| BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
|---|
| end name | MSMg01-469B16.T7 (MSMg01no469_b16.b1) | MSMg01-469B16.TJ (MSMg01no469_b16.g1) |
|---|
| ACC | AG552418 | AG552419 |
|---|
| length | 754 | 1,007 |
|---|
length of high quality
(start - end) | 524 (73 - 596) | --- |
|---|
| definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no469_b16.b1 PHD_FILE: MSMg01no469_b16.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 19:45:33 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no469_b16.g1 PHD_FILE: MSMg01no469_b16.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 19:45:33 2005 |
|---|
| singlet/doublet | singlet | --- |
|---|
| BLAST hit | unique | no hit data |
|---|
| sequence | NATCTATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGC
GGAATTAATTCTTTCCCTAGAGATTCTGCCAAAAGGACAGCCATAGTATT
ATGCATAACAAAGATCTACCTCCTATTTGCATACTGCCTTTTATGAGGTG
TGACCATAATATAGCAGAGCAATTTAAAAAAAAATAAACACAGCAAATTA
TATTACAGGGAATCTCAGTGTGAGGGGAAAAAACACAAACAACAACAATA
ACAACAACAACCACAACCAAAGGTCCCATTGCTGTCTTTGTGAGGAGACT
TTCTCTCTACAATGTGCCTAGTGAAGATTTTTCTGGATTCTACTTGAAAT
TTTCTAAAAATTGTTTTTCATGGACGCAGATGTAGCTGTCTCTTGTGAGA
CTATGCCGGGGCCCAGCAAACACAGAAGTGGATGCTCACAGTCAGCTAAT
GGATGGATCATAGGGCTCCCAATGGAGGAGCTAGAGAAAGTAGCCAAGGA
GCTAAAGGGATCTGCAACCCTATAGGTGGAACAACATTATGAGCTAACCA
GTACCCCCGAGCTCTTGACTCTAGCTGCATATATATCAAAAGATGGCCTA
GTCGGCCATCACTGGAAAGAGAGGCCCATTGGACTTGCAAACTTTATATG
CCCCAGTACAGGGAAACACCAGGGCCAAAAAGGGGGAGTGCGTGGGCAGG
GAATTCGCGGCGCCTCCTTCTCCTCTTTTTCCTCCCCCTTCCTTCTTTTT
CCTT
| CTCTTACGCATTCCCTCCGCCTGACCGACCGCCTTTCCCAAAAAAATTCA
CTTTGATACCATTTTTTCCCCCAGAGAAACCCTCGCCTACGCTATTGTAC
CGAGCACTCCCTTTATGTTACACACGACAATTACAGCTGCATAAAGGTCA
CCTTAACCAACCTGACCATCTCTATTACCGCTAAAACCCGCCTTGCCTTA
GTATGACACCCCCCACGCTACCCTTATGCCATACTATTTATCTACACTCC
CCCTACGTACTTGCCCCGCCCCCTCTCTCTATTGCCTTTTCCCAAATACC
CCCCGTCCCTTTTCCCACATGCACTATTCCACTATCCACATGCACAAGTC
CTTCCAGACCTATTCTTTATTTTTTCTACCCCCCCCCCCGGACTTTTCTG
CCCACTATTCCCACTCCTTCCTCCTACACCCCCTTTCGCTGATGAGCACG
GCCCTTAAACCCGCTATATCACCTTGAATTCGTTACCATTTCCCCCTAAA
CATACTATTATTCGGCCCTGTTAATTAGGTTGTACTCGCTCACTATCACC
GTTATTCTCTTTCTTCATTCCAACTCGCCACTTTTTTCGATTTTTTTTCC
AATCTCGCTTTCCCGTGTTTCTCCTACTTTCATATGCTTCTCTATATCTT
TTACCATATGAGTCACCGTATTACATCGGCACACTTTGACATCCGCGGTA
TATTAATTGTTTCTCCCTTACCGCCACCCTTTTATACCCTTTTTATCGTC
CCTACCTTCTATTACCACTGCCACTCACTCCTCCACCTTGTTGTTTTTTT
TATTTGTCACCCCCATGTATTTGTTCCCTCTTTATATTTCCCACCCCCAT
CCCTCACGTTTCGCTTCTTCATCGTACCTTTGTTTACGATCTTTATATTC
ACCTCCCGCCATGTATGAGTATATTTTCCACCCTCTGCACTCTTCGTCTC
TCACATATTACCCCGATCAAGTTGCGTACGCTGTATTATCCCTCCACACC
CACTATN
|
|---|
| quality values | Open.Hide. 0 3 9 10 10 9 9 9 11 12 25 19 16 8 8 6 6 8 8 9 9 10 10 10 25 25 32 22 10 13 8 7 7 8 9 10 9 9 9 9 12 12 18 18 23 25 27 30 59 59
59 30 26 26 28 28 24 16 21 9 9 9 11 11 12 13 11 15 12 12 10 18 19 30 20 28 33 25 24 23 32 32 32 44 37 37 37 37 37 37 48 50 50 53 57 59 59 59 59 57
57 53 53 50 53 53 47 47 42 42 48 51 54 68 68 54 54 54 50 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 54 54 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 57 57 48 48 48
57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 57 59 59 59 59 59 50 50 50 50 50 50 57 57 54 54 57 57 57 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 59 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 57
57 57 57 57 57 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 52 62 62 62 62 62 62 62 39 39 39 43 43 43 43 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 68 68 62 62
62 62 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 52 57 57 68 68 68 68
