BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-361H15.T7 (MSMg01no361_h15.b1) | MSMg01-361H15.TJ (MSMg01no361_h15.g1) |
ACC | AG470395 | AG470396 |
length | 753 | 749 |
length of high quality (start - end) | 415 (44 - 458) | 381 (142 - 522) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no361_h15.b1 PHD_FILE: MSMg01no361_h15.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 22:56:32 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no361_h15.g1 PHD_FILE: MSMg01no361_h15.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 22:56:32 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | plural |
---|
sequence | NACTTTTTCCTCNTGTCAGCTAACCGACTCACTTTCGGGAGAGGATCCGC
GGAATTCTCAATTTACCAAAAGAGATGACTAGGAAATGTATCAAAAACAG
TCTATTCTTTCTAGCAATTAGGCAAATTCAAGTCAAAATACCTTTGAGAG
TTTATCTTAACCCAGTCAGAATGGAAATGACCAAGCAAACAAAGAACAAT
GAATGCTGCATGGGGGCTGGGAAAGAACAAAAAGGGTCTCCTTCACTGTT
GTTAGGAGCTGCAAACCAGAGCAGTCACTGTGGAAATCAGTGTGGACCCA
CCCCTTGGCATATGCGCATAGGTATTTGCTCATCCATGTTCATTGCTGCT
CTATTCACAATAGCTAGAGAATGAAAGTAACCTAAATGTCCTTCAATTGA
TGAATGGATAATGAAAATGTGGTTCACATACACCATGAACTATTATTCAG
CTGCAAAGAGAAAAAGGAAATTATGAACATTGCAGAGAAATGGATGGAAC
TAGAAAAGATCATATTGAATGATGTAACCCAAAAAGACAAAGAGCACCTG
TTCTAAGTTGTTGGAGGCTCCTACCTCTAAATCGTCCGATGTGAGTACAT
AACCCGCAGTAACCACCGTAATCAAGACAGTAAAATAGGGGCCATTACCA
CGATATGAAGGTGGGTACCACACCACACGGATAATGATACGACCCCAGTT
GACTTGACCTCAAAACCCGCGAAAATGGTATCTTCTACTTATTTAGCGCG
TAN
| NCCCGATGXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCCTGGAATTGGCAACAAAGTAG
ATGCTGTCTATGAGAAAAATGGTAAGTAGTTACATTGCACTGATTTTATA
AAAGGGCTTCTGGGCCCTCAGACGTTTTTCATATACAAAGAATTTTAATA
AAGAATTCAAATGGCTTATATATGCATGCTCACTAAGGTATTGTTTCTGT
GTGATTACTTAGATAGCAAAAAAATAACCTGATTAGAATCAATGAGAATT
TTACTTAATTACTACCAAGTGTGTGAACAACAGATCTTGAACCTCAGGAT
GACCTTAAATTACATGTAAAAGTGTCAAGAGGCAGAGGGTTATGTCAAAA
TTCAAATTAGGGCTGGAGTGGAGAGTAATTTATAAAGATTCATAATTATC
ATAACTATACAGTTATTTTTGCTTTAATTACAATGGGAATTATCTCTGAA
TATGAACGTTCAAAACTAGAACTTGTAACAAGACAGTTAATTCTAGTGCA
TAATTTATGTAATCTATGAATATTTATATATATTTTTAAAATACCTCCAA
TAGAGTATATTTTAATAATCTCCCCTGCTCCTCTATTTTCCCTTAAACTC
CCTTATGTGCCTTCCTCACATAGCTGTCTTTCCTTGATTTTAAACTCTTA
TATCCCTTATATTAACACCTACGCCCCCAAAACTCTGTTATACTTTTAC
|
quality values | Open.Hide. 0 3 6 6 6 8 8 8 9 10 13 3 0 3 8 8 8 6 6 13 19 16 10 10 11 17 11 10 10 8 8 7 7 13 12 9 9 12 12 17 22 22 16 20 28 28 28 28 43 43
39 37 37 37 37 41 39 25 20 11 10 10 8 8 8 8 8 11 17 34 33 35 28 21 24 28 28 28 43 43 43 37 33 37 30 32 39 39 39 43 43 43 43 43 57 42 40 40 40 36
41 43 43 43 48 48 54 57 54 54 48 48 46 47 47 46 46 37 42 30 37 37 57 57 43 48 39 39 35 39 42 41 43 43 46 57 54 57 54 57 57 59 59 59 44 44 33 32 32 44
44 43 43 43 44 47 44 44 37 37 43 50 44 43 35 35 38 43 43 50 43 43 52 57 57 52 52 52 57 57 57 43 43 38 50 43 52 52 57 54 57 57 52 52 52 57 57 52 52 52
57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 52 52 52 52 57 57 43 43 39 44 39 45 45 57 57 57 57 57 59 57 57 52 45 45 45 57 57 57 57 57 57 52 52 57 52 57 57
57 57 57 52 52 52 52 52 52 57 59 59 57 52 52 47 47 38 38 38 42 43 43 32 32 15 32 32 43 43 52 52 57 57 57 57 57 57 52 43 43 41 41 37 43 42 50 50 44 44
44 57 57 57 50 50 43 50 50 48 50 57 57 57 43 43 28 32 21 20 20 28 28 42 59 59 44 44 37 37 43 44 44 57 57 48 48 48 47 47 47 47 47 48 48 48 48 48 48 54
