BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-457A11.T7 (MSMg01no457_a11.b1) | MSMg01-457A11.TJ (MSMg01no457_a11.g1) |
ACC | AG543192 | AG543193 |
length | 751 | 745 |
length of high quality (start - end) | 302 (329 - 630) | 264 (333 - 596) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no457_a11.b1 PHD_FILE: MSMg01no457_a11.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 19:29:04 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no457_a11.g1 PHD_FILE: MSMg01no457_a11.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 19:29:04 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | TCATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTTTCGNAAATCCGCGGA
ATTCTTTTAGAATGTCCTATAATAAAAACAGCACTAACAAAGAAAGCAAT
GTAAAAGAATGTATTAAAGATGAGTCTTACATATACTTCTGTTCTCTCAT
TTTTAAAATTTTTGTCAGGAATGTGGTAGTTTGTCTCATGTCATTGTTAA
AACTTCTTGCCTAAAACCATTTTCATTATGTTATATATATGAATTCCAAA
GCACTGCACAGAAGATCATGTGCATCTCCAGCTATGCCCACTTTAGCATC
ACCTCCATAAAGTGGATAATACTTTATATTTGCCATTCAAATGCACATTT
GTGATACAAAATAAAATTATATCGATGGAATTATGCTCTAGGGAGCATTG
TATTAGTGACTTCTCTCGTTTCTGTGATCTGGCAAAAACAACTTACGGGA
GAAGGATTTAGTTTGCCTGATAGTTTAAGAATGGATGATGTCCATGATGG
AGTAGAAGTCATGACAGCAGGAGCTGGACAAACCTTGTCTCTTGTGTCTG
CATTCAGAAAGGAGAGAGTGGGGGTCCAGACTATCAAACCTGATATCCCA
TCACAAGTGAATCACTTCTAAGAGTTTGGAACTACTATAGGTTTCCCAGC
TTTTATTACCAGCTGTGCTAGTTGGGGGCTAATTGTATAGAGCACACTAC
CATATGAGGGGCATGGCATATTCAAACGGCAGGCATGAAGGTCAGCTCTT
T
| TTCCCGATGAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXTTCAAAAATTCTTTATAATGCTTACATGGGACGAG
ACTGCATTAGGTTGTGGTATTCTTTCTCTTTGTATAGAGTATAGCTAAGT
AGCCAAACCTTGTGCTCATGTGCTTAGGGTACTGTGAATGATGTACAGTA
CCACTCTGATAGTGTTTTGTTAGTGCAGAAGCAACATCAACTTATGGATA
AGCCTATCTTGAAAATGTAGTGATAACCATTAAAAACAATTGCCTCTTCA
TCTCTAAAACCTTCTAGAGAATTTAGTGATTAAGTGTGGCATATATATAT
ATATATATATATATTCTGGGATACTAGCTACTAAAGTGGGTACAGATTGA
GAATGAATTCAGTATGACTGGGAATTTATATACGAGCATCAGAGACAGAA
GAGAAGGGAAAAGGAAACAGAGTGTGGGTATTGGGATATTGTTATGAGCA
CACCTCAAGATTAACGAAGAGACAGAAAATTATCATTATGAAGATATAGA
GGGCTTAAGAGGATAGAGGAAAGAGAAATGAGGTAGAAATGAGAGGAGAA
AATTATAGGTTATTGGTAATTGAAATAGTAGAGAATACATAGCAGATTAT
TCATAGAAATTTATTTTTTTTTCTTTTGTTATCTAGCTCTAAACACCTTA
TTAACTTAAGCATTTTACATAGGGGCGTAATATTTAGTATAAACC
|
quality values | Open.Hide. 8 8 8 8 8 11 9 15 25 25 37 37 38 36 36 37 23 18 9 9 9 21 21 39 28 26 28 25 23 21 21 9 10 10 15 12 6 3 0 3 8 7 8 12 15 21 25 24 30 30
31 31 33 33 59 59 59 29 29 9 6 6 6 6 6 6 10 9 8 6 6 6 6 7 13 34 37 33 33 33 33 33 50 59 59 53 53 53 53 53 44 59 41 47 43 48 48 48 48 53
57 57 68 68 57 57 42 42 42 47 47 47 68 68 59 59 44 25 20 20 24 29 19 24 25 32 44 48 68 68 68 68 68 68 68 51 51 51 51 51 50 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 50 50 50 50 50 50 57 68 68 57 57 57 68 50 50 50 50 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 53 53 53 53 53 53 57 57 57 57 59 57 57 57 53 53 53 53 53 44 44 39 37 29
31 14 12 13 14 11 11 12 19 30 28 43 37 41 44 53 53 57 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 68 68 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 57 57 57
57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 50 41 27 23 13 13 9 9 9 11 17 6 6 6 8 8 23 34 47 50 50 50 50 53 50 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59