68 68 68 68 68 57 59 59 59 59 59 57 57 59 59 59 52 57 57 57 57 57 57 59 68 68 59 59 59 59 57 59 57 59 59 59 59 59 59 57 57 52 43 43 32 32 35 44 44 57
57 57 59 59 57 59 59 57 57 47 50 50 57 57 43 43 43 46 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 54 48 48 48 48 48 59 59 59 59 48 48 48 48 48 48 48 43 43
43 43 43 47 46 57 57 42 42 30 30 30 41 41 43 43 43 43 48 48 43 43 43 43 47 47 43 39 39 43 43 48 48 48 43 43 39 36 36 41 34 34 25 19 19 19 15 18 28 15
12 12 11 21 15 24 24 37 37 39 39 37 43 43 48 39 43 28 28 23 23 19 24 16 18 18 30 34 37 37 27 27 30 31 30 30 28 23 20 22 22 28 28 28 37 36 36 35 35 31
25 25 30 29 28 24 31 20 24 28 22 26 36 36 26 18 18 18 12 13 11 14 18 20 19 22 22 29 32 32 30 22 20 20 20 24 22 9 10 6 6 6 8 12 12 14 11 19 12 10
8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 6 6 8 8 13 15 24 9 9 9 9 7 7 9 11 17 17 19 10 10 10 16 9 9 12 19 19 19 19 12 12
13 9 9 9 | Open.Hide. 7 10 10 10 8 8 8 8 6 7 7 8 8 11 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 6 8 8 8 8 8 9 11 10 8 11 8 8 8 9 9 10 13 12 10 11 11 11 10 10
10 11 10 10 10 11 9 8 8 8 10 8 10 10 9 9 9 9 9 7 8 6 6 8 8 9 9 12 12 14 13 10 10 8 6 6 8 6 6 8 8 8 8 9 14 8 8 6 6 8
8 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 9 9 9 9 9 9 9 9 8 10 10 8 10 10 11 10 8 8 6 6 6 8 8 12 8 8 7 8 8 8 12 12 11 11 11 11
11 17 17 11 11 8 8 6 6 8 7 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 9 13 16 15 10 6 6 8 8 12 16 12 11 11 11 8 8 6 6 6 6 8 10 8 10 10 8 8 8
8 10 11 18 14 8 8 8 8 8 10 14 11 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 10 9 9 9 11 8 8 10 10 6 6 8 8 8 12 15 17 13 8 8 8 8 8 10 15 13 22
17 16 14 12 14 18 12 11 8 10 9 9 10 10 11 9 7 7 8 8 8 10 10 10 10 8 8 12 8 8 8 10 14 12 9 16 15 21 19 12 8 8 8 10 8 8 8 9 9 9
10 11 16 11 11 11 10 16 21 21 19 21 13 8 6 6 6 8 8 8 10 8 8 6 7 7 9 10 11 8 8 8 8 6 6 8 8 9 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8
9 10 9 9 10 10 10 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 13 11 12 10 10 9 9 9 9 10 10 11 13 16 12 7 8 6 6 6 6 6 6 8 8 10 10 11 11
11 11 11 10 8 8 8 8 11 8 9 9 9 9 9 9 12 10 11 12 19 28 19 16 10 8 8 8 8 10 13 15 16 16 10 10 8 8 8 8 8 8 10 10 8 8 8 6 6 8
8 10 13 12 12 12 9 9 9 9 9 9 9 9 10 10 10 8 10 8 8 8 8 9 9 9 11 13 15 12 10 8 8 10 8 8 8 8 8 8 12 10 10 10 9 10 10 8 8 6
6 6 8 8 8 8 8 8 10 7 7 8 6 6 6 6 8 8 9 9 9 10 10 8 8 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 9 8 8 10 10 10 8 8 8 8 8 10 10 9 9
9 9 8 10 8 8 8 15 11 11 12 11 12 8 10 6 7 8 10 8 7 6 8 8 8 8 10 10 10 10 10 11 12 17 12 10 10 10 9 9 10 10 13 12 12 12 12 10 10 8
8 6 6 11 13 6 6 6 8 13 16 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 9 10 10 11 8 8 8 8 8 8 9 10 11 11 16
10 8 7 7 9 9 10 10 8 8 8 8 9 9 9 11 13 11 11 11 11 11 11 11 9 9 9 9 9 6 6 6 6 8 10 13 9 7 7 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8
17 8 8 6 6 8 8 6 6 6 7 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 8 7 6 8 8 9 11 11 11 10 10 10 11 18 16 20 23 11 8 8 8 8 8 8 8 10
8 8 8 10 8 8 8 18 12 11 11 8 8 6 7 10 12 8 8 9 9 10 9 8 8 6 6 10 8 9 11 13 13 11 10 10 8 10 8 8 8 8 9 9 13 17 15 12 10 10
10 10 13 10 10 10 10 8 8 8 12 9 9 8 8 7 7 7 7 8 10 10 10 10 10 12 10 8 6 8 8 10 10 8 8 8 8 13 8 11 11 11 13 12 19 16 21 13 13 14
14 12 8 8 8 8 8 8 10 13 13 9 9 9 12 16 12 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 11 10 9 7 6 8 6 6 8 8 8 10 9 10 9 9 9 9 13 8 8
8 8 8 8 9 6 6 6 6 8 8 8 11 10 10 10 10 10 10 10 8 8 6 6 7 7 11 13 13 13 14 9 8 6 6 6 6 8 6 6 8 8 11 11 11 8 8 8 6 6
8 8 8 8 7 9 10 13 11 12 12 16 14 12 12 12 16 15 8 8 6 6 8 8 6 7 8 8 12 8 8 8 8 8 11 10 12 10 8 6 6 6 7 7 8 6 6 6 6 8
8 6 6 8 8 3 0 |
|---|