54 54 54 42 42 34 34 34 42 37 42 35 23 23 15 12 14 26 30 43 57 57 48 48 43 43 37 36 36 37 32 31 28 25 25 28 24 32 30 28 30 24 24 12 12 12 25 26 39 36
39 37 33 33 33 29 29 22 28 25 31 28 30 39 37 34 34 36 36 28 32 24 30 18 20 24 28 34 25 25 12 12 12 24 24 32 35 34 32 32 20 17 19 22 28 22 22 14 14 18
22 31 33 37 34 34 20 20 15 24 14 24 28 23 20 20 23 28 28 30 32 23 23 23 23 19 24 17 17 17 24 21 12 12 12 12 12 11 20 14 17 13 12 14 16 28 32 37 37 21
21 13 13 15 28 30 29 32 16 24 15 15 14 15 15 25 25 29 31 28 28 20 23 20 20 31 32 28 27 11 11 11 11 22 19 21 21 14 11 11 12 9 9 13 13 13 9 13 17 18
18 20 21 16 20 12 12 12 11 12 12 27 26 17 16 11 11 12 24 16 24 22 31 31 23 13 10 10 10 10 10 13 11 11 12 12 12 12 14 15 12 14 12 13 13 23 10 12 10 8
8 8 8 8 12 9 10 8 8 8 8 13 10 11 9 9 13 10 12 13 17 17 10 10 10 10 9 10 9 12 9 9 8 8 9 8 8 8 8 10 9 9 10 10 14 15 13 13 8 8
8 10 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 13 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 11 13 15 12 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 8 8 6
6 8 8 10 8 9 8 8 8 12 11 10 10 10 8 8 6 6 6 6 8 8 9 9 10 10 10 12 11 10 10 12 10 10 9 9 12 12 13 9 8 6 8 6 6 6 6 8 8 8
8 3 0 | Open.Hide. 0 3 6 6 6 6 8 8 9 9 9 8 8 8 8 8 8 9 15 35 28 39 37 37 37 30 36 31 34 39 28 13 13 7 7 7 10 8 11 12 21 11 13 13 23 21 23 16 19 20
25 25 28 23 24 33 34 41 39 34 23 12 11 9 9 13 13 11 16 30 39 34 19 9 10 11 14 19 39 33 33 25 25 11 12 15 25 25 37 37 28 32 37 37 37 37 37 37 32 32
22 31 37 39 44 57 57 57 57 57 59 59 59 59 57 34 26 28 28 24 20 28 30 37 37 47 39 39 30 27 12 19 13 27 27 24 22 16 16 11 11 15 27 27 37 37 32 31 28 34
36 41 41 43 41 39 39 25 23 12 12 12 25 25 27 15 24 24 28 28 47 47 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 57 43 43 39 39 42 47 44 57 57 48 48 53
48 59 33 33 33 33 33 32 44 37 37 39 39 39 59 59 59 59 59 59 53 53 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 68 68 57 57 68 68 68 68 59 59 57 57 52 52 52 57 52 54 54 57 57 57 57 59 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 52 57 57 57 57
57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 52 52 52 57 57 59 52 52 43 43 39 39 43 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 68 59 59
59 59 50 48 48 48 44 48 43 37 37 43 47 57 48 48 48 57 43 43 39 39 43 59 59 43 43 46 57 57 57 68 68 57 59 48 48 48 57 57 57 57 57 54 57 57 57 57 57 68
59 59 59 59 59 57 59 43 44 40 40 40 43 43 43 47 48 48 59 59 59 57 36 36 36 33 33 33 41 41 41 41 41 39 30 29 28 28 30 34 37 37 40 43 43 43 39 24 23 23
24 28 33 48 43 43 40 39 39 33 28 23 20 19 24 29 30 24 16 16 11 11 11 22 23 10 10 10 10 12 12 29 30 15 13 8 10 10 8 14 15 37 25 25 25 25 28 34 28 23
15 15 15 15 18 24 30 34 34 28 24 19 24 23 23 22 22 30 20 20 23 28 28 28 35 39 39 48 48 48 37 26 13 10 10 10 10 12 11 18 19 28 28 26 21 31 18 11 13 10
10 10 13 15 23 12 10 8 10 12 13 13 6 6 8 8 10 12 11 11 10 10 8 8 8 11 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 12 18 21 17 15 8 8 8 8 9 9
10 10 10 10 10 9 7 7 7 7 8 8 8 10 11 16 9 9 8 8 8 8 8 8 11 8 8 10 8 8 10 11 12 12 13 10 8 8 15 15 21 13 11 8 8 8 8 8 8 8
8 10 10 8 8 10 11 13 8 8 8 8 10 6 6 6 6 6 8 11 11 11 11 11 11 7 7 6 6 8 8 10 8 8 8 10 8 11 13 15 10 10 9 9 9 16 16 10 10 |