
CTTTTCTCCTAACTCCCAATGAATTACTTCTTCTCAGTGAGTCCCTTTCT
AAGTTTATGATGTGTTTTTTTTTCTTTTTTTTTTTTCCTTTTTGGNAATT
CATTGACTTTAATTAAACTTACTTACTTTTCTAAGTTTGTATATTATTTA
CCGTTCTCTGTGCTCTTGTCAATGATACATTCATGATATACATTATTTGC
TCCCTCAACTCATTTTTTGTTCCTTTTTCTTTAATTCGCAATATCCTCCT
TAATTTTTTTCTTTCCCTCATTTATTGGTGATACCTTTTTCCCTGTTCCT
CTTTATAATTCTATTCCTGTCTTCTTTTCCTTTTATTCTTTTTTTTTTTT
CCTTTTTTTATAACCTTTCTTCTCTCTCTCTTTACTCACCTTTCTTCAAC
ACCCTTTCCTTTTTCTTTCTTCCTTTTCTCCTACTTTCTTCTTTCTTCTC
TTTTTCTCTCCCTTTCTACATTCTCTCTTATTCC
| NNNGGGTTCAGTGTAGCTGGGGCGCCXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXCCCTTAACTGAGGAATACTGAATGTCTGAGAAG
CACCTGACCCATTATCTTTACAGATGCAGAGATCTCTTAGGAAAACAAAT
GTAAATATCAAGTCTATACATTTTTGAAGTTTCACTGATAGAGGAGATAT
TTCTTTTTTTTTTCTTTAAATATTTTTATTACGTATTTTTCTCAATTGCA
TTTCCAATGCTATCCCAAAAGTCCCCCATACCCTCCCCCCACTCCCCTAC
CCACCCATTCCCACTTTTTCGCCCTGGTGTTCCCCTGTACTGGGACATAT
AAAGTTTGCAAGTCAAATTGGCTTGTCATATTTCAATAAGTTAATTTTGG
GTATTTTAATTCAAAAAAAAATATATGGGTGGGAAAAATGGCTCAGAGGA
TACTTTGTGAACCCGCCCCCCTGAGTTCAAATTATCAAACCCATGAAGAA
AGATATGTGAGATATCACACACCTAGAATTCCAGTGCTATTGTAGGAAGT
AACTGGAAGGTGCCAAAGATTTGGTGACTTCTATGGTAGCCCAAGTGCCA
GAAACTCCAAGTTCACAAAAGAGCCTGCTTCAGAGAAATAAGGAAAAGAA
TGATAGAGTAGAACACTTGATGTGTTCTCTGACCTCCATATGTATGTGCA
GGTGTGCCCATTCACACTCACTTGTGTTCATATATGATATCTACTTGTGC
TCATATATGATAGATATCCCATAGATGCTCATATACATTGGTAATTTTTT
AAAGTTTTTATTAAAATGTAAGTAACATATTTGTTTTCTACAGTCCAGAA
TGTTTCAATTTGGGGTATTTTTGTAGGTCAAACGTTTTAGTATAAGTCAT
TGGTGTTCTGTCAGGAACTTTTCCCTGTGCTCCTGCATTGAGACTTTTCC
CCCACTTCCCCTCCAATATTTGGAATTGGTTTAAGGGTAAGGCCTTATTC
TCTTTTTACTTTATTTTTTTTCGGTTTTTTATTTCTTGATGATTCCGGTT
CCTTCTCCTTTTTTTTTTGTCCCCTATTTTTTATCTCTTATCCTCCTTTT
ACTTTTTTTGACCTTCTTTCTTTCTCTTATTATGTTCTTCCTATCCTTCT
TCTTATCTCTATCTTTTCTTCTTTCTTTTTCTTTTTCTCCTCTTTCCTTT
TTCTTTACC
|
|---|
| quality values | Open.Hide. 0 3 10 13 10 11 9 3 0 0 0 0 0 0 0 3 8 7 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 15 8 8 8 8 11 12 19 19 33 25 23 24 24 33 34 37
43 43 50 47 48 48 43 50 42 40 43 43 42 36 36 36 36 36 36 36 31 33 33 33 33 21 14 8 8 9 8 8 9 9 9 6 7 6 10 10 14 12 10 9 9 19 22 33 37 50
39 33 33 36 36 50 36 36 36 36 36 36 53 50 50 37 30 28 21 19 10 10 10 10 10 11 11 25 20 28 25 21 21 21 22 31 31 36 41 20 15 15 13 15 19 32 43 57 57 47
47 47 47 47 51 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 50 50 50 51 50 51 51 51 51 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 68 68 68 68 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 44 39 39 16 39 39 29 29 17 29 29 39 39 41 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62
68 68 68 68 62 62 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 52 62 45 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62
