BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-402F17.T7 (MSMg01no402_f17.b1) | MSMg01-402F17.TJ (MSMg01no402_f17.g1) |
ACC | AG501523 | AG501524 |
length | 737 | 738 |
length of high quality (start - end) | 395 (50 - 444) | 355 (79 - 433) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no402_f17.b1 PHD_FILE: MSMg01no402_f17.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 18:16:13 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no402_f17.g1 PHD_FILE: MSMg01no402_f17.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 18:16:13 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | NAAAATTAATCCTCATGTCAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXC
GCGGAATTCTCACCTTACCAATACCGAATGGCAGAGAAGCACCTGAAAAA
ATGCTCAACATCCTTAATCATCAGGGAAATGCAAATCAAAACAACCCTGA
GATTCCACCTCACACCAGTCAGAATGGCTAAGATCAAAAATTCAGGTGAC
AGCAGATGCTGGCGTGGATGTGGAGAAAGAGGAACACTCCTCCATTGTTG
GTGGGATTGCAGGCTTGTACAACCACTCTGGAGATCAGTCTGGCGGTTCC
TCAGAAAACTGGATATAGTACTACCGGAGGATCCAGCAATACCTCTCTTG
GGCATATATCCAGAAGATGCCCCAACTGGTAAGAAGGACACATGCTCCAC
TATGTTCATAGCAGCCTTATTTATAATAGCCAGAAGCTGGAAGGAACCCA
GATGCCCCTCATCAGAGGAATGGATACAGAAGATGTGGTACATCTACACA
ATGGAGTACTACTCAGCTATTAAAAAGAATGAATTTATGAAATTCCTGGT
CTAATGGATGGACCTGGAGGGCATCATCCTGAGTGAGGTAACTCATTTCC
TAAGGAACCCCCATCATATGTACTCCCTGATAAGTGGATATTAGCTCTCC
AACCCTATATACTCCCGATACAAGATATCCTTTTTCTAATACTTGCAAAT
TCTTAATAATGAATAATGTCACCGCGTACTCTATGTG
| NCCCGATAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTCTCAGATGTTGAATACATACA
GTAGATAGACAGCCTCAATCCCATGACACAGCTTTCTGTGATAAACCACA
AGAGTCCAAGTCATAGGAAAATGAACAAATCATTCACTCATATTGGAAAC
AGACTCAGATGGGAAACCTCTTTGTCCAAAAGTACTGACAAGTAAGTAGC
ATCTGGTCTTAAAATGAGCTCCCCATCTCTACATCCAATGAGTTTCATGG
TATCACTTTAGAAACTGACCTTACTCTCTGTCACTTCTTCTAAATAGTTT
TTCAGCTTACCTATCCTTCTATATAGTTCACCTCCCCTCTATTGCTACTT
ATGACATGGAAAATTGCCTCCTGGTTTTCAAATTATATTCTGGACATACT
CTTTGGTTTACCCCAAACCTATCAGTGTGCCCATCCTCATGGAAACCACA
GGAACAGAAGTTGTATAACATTTTCCTCAATGCATTATATCCTGCAGGGA
AATATCATTAAGACTTGGAAAGTAAGCAACTCACAAAGCTCATGAAGTTC
CTGAAACTGACCCGATATACTTGGGCCTTCCCCCCTTGAAAATTCCTAAG
TATCAAGCACTGGTGGAGAAACACTTCCTAACCTACACAGCTGTCTAAAA
AAAGACTGAAACTGGCCTCAAACGTCCTGAAAAAAGAA
|
quality values | Open.Hide. 0 3 7 7 7 6 6 6 10 15 12 10 11 8 8 8 8 8 10 10 11 23 23 37 34 32 34 34 41 21 15 15 12 11 6 6 6 6 6 6 8 9 12 12 19 16 20 22 26 28
37 44 48 31 31 31 33 33 30 25 23 11 9 9 9 11 11 12 11 13 14 16 19 28 34 37 37 37 37 47 47 57 48 47 47 42 42 47 47 48 57 57 50 50 50 50 53 68 53 51
42 42 42 47 42 42 41 50 51 50 50 50 57 57 54 50 47 47 47 47 42 42 57 46 37 44 41 48 48 50 47 47 54 57 47 44 42 31 31 44 42 46 47 47 48 48 48 44 44 40
50 50 50 50 50 54 54 57 57 57 57 57 57 59 57 52 52 59 52 57 54 50 50 50 50 50 47 52 47 57 50 50 47 50 50 50 57 50 50 50 50 50 57 52 59 57 57 57 57 52
52 44 44 57 39 34 44 43 43 43 57 44 59 59 59 52 52 52 57 57 57 57 57 57 57 52 57 57 57 57 68 68 57 57 57 57 57 59 59 59 59 62 52 52 62 62 62 62 62 62
52 52 62 52 62 62 62 62 62 62 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 62 43 62 43 43 43 43 52 59 59 57 52 52 43 43 23 38 43
28 27 14 14 14 32 34 52 59 59 57 57 57 59 59 57 38 38 16 22 24 27 29 23 24 19 30 38 57 57 52 52 52 57 52 52 57 50 44 38 35 43 43 57 57 57 57 57 50 59