59 57 57 57 57 57 47 47 43 43 43 43 43 43 46 59 59 59 59 59 57 57 48 57 57 57 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 68 59 59 59 59 59 59 59 59 57
57 57 57 57 42 42 33 42 44 59 59 68 59 59 59 59 59 57 57 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 52 52 52 59 59 57 57 57 57 57 57 68 68 59 59 43 35 35 47
47 57 57 57 57 46 57 42 42 41 41 59 44 57 57 57 57 57 57 57 46 43 43 32 34 27 23 14 32 32 57 57 68 57 59 57 54 54 54 54 46 46 43 43 48 48 43 57 57 57
54 48 59 41 32 20 28 28 35 39 40 43 43 37 32 28 23 32 32 43 48 48 39 43 43 40 34 34 28 28 28 32 24 28 40 59 47 47 59 46 46 34 34 23 23 23 34 41 59 48
47 59 47 59 32 32 20 18 28 28 32 32 18 18 17 22 22 24 30 27 23 27 22 22 22 30 27 28 28 28 28 25 30 37 30 30 30 37 31 34 25 25 9 9 9 15 17 25 27 28
28 23 32 32 41 36 34 28 18 14 14 16 18 20 39 39 34 39 20 16 11 20 20 33 29 29 32 29 19 23 15 15 17 17 12 13 8 8 8 9 10 18 22 28 23 26 21 13 13 26
22 21 23 12 9 9 9 11 12 11 11 9 11 9 15 15 14 19 20 13 19 21 27 21 20 19 17 19 19 18 20 11 11 10 12 10 10 11 11 11 10 12 12 21 16 10 8 8 8 8
11 25 18 24 16 16 12 16 16 12 12 12 19 15 13 13 16 13 18 26 22 20 10 10 10 10 10 10 10 13 12 12 10 8 7 8 10 8 11 11 11 15 17 11 11 6 6 6 6 6
6 | Open.Hide. 7 7 6 6 6 6 8 10 10 9 9 9 15 3 0 3 9 9 15 25 41 41 41 39 39 39 37 32 32 37 37 25 25 12 9 9 9 9 9 9 9 9 9 11 11 18 12 12 25 23
11 12 11 26 26 50 50 42 47 27 27 8 6 6 6 7 6 9 9 9 9 12 11 12 13 19 24 31 28 32 34 39 48 53 53 53 57 53 50 50 50 43 43 57 57 57 57 57 57 50
50 53 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 50 47 25 27 22 32 35 36 36 23 23 23 44 34 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 34 34 14 14 14 14 28 28 35 44 43 43 43 59 59 54 48 59 57 57 57 57 57 51 68 50 50 50 50 68 68 68 68 68 57 57 59 57 57 59
59 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 43 43 29 25 25 43 36 59 59 59 59 53 53 50 50 34
34 23 16 18 8 8 8 8 8 15 20 23 23 27 11 12 9 27 27 50 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 68 68 68 59 59 57 57 57 57
57 57 59 59 59 59 57 57 53 53 53 53 53 50 59 59 41 30 24 15 21 15 14 9 9 9 9 9 6 6 6 6 8 8 24 28 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59
59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 24 24 13 13 12 23 16 17 30 24 36 36 44 44 43 46 46 47 48 48 59 59 59 59 57 57 57 59 59 59 59 59 59 48 48 48 57 57 68
68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 59 59 59 57 57 50 44 57 43 57 32 57 43 44 42 42 32 28 17 20 20 33 40 47 57 59 59 59 57 57 57 54 54 48 59 59
57 57 57 57 59 54 54 54 57 59 59 68 68 68 68 54 54 54 54 54 59 48 48 43 42 31 30 30 30 37 42 43 43 57 43 43 39 39 37 40 29 35 43 43 43 48 48 48 48 57
48 48 48 48 44 41 39 37 32 37 37 25 22 22 25 30 30 31 31 35 39 39 41 41 41 28 24 20 20 24 28 34 59 37 33 33 33 33 32 28 22 22 24 25 39 47 47 46 47 47
34 34 28 28 28 30 24 24 28 28 34 32 32 32 20 19 31 22 18 19 20 23 26 28 31 25 19 24 22 30 19 24 28 28 13 13 13 24 24 32 28 20 21 21 22 24 25 25 18 17
12 14 16 17 19 32 30 23 16 18 10 12 10 10 9 10 11 15 13 9 9 12 10 15 12 10 10 10 15 15 18 16 15 8 7 6 8 8 9 9 10 10 10 10 10 10 8 8 8 8
8 8 9 16 12 12 12 17 12 12 8 8 8 9 11 12 26 32 29 17 12 9 9 7 9 15 10 9 9 10 8 8 6 6 8 8 8 8 8 6 6 8 6 6 8 7 8 8 8 8
8 8 8 8 8 10 9 8 8 8 8 8 12 17 10 8 6 6 8 8 9 9 9 10 10 12 10 10 9 9 9 8 8 8 8 8 8 8 11 10 10 10 9 9 9 |