62 62 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 62 62 62 62 62 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 68 68
57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 54 57 57 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
59 59 57 59 59 68 68 68 68 68 57 54 54 48 48 48 46 59 46 47 48 22 22 10 10 13 23 43 53 48 48 48 48 57 57 59 59 59 59 59 48 48 59 59 59 59 59 59 47 47
47 39 37 30 32 21 21 11 11 18 23 28 37 35 37 37 37 37 43 57 47 47 41 48 42 39 43 39 35 36 39 36 37 37 39 39 59 43 37 30 27 27 24 26 35 35 37 39 41 41
37 37 31 32 37 37 41 47 39 43 35 41 44 44 37 37 37 31 23 28 28 23 31 37 43 39 39 39 39 39 30 18 15 13 13 18 18 37 37 26 20 14 15 18 23 25 27 18 14 11
18 21 19 10 10 10 15 15 28 17 16 9 9 9 13 15 21 12 15 13 19 17 23 10 10 8 8 8 19 17 15 10 11 14 12 10 9 8 8 9 10 10 10 11 3 0 3 6 6 8
8 8 10 15 18 11 14 11 23 21 19 10 10 10 8 8 8 8 9 9 10 17 16 10 10 10 10 10 6 6 6 6 8 6 8 8 10 11 11 11 8 10 8 8 8 13 10 12 10 18
15 19 11 11 8 8 6 6 10 6 6 6 8 8 8 10 8 8 9 10 11 11 10 10 10 9 9 9 8 10 7 6 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 10 12 8 10 10 8 8 8
8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 8 10 9 11 10 10 7 6 8 8 9 8 11 10 10 11 10 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 10 11 11 13 15 14 16 10 9 8 8
8 8 9 11 17 22 16 9 8 8 8 8 8 11 10 6 8 10 8 8 8 10 9 9 10 13 8 8 8 8 8 8 8 8 8 11 11 11 17 11 11 9 9 10 10 10 12 12 11 10
10 8 8 6 6 8 6 6 6 6 6 8 15 15 8 8 8 8 8 8 8 9 9 10 10 15 15 15 11 10 9 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 9 8 7 7 9 8 7 8 8
8 8 8 8 10 21 22 15 8 6 6 10 10 12 7 7 8 8 6 8 8 8 6 6 6 7 8 8 8 11 14 13 9 9 9 9 9 8 8 8 8 10 8 8 10 7 7 8 8 8
8 8 10 10 11 11 8 8 8 6 10 8 9 12 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 9 9 9 9 8 11 7 6 8 8 7 7 8 7 8 8 8 6 6 10
10 12 10 10 10 22 15 12 12 8 8 8 12 12 10 10 8 8 8 10 11 9 9 8 8 8 8 8 8 9 10 13 10 10 | Open.Hide. 0 0 0 3 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 10 8 6 6 6 6 8 10 11 8 7 9 8 11 9 19 19 19 8 9 10 22 21 28 24 24 35 35 36 38 36 37 37 37 37
28 35 35 36 53 53 53 50 50 50 50 47 41 27 23 9 11 9 11 11 11 11 10 10 10 10 16 10 12 13 21 25 32 36 36 36 50 50 50 50 50 50 42 42 47 57 57 53 53 44
50 33 33 33 33 28 28 12 8 8 8 8 6 7 8 10 15 17 18 10 14 14 23 32 41 41 23 23 23 34 35 47 53 53 53 47 47 47 47 50 50 57 57 57 57 57 54 54 54 54
54 54 54 68 68 68 54 54 54 57 57 57 50 50 50 50 50 50 50 50 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 44 44 28 32 32 43 43 57 57 68 57 57 59 59 57 57 57 59 59 59
59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 68 68 68 68 68 68 68 57 68 68 68 68 68 57 68 57 57 59 59 59 59 68 57 57 57 57 57 57 59 57 59 57 59 59
68 68 68 68 57 57 52 52 52 57 57 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 57 57