50 52 52 52 57 57 57 57 57 57 52 43 42 43 24 24 12 24 24 43 44 44 43 35 35 35 32 32 19 29 33 37 42 47 47 44 47 57 46 48 48 48 48 46 46 43 44 43 44 44
48 46 57 44 44 44 44 36 36 25 23 23 36 36 43 43 44 48 57 48 46 43 43 43 43 30 34 32 20 20 41 28 30 26 24 28 28 24 24 37 30 24 17 15 26 19 19 16 16 9
9 10 19 15 17 23 28 24 15 10 9 6 8 10 12 24 25 24 28 27 27 22 22 23 21 21 19 22 21 19 12 12 11 13 15 29 26 28 28 33 27 19 11 14 12 15 9 15 21 12
12 15 15 15 10 10 10 16 19 20 28 15 15 11 11 11 15 24 23 37 33 33 29 22 19 13 12 15 22 26 32 29 26 28 26 23 20 10 12 8 8 8 15 9 13 15 23 12 10 10
10 8 8 8 15 9 11 10 10 9 11 16 18 12 17 12 12 11 10 12 11 10 10 10 11 11 11 12 12 12 12 11 12 12 19 16 10 10 8 8 8 8 8 8 6 12 10 8 8 8
8 8 9 9 11 13 13 11 11 11 12 15 8 8 8 8 8 8 8 14 18 22 20 10 10 10 14 14 14 12 10 11 8 9 12 11 12 10 9 9 9 10 8 6 8 8 8 8 8 8
9 11 11 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 13 8 10 10 17 11 12 10 11 10 10 10 8 8 8 8 8 10 8 8 7 7 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 7 9 6
10 6 6 8 8 8 9 10 10 10 12 10 9 10 8 8 10 8 8 6 7 8 6 8 8 8 8 10 10 10 10 10 10 10 11 9 9 | Open.Hide. 0 3 6 8 6 6 8 8 6 6 10 10 9 9 9 10 10 21 25 30 39 39 41 39 39 39 37 31 31 37 31 31 25 17 8 6 7 6 7 8 15 10 16 16 32 26 43 37 39 43
39 36 33 33 33 33 33 41 37 23 19 9 9 9 10 10 17 25 28 28 37 39 24 24 28 24 28 28 48 34 24 22 16 16 27 32 48 50 57 50 50 48 42 42 32 28 28 37 42 41
33 39 42 42 54 50 46 48 47 47 46 48 41 41 46 42 46 41 41 46 57 54 47 47 57 57 57 57 57 57 57 68 59 57 57 57 57 44 44 47 57 57 47 54 48 57 44 44 43 44
50 50 57 57 44 43 43 43 59 59 57 52 52 52 47 47 52 57 50 50 52 52 52 52 52 54 54 54 57 57 57 57 57 57 52 52 52 57 52 52 52 59 57 52 52 52 57 57 57 57
57 43 43 42 32 24 19 24 23 43 43 50 43 48 50 44 48 48 48 48 57 47 59 47 42 35 37 37 43 42 43 43 44 42 42 39 37 37 31 30 32 42 37 44 30 30 30 44 44 43
32 34 32 26 26 24 24 14 23 23 41 41 46 43 46 46 43 43 43 43 47 48 57 43 43 36 43 43 46 33 33 28 28 33 36 43 43 43 47 39 39 35 37 33 30 28 37 25 25 24
35 28 30 26 36 36 39 28 28 13 13 13 30 30 59 39 39 32 28 28 39 37 41 41 41 43 43 32 32 17 17 17 26 26 37 35 35 32 34 34 28 19 22 31 28 32 28 28 28 37
37 44 43 36 36 39 37 37 32 35 35 39 39 46 46 46 42 42 30 30 30 42 37 37 37 30 19 24 24 22 32 39 39 43 43 43 25 25 20 31 31 36 39 39 39 39 39 35 39 43
43 43 43 35 31 25 30 17 17 17 30 30 39 39 32 37 37 36 30 28 23 18 14 14 24 24 27 24 28 22 22 24 28 20 24 21 19 11 11 11 13 13 29 23 20 20 23 31 28 28
23 23 23 24 24 17 12 12 14 20 28 21 27 12 12 12 19 15 11 12 12 15 12 11 10 13 10 10 10 16 12 12 12 13 16 13 13 12 12 12 19 19 25 22 18 15 11 11 12 12
12 15 24 15 15 12 15 15 30 28 19 12 12 12 18 18 16 14 16 16 18 25 26 21 13 11 11 10 10 9 8 8 8 8 13 12 16 12 11 11 11 11 15 10 10 10 11 19 21 19
19 22 30 26 26 22 16 16 16 16 11 15 12 24 24 33 28 25 17 14 14 13 11 15 11 11 8 12 9 9 8 8 8 12 13 20 28 28 18 16 11 10 10 11 9 9 10 11 9 16
11 11 12 19 18 22 14 8 8 7 6 6 8 8 8 8 8 10 15 14 14 12 16 12 12 11 15 11 16 18 18 24 19 19 14 14 14 17 19 10 9 10 10 10 9 9 9 9 9 9
10 12 11 8 8 8 6 6 6 8 8 9 9 10 10 11 15 23 13 10 9 10 10 8 14 13 11 11 11 13 13 18 10 10 10 10 11 11 8 8 8 8 8 8 9 15 21 21 17 15
18 7 6 6 6 8 8 10 12 12 13 12 11 12 11 12 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 10 8 8 10 8 8 8 6 6 |