BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-481M08.T7 (MSMg01no481_m08.b1) | MSMg01-481M08.TJ (MSMg01no481_m08.g1) |
ACC | AG562098 | AG562099 |
length | 763 | 747 |
length of high quality (start - end) | 402 (327 - 728) | 560 (71 - 630) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no481_m08.b1 PHD_FILE: MSMg01no481_m08.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 20:02:31 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no481_m08.g1 PHD_FILE: MSMg01no481_m08.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 20:02:31 2005 |
singlet/doublet | doublet | doublet |
---|
BLAST hit | unique | unique |
---|
Map location. | (49,472,008 - 49,472,409) | (49,637,244 - 49,637,803) |
---|
sequence | XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTTCGTAAACTCCGCGGAATCAAC
GCATTTTACTGATAATTTAANAAGAACTGCAGAGCCCTTCCTACACCTCT
CAGCATGCCAATGGGACATCCTGCAGTGGACACCAAATGCAGGGAGATTG
AAAAGGACAGATGTGGCTGATTTGGTCACATTTCCTGCTCACCATCTAGA
TCCTGACCAAGTCCTCTCAAAGGAAAAACAATCCATGAATGAGACTTCTT
CATGCATCATGATTAAAAGACAAACAAAAAAACAAAAACAAAGAAAATAC
CACAAACCCCAGAGCTGNCTCACTTCTAAAGGATCGGGACTTAAGTTTAA
TTTAGCTAATGAGGCTTTGGAGAGTCAGTTATCCTCCCAAGGCTGCTGAC
ACCAGCAGGACAGCAGAAGAAACTCCATATTTCAGCAGGAGTCCCACCCT
ACCAGGCGCCACACAGAATGGGACAAACCTGTAGATCCAACTTAGAACAT
TCCTGGGAGCCCGGTCATGGGTATAACCGCCAAGCAGACATGAATCAGAA
TAGCCCAAGAGGCACCCACAGGATCTTTCAGGTCTATTTTAGGTAATGAT
CGGAGCCAACAGAAAGTTATATAGAATTCTAGAGAGAAACATAGTCAGCA
AAGCCAGATGCACTATGATGCGTTCCTAGGGTGTAAGACAACCAACCACA
TCTCCTTAAGTTGTCCACTGTACCCTGCCATGTTCATAGCACCAGGCCAA
CATCAGCAACTTA
| TGATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXTTCAGGAATTCCTCCTCTCCAGCTACAGTTTACTTGAAGAT
TTACCGGGCAGCTCTTCCACCAGCCAATAAGCTCTGGCCTAGATTCAGGT
CCTTTTTTTACTCAGACTTTGCAAGCCCAGAACCCCTTACTAGATCTGGG
AACAAAATAAGGGCTCGTTTGTTCCTTTGAGGCCCTGTTACCTACACAGA
ACATGTCTCTACTTAGTTCCAAACAGCAAAGAAAACCCAAGTATGGCCTG
AGAGGTTTTCTGTTTGGGGTCTTTCCTTCATTCCTCTGGGAAGGCTAACT
TCCTCCAACTCCTAAGGCACCATTTAAGCCACCATCAAAGACATGGAATC
CCTGGGAGTGATCTCCCATCTGAACCTTCTCATGTGCATTTAAAGCGGTG
CCTGGGTCTGGGCCTTTGATTCCTGAAAGCCTAGCACCTGGACCAAGAAA
ACGCGTTCCAAATGTACTGGTGGGCAGCCTCAGATTCGGCTCTCTGTGAG
AAAAGGAACGTTAAGCCTCCACTTTTGTCCACTTTCAGCATGTCAGATGC
TAAAGGGAACAGTGGGTTTAATGTGTGCCAGGTTGTGTACCAAGCTCCTA
CCACCTAACGTACCTCCTGCAGGCAATTCCACAGAAACTCAACAATGACA
GCTTCAAGGTCCAAGCTTCCACAGCCCTGGAAGTAGATAGGCCTGTG
|
quality values | Open.Hide.19 19 19 23 19 17 15 15 28 23 15 9 9 9 21 21 41 31 31 31 30 29 23 23 8 6 6 6 7 6 6 6 6 7 7 9 9 8 8 11 12 11 21 10 8 8 8 8 19 21
37 29 23 15 7 7 6 6 6 6 8 8 9 9 11 11 11 12 8 3 0 3 8 9 27 30 33 50 50 50 50 53 53 59 59 59 59 59 59 59 59 57 53 53 53 53 53 57 47 47
47 42 42 51 68 68 48 43 33 17 17 15 15 12 11 11 11 11 16 24 32 44 57 57 57 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 48 48 46 50 50 51
57 57 59 57 57 57 57 57 50 50 50 50 50 50 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 59 59 59 57 57 54
57 57 54 54 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 57 57 57 57 50 50 57 57 57 57 57 53 47 47 44 48 42 40 41 27 21 12 10 10 10
10 14 15 30 30 59 59 59 50 53 53 57 57 57 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 57 57 57 57 57 57
57 57 57 57 53 53 59 59 59 59 59 34 28 20 20 9 3 0 3 9 7 7 9 9 9 9 10 22 23 59 41 50 50 50 50 53 50 50 44 43 43 43 43 43 59 59 59 59 59 59