57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 57 57 57 57 59 52 57 57 57 57 57 52 57 57 57 57 54 57 57 57 57 57 57 59 59
59 59 59 59 59 57 59 57 59 59 59 68 68 59 59 59 59 59 59 54 59 59 54 57 54 59 59 57 57 59 59 59 59 59 59 59 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 59 44 44 16
16 11 12 12 15 23 27 54 54 57 59 54 59 59 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 57 57 57 48 48 48 59 48 48 48 59 59 59 48 47 43 47 47 43 59 35 35 35 39 28 30
26 18 20 12 12 11 12 11 11 10 12 11 8 8 8 8 8 8 9 11 28 30 41 42 42 50 50 59 59 47 47 43 47 47 39 32 30 28 21 24 18 23 15 15 12 12 12 18 18 33
33 43 46 46 68 68 68 54 57 54 54 54 54 54 57 54 54 54 54 57 54 54 57 59 59 57 54 57 44 57 47 43 43 47 44 37 43 43 57 44 59 57 59 57 57 57 57 57 57 57
57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 54 54 54 54 54 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 50 57 50 47 47 59 59 59 57 57 44 44 43 44 50 57 57 57 48 48 43 43 37
37 37 44 40 46 42 42 35 42 44 57 46 48 44 44 40 43 57 57 57 48 36 36 23 23 36 37 39 43 44 39 43 42 42 32 31 25 25 28 40 40 48 59 59 59 54 47 47 39 43
33 37 28 33 32 33 43 43 43 43 34 26 26 19 28 28 37 39 41 41 41 39 39 37 34 31 39 39 44 39 39 39 34 34 37 37 37 47 40 40 41 48 50 48 48 50 50 48 48 48
43 43 40 43 43 43 44 57 57 48 43 43 43 43 36 43 43 47 43 48 48 40 40 30 18 18 16 16 19 32 32 48 48 48 57 48 48 48 48 47 46 46 59 59 30 30 12 12 9 9
9 23 25 47 47 48 48 43 43 35 37 30 28 24 30 30 37 34 34 41 30 27 15 15 15 26 21 22 21 13 13 13 25 17 19 12 15 16 23 14 18 25 36 37 31 23 23 12 12 8
10 19 19 19 14 15 19 22 18 17 15 11 12 9 14 14 24 23 24 21 28 14 14 14 17 10 10 8 10 8 15 9 8 8 8 8 10 13 15 16 18 23 30 34 19 20 19 10 8 8
10 10 8 9 10 13 10 14 13 9 19 11 20 23 25 12 12 19 28 37 37 37 28 25 22 25 13 8 8 9 12 15 15 25 22 19 10 10 7 8 8 8 8 8 10 12 14 12 11 10
9 9 8 8 8 7 7 6 6 8 10 9 10 16 18 13 15 15 10 21 11 12 13 10 11 11 9 9 11 15 10 11 10 8 10 8 8 8 10 8 6 6 7 8 8 10 8 9 12 19
21 15 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 12 18 12 13 17 11 11 14 16 21 19 9 10 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 11 14 9 8 8 8 8 9 8 8
7 7 10 10 10 15 11 11 10 11 11 8 8 8 11 19 15 16 9 8 8 8 8 8 8 8 8 9 8 8 8 6 6 6 7 8 8 9 9 9 9 9 9 9 8 8 8 8 8 8
8 8 8 6 6 8 8 6 6 8 8 11 19 19 17 10 9 8 8 11 8 10 10 8 8 10 8 8 8 8 8 10 10 6 7 8 8 10 11 11 11 12 13 10 10 8 10 8 8 6
6 6 6 8 8 13 7 7 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 9 10 9 10 8 10 10 9 9 9 15 11 10 11 10 11
8 11 11 11 11 11 11 9 9 8 9 9 9 9 10 13 8 8 8 11 10 8 8 8 8 8 8 8 11 13 13 12 14 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 12 12 9 9 10 10
10 10 6 6 8 6 8 8 8 |
|---|