59 57 57 57 34 32 31 31 36 37 42 32 47 47 47 47 48 48 43 48 47 48 59 59 68 68 68 68 68 68 68 57 68 68 68 57 57 57 57 57 57 59 68 68 68 57 57 57 57 48
57 57 57 59 59 59 57 57 46 48 39 39 36 36 28 30 35 59 59 54 59 59 59 57 46 43 43 43 48 57 57 44 43 40 40 43 43 48 57 57 57 57 59 59 57 57 57 59 59 59
50 41 41 41 41 39 34 34 31 26 30 39 34 59 47 47 59 59 59 50 48 48 48 48 48 57 57 57 57 50 48 48 48 48 48 43 43 43 43 43 43 43 59 43 43 43 43 40 48 48
57 59 59 59 59 59 57 48 48 48 48 41 47 41 59 59 59 41 41 37 41 39 39 39 40 41 41 48 43 43 36 36 36 37 41 47 47 35 39 37 46 59 59 59 59 47 36 35 39 36
41 41 41 37 37 41 43 43 59 41 37 37 41 41 47 59 41 41 41 37 37 37 37 37 37 41 41 41 41 35 31 27 32 28 32 32 47 47 37 37 37 31 31 35 37 39 39 40 39 39
36 35 35 37 34 31 31 31 31 37 37 37 39 39 40 35 31 28 37 37 37 39 40 40 40 48 43 43 34 28 25 25 34 34 43 41 37 37 37 41 37 40 39 36 39 39 39 41 43 41
37 39 41 37 32 34 37 28 28 19 11 11 11 13 13 22 31 32 34 32 37 36 39 39 37 37 39 38 19 19 11 11 11 17 16 24 28 24 24 24 31 29 24 24 20 22 19 28 28 37
39 39 39 31 31 29 24 26 24 17 17 14 13 13 14 23 32 28 30 32 32 27 26 37 28 30 13 13 13 15 15 24 24 31 16 16 12 12 9 16 15 11 9 9 9 10 10 10 14 11
15 9 9 9 9 13 17 20 19 22 16 13 13 | Open.Hide. 8 8 8 8 8 15 9 9 9 14 15 22 23 39 29 34 34 35 35 39 39 39 39 44 37 33 21 21 8 6 6 6 7 6 6 6 6 6 6 6 6 11 11 11 11 11 10 21 21 42
50 42 41 25 27 9 7 7 7 8 8 9 9 9 14 14 13 13 17 21 23 25 25 28 37 41 36 50 50 50 50 50 57 57 57 57 57 57 59 59 57 57 68 68 68 68 51 51 54 57
57 54 59 68 68 68 50 50 50 51 50 50 54 44 44 42 39 35 42 38 47 47 47 57 57 57 57 57 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 68 68 57 57 57 57 57 57 52 52 52 52 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 57
57 57 68 68 68 68 68 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 48
48 54 48 57 59 68 59 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 57 57 57 57 57 57 54 54 54 57 54 54 54 59 57 54 54 57 57 57 54 57 57 57 57 57 57 57 57 57 53 53 57
53 53 53 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 41 31 15 10 8 8 8 10 25 30 47 46 41 41 48 50 50 53 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 48 57 57 59 59
68 68 68 57 57 57 57 57 57 59 57 57 48 48 48 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 57 57 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 48 48 44 59 43 43 43 57 59 57 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 54 54 54 59 59 68 68 68 68 68 59 59 59 54 54 57
57 46 54 47 59 59 59 59 59 59 57 48 48 48 59 59 57 57 48 48 48 57 59 59 59 57 57 57 48 48 48 48 40 39 39 39 37 41 39 32 32 32 37 37 37 41 41 41 43 43
48 48 57 57 48 46 39 39 39 39 39 39 59 48 48 48 48 43 43 42 32 32 37 40 39 39 43 43 46 44 43 35 35 35 47 42 43 43 43 43 43 48 43 59 39 35 32 36 34 40
47 59 59 48 48 48 48 48 48 48 48 47 41 40 39 39 39 39 31 31 35 36 39 41 59 41 40 48 48 48 48 47 47 39 36 28 25 25 34 34 32 24 22 22 32 34 23 32 31 34
32 31 31 35 31 37 36 39 37 30 27 12 8 8 7 7 13 19 19 12 14 24 25 25 23 28 23 17 17 30 22 16 21 11 12 12 12 12 14 26 28 37 40 40 46 46 34 30 24 22
18 25 21 22 22 23 23 22 26 24 17 15 12 12 14 14 22 25 24 15 15 12 13 11 11 11 14 17 19 14 14 14 24 26 39 34 34 34 34 23 20 14 22 10 10 13 19 19 14 17
19 21 21 18 11 11 8 9 9 8 8 8 8 19 20 17 17 15 12 11 18 17 22 16 9 9 9 9 11 13 13 10 15 16 10 6 6 6 6 9 9 19 12 18 10 10 10 |